MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008765	GC	3	6	1124	1129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008765	TC	3	6	1825	1830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008765	GC	3	6	2002	2007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008765	GC	3	6	17030	17035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008765	AG	3	6	24391	24396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008765	CA	3	6	25598	25603	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008765	CG	4	8	25655	25662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008765	GC	3	6	25680	25685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008765	GC	3	6	31517	31522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008765	TG	3	6	31562	31567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008765	GA	3	6	32226	32231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008765	GC	3	6	32249	32254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008765	GC	3	6	35833	35838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008765	CG	4	8	35936	35943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008765	GC	4	8	36198	36205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008765	GC	3	6	36207	36212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008765	CG	3	6	36538	36543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008765	GA	3	6	39653	39658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008765	CG	3	6	40067	40072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008765	CG	4	8	40132	40139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008765	GC	3	6	40178	40183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008765	GC	3	6	40483	40488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008765	CG	3	6	40548	40553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008765	CG	3	6	40870	40875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008765	CG	3	6	41661	41666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008765	GC	3	6	42564	42569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008765	GA	3	6	43157	43162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008765	CG	3	6	43571	43576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008765	CG	4	8	43636	43643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008765	GC	3	6	43682	43687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008765	CG	3	6	46294	46299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008765	CG	4	8	46348	46355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008765	GC	3	6	48921	48926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008765	GC	3	6	48968	48973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008765	GC	3	6	49141	49146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008765	TG	3	6	49149	49154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008765	GC	3	6	49539	49544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008765	GC	3	6	49546	49551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008765	GC	3	6	49749	49754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008765	CG	5	10	49894	49903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008765	CG	4	8	52612	52619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008765	CG	3	6	55658	55663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008765	GC	4	8	55723	55730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008765	CG	3	6	56240	56245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008765	CG	4	8	56262	56269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008765	GT	3	6	65151	65156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008765	CG	4	8	69500	69507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008765	GC	3	6	72567	72572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.