MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008765	CAA	2	6	6	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008765	GTC	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008765	GGC	2	6	1917	1922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008765	TGG	2	6	1953	1958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008765	TGT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008765	TCA	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008765	GCC	2	6	16251	16256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008765	GCA	2	6	16971	16976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008765	CCT	2	6	20727	20732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008765	CCG	2	6	22202	22207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008765	TCG	2	6	25424	25429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008765	CAT	2	6	25438	25443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008765	CGG	2	6	25484	25489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008765	TCA	2	6	25594	25599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008765	GCC	2	6	25643	25648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008765	CGC	2	6	31481	31486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_008765	GTG	2	6	31558	31563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008765	TTC	2	6	31572	31577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008765	GAA	2	6	31606	31611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008765	GCA	2	6	31684	31689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008765	CTT	2	6	32161	32166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008765	CAG	2	6	32330	32335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008765	AAG	2	6	32430	32435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008765	GCA	2	6	32554	32559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008765	GGC	2	6	32956	32961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008765	CAG	2	6	33033	33038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008765	GCA	2	6	33072	33077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008765	GCC	2	6	33089	33094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008765	GCC	2	6	33163	33168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_008765	GGC	2	6	33173	33178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008765	GGC	2	6	33226	33231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008765	AGC	2	6	33242	33247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008765	GGC	2	6	33350	33355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008765	TGG	2	6	33369	33374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008765	GAA	2	6	33460	33465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008765	CGG	2	6	33509	33514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008765	CAG	2	6	35225	35230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008765	CAC	2	6	35902	35907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_008765	GCA	2	6	36010	36015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008765	AGC	2	6	36053	36058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008765	CAG	2	6	36090	36095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008765	CAG	3	9	36161	36169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008765	GCC	2	6	36522	36527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008765	GCC	2	6	36998	37003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008765	TGG	2	6	37523	37528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008765	TCA	2	6	39594	39599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008765	TTC	2	6	39695	39700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008765	CCA	2	6	39861	39866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008765	TCG	2	6	39873	39878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008765	GAC	2	6	40026	40031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008765	GTG	2	6	40050	40055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008765	CAC	2	6	40101	40106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008765	CGC	2	6	40235	40240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008765	GGC	2	6	40242	40247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008765	ACG	2	6	40293	40298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008765	CAG	2	6	40537	40542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008765	GGC	2	6	41680	41685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008765	TGA	2	6	42535	42540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008765	TGG	2	6	43064	43069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008765	TGC	2	6	43074	43079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008765	TTC	2	6	43199	43204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008765	CCA	2	6	43365	43370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008765	TCG	2	6	43377	43382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008765	GAC	2	6	43530	43535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008765	GTG	2	6	43554	43559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008765	CAC	2	6	43605	43610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_008765	CGC	2	6	43739	43744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_008765	GGC	2	6	43746	43751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008765	TCA	2	6	46237	46242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008765	TGT	3	9	48836	48844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008765	TGT	2	6	48846	48851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008765	CAA	2	6	48868	48873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008765	GCC	2	6	49022	49027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008765	CGG	2	6	49063	49068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008765	GTC	2	6	49244	49249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008765	TCG	2	6	49289	49294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008765	CGG	2	6	49329	49334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008765	CCT	2	6	49426	49431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008765	CAT	2	6	49458	49463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008765	GCA	2	6	49516	49521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008765	CGG	2	6	49583	49588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008765	GTG	2	6	49683	49688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008765	CGG	2	6	49692	49697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008765	GGA	2	6	49805	49810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008765	CGG	2	6	49857	49862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008765	CCG	2	6	50050	50055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008765	GCA	2	6	50120	50125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008765	GAC	2	6	50313	50318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008765	CTT	2	6	51379	51384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008765	TGA	2	6	51435	51440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008765	GGC	2	6	52633	52638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008765	GCC	2	6	52644	52649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_008765	TGG	2	6	55223	55228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008765	GTT	2	6	55292	55297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008765	GGC	2	6	55443	55448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008765	GCA	2	6	55460	55465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008765	CTG	2	6	55482	55487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008765	CCA	2	6	55508	55513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008765	GAA	2	6	55569	55574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008765	GCG	2	6	55732	55737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008765	CGT	2	6	55748	55753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008765	AGA	2	6	55766	55771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008765	CAG	2	6	55791	55796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008765	GAC	2	6	55872	55877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008765	CCA	2	6	55892	55897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008765	GCC	2	6	55930	55935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_008765	GCC	2	6	56025	56030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008765	ATG	2	6	56071	56076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008765	CCA	2	6	56120	56125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_008765	GGT	2	6	56315	56320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008765	GGT	2	6	56711	56716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008765	TGG	2	6	56769	56774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008765	ACC	2	6	59791	59796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008765	CGG	2	6	60266	60271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008765	GCA	2	6	60330	60335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008765	GGA	2	6	60454	60459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008765	GCG	3	9	60472	60480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008765	GCG	2	6	65251	65256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008765	TTC	2	6	69481	69486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008765	CCA	2	6	71213	71218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008765	GCG	2	6	71242	71247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008765	TGA	2	6	71258	71263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008765	TGG	2	6	71266	71271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008765	TTC	2	6	71299	71304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008765	TGG	2	6	71577	71582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008765	ACA	2	6	72619	72624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.