MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax citrulli AAC00-1 chromosome

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008752	CACGCG	2	12	9930	9941	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008752	CGGCCT	2	12	28184	28195	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008752	CGGTGG	2	12	28393	28404	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008752	TTTCTT	2	12	47883	47894	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008752	CCAGCG	2	12	50732	50743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008752	GCCCTG	2	12	51482	51493	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008752	GTGGGG	2	12	51698	51709	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008752	GCCGAT	2	12	52704	52715	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008752	CGGGGG	2	12	53052	53063	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008752	TCCCAC	2	12	77177	77188	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_008752	CATTCC	2	12	78185	78196	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008752	CGCATG	2	12	91052	91063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008752	TCCAGT	2	12	91256	91267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008752	GGCCGG	2	12	114362	114373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008752	TGCCAT	2	12	122194	122205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008752	CGGTAA	2	12	136222	136233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008752	CGTGCG	2	12	145174	145185	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008752	GGCGAC	2	12	162826	162837	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008752	CGGGTT	2	12	221911	221922	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008752	CTCTTT	2	12	291807	291818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008752	CCTTCC	3	18	291824	291841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008752	TCGAGT	2	12	337368	337379	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008752	TCCCGA	2	12	433349	433360	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008752	CGCCGG	2	12	477449	477460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008752	CCTGGC	2	12	479009	479020	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008752	GCGCGT	2	12	491519	491530	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008752	GCCATG	2	12	578048	578059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008752	TTTTTG	2	12	614829	614840	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008752	GCAGGC	2	12	623740	623751	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008752	GCAGGC	2	12	657865	657876	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008752	GTTTTT	2	12	678614	678625	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008752	GCGAGC	2	12	683915	683926	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008752	TTCGTA	2	12	684000	684011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008752	CTGGTG	2	12	706374	706385	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008752	CCGCAC	2	12	706748	706759	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008752	GTGCAG	2	12	706874	706885	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008752	GCACCG	2	12	730428	730439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008752	GGCAGG	2	12	740800	740811	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008752	GCTGAA	2	12	803231	803242	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008752	GCCCAG	2	12	820411	820422	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008752	TGCGCC	2	12	850461	850472	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008752	GCCGGG	2	12	1015602	1015613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008752	TGCGCC	2	12	1024728	1024739	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008752	GAAAAC	2	12	1027485	1027496	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008752	AGGCCG	2	12	1056010	1056021	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008752	GGATGC	2	12	1070223	1070234	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008752	GTGGCG	2	12	1103110	1103121	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008752	GTGCCT	2	12	1113307	1113318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008752	GCCCCG	2	12	1160073	1160084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008752	GGGGTC	2	12	1180194	1180205	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008752	TGGCGG	2	12	1192421	1192432	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008752	TACGAA	2	12	1223101	1223112	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008752	GCTCGC	2	12	1223186	1223197	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008752	GCCGGG	2	12	1231065	1231076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008752	GGAGGC	2	12	1238348	1238359	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008752	CCGCGG	2	12	1255514	1255525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008752	CTTTTT	2	12	1256689	1256700	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008752	CGGCCC	2	12	1258059	1258070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008752	CGGCCT	2	12	1325741	1325752	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008752	CCGGCG	2	12	1359516	1359527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008752	TGGGGG	2	12	1359847	1359858	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008752	CACGAG	2	12	1369896	1369907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008752	CCGCGG	2	12	1381198	1381209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008752	CCGAAC	2	12	1407361	1407372	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008752	AGGCGG	2	12	1461804	1461815	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008752	TGCCGC	2	12	1484106	1484117	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008752	TACGAA	2	12	1528572	1528583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008752	GCTCGC	2	12	1528657	1528668	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008752	ATCGGG	2	12	1582286	1582297	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008752	TTCCGG	2	12	1623830	1623841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008752	ATTTCC	2	12	1640185	1640196	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008752	TACGAA	2	12	1677459	1677470	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008752	GCTCGC	2	12	1677544	1677555	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008752	CGCATG	2	12	1751090	1751101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008752	TGGCGT	2	12	1757174	1757185	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008752	TGGGGC	2	12	1761106	1761117	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008752	GGAAAG	2	12	1761799	1761810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008752	AGAAAA	2	12	1832948	1832959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008752	TTGGCA	2	12	1838679	1838690	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008752	CCCGGC	2	12	1861192	1861203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008752	AGCCGT	2	12	1900768	1900779	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008752	GAAAAG	2	12	1903938	1903949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008752	GAGGCG	2	12	1911868	1911879	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008752	CGGTGG	3	18	1911881	1911898	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008752	GTGCGG	2	12	1912032	1912043	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008752	ACAAGC	2	12	1920283	1920294	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008752	GCACGG	2	12	1925758	1925769	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008752	TCCTGC	2	12	1965561	1965572	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008752	CATGGT	2	12	1970655	1970666	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008752	TGGTCG	2	12	1970732	1970743	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008752	GTTGTG	3	18	1994978	1994995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008752	GCCCGG	2	12	2091146	2091157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008752	GCGAGC	2	12	2108193	2108204	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008752	TTCGTA	2	12	2108278	2108289	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008752	TGCCGC	2	12	2140901	2140912	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008752	GCGAGC	2	12	2197202	2197213	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008752	TTCGTA	2	12	2197287	2197298	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008752	CGTGGC	2	12	2215635	2215646	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008752	TTGAAT	2	12	2243261	2243272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008752	CGCCCG	2	12	2248216	2248227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008752	CCAGTT	2	12	2248300	2248311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008752	TCCTGT	2	12	2259050	2259061	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008752	GGGCGG	2	12	2280284	2280295	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008752	TCCCGC	2	12	2364831	2364842	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_008752	GGCCCC	2	12	2397432	2397443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008752	GCGGTC	2	12	2402659	2402670	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008752	ACGGAT	2	12	2406850	2406861	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008752	CCGCGG	2	12	2415050	2415061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008752	GAGGGG	2	12	2481124	2481135	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008752	CGAGCG	2	12	2492073	2492084	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008752	CCGGGC	2	12	2509835	2509846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008752	CCGCGG	2	12	2514527	2514538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008752	GGCCCG	2	12	2525985	2525996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008752	TGCCGA	2	12	2536173	2536184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008752	CCGTGG	2	12	2536340	2536351	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008752	CCGGCC	2	12	2536547	2536558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_008752	CGCGGG	2	12	2537028	2537039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008752	CGTTTT	2	12	2551738	2551749	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008752	CGGCAA	2	12	2562342	2562353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008752	CGGCCG	2	12	2578511	2578522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008752	GCTTTC	2	12	2618610	2618621	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008752	CAAGCA	2	12	2621559	2621570	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008752	AAAGCG	2	12	2707725	2707736	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_008752	CGGGCC	2	12	2716447	2716458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008752	GGCGGT	2	12	2724911	2724922	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008752	ATCGTC	2	12	2740021	2740032	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008752	TGAAGT	2	12	2768415	2768426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008752	TGAACG	2	12	2772130	2772141	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008752	GGCCGG	2	12	2793364	2793375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008752	CAAGGA	2	12	2798164	2798175	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_008752	GCGAGC	2	12	2852690	2852701	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008752	TTCGTA	2	12	2852775	2852786	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_008752	GCGCCG	2	12	2853802	2853813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008752	CGGGCA	2	12	2855012	2855023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_008752	GAGGGG	2	12	2979453	2979464	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_008752	CGGGCC	2	12	3453223	3453234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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240	NC_008752	GCCACC	2	12	4959154	4959165	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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243	NC_008752	CTCGCT	2	12	5023001	5023012	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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247	NC_008752	GGCCGG	2	12	5076575	5076586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_008752	CCGCGG	2	12	5086959	5086970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
249	NC_008752	CGGCCC	2	12	5097318	5097329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
250	NC_008752	CAGGCC	2	12	5111952	5111963	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
251	NC_008752	CCGCGC	2	12	5111968	5111979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
252	NC_008752	CGCGGC	2	12	5126396	5126407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
253	NC_008752	GTGCAG	2	12	5135597	5135608	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_008752	CCGCAT	2	12	5203424	5203435	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
255	NC_008752	TCCCGG	2	12	5217217	5217228	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
256	NC_008752	GTGCCC	2	12	5256181	5256192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
257	NC_008752	GTACTT	2	12	5261583	5261594	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_008752	ATCGGC	2	12	5299366	5299377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_008752	TCGTGG	2	12	5300008	5300019	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_008752	TTTTCG	2	12	5319011	5319022	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
261	NC_008752	ACCCCG	2	12	5326589	5326600	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_008752	CCCGCC	2	12	5341213	5341224	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
263	NC_008752	GCCTTC	2	12	5341879	5341890	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.