MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008570	AACGG	2	10	1595	1604	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008570	AGGAT	2	10	8287	8296	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008570	AGCGG	2	10	29094	29103	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008570	CCTTG	2	10	46840	46849	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_008570	CGTAT	2	10	54219	54228	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008570	CTCTG	2	10	81072	81081	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_008570	CGCGG	2	10	84847	84856	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008570	TCGTG	2	10	86244	86253	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008570	CTTCT	2	10	87020	87029	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008570	TAGCG	2	10	87424	87433	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008570	AGTCG	2	10	88351	88360	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008570	CAAAT	2	10	109935	109944	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008570	CTGAC	2	10	113975	113984	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008570	CTTGC	2	10	114817	114826	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008570	CAGAT	2	10	115326	115335	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008570	GTTTT	2	10	117900	117909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008570	CTGGT	2	10	117938	117947	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008570	GGCTC	2	10	139973	139982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008570	TAATT	2	10	140662	140671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008570	CAATT	2	10	141317	141326	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008570	GGGCC	2	10	148382	148391	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008570	CGGGC	2	10	153184	153193	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008570	CGCGG	2	10	163045	163054	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_008570	TCGTG	2	10	164442	164451	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008570	CTTCT	2	10	165192	165201	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008570	AGTCG	2	10	166520	166529	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008570	TGGAG	2	10	179796	179805	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008570	AAAAT	2	10	183898	183907	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008570	GCCTT	2	10	200131	200140	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_008570	CACTG	2	10	200144	200153	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008570	CGTTT	2	10	200854	200863	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008570	TCGTG	2	10	215977	215986	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008570	AGTCG	2	10	218018	218027	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008570	GGTTT	2	10	247251	247260	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008570	GGCCC	2	10	260547	260556	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_008570	TTTAA	2	10	268837	268846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008570	GAGAG	2	10	305177	305186	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008570	TGGCG	2	10	327344	327353	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008570	GAGAG	2	10	332117	332126	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008570	CTTTT	2	10	349117	349126	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008570	TCGTG	2	10	351016	351025	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008570	CTTCT	2	10	351766	351775	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_008570	AGTCG	2	10	353094	353103	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_008570	AGCGG	2	10	355177	355186	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008570	TCCGC	2	10	355245	355254	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_008570	AGTCC	2	10	355745	355754	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008570	CAGGC	2	10	360112	360121	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_008570	GTGTC	2	10	367250	367259	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008570	GCCTT	2	10	391406	391415	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008570	GTATG	2	10	391428	391437	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008570	CTCAG	2	10	415825	415834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008570	TGACC	2	10	418408	418417	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_008570	AGGCA	2	10	425561	425570	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008570	GAATC	2	10	439613	439622	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008570	GTCAT	2	10	452726	452735	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008570	ATTTG	2	10	456540	456549	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008570	TGCCG	2	10	461644	461653	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_008570	GGGGC	2	10	480929	480938	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008570	AATAA	2	10	482403	482412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008570	GCCGC	2	10	504037	504046	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_008570	GGGCC	2	10	507953	507962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_008570	GCGGG	2	10	510827	510836	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008570	GTTTT	2	10	523224	523233	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008570	CTTTG	2	10	535186	535195	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008570	GCAGC	2	10	535247	535256	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008570	CGATG	2	10	535974	535983	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_008570	TGGCA	2	10	551021	551030	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_008570	GGCAA	2	10	568512	568521	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008570	TTTGA	2	10	573125	573134	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008570	CCTGA	2	10	585386	585395	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_008570	CAAGG	2	10	599380	599389	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_008570	AGTCG	2	10	613760	613769	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008570	GGGAG	2	10	617677	617686	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008570	ATTCC	2	10	619472	619481	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_008570	ATGTC	2	10	637619	637628	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008570	CGTTT	2	10	638303	638312	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_008570	GTGCT	2	10	663055	663064	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_008570	GTATA	2	10	669919	669928	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008570	CCGAT	2	10	671509	671518	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008570	CTGGA	2	10	684960	684969	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008570	TCATT	2	10	685129	685138	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_008570	CTTGG	2	10	686932	686941	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008570	GGGCA	2	10	688836	688845	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008570	GCCAT	2	10	696679	696688	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_008570	TTCTT	2	10	726855	726864	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008570	ATAGA	2	10	758643	758652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008570	GGGAT	2	10	758732	758741	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008570	CTTCA	2	10	768773	768782	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008570	AACCG	2	10	778314	778323	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_008570	AAAAC	2	10	790830	790839	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008570	GATAT	2	10	791865	791874	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008570	TGGTT	2	10	792181	792190	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008570	TCTCC	2	10	792204	792213	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_008570	TCGTG	2	10	804913	804922	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_008570	CTTCT	2	10	805666	805675	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_008570	TAGCG	2	10	806069	806078	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008570	AGTCG	2	10	806996	807005	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_008570	AGCGG	2	10	809119	809128	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008570	TCCGC	2	10	809187	809196	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_008570	CCCGA	2	10	826070	826079	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_008570	GTCGC	2	10	831867	831876	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_008570	TTTCA	2	10	832775	832784	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_008570	CGTTT	2	10	841656	841665	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_008570	AACGC	2	10	843012	843021	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_008570	GAAAA	2	10	852900	852909	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008570	CCTAA	2	10	855781	855790	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_008570	TGCTT	2	10	870989	870998	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008570	CGAAA	2	10	871033	871042	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008570	TCAAT	2	10	871130	871139	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008570	GAGGC	2	10	904759	904768	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008570	GACGC	2	10	904873	904882	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008570	CCTCC	2	10	912746	912755	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
113	NC_008570	CATAA	2	10	915810	915819	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008570	GGCAT	2	10	929534	929543	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008570	TCGTG	2	10	934090	934099	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008570	CTTCT	2	10	934843	934852	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_008570	TAGCG	2	10	935246	935255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008570	AGTCG	2	10	936173	936182	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008570	TCAAT	2	10	938358	938367	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_008570	TTCTC	2	10	944513	944522	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_008570	GCCTG	2	10	948775	948784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_008570	GATCT	2	10	959383	959392	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_008570	GCGGG	2	10	964408	964417	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008570	TGCCG	2	10	969318	969327	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_008570	CGGGT	2	10	973022	973031	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_008570	TCTCT	2	10	978214	978223	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_008570	GAGAG	2	10	1003171	1003180	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008570	GTGTG	2	10	1011122	1011131	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008570	GTTTT	2	10	1016139	1016148	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008570	AAGAA	2	10	1031013	1031022	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008570	GTTGC	2	10	1055766	1055775	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008570	GGGCG	2	10	1080306	1080315	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
133	NC_008570	GCGCC	2	10	1080895	1080904	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_008570	CGGGG	2	10	1087242	1087251	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008570	GCAGA	2	10	1089738	1089747	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008570	CATTT	2	10	1104338	1104347	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_008570	CTTCT	2	10	1108775	1108784	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_008570	CTGGT	2	10	1134062	1134071	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008570	AACTT	2	10	1146435	1146444	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008570	TAAAT	2	10	1151615	1151624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008570	ATACG	2	10	1160795	1160804	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008570	GGGGC	2	10	1164040	1164049	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008570	GGTAG	2	10	1178104	1178113	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008570	ATCTC	2	10	1181265	1181274	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_008570	CCAGC	2	10	1204874	1204883	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_008570	AATTG	2	10	1204991	1205000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008570	TCTCG	2	10	1210425	1210434	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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153	NC_008570	CATTC	2	10	1264395	1264404	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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160	NC_008570	CAGCA	2	10	1359476	1359485	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_008570	GCATG	2	10	1361365	1361374	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_008570	GTTTT	2	10	1367734	1367743	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008570	TGAGG	2	10	1369236	1369245	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_008570	GATGT	2	10	1528043	1528052	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_008570	CCCGC	2	10	2703584	2703593	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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289	NC_008570	GCTGC	2	10	2768710	2768719	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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294	NC_008570	TATTT	2	10	2826190	2826199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_008570	CGCTG	2	10	2827110	2827119	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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451	NC_008570	TATTT	2	10	4276059	4276068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_008570	GCCAG	2	10	4327091	4327100	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
453	NC_008570	AAAGA	2	10	4335308	4335317	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
454	NC_008570	ATTGC	2	10	4338249	4338258	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
455	NC_008570	TTTTG	2	10	4350665	4350674	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_008570	CGCTA	2	10	4452251	4452260	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
472	NC_008570	TAAGG	2	10	4452896	4452905	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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