MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 6849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008340	CGG	2	6	264374	264379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_008340	GGGT	2	8	264380	264387	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008340	G	7	7	264392	264398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
504	NC_008340	TGCC	2	8	265040	265047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_008340	C	6	6	265085	265090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
506	NC_008340	GAC	2	6	266534	266539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008340	GGC	2	6	266550	266555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008340	CCT	2	6	266598	266603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_008340	GGA	2	6	266644	266649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008340	AGGGC	2	10	267064	267073	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
511	NC_008340	GC	3	6	267081	267086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
512	NC_008340	GCG	2	6	267108	267113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_008340	TCC	2	6	267819	267824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_008340	TGA	2	6	267827	267832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008340	ACCG	2	8	269544	269551	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
516	NC_008340	CGG	2	6	270165	270170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008340	CGT	2	6	270176	270181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_008340	CCT	2	6	270232	270237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_008340	GGGGC	2	10	270270	270279	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
520	NC_008340	CCT	2	6	270600	270605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_008340	ACCC	2	8	270621	270628	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
522	NC_008340	GAC	2	6	270646	270651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008340	TGT	2	6	271135	271140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_008340	GCC	2	6	271162	271167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_008340	TCG	2	6	271223	271228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_008340	CTC	2	6	271234	271239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_008340	TAA	2	6	271319	271324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_008340	G	7	7	273914	273920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
529	NC_008340	A	6	6	273984	273989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008340	CCG	2	6	273992	273997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_008340	GGGC	2	8	273999	274006	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
532	NC_008340	TGT	3	9	274046	274054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008340	TGG	2	6	274056	274061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008340	TGC	2	6	274184	274189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_008340	GAG	2	6	274218	274223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_008340	GC	3	6	274269	274274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_008340	GAT	2	6	274310	274315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_008340	GAG	2	6	274336	274341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_008340	CGC	2	6	274375	274380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_008340	GC	3	6	274387	274392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_008340	GCG	2	6	274439	274444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_008340	GC	3	6	279398	279403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_008340	TGGA	2	8	279425	279432	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008340	AGCGGG	2	12	279492	279503	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
545	NC_008340	CGG	2	6	279506	279511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008340	ACC	2	6	279515	279520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_008340	GCGG	2	8	279537	279544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
548	NC_008340	CCT	2	6	279678	279683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_008340	GGTGGG	2	12	279693	279704	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_008340	TTG	2	6	282108	282113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_008340	TGATT	2	10	282148	282157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
552	NC_008340	TAT	2	6	282158	282163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_008340	CCG	2	6	282166	282171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_008340	CAGGG	2	10	282227	282236	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
555	NC_008340	CGG	2	6	282252	282257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_008340	TAA	2	6	282262	282267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_008340	GCA	2	6	282340	282345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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559	NC_008340	CAG	2	6	282690	282695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_008340	GCC	2	6	282751	282756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_008340	CGC	2	6	282770	282775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_008340	ACG	2	6	282798	282803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_008340	GCA	2	6	282824	282829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_008340	TCA	2	6	282875	282880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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568	NC_008340	GTC	2	6	282972	282977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_008340	CG	3	6	282982	282987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_008340	GT	3	6	283032	283037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_008340	TGGC	2	8	283055	283062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
572	NC_008340	AAT	2	6	283080	283085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008340	CCG	2	6	283121	283126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_008340	GAG	2	6	283154	283159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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604	NC_008340	CCCA	2	8	295705	295712	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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622	NC_008340	GC	3	6	305231	305236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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632	NC_008340	GC	3	6	307155	307160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
633	NC_008340	GT	3	6	309898	309903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008340	CAG	2	6	309929	309934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_008340	GGAA	2	8	309937	309944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_008340	GGC	2	6	313508	313513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_008340	GTG	2	6	368100	368105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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913	NC_008340	GGC	2	6	412833	412838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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932	NC_008340	GTGCA	2	10	418372	418381	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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952	NC_008340	ACC	2	6	426422	426427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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