MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 6849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008340	GA	3	6	2840092	2840097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_008340	GCC	2	6	2840685	2840690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_008340	GCA	2	6	2840715	2840720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_008340	GCC	3	9	2840727	2840735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_008340	GGC	2	6	2840739	2840744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_008340	CAT	2	6	2840750	2840755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_008340	GCC	2	6	2841419	2841424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_008340	CCA	2	6	2842773	2842778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_008340	TACT	2	8	2842789	2842796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_008340	CTG	2	6	2842858	2842863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_008340	GCC	2	6	2846746	2846751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_008340	GCC	2	6	2846759	2846764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_008340	GGT	3	9	2847374	2847382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_008340	CGGGG	2	10	2847400	2847409	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6015	NC_008340	AGCGA	2	10	2847481	2847490	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6016	NC_008340	CG	3	6	2847496	2847501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6017	NC_008340	GAC	2	6	2847563	2847568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_008340	C	6	6	2847568	2847573	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6019	NC_008340	GTG	2	6	2851326	2851331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008340	CCA	2	6	2851435	2851440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_008340	GGA	2	6	2851451	2851456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_008340	CCACGG	2	12	2855942	2855953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_008340	CGG	2	6	2855964	2855969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_008340	GTT	2	6	2857773	2857778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_008340	CGC	2	6	2857810	2857815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6027	NC_008340	CCGGC	2	10	2857909	2857918	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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6029	NC_008340	CCGGG	2	10	2857953	2857962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6030	NC_008340	GTC	2	6	2858908	2858913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_008340	CGTC	2	8	2858932	2858939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_008340	GAAC	2	8	2858985	2858992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_008340	TGG	2	6	2859072	2859077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_008340	TA	3	6	2859162	2859167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_008340	CCGGG	2	10	2859175	2859184	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6036	NC_008340	CCGGC	2	10	2859189	2859198	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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6039	NC_008340	TG	3	6	2862978	2862983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_008340	ACCG	2	8	2862995	2863002	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_008340	CTG	2	6	2863471	2863476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_008340	GAA	2	6	2863824	2863829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_008340	CG	3	6	2865499	2865504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_008340	CCG	2	6	2865552	2865557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_008340	TGCCG	2	10	2865561	2865570	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6047	NC_008340	A	6	6	2865628	2865633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_008340	GC	3	6	2865635	2865640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_008340	AGCGA	2	10	2865648	2865657	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6050	NC_008340	CGC	2	6	2865663	2865668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_008340	CGGCA	2	10	2865739	2865748	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6052	NC_008340	CAC	2	6	2865847	2865852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_008340	CGG	2	6	2867927	2867932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_008340	A	6	6	2867998	2868003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_008340	GC	4	8	2868004	2868011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_008340	AGCGA	2	10	2868019	2868028	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6057	NC_008340	CG	3	6	2868032	2868037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_008340	C	6	6	2868137	2868142	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6059	NC_008340	AC	3	6	2868175	2868180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_008340	GTG	2	6	2873173	2873178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_008340	TGA	2	6	2874680	2874685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_008340	GCC	2	6	2874715	2874720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_008340	GCG	2	6	2874737	2874742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_008340	GCG	2	6	2874746	2874751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_008340	CAC	2	6	2874811	2874816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_008340	TGC	2	6	2875329	2875334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_008340	GTTG	2	8	2875423	2875430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_008340	GTTG	2	8	2875467	2875474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_008340	GCG	2	6	2875504	2875509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_008340	CCAT	2	8	2875538	2875545	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6071	NC_008340	GCA	2	6	2875558	2875563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_008340	CTG	2	6	2875567	2875572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6074	NC_008340	GCT	2	6	2875637	2875642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_008340	G	6	6	2875645	2875650	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_008340	GA	3	6	2875697	2875702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6079	NC_008340	G	6	6	2877940	2877945	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_008340	CGGG	2	8	2877992	2877999	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6081	NC_008340	GC	3	6	2878068	2878073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_008340	TCGCT	2	10	2878080	2878089	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6089	NC_008340	AAT	2	6	2881453	2881458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_008340	GC	3	6	2881595	2881600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_008340	AGCGA	2	10	2881608	2881617	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6097	NC_008340	C	6	6	2882411	2882416	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6098	NC_008340	ATG	2	6	2882601	2882606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_008340	CGG	2	6	2882963	2882968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_008340	GAC	2	6	2883195	2883200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_008340	GC	3	6	2883231	2883236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_008340	CCA	2	6	2883269	2883274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_008340	GTG	2	6	2883296	2883301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6111	NC_008340	TGC	2	6	2893578	2893583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_008340	CGGC	2	8	2893588	2893595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_008340	CGG	2	6	2893606	2893611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_008340	CG	3	6	2893615	2893620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_008340	CCG	2	6	2894021	2894026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_008340	GCCCG	2	10	2894046	2894055	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6117	NC_008340	GC	3	6	2894893	2894898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_008340	CGGTGC	2	12	2895861	2895872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_008340	CGC	2	6	2895877	2895882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_008340	ACGCT	2	10	2895893	2895902	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6121	NC_008340	CCCCG	2	10	2897017	2897026	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6122	NC_008340	C	6	6	2898356	2898361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6123	NC_008340	CGG	2	6	2898376	2898381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_008340	C	6	6	2898427	2898432	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6125	NC_008340	GCCG	2	8	2898539	2898546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_008340	TGA	2	6	2899980	2899985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_008340	CCG	2	6	2899987	2899992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_008340	CGC	2	6	2899993	2899998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_008340	G	7	7	2903513	2903519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_008340	CTGGG	2	10	2903624	2903633	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6131	NC_008340	AT	3	6	2903948	2903953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_008340	ATAC	2	8	2903957	2903964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6133	NC_008340	ATC	2	6	2904536	2904541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6138	NC_008340	TCG	2	6	2906148	2906153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6140	NC_008340	GTT	2	6	2906189	2906194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_008340	ATGGG	2	10	2906218	2906227	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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6258	NC_008340	A	8	8	2948437	2948444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_008340	CCGT	2	8	2949670	2949677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6379	NC_008340	CGCC	2	8	3015390	3015397	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6380	NC_008340	GCG	2	6	3015424	3015429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6382	NC_008340	CGG	2	6	3015681	3015686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6383	NC_008340	GTT	2	6	3015707	3015712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6387	NC_008340	AGCGA	2	10	3016541	3016550	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6388	NC_008340	CG	3	6	3016556	3016561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6389	NC_008340	CCGGC	2	10	3016719	3016728	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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6399	NC_008340	CGCC	2	8	3025619	3025626	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6400	NC_008340	CTG	2	6	3027100	3027105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6401	NC_008340	CTG	2	6	3027108	3027113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6402	NC_008340	CGGG	2	8	3027135	3027142	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6403	NC_008340	GCA	2	6	3027181	3027186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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