MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum HZ

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007797	GCAGGA	2	12	74006	74017	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007797	GCTTTA	2	12	80641	80652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007797	TAACTC	2	12	82899	82910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007797	CAACGC	2	12	83371	83382	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007797	CACCCT	2	12	83525	83536	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007797	TGCGTG	2	12	92681	92692	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007797	GTAAGT	2	12	119198	119209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007797	ATACTT	2	12	136714	136725	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007797	CTATAA	2	12	136773	136784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007797	TATGGT	2	12	149444	149455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007797	TTACCA	2	12	207196	207207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007797	ATGTGG	2	12	207351	207362	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007797	ACAGAA	2	12	221195	221206	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007797	GCAGTT	2	12	226861	226872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007797	CGAGGA	2	12	246297	246308	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007797	CTATTA	2	12	290530	290541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007797	TTGAGC	2	12	303832	303843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007797	TACATA	2	12	320121	320132	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007797	TAATAG	2	12	320748	320759	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007797	GCCCGT	2	12	387336	387347	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007797	TTATGG	2	12	390407	390418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007797	CTATAG	2	12	421400	421411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007797	TGTACT	2	12	421818	421829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007797	TAACGG	2	12	423879	423890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007797	TAAATG	2	12	423933	423944	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007797	TCAGAA	2	12	424534	424545	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007797	TGGTAG	2	12	436570	436581	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007797	AGGGAG	2	12	441760	441771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007797	AATTTT	2	12	451200	451211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007797	AAATAG	2	12	514132	514143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007797	AGATCA	2	12	527215	527226	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007797	ATCAGT	2	12	553102	553113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007797	TTATAC	2	12	554263	554274	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007797	TACGTG	2	12	586817	586828	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007797	TAAAGC	2	12	600152	600163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007797	TTTTTA	2	12	611764	611775	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007797	TAGGTA	2	12	615679	615690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007797	GTTTTT	2	12	654373	654384	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007797	AGGTTG	2	12	657712	657723	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007797	CCTGTT	11	66	657817	657882	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007797	ATTTCA	2	12	680301	680312	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007797	CTTTTT	2	12	685137	685148	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007797	AATCTG	2	12	685756	685767	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007797	ATCTTT	2	12	688268	688279	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007797	ATACTT	2	12	708349	708360	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_007797	ATGGCT	2	12	708378	708389	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_007797	AGAGAA	2	12	724180	724191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007797	AGGTTT	2	12	724529	724540	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007797	ACAGCC	2	12	728782	728793	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007797	AGCATG	2	12	729420	729431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007797	AAAATG	2	12	743045	743056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007797	ATTAAA	2	12	764055	764066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007797	ATATTA	2	12	764994	765005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007797	AAAAGC	2	12	778297	778308	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007797	TTCTGA	2	12	880429	880440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007797	TTTGTA	2	12	895643	895654	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007797	ATGGAA	2	12	945001	945012	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007797	CCGAAA	2	12	953827	953838	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007797	AGAGGA	2	12	963926	963937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007797	ATAATT	2	12	980032	980043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007797	CATATG	2	12	991041	991052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007797	GGTACA	2	12	1000271	1000282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007797	TTTATG	2	12	1011972	1011983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007797	GCTTTT	2	12	1033990	1034001	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007797	GCCCCT	2	12	1040165	1040176	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_007797	TAGATA	2	12	1065065	1065076	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007797	CAGTAA	2	12	1073923	1073934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007797	TAAATA	2	12	1077574	1077585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007797	GCCCCT	2	12	1078803	1078814	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_007797	CTGTAT	2	12	1118550	1118561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007797	GGGCTT	2	12	1118991	1119002	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007797	AAGTAT	2	12	1127035	1127046	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007797	CAAAGG	2	12	1137223	1137234	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007797	CTGTAT	2	12	1155832	1155843	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007797	GGGCTT	2	12	1156273	1156284	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007797	TGCATA	2	12	1172646	1172657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007797	TACCCA	2	12	1175263	1175274	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007797	TAAACA	2	12	1197569	1197580	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007797	TAAACA	2	12	1198790	1198801	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007797	AACACA	2	12	1201220	1201231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007797	TACACA	2	12	1202633	1202644	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007797	GTTTGC	2	12	1208857	1208868	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007797	GGCGTT	2	12	1241280	1241291	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007797	GGCGTT	2	12	1257349	1257360	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007797	TGTACC	2	12	1270526	1270537	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007797	AGAGCT	2	12	1273260	1273271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_007797	GCTTCT	2	12	1273284	1273295	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007797	AAAAAC	2	12	1274686	1274697	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007797	CGATTC	2	12	1309495	1309506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007797	CAACGC	2	12	1330902	1330913	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007797	AAGTAT	2	12	1331118	1331129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007797	AACGTA	2	12	1351661	1351672	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_007797	GTTCCG	2	12	1380860	1380871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007797	ACATGT	2	12	1385071	1385082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007797	TGCAGA	2	12	1386161	1386172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007797	GAATCG	2	12	1396749	1396760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007797	AACGTA	2	12	1405939	1405950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007797	CCACCC	2	12	1410057	1410068	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
99	NC_007797	CAACGC	2	12	1416939	1416950	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007797	TATGTA	2	12	1438667	1438678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007797	TAGTAT	2	12	1440194	1440205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007797	TGCGAA	2	12	1448562	1448573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.