MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid C

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007412	TATC	2	8	58	65	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007412	ATTC	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007412	TGTT	2	8	26982	26989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007412	TTCA	2	8	27018	27025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007412	AATT	2	8	27094	27101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007412	TAAC	2	8	27272	27279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007412	AATC	3	12	27288	27299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007412	AAAT	2	8	27311	27318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007412	GAAA	2	8	27339	27346	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007412	ATAG	2	8	27405	27412	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007412	TCAA	2	8	35324	35331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007412	AGCC	2	8	35690	35697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007412	TGTA	2	8	37073	37080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007412	ATAA	2	8	37153	37160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007412	TAAT	2	8	38216	38223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007412	ATCA	2	8	50087	50094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007412	TCAA	2	8	51242	51249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007412	AAAG	2	8	53319	53326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007412	TAAT	2	8	56876	56883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007412	ATTC	2	8	58211	58218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007412	AAAT	2	8	60770	60777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007412	ATTT	2	8	70283	70290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007412	AATA	2	8	81046	81053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007412	TTAA	2	8	82166	82173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007412	ATTT	2	8	86999	87006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007412	TAAT	2	8	87012	87019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007412	TTGT	2	8	87733	87740	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007412	ATCA	2	8	88975	88982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007412	TTAC	2	8	100655	100662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007412	TCTA	2	8	102658	102665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007412	ATCA	2	8	102677	102684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007412	ATTA	2	8	102765	102772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007412	TAAA	2	8	105221	105228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007412	TTTA	2	8	106581	106588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007412	TAAG	2	8	110571	110578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007412	CAAG	2	8	110607	110614	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_007412	TAAA	2	8	113517	113524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007412	TATT	2	8	115276	115283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007412	CGTG	2	8	121945	121952	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007412	TTCT	2	8	122873	122880	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007412	ATTT	3	12	122924	122935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007412	TGAT	2	8	124068	124075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007412	TTGT	2	8	125832	125839	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007412	AAAC	2	8	126718	126725	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007412	ATCG	2	8	126808	126815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007412	GCTT	2	8	129286	129293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007412	CAAT	2	8	129351	129358	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007412	TCTA	3	12	133026	133037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007412	GCTT	2	8	133340	133347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007412	TCTG	2	8	134563	134570	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007412	TTCC	2	8	146219	146226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007412	ATAC	2	8	147545	147552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007412	TAAA	2	8	147672	147679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007412	AATC	2	8	148190	148197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007412	CAGG	2	8	148660	148667	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007412	CAAG	2	8	149582	149589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007412	GTTT	2	8	158401	158408	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007412	CACC	2	8	158435	158442	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_007412	ATCT	2	8	158818	158825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007412	AAAT	2	8	162969	162976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007412	TTGT	2	8	166752	166759	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007412	GTTG	2	8	166914	166921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007412	ACGC	2	8	169510	169517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007412	ATAA	2	8	171577	171584	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007412	AGTG	2	8	175764	175771	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007412	TCTT	2	8	175803	175810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007412	ATTG	2	8	175852	175859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007412	TTGA	2	8	178565	178572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007412	GGAC	2	8	178908	178915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007412	CCCA	2	8	178979	178986	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_007412	TTAT	2	8	179187	179194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007412	GAAT	2	8	179978	179985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007412	CCTG	2	8	184652	184659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007412	ATCC	2	8	184673	184680	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007412	TAAT	2	8	185379	185386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007412	ATTG	2	8	185516	185523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007412	TCAT	2	8	185566	185573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007412	AGTG	2	8	185635	185642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007412	CCTA	2	8	185736	185743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007412	AGTC	2	8	187939	187946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007412	TTGG	2	8	188137	188144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007412	ATTT	2	8	188579	188586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007412	AAGT	2	8	188775	188782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007412	ATAG	2	8	188942	188949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007412	AAAT	2	8	188992	188999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007412	ATTA	2	8	189268	189275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007412	ATGT	2	8	189403	189410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007412	ATTT	2	8	189799	189806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007412	TCTT	2	8	191318	191325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_007412	ATTG	2	8	192359	192366	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007412	AATC	2	8	192420	192427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007412	AAAT	2	8	192611	192618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007412	AAGC	2	8	195065	195072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_007412	TTTC	2	8	196191	196198	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007412	TAGT	2	8	197423	197430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007412	TGCT	2	8	198392	198399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007412	CATT	2	8	198624	198631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007412	AAAT	2	8	198897	198904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007412	TTAT	2	8	199436	199443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007412	AGTC	2	8	201193	201200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007412	AAGC	2	8	203715	203722	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007412	ATTT	2	8	204329	204336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007412	ATTT	2	8	204904	204911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007412	AGTT	2	8	206994	207001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007412	TAAT	2	8	207042	207049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007412	TATT	2	8	207247	207254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007412	AATT	2	8	207470	207477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007412	AATA	2	8	207715	207722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007412	AAGT	2	8	207805	207812	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007412	TATT	2	8	210446	210453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007412	TTAG	2	8	211089	211096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007412	TAAA	2	8	213073	213080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007412	AACT	2	8	213195	213202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007412	AAGC	2	8	223705	223712	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_007412	AGAT	2	8	223879	223886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007412	CAAA	2	8	224017	224024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007412	AGTA	2	8	225448	225455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007412	ACTC	2	8	230377	230384	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_007412	ATCC	2	8	230603	230610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007412	AAGT	2	8	230831	230838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007412	GGTT	2	8	238128	238135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007412	TAAT	2	8	239905	239912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007412	AATT	2	8	239930	239937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007412	GAAA	2	8	240057	240064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007412	TTAA	2	8	240106	240113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007412	TGGG	2	8	240194	240201	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007412	CCAA	2	8	241443	241450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007412	GTAC	2	8	252286	252293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007412	TGGT	2	8	255902	255909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007412	AAAC	2	8	257113	257120	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007412	AGTT	2	8	263235	263242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007412	GTTT	2	8	269456	269463	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007412	TCAG	2	8	269477	269484	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007412	AGCT	2	8	271749	271756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007412	ATTA	2	8	274132	274139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007412	GCAA	2	8	285264	285271	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007412	AACT	2	8	285382	285389	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007412	TTGA	2	8	292286	292293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007412	TACT	2	8	293260	293267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007412	GGCG	2	8	295118	295125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007412	TACT	2	8	298842	298849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007412	ACAA	2	8	299383	299390	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.