MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmid A

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007410	TAAT	2	8	120	127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007410	TAAT	2	8	3339	3346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007410	CATA	2	8	5417	5424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_007410	CTAT	2	8	5653	5660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007410	AGAT	2	8	5661	5668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007410	TAAT	2	8	5689	5696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007410	TTGC	2	8	5754	5761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_007410	ATTT	3	12	14662	14673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007410	TGAA	2	8	16740	16747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007410	TCAC	2	8	22211	22218	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007410	CAAA	2	8	22615	22622	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007410	TCAA	2	8	23546	23553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007410	AAAG	2	8	25623	25630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007410	ATTA	2	8	25673	25680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007410	AGAC	2	8	25862	25869	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_007410	ACAA	2	8	29946	29953	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007410	GCTT	2	8	31149	31156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_007410	CAGA	2	8	43192	43199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007410	ATAA	2	8	46887	46894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007410	TTCT	2	8	46936	46943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007410	TAAA	2	8	59054	59061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007410	ATTA	2	8	62952	62959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007410	GATA	2	8	63444	63451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007410	TAAC	2	8	63536	63543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007410	GAAA	2	8	66790	66797	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007410	TCGC	2	8	72006	72013	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007410	TGAA	2	8	72116	72123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007410	CTGG	2	8	72198	72205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007410	GATA	2	8	72241	72248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007410	AGTA	2	8	76758	76765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007410	ACTC	2	8	81687	81694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007410	AATT	2	8	84838	84845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007410	TGAC	2	8	85214	85221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007410	TTAT	2	8	86811	86818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007410	TAGT	2	8	86890	86897	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007410	AAAG	2	8	87465	87472	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007410	TGGT	2	8	87576	87583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007410	CTGG	2	8	89858	89865	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007410	CAAT	2	8	90044	90051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007410	AGTT	2	8	91715	91722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007410	ATGA	2	8	102111	102118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007410	AATC	2	8	103134	103141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007410	TAAA	2	8	103226	103233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007410	CGGA	2	8	104393	104400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007410	GGTG	2	8	105208	105215	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007410	TATT	3	12	113071	113082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007410	TTAC	2	8	113245	113252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007410	TCTA	2	8	115035	115042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007410	ACTC	2	8	120117	120124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007410	TAAA	2	8	120262	120269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007410	TTAC	2	8	125769	125776	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007410	TCAA	2	8	125882	125889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007410	ACAT	2	8	127072	127079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007410	AGTA	2	8	133001	133008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007410	CGCC	2	8	136725	136732	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_007410	CAGG	2	8	141510	141517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007410	TGAT	2	8	143054	143061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007410	CAGG	2	8	143855	143862	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007410	CGCC	2	8	144314	144321	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_007410	CTCA	2	8	146082	146089	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007410	TAAG	2	8	148940	148947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007410	AAAT	2	8	152804	152811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007410	ATTA	3	12	152821	152832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007410	TACT	2	8	173269	173276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007410	TTCA	2	8	173718	173725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_007410	CAAT	2	8	175543	175550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007410	ATCA	2	8	175887	175894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007410	CAAT	2	8	176496	176503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007410	GCTT	2	8	183095	183102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007410	AGAC	2	8	183128	183135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007410	AAAC	2	8	183867	183874	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_007410	CAGA	2	8	184050	184057	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007410	TGCT	2	8	187350	187357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007410	ACCC	2	8	187435	187442	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_007410	GACT	2	8	187902	187909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007410	TAGA	2	8	191053	191060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007410	TAAA	2	8	192125	192132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007410	TAAC	2	8	194906	194913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007410	CATA	2	8	195094	195101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007410	TTAT	2	8	195142	195149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007410	ATTG	2	8	204359	204366	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007410	TTAT	2	8	204605	204612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007410	TAAT	2	8	210209	210216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007410	GTAA	2	8	213364	213371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007410	TAAA	2	8	218514	218521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007410	TCTA	2	8	218542	218549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_007410	TTTA	2	8	218774	218781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007410	TAAA	2	8	221023	221030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007410	GGAT	2	8	221303	221310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007410	TGAA	2	8	221425	221432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007410	TCAG	2	8	221585	221592	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_007410	TTGT	2	8	231981	231988	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007410	ATTT	2	8	231993	232000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007410	GAAG	2	8	232021	232028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007410	TTTA	2	8	232176	232183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007410	ATTT	2	8	232189	232196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007410	ATAA	2	8	232210	232217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007410	TAAA	2	8	232321	232328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007410	TTTA	2	8	234304	234311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007410	CTTG	2	8	234681	234688	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_007410	GTTT	2	8	234890	234897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007410	AGTT	2	8	234968	234975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007410	ACTG	2	8	236611	236618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007410	TAAA	2	8	237420	237427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007410	TCAC	2	8	245161	245168	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007410	ACGC	2	8	245188	245195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_007410	ACTT	2	8	248260	248267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007410	CACC	2	8	253890	253897	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_007410	AAAT	2	8	254005	254012	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007410	ACTA	2	8	256557	256564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007410	CCAC	2	8	259151	259158	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_007410	CTAC	2	8	259218	259225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007410	TGGA	2	8	262283	262290	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007410	GCTT	2	8	271661	271668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_007410	CCTA	2	8	271874	271881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007410	TAAA	2	8	271912	271919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007410	TAAA	2	8	271928	271935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007410	AGTT	2	8	271997	272004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007410	AAAC	2	8	272038	272045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007410	TATC	2	8	272228	272235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_007410	TGCT	2	8	272296	272303	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_007410	CATT	2	8	272567	272574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007410	TAAG	2	8	273218	273225	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007410	TGTA	2	8	274329	274336	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007410	AATA	2	8	274442	274449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007410	AAAT	2	8	274484	274491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007410	AATT	2	8	277070	277077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007410	ATTT	2	8	277124	277131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007410	AAAT	3	12	277878	277889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007410	GAAT	2	8	281284	281291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007410	TGTT	2	8	286091	286098	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007410	TTAA	2	8	290671	290678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007410	CAGA	2	8	298282	298289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007410	GTTG	2	8	298657	298664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007410	TTCT	2	8	299077	299084	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007410	TCAG	2	8	311461	311468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007410	TTTG	2	8	314686	314693	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007410	GTTT	2	8	319435	319442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007410	CTTG	2	8	322855	322862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_007410	TTCT	2	8	322911	322918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007410	AATC	2	8	323016	323023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007410	TTAA	2	8	325232	325239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007410	TAAG	2	8	328174	328181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007410	TAAT	2	8	328185	328192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007410	AAGA	2	8	332746	332753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007410	TTGA	2	8	338249	338256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007410	CAAT	2	8	344991	344998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007410	TAAT	2	8	349411	349418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007410	TTAA	2	8	351199	351206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007410	AAAT	2	8	358633	358640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007410	TCAA	2	8	359920	359927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_007410	TTTA	2	8	359978	359985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007410	TTCA	2	8	361842	361849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_007410	CCAA	2	8	362073	362080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_007410	ATTC	2	8	362143	362150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_007410	CTTA	2	8	366150	366157	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.