MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Azoarcus sp. EbN1 plasmid 2

Total Repeats: 487

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006824	TTA	2	6	7	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006824	GAA	2	6	108	113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006824	CTC	2	6	1889	1894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_006824	CGG	2	6	1918	1923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006824	CGG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006824	CGG	2	6	1969	1974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006824	TTC	2	6	1976	1981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006824	CTG	2	6	2068	2073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006824	ACG	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006824	GCG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006824	CGG	2	6	4361	4366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006824	GCC	2	6	9631	9636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_006824	CAA	2	6	9640	9645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006824	TGA	2	6	9662	9667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006824	GAG	2	6	9793	9798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006824	GGC	2	6	9837	9842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006824	CTC	2	6	10531	10536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_006824	AGT	2	6	10595	10600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006824	TCT	2	6	10645	10650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006824	GAA	2	6	10679	10684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006824	TGC	2	6	10696	10701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006824	ACG	2	6	10705	10710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006824	GCG	2	6	10768	10773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006824	CGT	2	6	11067	11072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006824	AGG	2	6	11574	11579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006824	AAC	2	6	11724	11729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006824	TCA	2	6	11826	11831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006824	GCC	2	6	11875	11880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_006824	ATC	2	6	11945	11950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006824	CGC	2	6	12521	12526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_006824	TTC	2	6	12553	12558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_006824	AGA	2	6	25116	25121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006824	CTG	2	6	25196	25201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_006824	GAT	2	6	25246	25251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006824	TCA	2	6	25727	25732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006824	GTC	2	6	25837	25842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006824	GAA	2	6	25863	25868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006824	AGC	2	6	25870	25875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006824	GAG	2	6	25908	25913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006824	CTC	2	6	25929	25934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_006824	AAG	2	6	25935	25940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006824	GTT	2	6	25962	25967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006824	GGC	2	6	25970	25975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006824	CAC	2	6	25991	25996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_006824	GCC	2	6	26007	26012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_006824	GAA	2	6	27904	27909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006824	AAC	2	6	32995	33000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006824	ATT	2	6	37352	37357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006824	GGC	2	6	37487	37492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006824	GGC	2	6	37513	37518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_006824	ACA	2	6	37538	37543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006824	CTT	2	6	37560	37565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006824	AGC	2	6	37586	37591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006824	GCA	2	6	37625	37630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006824	CTG	2	6	38269	38274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006824	GCC	2	6	39640	39645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_006824	GGC	2	6	39655	39660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_006824	GCT	3	9	39793	39801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006824	CGG	2	6	39967	39972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006824	GCA	2	6	43628	43633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006824	CGC	2	6	43655	43660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_006824	CTG	2	6	43793	43798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006824	GCC	3	9	43846	43854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_006824	AGG	2	6	43857	43862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006824	CGC	2	6	43970	43975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_006824	TGC	2	6	43990	43995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006824	GGC	2	6	44019	44024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006824	CGA	2	6	44930	44935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006824	GCT	2	6	44996	45001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006824	GCT	2	6	47220	47225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006824	TGG	2	6	47262	47267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006824	TCC	2	6	53317	53322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_006824	CGG	2	6	58416	58421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006824	GCG	2	6	58720	58725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006824	CGG	2	6	60338	60343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006824	GCG	2	6	60444	60449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006824	GTC	2	6	60462	60467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006824	ACC	2	6	61144	61149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_006824	TCG	2	6	61178	61183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006824	GCT	2	6	61239	61244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006824	TTC	2	6	61321	61326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006824	GCT	2	6	61343	61348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006824	CGA	2	6	61391	61396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006824	CTG	3	9	62029	62037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_006824	CCG	3	9	64191	64199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_006824	TCC	2	6	65203	65208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_006824	CAA	2	6	65223	65228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006824	CTT	2	6	65286	65291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006824	CAA	2	6	65321	65326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006824	CCA	2	6	65359	65364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_006824	CGG	2	6	65402	65407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006824	GTG	2	6	66322	66327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006824	GCA	2	6	68773	68778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006824	CTG	2	6	71054	71059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006824	TGC	2	6	71112	71117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006824	TCC	2	6	72315	72320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_006824	GCC	2	6	72422	72427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_006824	CTC	2	6	73690	73695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_006824	CGG	2	6	73937	73942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006824	TCA	2	6	73954	73959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006824	CCG	2	6	73966	73971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_006824	GGA	2	6	74049	74054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006824	TCA	2	6	74055	74060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006824	TCT	2	6	75610	75615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_006824	CTC	2	6	78379	78384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_006824	TCT	2	6	78438	78443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006824	AAC	2	6	78468	78473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006824	TTG	2	6	78555	78560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006824	TTC	2	6	78578	78583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006824	TCC	2	6	78646	78651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_006824	GGC	2	6	78686	78691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006824	CCG	2	6	78730	78735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_006824	GCA	2	6	78900	78905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006824	ATA	2	6	81192	81197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006824	AAC	2	6	81209	81214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006824	GCA	2	6	81275	81280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006824	ATG	2	6	81505	81510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006824	TGG	2	6	82536	82541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006824	TGC	2	6	83184	83189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006824	AGC	2	6	83239	83244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006824	CCG	2	6	83261	83266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_006824	GCT	2	6	84782	84787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_006824	TCC	2	6	85463	85468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_006824	TCA	2	6	85472	85477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006824	GGA	2	6	85544	85549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006824	CCT	2	6	85568	85573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_006824	CGT	2	6	85766	85771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006824	GCC	2	6	85822	85827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_006824	GTG	2	6	85859	85864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006824	CCG	2	6	87926	87931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_006824	CCT	2	6	88026	88031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_006824	GAG	2	6	88049	88054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006824	CGA	2	6	88078	88083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_006824	GCC	2	6	88092	88097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_006824	ACA	2	6	88125	88130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_006824	ACG	2	6	88140	88145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006824	GCG	3	9	88148	88156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_006824	GCA	2	6	88314	88319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_006824	GCT	2	6	88371	88376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006824	CGA	2	6	88410	88415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_006824	GGC	2	6	88478	88483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_006824	GGA	2	6	89417	89422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.