MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azoarcus sp. EbN1 plasmid 1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006823	AGAT	2	8	2697	2704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006823	GGCG	2	8	2860	2867	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_006823	CCCT	2	8	3772	3779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_006823	CGCC	2	8	3799	3806	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_006823	CTTT	2	8	8542	8549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_006823	TTTC	2	8	8596	8603	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006823	GAAC	2	8	8632	8639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_006823	TGAG	2	8	8692	8699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006823	GCGA	2	8	10269	10276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006823	CAAG	2	8	13725	13732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006823	ATGC	2	8	15203	15210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006823	ATCC	2	8	16481	16488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006823	ACGA	2	8	17385	17392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_006823	CGCC	2	8	17423	17430	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_006823	CGAC	2	8	17518	17525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_006823	CCTC	2	8	19341	19348	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_006823	ATTA	2	8	20881	20888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006823	GCCC	2	8	20986	20993	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_006823	CACG	2	8	22316	22323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_006823	CTCC	2	8	23214	23221	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_006823	AAGA	2	8	23225	23232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006823	GCCT	2	8	23366	23373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006823	GATC	2	8	23619	23626	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006823	AACA	2	8	27357	27364	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_006823	ACAA	2	8	28261	28268	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_006823	AGAA	2	8	28331	28338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006823	CTGC	2	8	29050	29057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006823	TCCT	2	8	29585	29592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006823	GAAG	2	8	29604	29611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006823	TTGA	2	8	31509	31516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006823	TGGG	2	8	31589	31596	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006823	TGGT	2	8	39719	39726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006823	TGGT	2	8	41214	41221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006823	GCCT	2	8	42334	42341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_006823	TGTT	2	8	42964	42971	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006823	GGGC	2	8	56008	56015	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006823	CCGC	2	8	58369	58376	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_006823	AAGG	2	8	58382	58389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006823	CTCC	2	8	60047	60054	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_006823	CATG	2	8	68679	68686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006823	CTTC	2	8	76410	76417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_006823	AACT	2	8	76424	76431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_006823	GTTG	2	8	102362	102369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006823	ATCT	2	8	102507	102514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_006823	GGAT	2	8	102649	102656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006823	AGTC	2	8	104175	104182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_006823	CCTG	2	8	107015	107022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006823	CTCA	2	8	118470	118477	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_006823	GGGC	2	8	120547	120554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_006823	AGTC	2	8	120562	120569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_006823	GACC	2	8	123065	123072	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006823	ACGC	2	8	125429	125436	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006823	TCGG	2	8	126393	126400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_006823	GGTC	2	8	126553	126560	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006823	TGGC	2	8	126583	126590	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_006823	ATGC	2	8	130096	130103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006823	TCAT	2	8	133000	133007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_006823	TTGA	2	8	139866	139873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006823	GTTA	2	8	151742	151749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006823	TGCA	2	8	151799	151806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_006823	TCAG	2	8	159651	159658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006823	CAAG	2	8	163303	163310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_006823	TCCT	2	8	173392	173399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006823	ATGG	2	8	184785	184792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006823	CCAT	2	8	185102	185109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006823	CGCT	2	8	186012	186019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_006823	TCAG	2	8	187967	187974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_006823	TTGC	2	8	188399	188406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_006823	CAAA	2	8	189645	189652	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_006823	TTGT	2	8	192531	192538	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006823	TGGC	2	8	194386	194393	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006823	AAAG	2	8	198238	198245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006823	GTTC	2	8	198651	198658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_006823	CATT	2	8	199729	199736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_006823	GAAA	2	8	199739	199746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.