MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aromatoleum aromaticum EbN1 chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006513	CGGTTG	2	12	29040	29051	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006513	GCGCTG	2	12	31270	31281	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006513	TGCAGT	2	12	81519	81530	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_006513	TCAGGA	2	12	91246	91257	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_006513	CGAGAG	2	12	91989	92000	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_006513	CTTGCT	2	12	143446	143457	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006513	GCACCG	2	12	143849	143860	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_006513	AAGTCG	2	12	180291	180302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_006513	GTCTCC	2	12	210764	210775	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_006513	CCGACT	2	12	261258	261269	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_006513	GTTGCG	2	12	288141	288152	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_006513	GACCCA	2	12	289945	289956	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006513	CCCGGC	2	12	292833	292844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_006513	GCGTTT	2	12	308665	308676	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_006513	GAAACA	2	12	313051	313062	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_006513	TGTTCA	2	12	349576	349587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_006513	CGCGGC	2	12	360195	360206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_006513	GGGTTG	2	12	414509	414520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006513	CGTGGC	2	12	421873	421884	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_006513	CCCATT	2	12	462257	462268	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006513	GCAGCC	2	12	605696	605707	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006513	GCGACG	2	12	643639	643650	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006513	TCGGCG	2	12	667653	667664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006513	TGACGT	2	12	708398	708409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_006513	CGCCAC	5	30	721045	721074	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_006513	ACGTCG	2	12	721116	721127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_006513	GCTTTT	2	12	735484	735495	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_006513	CTTTCC	2	12	763737	763748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006513	TCCGGG	2	12	782530	782541	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006513	GCCGAT	2	12	848772	848783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006513	GCCGGC	2	12	869935	869946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006513	CAGGCG	2	12	882124	882135	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006513	CCAGCA	2	12	884840	884851	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006513	ATGCCA	2	12	892660	892671	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006513	CAGGAT	2	12	907853	907864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_006513	ACGCCG	2	12	954725	954736	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006513	CATCGG	2	12	962634	962645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_006513	ACCCGA	2	12	1039354	1039365	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006513	GTTTTT	2	12	1137247	1137258	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006513	TATAAA	2	12	1151248	1151259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006513	GACCGG	2	12	1151505	1151516	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006513	CAGCGA	2	12	1219704	1219715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006513	ATTCTC	2	12	1240114	1240125	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_006513	GCGCCG	2	12	1288099	1288110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_006513	GAGCCG	2	12	1302287	1302298	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006513	ACGCGC	2	12	1302625	1302636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006513	TCAGCC	2	12	1337624	1337635	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006513	TCGATG	2	12	1337862	1337873	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_006513	CCGGCT	2	12	1374819	1374830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_006513	GCCCGG	2	12	1383980	1383991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_006513	TTTCCC	2	12	1388080	1388091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_006513	CGATCA	2	12	1478027	1478038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006513	AGGAAA	2	12	1524713	1524724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006513	GCTCCG	2	12	1536801	1536812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_006513	GACGCT	2	12	1551091	1551102	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006513	ACATCC	2	12	1600470	1600481	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006513	ACAGGA	2	12	1600732	1600743	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_006513	CAACGG	9	54	1627450	1627503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006513	AAGGAA	2	12	1648050	1648061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006513	CAGCCC	2	12	1695412	1695423	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_006513	CCGACC	2	12	1730363	1730374	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_006513	ACGCGG	2	12	1788642	1788653	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006513	GGGCCA	2	12	1821495	1821506	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_006513	AGCGGC	2	12	1859667	1859678	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006513	GGCGCG	2	12	1877774	1877785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006513	TCGCCC	2	12	1897788	1897799	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_006513	CGTGAT	2	12	1943326	1943337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_006513	AGCGCC	2	12	1943890	1943901	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006513	GTCCAT	2	12	1946201	1946212	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006513	GGTCGA	2	12	1953232	1953243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_006513	CCCCGA	2	12	1964720	1964731	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_006513	CGAAAA	2	12	1969449	1969460	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_006513	AGGACG	2	12	1989277	1989288	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_006513	GCGGGC	2	12	2000200	2000211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006513	GCAAAA	2	12	2055622	2055633	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_006513	TTTTGC	2	12	2087165	2087176	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_006513	GCCGTC	3	18	2121712	2121729	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_006513	GCCGGA	2	12	2129324	2129335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_006513	CGATTG	2	12	2169240	2169251	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_006513	CCGGCA	2	12	2178041	2178052	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006513	GCGCCG	2	12	2208878	2208889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_006513	TTCTGA	2	12	2243005	2243016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_006513	GCGAGG	2	12	2275918	2275929	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_006513	TGCCCG	2	12	2294823	2294834	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_006513	CGCCGG	2	12	2301220	2301231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006513	GCGCCG	2	12	2340025	2340036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_006513	CCGGTG	2	12	2346560	2346571	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006513	AAAAGC	2	12	2379427	2379438	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_006513	GCTTTT	2	12	2379453	2379464	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_006513	GGTCCA	2	12	2385611	2385622	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_006513	CGAGGG	2	12	2447826	2447837	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_006513	ACGCCG	2	12	2600009	2600020	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_006513	CTCCCC	2	12	2626162	2626173	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
94	NC_006513	CGGTTC	2	12	2649917	2649928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006513	AGCGAA	2	12	2652828	2652839	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_006513	TTTCGG	2	12	2665766	2665777	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_006513	CGCTGG	2	12	2671246	2671257	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006513	CGGGGC	2	12	2686565	2686576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006513	GGCGCA	2	12	2705425	2705436	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006513	CTGCGG	2	12	2732324	2732335	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006513	GAATGA	2	12	2733647	2733658	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006513	GGACCG	2	12	2745108	2745119	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006513	CGGCCC	2	12	2764777	2764788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_006513	GGAGAT	2	12	2772784	2772795	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006513	CCGCTG	2	12	2875568	2875579	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_006513	CCATTC	2	12	2927472	2927483	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_006513	CCCGGC	2	12	2969854	2969865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_006513	GTTGAC	2	12	3036447	3036458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_006513	TCGCTT	2	12	3055377	3055388	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006513	GCTTGA	2	12	3108818	3108829	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_006513	GGCCAG	2	12	3180211	3180222	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006513	GAAAAA	2	12	3240267	3240278	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006513	TGCGCC	2	12	3251749	3251760	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_006513	TCGAGG	3	18	3286756	3286773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_006513	TGCGCT	2	12	3288906	3288917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006513	GCTTCA	2	12	3321903	3321914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006513	GCTTCC	2	12	3332083	3332094	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_006513	GAAACC	2	12	3337727	3337738	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006513	CGGAAA	2	12	3384620	3384631	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_006513	CATCGA	2	12	3416793	3416804	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006513	GACTTC	2	12	3482075	3482086	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006513	TGTTGC	2	12	3489936	3489947	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_006513	GGGAAG	2	12	3617741	3617752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006513	TTCCGG	2	12	3744717	3744728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_006513	CACTCC	2	12	3765588	3765599	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_006513	GGTCCG	3	18	3857501	3857518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_006513	GCCGGC	2	12	3941477	3941488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_006513	GAATTG	2	12	3983563	3983574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006513	AACATG	2	12	4027470	4027481	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_006513	GATGCG	3	18	4035728	4035745	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_006513	CCCGCT	2	12	4040328	4040339	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_006513	CGCCTG	3	18	4067142	4067159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006513	AAAAAC	2	12	4068734	4068745	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_006513	CGGCGA	2	12	4086496	4086507	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006513	CCACTC	2	12	4139318	4139329	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_006513	TTCCGA	2	12	4185483	4185494	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_006513	ACCAGC	2	12	4206939	4206950	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_006513	GCGCCG	2	12	4266975	4266986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_006513	TTGGCC	2	12	4278221	4278232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_006513	CCTCGG	2	12	4288161	4288172	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_006513	TCGGCG	2	12	4288292	4288303	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.