MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 449

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004842	CGGA	2	8	6821	6828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_004842	ACGT	2	8	6865	6872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004842	TCCG	2	8	6901	6908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004842	CTTC	2	8	9906	9913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004842	CTTG	2	8	21232	21239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004842	GTAT	2	8	21318	21325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004842	GGAT	2	8	24848	24855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004842	TGGC	2	8	27576	27583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_004842	ACTG	2	8	27584	27591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_004842	GTTG	2	8	30963	30970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004842	TCGC	2	8	31043	31050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004842	GAAG	2	8	34075	34082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004842	GTAA	2	8	34262	34269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004842	TAGA	2	8	34731	34738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004842	GAAA	2	8	35058	35065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004842	AATT	2	8	35286	35293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004842	TCAC	2	8	35418	35425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004842	CAGC	2	8	35456	35463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_004842	ATGG	2	8	36742	36749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004842	AAGC	2	8	38161	38168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_004842	TAGG	2	8	43870	43877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004842	GACT	2	8	45216	45223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_004842	AGTT	2	8	45405	45412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004842	AGGA	2	8	45451	45458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004842	TCAG	2	8	45783	45790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_004842	AATT	2	8	45956	45963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004842	CTTT	2	8	46183	46190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_004842	CCAC	2	8	47099	47106	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_004842	TACT	2	8	47413	47420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_004842	CTTC	2	8	47599	47606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004842	GTGA	2	8	49045	49052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004842	AGTG	2	8	62417	62424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004842	TGCA	2	8	62905	62912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_004842	CTAG	2	8	62970	62977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_004842	ACCC	2	8	64273	64280	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_004842	CCAA	2	8	64785	64792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_004842	AATT	2	8	65463	65470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004842	TACC	2	8	66233	66240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_004842	TGCC	2	8	66647	66654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_004842	TACT	2	8	66779	66786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_004842	CTTC	2	8	66965	66972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_004842	GTGA	2	8	68616	68623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004842	GCAT	2	8	71623	71630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004842	GGAG	2	8	73225	73232	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004842	GAAG	2	8	73416	73423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004842	GTAA	2	8	73603	73610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004842	GAAG	2	8	74031	74038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004842	AATT	2	8	75047	75054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004842	TGGT	2	8	77078	77085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004842	CAAT	2	8	78647	78654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004842	GTGC	2	8	78758	78765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_004842	GAAT	2	8	81166	81173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004842	AAGA	2	8	81178	81185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004842	GATG	2	8	81192	81199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004842	AAAG	2	8	82268	82275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004842	TGGG	2	8	82803	82810	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004842	GCCT	2	8	83404	83411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_004842	TGCT	2	8	83985	83992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_004842	GTTT	2	8	84186	84193	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004842	GGTG	2	8	84222	84229	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004842	GAAG	2	8	84415	84422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004842	TCGC	2	8	86045	86052	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_004842	TGGG	2	8	95769	95776	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004842	CTGT	2	8	97226	97233	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_004842	ACCT	2	8	100479	100486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_004842	TTGG	2	8	108957	108964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004842	AATA	2	8	117286	117293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004842	TTAT	2	8	117299	117306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004842	AATT	2	8	120571	120578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004842	CAAT	2	8	125213	125220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_004842	CTGG	2	8	126193	126200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_004842	GCCA	2	8	143186	143193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_004842	TGGT	2	8	143223	143230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004842	GCGG	2	8	143332	143339	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_004842	GTTG	2	8	152897	152904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004842	GTAG	2	8	154344	154351	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004842	TTCG	2	8	156855	156862	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_004842	AAAG	2	8	161618	161625	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004842	ATTA	2	8	170185	170192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004842	ATGG	2	8	170226	170233	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004842	ACTC	2	8	170274	170281	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_004842	ATTT	2	8	170314	170321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004842	GTGA	2	8	176688	176695	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004842	GTAG	2	8	176806	176813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004842	GTTG	2	8	177474	177481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004842	ATGG	2	8	179120	179127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004842	GATT	2	8	179145	179152	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004842	CCGG	2	8	181768	181775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_004842	TATT	2	8	184477	184484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004842	GTTG	2	8	197099	197106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004842	ATTT	2	8	200534	200541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004842	GTAG	2	8	201631	201638	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004842	TCCC	2	8	203027	203034	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_004842	ATAG	2	8	206037	206044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004842	TGGG	2	8	215264	215271	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004842	ATTG	2	8	225250	225257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004842	GCAT	2	8	225261	225268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_004842	CTGC	2	8	228931	228938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_004842	GCTA	2	8	228940	228947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_004842	AAGT	2	8	228951	228958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004842	GGCA	2	8	229684	229691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_004842	TAAT	2	8	229708	229715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004842	ACCC	2	8	230994	231001	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_004842	CAAC	2	8	231127	231134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_004842	TTCT	2	8	235838	235845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_004842	CGAC	2	8	242004	242011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004842	TTTA	2	8	247397	247404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004842	GAAC	2	8	247503	247510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_004842	GTGA	2	8	247866	247873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004842	GGTT	2	8	249843	249850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004842	TGGT	2	8	251771	251778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004842	TATG	2	8	254903	254910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004842	CCTT	2	8	256287	256294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_004842	TAAC	2	8	257639	257646	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_004842	TGCG	2	8	265765	265772	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_004842	GTCT	2	8	267937	267944	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_004842	GTAA	2	8	269088	269095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004842	GCAC	2	8	270436	270443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_004842	AGGG	2	8	274632	274639	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004842	TGAC	2	8	277322	277329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_004842	CTTG	2	8	285864	285871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_004842	CTGC	2	8	289130	289137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_004842	GGAC	2	8	289482	289489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_004842	ACGC	2	8	289502	289509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_004842	GCCT	2	8	291182	291189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_004842	ACCT	2	8	293007	293014	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_004842	CATG	2	8	301011	301018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_004842	GTGC	2	8	306111	306118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_004842	CAGT	2	8	323149	323156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_004842	CAAT	2	8	325569	325576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_004842	TTGG	2	8	332953	332960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004842	TCAG	2	8	335126	335133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_004842	TCAG	2	8	335621	335628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_004842	TCAG	2	8	336116	336123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_004842	AATT	2	8	336638	336645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004842	GTAT	2	8	337422	337429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004842	GTCC	2	8	338030	338037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_004842	ATTT	2	8	339754	339761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004842	GTCT	2	8	339893	339900	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_004842	CCTA	2	8	349230	349237	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_004842	CCGA	2	8	364523	364530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_004842	GTAT	2	8	364749	364756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004842	ATGC	2	8	366335	366342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_004842	GCAC	2	8	366355	366362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_004842	GGCC	2	8	367328	367335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_004842	AACG	2	8	369375	369382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_004842	CTGC	2	8	372237	372244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_004842	TGCG	2	8	372262	372269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_004842	GCAC	2	8	384004	384011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_004842	CCTG	2	8	388106	388113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_004842	CTGC	2	8	388141	388148	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_004842	TCTT	2	8	394667	394674	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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155	NC_004842	CCTC	2	8	408254	408261	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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169	NC_004842	CAGC	2	8	459944	459951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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443	NC_004842	GTCC	2	8	1183177	1183184	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
444	NC_004842	CAGC	2	8	1183199	1183206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
445	NC_004842	GTGC	2	8	1183227	1183234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
446	NC_004842	CGTA	2	8	1185196	1185203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
447	NC_004842	TTGC	2	8	1185241	1185248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
448	NC_004842	AAGT	2	8	1197363	1197370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
449	NC_004842	ATAC	2	8	1197464	1197471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.