MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 3743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004842	ATC	2	6	994316	994321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_004842	GCT	2	6	994344	994349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_004842	AAT	2	6	994367	994372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_004842	GC	3	6	994435	994440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_004842	AGT	2	6	994462	994467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_004842	GCT	2	6	994476	994481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_004842	TATC	2	8	994487	994494	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3008	NC_004842	ATT	2	6	994538	994543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_004842	CGTA	2	8	994594	994601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_004842	CAAC	2	8	994617	994624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_004842	GC	3	6	994675	994680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_004842	CAA	2	6	998860	998865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_004842	TCT	2	6	998891	998896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_004842	AGC	2	6	998952	998957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_004842	GGT	2	6	998988	998993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_004842	CGTG	2	8	998994	999001	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_004842	CCT	2	6	999030	999035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_004842	A	7	7	999117	999123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_004842	AGC	2	6	999178	999183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_004842	GC	3	6	999182	999187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_004842	AGG	2	6	999200	999205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_004842	CAGG	2	8	999210	999217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_004842	AG	3	6	999274	999279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_004842	AAG	2	6	999322	999327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_004842	GCA	2	6	1001168	1001173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_004842	GT	3	6	1001208	1001213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_004842	CAC	2	6	1001241	1001246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_004842	AAAT	2	8	1001247	1001254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_004842	GTT	2	6	1003501	1003506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_004842	CG	4	8	1003515	1003522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_004842	CACC	2	8	1003533	1003540	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3032	NC_004842	CGC	2	6	1003549	1003554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_004842	CA	3	6	1004308	1004313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_004842	GGTAG	2	10	1004317	1004326	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_004842	CG	3	6	1004438	1004443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_004842	CCG	2	6	1004492	1004497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_004842	CAC	2	6	1004543	1004548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_004842	CTC	2	6	1004559	1004564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_004842	CTC	2	6	1004570	1004575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_004842	CTC	2	6	1004581	1004586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_004842	CTC	2	6	1004592	1004597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_004842	CTC	2	6	1004603	1004608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_004842	CTC	2	6	1004614	1004619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_004842	CTC	2	6	1004625	1004630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_004842	CTC	2	6	1004636	1004641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_004842	CTC	2	6	1004647	1004652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3047	NC_004842	CTC	2	6	1004658	1004663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_004842	CTC	2	6	1004669	1004674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_004842	TGG	3	9	1004836	1004844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_004842	TCG	2	6	1006142	1006147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_004842	G	6	6	1006149	1006154	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_004842	CG	3	6	1009082	1009087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_004842	AAT	2	6	1009129	1009134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_004842	CAT	2	6	1012520	1012525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_004842	CGGT	2	8	1012553	1012560	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_004842	GAG	2	6	1012597	1012602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_004842	TGT	2	6	1012627	1012632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_004842	ACC	2	6	1017101	1017106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_004842	TAC	2	6	1017127	1017132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_004842	CCA	2	6	1017171	1017176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_004842	GC	3	6	1017211	1017216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3062	NC_004842	AGC	2	6	1017944	1017949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_004842	AAGC	2	8	1017970	1017977	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_004842	GCA	2	6	1018480	1018485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_004842	GT	3	6	1018546	1018551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_004842	ATTC	2	8	1018575	1018582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3067	NC_004842	CCA	2	6	1018590	1018595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_004842	GCC	2	6	1018615	1018620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_004842	TGCA	2	8	1018622	1018629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_004842	GGGCC	2	10	1018638	1018647	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3071	NC_004842	GAA	2	6	1018680	1018685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_004842	GTGCT	2	10	1018710	1018719	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3073	NC_004842	GGT	2	6	1020460	1020465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_004842	CAA	2	6	1020510	1020515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_004842	CTGCT	2	10	1020544	1020553	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3076	NC_004842	CGTT	2	8	1022189	1022196	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_004842	GT	3	6	1022215	1022220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_004842	AGT	2	6	1024353	1024358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_004842	TGT	2	6	1024359	1024364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_004842	GC	3	6	1024372	1024377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_004842	TCA	2	6	1024402	1024407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_004842	ATT	2	6	1024438	1024443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_004842	AAG	2	6	1025906	1025911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_004842	CTC	2	6	1026366	1026371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_004842	CGC	2	6	1026382	1026387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_004842	CG	3	6	1026402	1026407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_004842	GC	3	6	1026424	1026429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_004842	A	6	6	1026436	1026441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_004842	TGA	2	6	1026468	1026473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_004842	TAT	2	6	1026508	1026513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_004842	TATG	2	8	1026549	1026556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_004842	GTG	2	6	1027222	1027227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_004842	GGCAT	2	10	1027233	1027242	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3094	NC_004842	GCT	2	6	1027261	1027266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_004842	CTT	2	6	1027283	1027288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_004842	AGTC	2	8	1027297	1027304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_004842	GT	3	6	1027311	1027316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_004842	CA	3	6	1027353	1027358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_004842	TGC	2	6	1027379	1027384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_004842	ATTGC	2	10	1027417	1027426	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3101	NC_004842	CAG	2	6	1027437	1027442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_004842	AAC	2	6	1027455	1027460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_004842	AAGC	2	8	1027472	1027479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_004842	TGCA	2	8	1027497	1027504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_004842	AC	3	6	1027509	1027514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_004842	AGG	2	6	1028593	1028598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_004842	CAT	2	6	1028660	1028665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_004842	AT	3	6	1028678	1028683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_004842	CT	3	6	1028690	1028695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_004842	T	6	6	1028707	1028712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_004842	TAGA	2	8	1032251	1032258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_004842	TTC	2	6	1032330	1032335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_004842	TC	3	6	1032377	1032382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_004842	GGT	3	9	1032420	1032428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_004842	GTC	2	6	1032436	1032441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_004842	CA	3	6	1033493	1033498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_004842	ACTT	2	8	1033567	1033574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_004842	CTA	2	6	1033592	1033597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_004842	CCA	2	6	1033616	1033621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_004842	ATG	2	6	1033645	1033650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_004842	AGG	2	6	1033710	1033715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_004842	TAG	2	6	1033861	1033866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_004842	C	6	6	1033883	1033888	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3124	NC_004842	CTC	2	6	1033932	1033937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_004842	CTCC	2	8	1033955	1033962	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3126	NC_004842	GAT	2	6	1034122	1034127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_004842	CTA	2	6	1034210	1034215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_004842	TG	3	6	1034225	1034230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_004842	ACTT	2	8	1034235	1034242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3130	NC_004842	GGA	2	6	1034271	1034276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_004842	CAT	2	6	1034323	1034328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_004842	CAC	2	6	1034329	1034334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_004842	TCAC	2	8	1034349	1034356	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3382	NC_004842	CGCC	2	8	1093960	1093967	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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3391	NC_004842	TGT	2	6	1094734	1094739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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