MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003065	AAGAC	2	10	1875	1884	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_003065	TTTAT	2	10	3244	3253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003065	ATGAG	2	10	3308	3317	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003065	AAAGG	2	10	5451	5460	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003065	CCAAC	2	10	5704	5713	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_003065	GCGTG	2	10	10215	10224	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003065	ACGAC	2	10	12897	12906	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_003065	TATTC	2	10	14475	14484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_003065	GTGGC	2	10	14615	14624	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003065	TAAAA	2	10	18724	18733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003065	TATTG	2	10	18743	18752	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003065	TTTCT	2	10	20542	20551	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_003065	TGTTT	2	10	39235	39244	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003065	CGCCA	2	10	78256	78265	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_003065	TGAGG	2	10	85217	85226	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003065	AGGGA	2	10	119123	119132	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003065	TCCGC	2	10	125798	125807	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_003065	CTCCG	2	10	139205	139214	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_003065	GACGC	2	10	143896	143905	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_003065	GGTGC	2	10	157259	157268	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_003065	CCGTT	2	10	169148	169157	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_003065	CATCG	2	10	173462	173471	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_003065	GCATA	2	10	180537	180546	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_003065	AGGTC	2	10	188438	188447	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_003065	GATAC	2	10	192281	192290	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_003065	TGGGC	2	10	205985	205994	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.