MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	AT	3	6	513	518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001880	AT	3	6	580	585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001880	AT	3	6	646	651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001880	TA	3	6	3715	3720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001880	TA	3	6	4031	4036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001880	CT	3	6	5380	5385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_001880	TA	3	6	5763	5768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001880	CT	3	6	7318	7323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_001880	AT	4	8	8499	8506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001880	AC	3	6	10246	10251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_001880	AG	3	6	11737	11742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001880	GA	3	6	14460	14465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001880	AT	3	6	14674	14679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001880	TC	3	6	15001	15006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_001880	TC	3	6	15109	15114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_001880	TC	3	6	16017	16022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_001880	GA	3	6	20079	20084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001880	TA	3	6	20911	20916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001880	TA	3	6	21366	21371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001880	CT	3	6	22407	22412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_001880	CT	3	6	22613	22618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_001880	AT	4	8	22664	22671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001880	TA	3	6	26273	26278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001880	TA	3	6	28261	28266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001880	AT	3	6	28290	28295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001880	CT	3	6	29437	29442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_001880	TA	4	8	29613	29620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001880	AC	3	6	29659	29664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_001880	TA	3	6	29810	29815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001880	TA	4	8	29860	29867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001880	CA	3	6	31053	31058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_001880	TA	3	6	31914	31919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001880	TC	4	8	32780	32787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_001880	GT	3	6	33109	33114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001880	TA	4	8	34899	34906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001880	AT	3	6	35032	35037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001880	AC	3	6	36180	36185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_001880	TG	3	6	36665	36670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001880	TA	3	6	37012	37017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001880	TA	3	6	38224	38229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001880	TA	3	6	38551	38556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001880	AT	3	6	39023	39028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_001880	AT	3	6	39155	39160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001880	AG	3	6	39344	39349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.