MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000918	TTTTAA	2	12	12615	12626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000918	GTTCTT	2	12	12762	12773	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_000918	GAAAAG	2	12	87908	87919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000918	GGAATA	2	12	105872	105883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000918	CGTATA	2	12	124712	124723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_000918	CGGAAA	2	12	163915	163926	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_000918	AATTAT	2	12	168853	168864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000918	TCCTTT	2	12	177583	177594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_000918	TTTCCT	2	12	258817	258828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_000918	TTAAAA	2	12	267000	267011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000918	TAAAAA	2	12	272117	272128	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000918	CCTCAC	2	12	287238	287249	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_000918	ACCTTG	2	12	294119	294130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_000918	TGAGTT	2	12	314270	314281	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000918	AAAGGA	2	12	328304	328315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000918	AGAGGG	2	12	328316	328327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000918	AAAGAA	2	12	348373	348384	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000918	GACTTG	2	12	351699	351710	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_000918	TTTACT	2	12	418408	418419	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_000918	GTTGAA	2	12	428254	428265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000918	CCTCGT	2	12	436163	436174	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_000918	TTTAAA	2	12	436442	436453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000918	TATTTA	2	12	505637	505648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000918	CTTTTG	2	12	533839	533850	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_000918	TCTACT	2	12	600753	600764	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_000918	GGAAAT	2	12	621688	621699	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000918	GGAGGG	2	12	643596	643607	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000918	AAAAAT	2	12	675704	675715	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000918	GAGAAA	2	12	692034	692045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000918	TAAATA	2	12	719181	719192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000918	TTCCTT	2	12	776389	776400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_000918	GGAGAC	2	12	823000	823011	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_000918	GTTCCT	2	12	988577	988588	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_000918	AAGGGA	2	12	1057914	1057925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000918	ATAAAA	2	12	1128593	1128604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000918	GGATGT	2	12	1129051	1129062	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000918	AGCGAG	2	12	1153740	1153751	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_000918	TATGAG	2	12	1209333	1209344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000918	AGAAAG	2	12	1216568	1216579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000918	AGACAC	2	12	1226610	1226621	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_000918	TCTACA	2	12	1231540	1231551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_000918	CTTTTC	2	12	1242757	1242768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_000918	AAAGGG	2	12	1305450	1305461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000918	TTGAGC	2	12	1326971	1326982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_000918	CTTCAA	2	12	1344128	1344139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_000918	TTCCTT	2	12	1361569	1361580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_000918	TTTAAA	2	12	1361688	1361699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000918	ATAAAT	2	12	1405440	1405451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000918	GGCTCC	2	12	1418654	1418665	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_000918	GCTAAG	2	12	1497573	1497584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_000918	GAAAAG	2	12	1536328	1536339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000918	TTTTCC	2	12	1551093	1551104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.