MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Aquifex aeolicus VF5

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000918	AATC	2	8	6962	6969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_000918	GCGG	2	8	12702	12709	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_000918	TTAA	2	8	29218	29225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000918	GAAT	2	8	37765	37772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000918	TGAA	2	8	44443	44450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000918	TGAA	2	8	44470	44477	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000918	CAGA	2	8	66686	66693	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_000918	TAAA	2	8	67171	67178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000918	TTCC	2	8	71724	71731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_000918	TCCT	2	8	72342	72349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_000918	CCTT	2	8	92444	92451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_000918	AAAG	2	8	92569	92576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000918	CCTT	2	8	92731	92738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_000918	AAAG	2	8	92856	92863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000918	AAAC	2	8	95999	96006	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_000918	TAAA	2	8	109159	109166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000918	CTCC	2	8	112103	112110	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_000918	CCTT	2	8	113972	113979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_000918	AAAT	2	8	139206	139213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000918	TTTC	2	8	144122	144129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_000918	AATA	2	8	144241	144248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000918	ATAA	2	8	149083	149090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000918	GATG	2	8	149097	149104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000918	CGTT	2	8	156387	156394	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_000918	TTCT	2	8	156577	156584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_000918	AAAT	2	8	163181	163188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000918	ATTA	2	8	163907	163914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000918	TATT	2	8	166844	166851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000918	TTAT	2	8	166969	166976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000918	CAGG	2	8	167237	167244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_000918	TCCT	2	8	167425	167432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_000918	TAAT	2	8	171565	171572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000918	TCCC	2	8	172735	172742	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_000918	TTTA	2	8	176340	176347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000918	AGGA	2	8	178522	178529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000918	CAGA	2	8	183224	183231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_000918	TCTT	2	8	200705	200712	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_000918	AGGA	2	8	203456	203463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000918	AGGA	2	8	206105	206112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000918	GAAA	2	8	206113	206120	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000918	TAAG	2	8	207192	207199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000918	AAAG	2	8	207329	207336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000918	ATTC	2	8	212593	212600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_000918	AGAA	2	8	221176	221183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000918	CGGA	2	8	221234	221241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_000918	AAAG	2	8	221519	221526	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000918	ATAG	2	8	225311	225318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000918	CTTC	2	8	228605	228612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_000918	CCTT	2	8	244733	244740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_000918	AATG	2	8	244857	244864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000918	TCGG	2	8	245073	245080	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_000918	TCCT	2	8	245294	245301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_000918	AAGT	2	8	252265	252272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000918	AGGG	2	8	265086	265093	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000918	AATG	2	8	279621	279628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000918	TCAC	2	8	279751	279758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_000918	TCCC	2	8	292098	292105	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_000918	CGTA	2	8	300120	300127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_000918	AATT	2	8	302328	302335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000918	TAAA	2	8	307407	307414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000918	TTCT	2	8	307636	307643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_000918	GAGT	2	8	314285	314292	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000918	ACGA	2	8	314434	314441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_000918	GAAA	2	8	321496	321503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000918	GAAA	2	8	321801	321808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000918	CTTC	2	8	321913	321920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_000918	GCTC	2	8	321926	321933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_000918	TTAA	2	8	322178	322185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000918	CTTC	2	8	328064	328071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_000918	GAAA	2	8	328221	328228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000918	TCCT	2	8	329536	329543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_000918	TAAT	2	8	331359	331366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000918	CCTT	2	8	337034	337041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_000918	AAAG	2	8	337096	337103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000918	ATAA	2	8	344317	344324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000918	CTTT	2	8	344480	344487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_000918	GGAT	2	8	344649	344656	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000918	TGAA	2	8	344763	344770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000918	GTAA	2	8	344829	344836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000918	GAAA	2	8	344925	344932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000918	AAAG	2	8	345020	345027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000918	GTAT	2	8	348492	348499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000918	ACCA	2	8	348997	349004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_000918	AAAG	2	8	349019	349026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000918	AAGG	2	8	359318	359325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000918	GGTG	2	8	359400	359407	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000918	GAAA	2	8	359551	359558	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000918	GAGG	2	8	367965	367972	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000918	ATTT	2	8	387423	387430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000918	TCTT	2	8	388371	388378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_000918	ACTA	2	8	397115	397122	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_000918	TTTA	2	8	397263	397270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000918	AGGG	2	8	407839	407846	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000918	ATTG	2	8	416702	416709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000918	AGAA	2	8	416730	416737	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000918	ATTG	2	8	416769	416776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000918	AGAA	2	8	416797	416804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000918	GGAA	2	8	418202	418209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000918	CTGG	2	8	418329	418336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_000918	GTAA	2	8	418629	418636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000918	CCTC	2	8	432022	432029	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_000918	AATT	2	8	435751	435758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000918	GAAC	2	8	436004	436011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_000918	TCCT	2	8	436086	436093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_000918	GTAA	2	8	436409	436416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000918	GAAG	2	8	437592	437599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000918	CTGG	2	8	437603	437610	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_000918	ATTT	2	8	440778	440785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000918	ATTT	2	8	442144	442151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000918	AGGA	2	8	442308	442315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000918	AAAG	2	8	442462	442469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000918	TAAA	2	8	444007	444014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000918	CCTT	2	8	450824	450831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_000918	TGAA	2	8	450862	450869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000918	CTCC	2	8	463177	463184	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_000918	TAAT	2	8	464399	464406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000918	ATCA	2	8	472801	472808	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_000918	GGAA	2	8	472886	472893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000918	TCTT	2	8	533826	533833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_000918	ATTT	2	8	544325	544332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000918	AATT	2	8	567749	567756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000918	TGCC	2	8	568137	568144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_000918	GGAC	2	8	568168	568175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_000918	GGGT	2	8	568420	568427	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000918	CGGC	2	8	568910	568917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_000918	CGGC	2	8	569259	569266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_000918	GGAA	2	8	569954	569961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000918	TCGC	2	8	570640	570647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_000918	CCGG	2	8	571322	571329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_000918	GGCC	2	8	572449	572456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_000918	CGGC	2	8	572688	572695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_000918	AATT	2	8	573038	573045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000918	TTAA	2	8	586069	586076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000918	ATTA	2	8	594241	594248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000918	GAAG	2	8	600796	600803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000918	ATTA	2	8	600815	600822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000918	GGAG	2	8	601724	601731	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000918	CTAA	2	8	601801	601808	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_000918	AGAA	2	8	601828	601835	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000918	AAGT	2	8	610336	610343	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000918	AAGA	2	8	613847	613854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000918	AAAT	2	8	619994	620001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000918	ATGA	2	8	620036	620043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000918	ACAG	2	8	631326	631333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_000918	GGAC	2	8	631354	631361	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_000918	AAGG	2	8	631416	631423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000918	TTAT	2	8	650030	650037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000918	TTTC	2	8	650163	650170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_000918	TAAT	2	8	650206	650213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000918	TAAG	2	8	650569	650576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000918	TTCC	2	8	651277	651284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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297	NC_000918	CCTT	2	8	1379840	1379847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
298	NC_000918	GCCA	2	8	1386396	1386403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
299	NC_000918	TCCC	2	8	1393000	1393007	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
300	NC_000918	ATTT	2	8	1393196	1393203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_000918	AGGG	2	8	1410463	1410470	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
302	NC_000918	AAAC	2	8	1418585	1418592	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
303	NC_000918	GACG	2	8	1423847	1423854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
304	NC_000918	TAAA	2	8	1453020	1453027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_000918	CACC	2	8	1453136	1453143	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
306	NC_000918	AAAG	2	8	1471375	1471382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
307	NC_000918	AATA	2	8	1497372	1497379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_000918	ACCT	2	8	1501210	1501217	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
309	NC_000918	CGGG	2	8	1515355	1515362	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
310	NC_000918	ATAC	2	8	1515566	1515573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
311	NC_000918	TGAG	2	8	1528572	1528579	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
312	NC_000918	CCAA	2	8	1533421	1533428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
313	NC_000918	TACT	2	8	1536296	1536303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
314	NC_000918	TAAT	2	8	1537671	1537678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_000918	TCCT	2	8	1541739	1541746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
316	NC_000918	ATTA	2	8	1541910	1541917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_000918	ATGA	2	8	1541953	1541960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
318	NC_000918	GTAA	2	8	1547175	1547182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
319	NC_000918	CCTT	2	8	1551120	1551127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.