MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Archaeoglobus fulgidus DSM 4304

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000917	GCTCA	2	10	62598	62607	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_000917	TGGCT	2	10	81148	81157	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_000917	TCGAA	2	10	81724	81733	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_000917	TGTTT	2	10	81808	81817	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000917	AAACC	2	10	96197	96206	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_000917	AGGAG	2	10	99032	99041	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000917	TTCCA	2	10	111365	111374	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_000917	GATGG	2	10	111403	111412	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000917	TTCTC	2	10	111623	111632	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_000917	TGATT	2	10	116682	116691	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000917	ACCCC	2	10	117624	117633	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
12	NC_000917	GTTTT	2	10	131632	131641	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000917	TTAAC	2	10	145840	145849	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_000917	GTTTG	2	10	158077	158086	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000917	AAGCA	2	10	167041	167050	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_000917	GTGGA	2	10	168789	168798	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000917	TCTGT	2	10	168841	168850	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_000917	GCAAA	2	10	180464	180473	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_000917	CAAAT	2	10	197169	197178	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_000917	TAAAA	2	10	208069	208078	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000917	TTAAA	2	10	232425	232434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000917	CCGGG	2	10	235752	235761	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_000917	TAGCT	2	10	240574	240583	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_000917	CCCAT	2	10	250696	250705	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_000917	CATTT	2	10	256497	256506	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_000917	TGCTG	2	10	269019	269028	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_000917	CCTTT	2	10	272070	272079	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_000917	AGGGT	2	10	274521	274530	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000917	ATCCC	2	10	283023	283032	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_000917	ACTTC	2	10	296877	296886	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_000917	AAAGT	2	10	304566	304575	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000917	ATTTT	2	10	334413	334422	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000917	TAAAC	2	10	345031	345040	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_000917	TCCTT	2	10	399109	399118	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_000917	GAAGA	2	10	399910	399919	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000917	TAAAC	2	10	413548	413557	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_000917	TGATT	2	10	481717	481726	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000917	TCAAA	2	10	497195	497204	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_000917	ATCTT	2	10	497356	497365	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_000917	GTCCC	2	10	515599	515608	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_000917	ATTCA	2	10	535799	535808	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_000917	ATAAA	2	10	540466	540475	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000917	AATCC	2	10	552333	552342	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_000917	CAACT	2	10	556693	556702	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_000917	TCTGC	2	10	563946	563955	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_000917	ATATT	2	10	564024	564033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000917	CTTTC	2	10	571099	571108	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_000917	AGAAC	2	10	580096	580105	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_000917	ACAAA	2	10	611310	611319	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_000917	TATAC	2	10	619946	619955	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_000917	TTGCC	2	10	629118	629127	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_000917	CTGCT	2	10	689082	689091	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_000917	TTCAA	2	10	704348	704357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_000917	TTTGA	2	10	714912	714921	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000917	TTTTC	2	10	732667	732676	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_000917	AGAGA	2	10	783290	783299	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000917	GTGAT	2	10	783950	783959	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000917	TGATT	2	10	804325	804334	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000917	ATTTT	2	10	824771	824780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000917	AACTG	2	10	848730	848739	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_000917	ATTTA	2	10	908850	908859	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000917	TACAC	2	10	910091	910100	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_000917	AACAT	2	10	910347	910356	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_000917	TCAAA	2	10	927433	927442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_000917	ATTTT	2	10	933366	933375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000917	TCTCC	2	10	964840	964849	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_000917	TATTT	2	10	971820	971829	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000917	ATTTG	2	10	976478	976487	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000917	AGTTG	2	10	998709	998718	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000917	CTTAC	2	10	1009941	1009950	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_000917	GAAAT	2	10	1032509	1032518	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000917	CACTC	2	10	1032645	1032654	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_000917	TCACA	2	10	1104520	1104529	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_000917	ATCAA	2	10	1118487	1118496	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_000917	TATAA	2	10	1130278	1130287	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000917	ACTTT	2	10	1139066	1139075	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_000917	GAATT	2	10	1148525	1148534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000917	ACCTC	2	10	1156892	1156901	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_000917	ATTTG	2	10	1251131	1251140	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000917	TCCAA	2	10	1278132	1278141	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_000917	TCTTT	2	10	1305617	1305626	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_000917	TTTTG	2	10	1311280	1311289	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000917	CCTCC	2	10	1315848	1315857	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
84	NC_000917	CCCTG	2	10	1325417	1325426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_000917	TTTTC	2	10	1326729	1326738	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_000917	AATAA	3	15	1344579	1344593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000917	CAAAC	2	10	1399886	1399895	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_000917	TTTGT	2	10	1413941	1413950	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000917	ATCTC	2	10	1420393	1420402	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_000917	AAATC	2	10	1429902	1429911	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_000917	AACCA	2	10	1446405	1446414	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_000917	TAATT	2	10	1480042	1480051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000917	ATGTT	2	10	1492365	1492374	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000917	AGGTG	2	10	1498908	1498917	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000917	ATTGC	2	10	1500896	1500905	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_000917	GTTTT	2	10	1514352	1514361	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000917	CAAAA	2	10	1537485	1537494	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_000917	ATTTT	2	10	1572139	1572148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000917	TCTCC	2	10	1618397	1618406	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_000917	TCATC	2	10	1625781	1625790	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_000917	CTTTT	2	10	1625994	1626003	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_000917	AAAGG	2	10	1646272	1646281	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000917	CTTTC	2	10	1649859	1649868	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_000917	TCATC	2	10	1649991	1650000	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_000917	TAAAA	2	10	1741710	1741719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000917	TCTCC	2	10	1764215	1764224	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_000917	ATTTT	2	10	1778093	1778102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000917	TTTCC	2	10	1788579	1788588	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_000917	CGAGC	2	10	1788717	1788726	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_000917	TGTGG	2	10	1842322	1842331	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000917	AAAAT	2	10	1870078	1870087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000917	TAAAA	2	10	1887403	1887412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000917	TAATT	2	10	1908304	1908313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000917	TTTTA	2	10	1918421	1918430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000917	TACTC	2	10	1944546	1944555	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_000917	TTGAG	2	10	1959765	1959774	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000917	AAGTC	2	10	1978965	1978974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_000917	TTGGA	2	10	1979474	1979483	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000917	TTCTG	2	10	1979605	1979614	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_000917	ATTTA	2	10	1985584	1985593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000917	TTGAA	2	10	2003881	2003890	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000917	TTAAA	2	10	2012785	2012794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000917	CTGTT	2	10	2018453	2018462	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_000917	AAAGA	2	10	2024374	2024383	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000917	CAAAT	2	10	2042946	2042955	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_000917	ATTTG	2	10	2062621	2062630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000917	ATTTG	2	10	2089428	2089437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000917	GGTGA	2	10	2096861	2096870	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000917	TCAAA	2	10	2101379	2101388	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.