MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Archaeoglobus fulgidus DSM 4304

Total Repeats: 443

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000917	GTTG	2	8	889	896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000917	TGTT	2	8	1153	1160	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000917	GAAA	2	8	1395	1402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000917	AACG	2	8	2660	2667	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_000917	GAAA	2	8	2899	2906	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000917	ATCC	2	8	3205	3212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_000917	ATTT	2	8	4880	4887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000917	TTAT	2	8	9442	9449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000917	TTTA	2	8	9469	9476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000917	TAAT	2	8	16644	16651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000917	ATCT	2	8	29773	29780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_000917	CTGT	2	8	32631	32638	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_000917	TAAA	2	8	34883	34890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000917	AGGC	2	8	45622	45629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_000917	AACT	2	8	53842	53849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_000917	CATT	2	8	71223	71230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_000917	TGCT	2	8	72027	72034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_000917	TGAA	2	8	72045	72052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000917	GGCT	2	8	72684	72691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_000917	GAAA	2	8	72705	72712	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000917	AGGA	2	8	72743	72750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000917	TCAG	2	8	73343	73350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_000917	TTAA	2	8	78481	78488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000917	CCGG	2	8	81793	81800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_000917	TTTC	2	8	92768	92775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_000917	TTCT	2	8	93018	93025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_000917	ATTA	2	8	93690	93697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000917	TAAA	2	8	94874	94881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000917	AAAC	2	8	95863	95870	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_000917	CAAT	2	8	95895	95902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_000917	GCAG	2	8	101544	101551	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_000917	ATAA	2	8	104216	104223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000917	GAAA	2	8	105037	105044	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000917	TCCA	2	8	110842	110849	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000917	CAAA	2	8	110894	110901	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_000917	ATTC	2	8	110968	110975	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_000917	ATCT	2	8	111143	111150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_000917	TTGT	2	8	111767	111774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000917	TCTG	2	8	129766	129773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_000917	AGTT	2	8	130963	130970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000917	CTTT	2	8	131662	131669	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_000917	AAAG	2	8	132079	132086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000917	ATAA	2	8	135292	135299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000917	CCAA	2	8	136014	136021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_000917	TCCA	2	8	145234	145241	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_000917	TTAA	2	8	145854	145861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000917	AAAT	2	8	147506	147513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000917	AAGC	2	8	166470	166477	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_000917	GATT	2	8	166599	166606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000917	TCTG	2	8	167096	167103	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_000917	GATG	2	8	168728	168735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000917	ATCG	2	8	168873	168880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_000917	GAAA	2	8	168998	169005	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000917	AGAA	2	8	169323	169330	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000917	TTTA	2	8	170495	170502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000917	TAAT	2	8	183956	183963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000917	AAAT	2	8	197141	197148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000917	TATC	2	8	208160	208167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_000917	TAAA	2	8	219629	219636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000917	GCCA	2	8	220972	220979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_000917	AAGC	2	8	223708	223715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_000917	GGTT	2	8	234098	234105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000917	AAAC	2	8	234926	234933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_000917	AAAT	2	8	235492	235499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000917	AGGC	2	8	235539	235546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_000917	ATCA	2	8	247402	247409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_000917	TAAT	2	8	252496	252503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000917	TTGG	2	8	258651	258658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000917	AAAG	2	8	260787	260794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000917	TAAA	2	8	260809	260816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000917	TCAT	2	8	266302	266309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_000917	GGTT	2	8	270342	270349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000917	TCCT	2	8	272015	272022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_000917	TCTT	2	8	272153	272160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_000917	TCCA	2	8	272233	272240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_000917	CCAA	2	8	273375	273382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_000917	TGGA	2	8	273687	273694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000917	TTTC	2	8	274912	274919	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_000917	TTGG	2	8	278901	278908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000917	TATT	2	8	280067	280074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000917	ATTA	2	8	280075	280082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000917	ATTC	2	8	280933	280940	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_000917	AATA	2	8	281325	281332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000917	CAAC	2	8	281386	281393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_000917	ATCA	2	8	283015	283022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_000917	TATT	2	8	284028	284035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000917	CTTT	2	8	284828	284835	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_000917	TTTC	2	8	285670	285677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_000917	TTCC	2	8	285716	285723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_000917	AGGG	2	8	287552	287559	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000917	GAAA	2	8	290649	290656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000917	AAAT	2	8	308751	308758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000917	GCCT	2	8	315988	315995	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_000917	TAAA	2	8	322020	322027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000917	CTTC	2	8	325929	325936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_000917	ATGG	2	8	325983	325990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000917	ATTA	2	8	330961	330968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000917	ATTT	2	8	334505	334512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000917	TTGG	2	8	337541	337548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000917	AAAT	2	8	337727	337734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000917	CTTA	2	8	349739	349746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_000917	TTAT	2	8	350702	350709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000917	TTTA	2	8	371571	371578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000917	TCCC	2	8	377507	377514	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_000917	GAAA	2	8	391307	391314	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000917	TCCC	2	8	398266	398273	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_000917	AGGC	2	8	398421	398428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_000917	TCGG	2	8	398815	398822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_000917	TTTC	2	8	398979	398986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_000917	TCAA	2	8	401192	401199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_000917	ATTT	2	8	401935	401942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000917	CTGG	2	8	413677	413684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_000917	AAGG	2	8	421110	421117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000917	ACGA	2	8	455342	455349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_000917	ACCA	2	8	457278	457285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_000917	AAAG	2	8	481926	481933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000917	TTAA	2	8	482085	482092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000917	AAAT	2	8	482097	482104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000917	AATC	2	8	482143	482150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_000917	AAAT	2	8	509634	509641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000917	GGCA	2	8	510163	510170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_000917	CCTT	2	8	510613	510620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_000917	GGAG	2	8	510905	510912	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000917	TGCT	2	8	510932	510939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_000917	CTGC	2	8	511286	511293	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_000917	AACT	2	8	515506	515513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_000917	TCCC	2	8	515630	515637	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_000917	ATTC	2	8	537583	537590	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_000917	TTGC	2	8	539084	539091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_000917	ATTT	2	8	539389	539396	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000917	AGGC	2	8	540422	540429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_000917	TCAT	2	8	543500	543507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_000917	CCTT	2	8	544868	544875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_000917	GAAT	2	8	544876	544883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000917	GACT	2	8	545954	545961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_000917	TTTC	2	8	550452	550459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_000917	TGAT	2	8	550617	550624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000917	TTCT	2	8	552293	552300	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_000917	CCAG	2	8	557700	557707	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_000917	ACAA	2	8	567982	567989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_000917	CTCC	2	8	571227	571234	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_000917	TTGG	2	8	578314	578321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000917	TTTA	2	8	600067	600074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000917	TTAT	2	8	611181	611188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000917	TAAC	2	8	611298	611305	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_000917	TAAA	2	8	644032	644039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000917	CAGC	2	8	644050	644057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_000917	CGGG	2	8	646697	646704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_000917	TAAA	2	8	653077	653084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000917	TAAA	2	8	653108	653115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_000917	TTCG	2	8	662930	662937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.