MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 3987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000854	GCA	2	6	1245907	1245912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_000854	CCAG	2	8	1248259	1248266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_000854	CAC	2	6	1250578	1250583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_000854	ACC	2	6	1250588	1250593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_000854	CTA	2	6	1250601	1250606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_000854	C	7	7	1251146	1251152	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3007	NC_000854	TAG	2	6	1251203	1251208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_000854	GTC	2	6	1251240	1251245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_000854	CT	3	6	1251292	1251297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_000854	CGC	2	6	1253015	1253020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_000854	TA	3	6	1253026	1253031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_000854	AAC	2	6	1253483	1253488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_000854	CAC	2	6	1254503	1254508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_000854	ACT	2	6	1254514	1254519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_000854	GA	3	6	1254559	1254564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_000854	AGC	2	6	1254682	1254687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_000854	CCCCT	2	10	1255340	1255349	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3018	NC_000854	GCT	2	6	1255384	1255389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_000854	AT	3	6	1255390	1255395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_000854	AG	3	6	1255420	1255425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_000854	AC	3	6	1257741	1257746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_000854	CAG	2	6	1257787	1257792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_000854	CAC	2	6	1259182	1259187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_000854	CCT	2	6	1259261	1259266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_000854	GGA	2	6	1259337	1259342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_000854	GAG	2	6	1259383	1259388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_000854	AGGC	2	8	1259425	1259432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_000854	CGTGA	2	10	1259443	1259452	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3029	NC_000854	C	6	6	1259453	1259458	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3030	NC_000854	CGA	2	6	1259478	1259483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_000854	GAG	2	6	1259521	1259526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_000854	G	6	6	1260148	1260153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_000854	C	6	6	1260178	1260183	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3034	NC_000854	ACATA	2	10	1260200	1260209	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3035	NC_000854	ACAACC	2	12	1260211	1260222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_000854	GAA	2	6	1260237	1260242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_000854	GGTA	2	8	1260245	1260252	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_000854	ATA	2	6	1260355	1260360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_000854	GTA	2	6	1260374	1260379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_000854	TAG	2	6	1260385	1260390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_000854	GGT	2	6	1260394	1260399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_000854	CAA	2	6	1261179	1261184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_000854	GTG	2	6	1261204	1261209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_000854	GTA	2	6	1261222	1261227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_000854	G	6	6	1261251	1261256	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_000854	TCA	2	6	1261329	1261334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_000854	GCC	2	6	1261348	1261353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_000854	TTG	2	6	1261432	1261437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_000854	CAC	2	6	1261571	1261576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_000854	CCAA	2	8	1261579	1261586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_000854	AC	3	6	1261599	1261604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_000854	CCAG	2	8	1266515	1266522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_000854	GT	3	6	1266533	1266538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_000854	CCG	2	6	1268186	1268191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_000854	CCCACC	2	12	1269569	1269580	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
3056	NC_000854	CG	3	6	1269587	1269592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_000854	G	6	6	1269598	1269603	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_000854	CTG	2	6	1270037	1270042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_000854	TGG	2	6	1270050	1270055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_000854	C	6	6	1272350	1272355	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3061	NC_000854	CCT	2	6	1272802	1272807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_000854	GCC	2	6	1272838	1272843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_000854	TAT	2	6	1272902	1272907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_000854	GGC	2	6	1272961	1272966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3066	NC_000854	GTA	2	6	1273462	1273467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_000854	TTG	2	6	1273794	1273799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_000854	AT	3	6	1273819	1273824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_000854	AGG	2	6	1275713	1275718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_000854	TCT	2	6	1275787	1275792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3089	NC_000854	TCC	2	6	1277321	1277326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3092	NC_000854	CGA	2	6	1277465	1277470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3096	NC_000854	TGG	2	6	1277737	1277742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3098	NC_000854	GC	3	6	1277848	1277853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_000854	ATTC	2	8	1277901	1277908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_000854	CTTC	2	8	1277929	1277936	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_000854	TA	3	6	1277980	1277985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_000854	GATTC	2	10	1278224	1278233	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3103	NC_000854	AGC	2	6	1278332	1278337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_000854	GT	4	8	1278504	1278511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_000854	GTA	2	6	1278513	1278518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3107	NC_000854	CA	3	6	1278667	1278672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3109	NC_000854	TA	3	6	1278705	1278710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_000854	G	6	6	1278723	1278728	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_000854	CA	4	8	1278753	1278760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_000854	AT	3	6	1278764	1278769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_000854	ACA	2	6	1278770	1278775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_000854	TAA	2	6	1278799	1278804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_000854	TA	3	6	1278825	1278830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_000854	CAC	2	6	1278834	1278839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_000854	AGT	2	6	1289080	1289085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_000854	G	6	6	1289097	1289102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_000854	GCT	2	6	1291083	1291088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3122	NC_000854	TGAG	2	8	1292264	1292271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_000854	GGT	2	6	1292764	1292769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3126	NC_000854	AGT	2	6	1293626	1293631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_000854	ACC	2	6	1295536	1295541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_000854	TAAA	2	8	1295578	1295585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_000854	GTA	2	6	1295586	1295591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_000854	GCCA	2	8	1295624	1295631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_000854	AGG	2	6	1295646	1295651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_000854	CTAT	2	8	1295683	1295690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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