MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 3987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000854	CA	3	6	200342	200347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_000854	AT	3	6	200374	200379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_000854	ATT	2	6	200408	200413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_000854	TAAT	2	8	200444	200451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_000854	CGT	2	6	200569	200574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_000854	AGG	2	6	200595	200600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_000854	ATT	2	6	200651	200656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_000854	TGAA	2	8	200666	200673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_000854	TAT	2	6	200727	200732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_000854	T	6	6	200737	200742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_000854	GAT	2	6	200744	200749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_000854	CTA	2	6	200763	200768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_000854	ATT	2	6	200807	200812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_000854	ATG	2	6	201247	201252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_000854	GAGC	2	8	201267	201274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
516	NC_000854	GCCA	2	8	201323	201330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
517	NC_000854	CAG	2	6	201399	201404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_000854	TCC	2	6	201407	201412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_000854	AT	3	6	201541	201546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_000854	ACC	2	6	201653	201658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_000854	TATGG	2	10	201673	201682	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
522	NC_000854	AGGT	2	8	201695	201702	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_000854	ATT	2	6	201741	201746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_000854	TTC	2	6	201824	201829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_000854	TC	3	6	201893	201898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_000854	GT	3	6	201910	201915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_000854	TTA	2	6	202192	202197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_000854	TCA	2	6	202203	202208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_000854	CAG	2	6	202242	202247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_000854	TGA	2	6	202248	202253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_000854	TCAC	2	8	202267	202274	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_000854	CGC	2	6	202364	202369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_000854	GCCC	2	8	202372	202379	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
534	NC_000854	TCC	2	6	202403	202408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_000854	TCT	2	6	202789	202794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_000854	G	6	6	202795	202800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
537	NC_000854	TA	3	6	202830	202835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_000854	TTC	2	6	202843	202848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_000854	AAG	2	6	202855	202860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_000854	CTAA	2	8	202861	202868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_000854	TCT	2	6	202972	202977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_000854	AATAT	2	10	203015	203024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_000854	G	6	6	203058	203063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
544	NC_000854	ATT	2	6	203115	203120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_000854	CGC	2	6	203123	203128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_000854	ATT	2	6	203959	203964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_000854	TGT	2	6	204021	204026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_000854	ATC	2	6	204140	204145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_000854	TC	3	6	204201	204206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_000854	GCAAT	2	10	204249	204258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
551	NC_000854	TTA	3	9	204259	204267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_000854	ACC	2	6	204927	204932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_000854	ATT	2	6	205006	205011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_000854	TCC	2	6	205061	205066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_000854	CGC	2	6	205133	205138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_000854	AT	3	6	205183	205188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_000854	CCT	2	6	205965	205970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_000854	TTA	2	6	206016	206021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_000854	GT	3	6	206060	206065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_000854	TTAT	2	8	206096	206103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_000854	CGG	2	6	206148	206153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_000854	CTAT	2	8	206167	206174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_000854	CAT	2	6	206177	206182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_000854	ACC	2	6	206203	206208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_000854	AC	3	6	206222	206227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_000854	CCT	2	6	206253	206258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_000854	GGA	2	6	206261	206266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_000854	CAG	2	6	206324	206329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_000854	G	6	6	206354	206359	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
570	NC_000854	GCT	2	6	206467	206472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_000854	GAG	2	6	206475	206480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_000854	CTC	2	6	206494	206499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_000854	TCT	2	6	206510	206515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_000854	CGA	2	6	206564	206569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_000854	AGA	2	6	206600	206605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_000854	AGG	2	6	206630	206635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_000854	AGA	2	6	206654	206659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_000854	AAAG	2	8	206690	206697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_000854	ACT	2	6	206705	206710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_000854	CAG	2	6	206728	206733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_000854	CAG	2	6	206755	206760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_000854	TCA	2	6	206800	206805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_000854	G	6	6	206844	206849	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
584	NC_000854	TCG	2	6	208850	208855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_000854	ACC	2	6	208883	208888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_000854	TCGG	2	8	208994	209001	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_000854	AGG	2	6	209040	209045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_000854	GAGTAG	2	12	209058	209069	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_000854	GAT	2	6	209071	209076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_000854	CGGACT	2	12	209110	209121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_000854	AAT	2	6	209132	209137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_000854	AAC	2	6	209147	209152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_000854	CGA	2	6	209164	209169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_000854	GAG	2	6	209215	209220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_000854	TG	5	10	209263	209272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_000854	TTGA	2	8	209301	209308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
597	NC_000854	TAT	2	6	209520	209525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_000854	ATTT	2	8	209583	209590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_000854	GAG	2	6	209610	209615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_000854	AT	3	6	209659	209664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_000854	GAT	2	6	209715	209720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_000854	TTC	2	6	209733	209738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_000854	CAG	2	6	209791	209796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_000854	TCA	2	6	209801	209806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_000854	GGC	2	6	209849	209854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_000854	TAT	2	6	209865	209870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_000854	ATC	2	6	209889	209894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_000854	TTC	2	6	209918	209923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_000854	GTT	2	6	209927	209932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_000854	TA	3	6	209937	209942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_000854	AT	3	6	209948	209953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_000854	GTT	2	6	209971	209976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_000854	GAA	2	6	210634	210639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_000854	ACT	2	6	210641	210646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_000854	AC	3	6	211319	211324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_000854	ATA	3	9	211972	211980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_000854	CAG	2	6	212049	212054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_000854	TAT	2	6	212605	212610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_000854	TA	3	6	212618	212623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_000854	TGC	2	6	212671	212676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_000854	G	6	6	212678	212683	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
622	NC_000854	GCCA	2	8	212711	212718	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_000854	GCT	2	6	213336	213341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_000854	AGA	2	6	213365	213370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_000854	TTAA	2	8	213382	213389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_000854	CAG	2	6	213424	213429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_000854	TTAGT	2	10	213457	213466	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
628	NC_000854	ATCG	2	8	214017	214024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
629	NC_000854	CCG	2	6	215560	215565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_000854	TCG	2	6	216054	216059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_000854	AC	3	6	216215	216220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
632	NC_000854	AT	3	6	216241	216246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_000854	CACCT	2	10	222952	222961	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
634	NC_000854	TA	3	6	223000	223005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_000854	T	6	6	223009	223014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_000854	ATTT	2	8	223019	223026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_000854	T	6	6	223024	223029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_000854	ATA	2	6	223030	223035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_000854	A	6	6	223109	223114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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771	NC_000854	CCT	2	6	306661	306666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
772	NC_000854	CCTC	2	8	308150	308157	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
773	NC_000854	TAAAGC	2	12	308923	308934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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