MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022784	AGATAT	2	12	174512	174523	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	557625423
2002	NC_022784	CCTG	2	8	174529	174536	0 %	25 %	25 %	50 %	557625423
2003	NC_022784	TA	3	6	174605	174610	50 %	50 %	0 %	0 %	557625423
2004	NC_022784	TGG	2	6	174642	174647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625423
2005	NC_022784	TCA	2	6	174798	174803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625423
2006	NC_022784	AGT	2	6	174829	174834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625423
2007	NC_022784	TGT	2	6	174967	174972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625423
2008	NC_022784	CAT	2	6	174988	174993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625423
2009	NC_022784	A	6	6	175108	175113	100 %	0 %	0 %	0 %	557625423
2010	NC_022784	GAG	3	9	175163	175171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625423
2011	NC_022784	TAC	2	6	175202	175207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625423
2012	NC_022784	TG	3	6	175253	175258	0 %	50 %	50 %	0 %	557625423
2013	NC_022784	GT	3	6	175271	175276	0 %	50 %	50 %	0 %	557625423
2014	NC_022784	ATG	2	6	175283	175288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625423
2015	NC_022784	GCA	2	6	175290	175295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625423
2016	NC_022784	CAA	2	6	175486	175491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625423
2017	NC_022784	TCAC	2	8	175497	175504	25 %	25 %	0 %	50 %	557625423
2018	NC_022784	GGT	2	6	175580	175585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625423
2019	NC_022784	TGCAT	2	10	175627	175636	20 %	40 %	20 %	20 %	557625423
2020	NC_022784	CAG	2	6	175742	175747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625423
2021	NC_022784	GTG	2	6	176053	176058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625424
2022	NC_022784	GTA	2	6	176092	176097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625424
2023	NC_022784	GT	3	6	176897	176902	0 %	50 %	50 %	0 %	557626117
2024	NC_022784	GTA	2	6	176911	176916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557626117
2025	NC_022784	GTGA	2	8	176927	176934	25 %	25 %	50 %	0 %	557626117
2026	NC_022784	GTG	2	6	176949	176954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557626117
2027	NC_022784	ATG	2	6	176955	176960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557626117
2028	NC_022784	N	70	70	176998	177067	0 %	0 %	0 %	0 %	557626117
2029	NC_022784	AGGTCA	2	12	177921	177932	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	557625425
2030	NC_022784	CTT	2	6	177982	177987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625425
2031	NC_022784	CCA	2	6	177991	177996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625425
2032	NC_022784	AGC	2	6	178008	178013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625425
2033	NC_022784	AT	3	6	178178	178183	50 %	50 %	0 %	0 %	557625425
2034	NC_022784	TATGT	2	10	178193	178202	20 %	60 %	20 %	0 %	557625425
2035	NC_022784	AC	3	6	178260	178265	50 %	0 %	0 %	50 %	557625425
2036	NC_022784	ACA	2	6	178352	178357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625425
2037	NC_022784	ATC	2	6	178358	178363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625425
2038	NC_022784	TG	3	6	178485	178490	0 %	50 %	50 %	0 %	557625425
2039	NC_022784	CTT	2	6	178526	178531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625425
2040	NC_022784	C	6	6	178547	178552	0 %	0 %	0 %	100 %	557625425
2041	NC_022784	TCC	2	6	178614	178619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625425
2042	NC_022784	CTA	2	6	178645	178650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625425
2043	NC_022784	TAC	2	6	178660	178665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625425
2044	NC_022784	AAT	2	6	178715	178720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625425
2045	NC_022784	T	6	6	178777	178782	0 %	100 %	0 %	0 %	557625425
2046	NC_022784	TAT	2	6	178826	178831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625425
2047	NC_022784	TGC	2	6	178838	178843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625425
2048	NC_022784	CTG	2	6	178865	178870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625425
2049	NC_022784	GCC	3	9	178883	178891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625425
2050	NC_022784	CT	3	6	178976	178981	0 %	50 %	0 %	50 %	557625425
2051	NC_022784	CTA	2	6	178990	178995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625425
2052	NC_022784	TAG	2	6	179084	179089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625425
2053	NC_022784	CACCC	2	10	179123	179132	20 %	0 %	0 %	80 %	557625425
2054	NC_022784	CTTC	2	8	179140	179147	0 %	50 %	0 %	50 %	557625425
2055	NC_022784	GGC	2	6	179177	179182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625425
2056	NC_022784	AGC	2	6	179189	179194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625425
2057	NC_022784	CGA	2	6	179218	179223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625425
2058	NC_022784	A	6	6	179246	179251	100 %	0 %	0 %	0 %	557625425
2059	NC_022784	AC	3	6	179259	179264	50 %	0 %	0 %	50 %	557625425
2060	NC_022784	ATAC	2	8	183596	183603	50 %	25 %	0 %	25 %	557625426
2061	NC_022784	GCA	2	6	183625	183630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625426
2062	NC_022784	GC	3	6	183635	183640	0 %	0 %	50 %	50 %	557625426
2063	NC_022784	AAC	2	6	183706	183711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625426
2064	NC_022784	TCTG	2	8	183718	183725	0 %	50 %	25 %	25 %	557625426
2065	NC_022784	GAT	2	6	183760	183765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625426
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2067	NC_022784	TGG	2	6	183777	183782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625426
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2070	NC_022784	GTT	2	6	183895	183900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625426
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2072	NC_022784	TTG	2	6	184003	184008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625426
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2079	NC_022784	TGG	2	6	184283	184288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625427
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2081	NC_022784	GC	3	6	184647	184652	0 %	0 %	50 %	50 %	557625427
2082	NC_022784	CTA	2	6	184657	184662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625427
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2085	NC_022784	ATTG	2	8	185020	185027	25 %	50 %	25 %	0 %	557625428
2086	NC_022784	GC	3	6	185071	185076	0 %	0 %	50 %	50 %	557625428
2087	NC_022784	AC	3	6	185123	185128	50 %	0 %	0 %	50 %	557625428
2088	NC_022784	G	6	6	185179	185184	0 %	0 %	100 %	0 %	557625428
2089	NC_022784	GAA	2	6	185287	185292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625428
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2092	NC_022784	AGC	2	6	185393	185398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625428
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2095	NC_022784	AAAAG	2	10	185638	185647	80 %	0 %	20 %	0 %	557625428
2096	NC_022784	CGGG	2	8	185652	185659	0 %	0 %	75 %	25 %	557625428
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2102	NC_022784	TGA	2	6	186027	186032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625429
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2104	NC_022784	TGC	2	6	186054	186059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625429
2105	NC_022784	TG	3	6	186064	186069	0 %	50 %	50 %	0 %	557625429
2106	NC_022784	ATT	2	6	186134	186139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625429
2107	NC_022784	TGC	2	6	186206	186211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625429
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2109	NC_022784	T	7	7	186256	186262	0 %	100 %	0 %	0 %	557625429
2110	NC_022784	TAGC	2	8	186277	186284	25 %	25 %	25 %	25 %	557625429
2111	NC_022784	TTGT	2	8	186310	186317	0 %	75 %	25 %	0 %	557625429
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2115	NC_022784	TTG	2	6	186647	186652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625430
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2121	NC_022784	ACTC	2	8	187112	187119	25 %	25 %	0 %	50 %	557625430
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2123	NC_022784	GTA	2	6	187202	187207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625430
2124	NC_022784	TTA	2	6	187235	187240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625430
2125	NC_022784	TGC	2	6	187329	187334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625430
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2127	NC_022784	CTG	2	6	187421	187426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625430
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2234	NC_022784	GT	3	6	192878	192883	0 %	50 %	50 %	0 %	557625434
2235	NC_022784	GCA	2	6	192898	192903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625434
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2241	NC_022784	AGC	2	6	193177	193182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625434
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2243	NC_022784	CTT	2	6	193328	193333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625435
2244	NC_022784	TCGC	2	8	193340	193347	0 %	25 %	25 %	50 %	557625435
2245	NC_022784	ATC	2	6	193349	193354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625435
2246	NC_022784	GC	3	6	193365	193370	0 %	0 %	50 %	50 %	557625435
2247	NC_022784	CCCT	2	8	193419	193426	0 %	25 %	0 %	75 %	557625435
2248	NC_022784	CTT	3	9	193433	193441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625435
2249	NC_022784	ACA	2	6	193541	193546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625435
2250	NC_022784	CAC	2	6	193582	193587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625435
2251	NC_022784	CAA	2	6	193595	193600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625435
2252	NC_022784	CAT	2	6	195610	195615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625436
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2255	NC_022784	CTT	3	9	195682	195690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625436
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2272	NC_022784	GAC	2	6	196712	196717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625437
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2369	NC_022784	GAG	2	6	203174	203179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625441
2370	NC_022784	G	6	6	203181	203186	0 %	0 %	100 %	0 %	557625441
2371	NC_022784	GCA	2	6	203216	203221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625441
2372	NC_022784	TAC	2	6	203239	203244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625441
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2374	NC_022784	ACT	2	6	203278	203283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625441
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2382	NC_022784	CTC	2	6	203860	203865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625442
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2403	NC_022784	GAGTG	2	10	205816	205825	20 %	20 %	60 %	0 %	557625443
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2410	NC_022784	GGA	2	6	206332	206337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625443
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