MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022784	AACC	2	8	1011907	1011914	50 %	0 %	0 %	50 %	557625969
12502	NC_022784	AGT	2	6	1012060	1012065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625969
12503	NC_022784	TGC	2	6	1012132	1012137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625969
12504	NC_022784	GTC	2	6	1012154	1012159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625969
12505	NC_022784	ATG	2	6	1012196	1012201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625969
12506	NC_022784	AGG	2	6	1012211	1012216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625969
12507	NC_022784	GAG	2	6	1012235	1012240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625969
12508	NC_022784	CGC	2	6	1012241	1012246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625969
12509	NC_022784	CTA	2	6	1012320	1012325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625969
12510	NC_022784	GA	3	6	1012393	1012398	50 %	0 %	50 %	0 %	557625969
12511	NC_022784	A	6	6	1012398	1012403	100 %	0 %	0 %	0 %	557625969
12512	NC_022784	TGCT	2	8	1012404	1012411	0 %	50 %	25 %	25 %	557625969
12513	NC_022784	G	6	6	1012429	1012434	0 %	0 %	100 %	0 %	557625969
12514	NC_022784	GTG	2	6	1012479	1012484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625969
12515	NC_022784	CGA	2	6	1012576	1012581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625969
12516	NC_022784	ACA	2	6	1012602	1012607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625969
12517	NC_022784	GAG	2	6	1012625	1012630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625969
12518	NC_022784	CGA	2	6	1012744	1012749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625969
12519	NC_022784	CAT	2	6	1012858	1012863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625969
12520	NC_022784	CGGT	2	8	1012891	1012898	0 %	25 %	50 %	25 %	557625969
12521	NC_022784	GAG	2	6	1012935	1012940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625969
12522	NC_022784	TGT	2	6	1012965	1012970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625969
12523	NC_022784	TGG	2	6	1013355	1013360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625970
12524	NC_022784	CGC	2	6	1013368	1013373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625970
12525	NC_022784	GGCGC	2	10	1013431	1013440	0 %	0 %	60 %	40 %	557625970
12526	NC_022784	ATGG	2	8	1013449	1013456	25 %	25 %	50 %	0 %	557625970
12527	NC_022784	AT	3	6	1013460	1013465	50 %	50 %	0 %	0 %	557625970
12528	NC_022784	AAAG	2	8	1013520	1013527	75 %	0 %	25 %	0 %	557625970
12529	NC_022784	CAA	2	6	1013556	1013561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625970
12530	NC_022784	AG	3	6	1013609	1013614	50 %	0 %	50 %	0 %	557625970
12531	NC_022784	ATT	2	6	1013696	1013701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625970
12532	NC_022784	GGA	2	6	1013770	1013775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625970
12533	NC_022784	GGA	2	6	1013785	1013790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625970
12534	NC_022784	GAA	2	6	1013791	1013796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625970
12535	NC_022784	GAA	2	6	1013816	1013821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625970
12536	NC_022784	A	6	6	1013838	1013843	100 %	0 %	0 %	0 %	557625970
12537	NC_022784	TCT	2	6	1013876	1013881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625970
12538	NC_022784	ATG	2	6	1013906	1013911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625970
12539	NC_022784	TA	3	6	1013966	1013971	50 %	50 %	0 %	0 %	557625970
12540	NC_022784	A	6	6	1013974	1013979	100 %	0 %	0 %	0 %	557625970
12541	NC_022784	CGGA	2	8	1014010	1014017	25 %	0 %	50 %	25 %	557625970
12542	NC_022784	AG	3	6	1014070	1014075	50 %	0 %	50 %	0 %	557625970
12543	NC_022784	CCA	2	6	1014111	1014116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625970
12544	NC_022784	CGC	2	6	1014143	1014148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625970
12545	NC_022784	CCAA	2	8	1014227	1014234	50 %	0 %	0 %	50 %	557625970
12546	NC_022784	AAG	2	6	1014244	1014249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625970
12547	NC_022784	GAT	2	6	1014260	1014265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625970
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12549	NC_022784	TAG	2	6	1014315	1014320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625970
12550	NC_022784	CAA	2	6	1014325	1014330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625970
12551	NC_022784	AGG	2	6	1014447	1014452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625970
12552	NC_022784	CAT	2	6	1014457	1014462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625970
12553	NC_022784	GCAG	2	8	1014470	1014477	25 %	0 %	50 %	25 %	557625970
12554	NC_022784	TGG	2	6	1014535	1014540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625970
12555	NC_022784	TGA	2	6	1014586	1014591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625970
12556	NC_022784	AGCGC	2	10	1014594	1014603	20 %	0 %	40 %	40 %	557625970
12557	NC_022784	GCG	2	6	1014656	1014661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625970
12558	NC_022784	G	6	6	1014661	1014666	0 %	0 %	100 %	0 %	557625970
12559	NC_022784	TTG	2	6	1014675	1014680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625970
12560	NC_022784	AGG	2	6	1014701	1014706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625970
12561	NC_022784	TCCTT	2	10	1014768	1014777	0 %	60 %	0 %	40 %	557625970
12562	NC_022784	A	6	6	1014829	1014834	100 %	0 %	0 %	0 %	557625970
12563	NC_022784	GC	3	6	1014892	1014897	0 %	0 %	50 %	50 %	557625970
12564	NC_022784	A	7	7	1014900	1014906	100 %	0 %	0 %	0 %	557625970
12565	NC_022784	TAA	2	6	1014960	1014965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625970
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12567	NC_022784	CG	3	6	1015068	1015073	0 %	0 %	50 %	50 %	557625970
12568	NC_022784	AT	3	6	1015142	1015147	50 %	50 %	0 %	0 %	557625970
12569	NC_022784	GGT	2	6	1015198	1015203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625970
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12571	NC_022784	AGAAA	2	10	1015237	1015246	80 %	0 %	20 %	0 %	557625970
12572	NC_022784	TGAA	2	8	1015404	1015411	50 %	25 %	25 %	0 %	557625970
12573	NC_022784	CA	3	6	1015519	1015524	50 %	0 %	0 %	50 %	557625970
12574	NC_022784	A	6	6	1015607	1015612	100 %	0 %	0 %	0 %	557625970
12575	NC_022784	CT	3	6	1015648	1015653	0 %	50 %	0 %	50 %	557625970
12576	NC_022784	CGT	2	6	1015672	1015677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625970
12577	NC_022784	TCAC	2	8	1015695	1015702	25 %	25 %	0 %	50 %	557625970
12578	NC_022784	T	7	7	1015826	1015832	0 %	100 %	0 %	0 %	557625970
12579	NC_022784	GTC	2	6	1015838	1015843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625970
12580	NC_022784	TGA	2	6	1015873	1015878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625970
12581	NC_022784	AGCC	2	8	1015970	1015977	25 %	0 %	25 %	50 %	557625971
12582	NC_022784	CCA	2	6	1015998	1016003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625971
12583	NC_022784	CAT	2	6	1016030	1016035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625971
12584	NC_022784	AC	3	6	1016068	1016073	50 %	0 %	0 %	50 %	557625971
12585	NC_022784	GCC	2	6	1016141	1016146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625971
12586	NC_022784	CTT	2	6	1016194	1016199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625971
12587	NC_022784	AGC	2	6	1016202	1016207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625971
12588	NC_022784	TGC	2	6	1016293	1016298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625971
12589	NC_022784	GTA	2	6	1016313	1016318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625971
12590	NC_022784	TAC	2	6	1016422	1016427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625971
12591	NC_022784	GTT	2	6	1016430	1016435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625971
12592	NC_022784	TAC	2	6	1016453	1016458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625971
12593	NC_022784	CTT	2	6	1016549	1016554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625971
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12596	NC_022784	C	6	6	1017898	1017903	0 %	0 %	0 %	100 %	557625972
12597	NC_022784	CGG	2	6	1017926	1017931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625972
12598	NC_022784	AGC	2	6	1018015	1018020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625972
12599	NC_022784	ATC	2	6	1018044	1018049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625972
12600	NC_022784	CAG	2	6	1018053	1018058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625972
12601	NC_022784	AC	3	6	1018085	1018090	50 %	0 %	0 %	50 %	557625972
12602	NC_022784	ACT	3	9	1018162	1018170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625972
12603	NC_022784	AAC	2	6	1018182	1018187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625972
12604	NC_022784	GCA	2	6	1018192	1018197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625972
12605	NC_022784	AGC	2	6	1018282	1018287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625972
12606	NC_022784	AAGC	2	8	1018308	1018315	50 %	0 %	25 %	25 %	557625972
12607	NC_022784	TGT	2	6	1018358	1018363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625972
12608	NC_022784	GAA	2	6	1018381	1018386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625972
12609	NC_022784	AGC	2	6	1018409	1018414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625972
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12611	NC_022784	GAG	2	6	1018471	1018476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625972
12612	NC_022784	CA	3	6	1018501	1018506	50 %	0 %	0 %	50 %	557625972
12613	NC_022784	GAC	2	6	1018621	1018626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625973
12614	NC_022784	A	6	6	1018658	1018663	100 %	0 %	0 %	0 %	557625973
12615	NC_022784	AGA	2	6	1018710	1018715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625973
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12617	NC_022784	CGA	2	6	1018752	1018757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625973
12618	NC_022784	GAA	2	6	1018759	1018764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625973
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12729	NC_022784	AC	3	6	1025974	1025979	50 %	0 %	0 %	50 %	557625978
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12732	NC_022784	GGC	2	6	1026076	1026081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625978
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12971	NC_022784	AT	3	6	1045810	1045815	50 %	50 %	0 %	0 %	557625994
12972	NC_022784	CAC	2	6	1045828	1045833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625994
12973	NC_022784	CAT	2	6	1045837	1045842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625994
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12975	NC_022784	CCA	2	6	1045939	1045944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625994
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12984	NC_022784	C	6	6	1046499	1046504	0 %	0 %	0 %	100 %	557625994
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12996	NC_022784	CAT	2	6	1050822	1050827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625995
12997	NC_022784	GCCC	2	8	1050955	1050962	0 %	0 %	25 %	75 %	557625995
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12999	NC_022784	ATC	2	6	1051021	1051026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625995
13000	NC_022784	GCCAA	2	10	1051169	1051178	40 %	0 %	20 %	40 %	557625996

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