MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 32264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022521	GGA	2	6	184498	184503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454829
3502	NC_022521	AGA	2	6	184510	184515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454829
3503	NC_022521	GA	4	8	184541	184548	50 %	0 %	50 %	0 %	549454829
3504	NC_022521	G	7	7	184563	184569	0 %	0 %	100 %	0 %	549454829
3505	NC_022521	AGG	2	6	184571	184576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454829
3506	NC_022521	AGG	2	6	184580	184585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454829
3507	NC_022521	TAGC	2	8	184626	184633	25 %	25 %	25 %	25 %	549454829
3508	NC_022521	AG	3	6	184673	184678	50 %	0 %	50 %	0 %	549454829
3509	NC_022521	AGG	2	6	184689	184694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454829
3510	NC_022521	TGA	2	6	184717	184722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454829
3511	NC_022521	GGA	2	6	184731	184736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454829
3512	NC_022521	GA	3	6	184761	184766	50 %	0 %	50 %	0 %	549454829
3513	NC_022521	ATG	2	6	184768	184773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454829
3514	NC_022521	TA	3	6	185209	185214	50 %	50 %	0 %	0 %	549454830
3515	NC_022521	CCTAT	2	10	185312	185321	20 %	40 %	0 %	40 %	549454830
3516	NC_022521	CAG	2	6	185337	185342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454830
3517	NC_022521	GA	3	6	185364	185369	50 %	0 %	50 %	0 %	549454830
3518	NC_022521	GAC	2	6	185383	185388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454830
3519	NC_022521	CAC	2	6	185425	185430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454830
3520	NC_022521	CAA	2	6	185493	185498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454830
3521	NC_022521	CCT	2	6	185558	185563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454830
3522	NC_022521	TTG	2	6	186116	186121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454831
3523	NC_022521	TTA	2	6	186182	186187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454831
3524	NC_022521	CTGG	2	8	186190	186197	0 %	25 %	50 %	25 %	549454831
3525	NC_022521	GAA	2	6	186303	186308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454831
3526	NC_022521	GGCT	2	8	186346	186353	0 %	25 %	50 %	25 %	549454831
3527	NC_022521	TC	3	6	186356	186361	0 %	50 %	0 %	50 %	549454831
3528	NC_022521	TAT	2	6	186393	186398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454831
3529	NC_022521	TCC	2	6	186541	186546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454831
3530	NC_022521	CTT	2	6	186549	186554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454831
3531	NC_022521	ACC	2	6	186556	186561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454831
3532	NC_022521	GGA	2	6	186679	186684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454832
3533	NC_022521	CAT	2	6	186719	186724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454832
3534	NC_022521	TGG	2	6	186787	186792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454832
3535	NC_022521	AGC	2	6	186803	186808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454832
3536	NC_022521	CAT	2	6	186878	186883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454832
3537	NC_022521	GCG	2	6	186888	186893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454832
3538	NC_022521	TAC	2	6	186929	186934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454832
3539	NC_022521	CT	3	6	187008	187013	0 %	50 %	0 %	50 %	549454832
3540	NC_022521	TCC	2	6	187138	187143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454832
3541	NC_022521	CGC	2	6	187381	187386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454832
3542	NC_022521	CGT	2	6	187399	187404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454832
3543	NC_022521	CCTG	2	8	187458	187465	0 %	25 %	25 %	50 %	549454832
3544	NC_022521	CATC	2	8	187480	187487	25 %	25 %	0 %	50 %	549454832
3545	NC_022521	ACA	2	6	187488	187493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454832
3546	NC_022521	CT	3	6	187551	187556	0 %	50 %	0 %	50 %	549454832
3547	NC_022521	CA	3	6	187593	187598	50 %	0 %	0 %	50 %	549454832
3548	NC_022521	CTC	2	6	187601	187606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454832
3549	NC_022521	AGA	2	6	187639	187644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454832
3550	NC_022521	CTGA	2	8	187680	187687	25 %	25 %	25 %	25 %	549454832
3551	NC_022521	GACA	2	8	187841	187848	50 %	0 %	25 %	25 %	549454833
3552	NC_022521	TCC	2	6	187908	187913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454833
3553	NC_022521	TC	3	6	187928	187933	0 %	50 %	0 %	50 %	549454833
3554	NC_022521	TGA	2	6	187948	187953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454833
3555	NC_022521	CTC	3	9	188043	188051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454833
3556	NC_022521	GGC	2	6	188069	188074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454833
3557	NC_022521	CCG	2	6	188130	188135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454833
3558	NC_022521	CCA	2	6	188147	188152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454833
3559	NC_022521	GAC	2	6	188168	188173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454833
3560	NC_022521	CTC	2	6	188204	188209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454833
3561	NC_022521	GAG	2	6	188216	188221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454833
3562	NC_022521	CTC	2	6	188240	188245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454833
3563	NC_022521	CAG	2	6	188312	188317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454833
3564	NC_022521	GGT	2	6	188327	188332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454833
3565	NC_022521	ACC	2	6	188394	188399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454833
3566	NC_022521	GCTC	2	8	188420	188427	0 %	25 %	25 %	50 %	549454833
3567	NC_022521	GAAG	2	8	188437	188444	50 %	0 %	50 %	0 %	549454833
3568	NC_022521	CTC	2	6	188507	188512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454833
3569	NC_022521	AAT	2	6	188546	188551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454833
3570	NC_022521	CAC	2	6	188560	188565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454833
3571	NC_022521	CGT	2	6	188617	188622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454833
3572	NC_022521	CT	3	6	188901	188906	0 %	50 %	0 %	50 %	549454834
3573	NC_022521	AGG	2	6	189017	189022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454834
3574	NC_022521	AT	3	6	189060	189065	50 %	50 %	0 %	0 %	549454834
3575	NC_022521	GGA	2	6	189168	189173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454834
3576	NC_022521	CAGG	2	8	189184	189191	25 %	0 %	50 %	25 %	549454834
3577	NC_022521	GAG	2	6	189239	189244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454834
3578	NC_022521	CTA	2	6	189267	189272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454834
3579	NC_022521	G	6	6	189273	189278	0 %	0 %	100 %	0 %	549454834
3580	NC_022521	CAG	2	6	189331	189336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454834
3581	NC_022521	GTT	2	6	189353	189358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454834
3582	NC_022521	GGAT	2	8	189378	189385	25 %	25 %	50 %	0 %	549454834
3583	NC_022521	AGC	2	6	189452	189457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454834
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3588	NC_022521	GAA	2	6	189655	189660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454834
3589	NC_022521	CGG	2	6	189676	189681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454834
3590	NC_022521	G	6	6	189726	189731	0 %	0 %	100 %	0 %	549454834
3591	NC_022521	GGCCA	2	10	189779	189788	20 %	0 %	40 %	40 %	549454834
3592	NC_022521	G	7	7	189813	189819	0 %	0 %	100 %	0 %	549454834
3593	NC_022521	TCC	2	6	189840	189845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454834
3594	NC_022521	AGG	2	6	189878	189883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454834
3595	NC_022521	CCT	2	6	190003	190008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454835
3596	NC_022521	AG	3	6	190095	190100	50 %	0 %	50 %	0 %	549454835
3597	NC_022521	GCT	2	6	190132	190137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454835
3598	NC_022521	ACT	2	6	190145	190150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454835
3599	NC_022521	AAG	2	6	190165	190170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454835
3600	NC_022521	TA	3	6	190183	190188	50 %	50 %	0 %	0 %	549454835
3601	NC_022521	GT	4	8	190216	190223	0 %	50 %	50 %	0 %	549454835
3602	NC_022521	GAG	3	9	190263	190271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454835
3603	NC_022521	CCA	2	6	190284	190289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454835
3604	NC_022521	GGCTG	2	10	190311	190320	0 %	20 %	60 %	20 %	549454835
3605	NC_022521	GGC	2	6	190360	190365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454835
3606	NC_022521	ATT	2	6	190388	190393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454835
3607	NC_022521	GAG	2	6	190396	190401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454835
3608	NC_022521	CGG	2	6	190454	190459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454835
3609	NC_022521	GAG	2	6	190573	190578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454835
3610	NC_022521	AGG	3	9	190582	190590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454835
3611	NC_022521	GCT	2	6	190674	190679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454835
3612	NC_022521	AGG	2	6	190742	190747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454835
3613	NC_022521	CT	3	6	190802	190807	0 %	50 %	0 %	50 %	549454835
3614	NC_022521	AGG	2	6	190828	190833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454835
3615	NC_022521	GCC	2	6	190870	190875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454835
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3619	NC_022521	CGG	2	6	191078	191083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454835
3620	NC_022521	ACT	2	6	191117	191122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454835
3621	NC_022521	GCC	2	6	191139	191144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454835
3622	NC_022521	CCCTCC	2	12	191258	191269	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	549454836
3623	NC_022521	C	6	6	191314	191319	0 %	0 %	0 %	100 %	549454836
3624	NC_022521	CT	3	6	191514	191519	0 %	50 %	0 %	50 %	549454836
3625	NC_022521	CTAT	2	8	191523	191530	25 %	50 %	0 %	25 %	549454836
3626	NC_022521	GA	3	6	191542	191547	50 %	0 %	50 %	0 %	549454836
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3628	NC_022521	GA	3	6	191578	191583	50 %	0 %	50 %	0 %	549454836
3629	NC_022521	CA	3	6	191612	191617	50 %	0 %	0 %	50 %	549454836
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3643	NC_022521	CTATA	2	10	192524	192533	40 %	40 %	0 %	20 %	549454837
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3656	NC_022521	GA	3	6	193110	193115	50 %	0 %	50 %	0 %	549454838
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3747	NC_022521	CCT	2	6	197211	197216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454844
3748	NC_022521	CTG	2	6	197217	197222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454844
3749	NC_022521	CTC	2	6	197324	197329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454844
3750	NC_022521	GCG	2	6	197415	197420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454844
3751	NC_022521	TG	3	6	197423	197428	0 %	50 %	50 %	0 %	549454844
3752	NC_022521	CCA	2	6	197442	197447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454844
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3754	NC_022521	GCT	2	6	197471	197476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454844
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3760	NC_022521	GCTG	2	8	197700	197707	0 %	25 %	50 %	25 %	549454844
3761	NC_022521	GGA	2	6	197828	197833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454845
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3797	NC_022521	GCT	2	6	200997	201002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454847
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3839	NC_022521	AG	4	8	203679	203686	50 %	0 %	50 %	0 %	549454852
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3850	NC_022521	ACA	2	6	205274	205279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454854
3851	NC_022521	CTC	2	6	205288	205293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454854
3852	NC_022521	TCCC	2	8	205294	205301	0 %	25 %	0 %	75 %	549454854
3853	NC_022521	GCT	2	6	205829	205834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454855
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3857	NC_022521	TAG	2	6	205917	205922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454855
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3862	NC_022521	TC	3	6	206349	206354	0 %	50 %	0 %	50 %	549454856
3863	NC_022521	ATT	2	6	206373	206378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454856
3864	NC_022521	CAA	2	6	206410	206415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454856
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3868	NC_022521	AAT	2	6	207295	207300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454857
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3989	NC_022521	GTT	2	6	214379	214384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454867
3990	NC_022521	AC	3	6	214398	214403	50 %	0 %	0 %	50 %	549454867
3991	NC_022521	GAT	2	6	214424	214429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454867
3992	NC_022521	TAA	2	6	214563	214568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549454867
3993	NC_022521	CA	3	6	214667	214672	50 %	0 %	0 %	50 %	549454868
3994	NC_022521	CTG	2	6	214715	214720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454868
3995	NC_022521	T	6	6	214741	214746	0 %	100 %	0 %	0 %	549454868
3996	NC_022521	CTC	2	6	214777	214782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454868
3997	NC_022521	GTA	2	6	214786	214791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454868
3998	NC_022521	C	6	6	214857	214862	0 %	0 %	0 %	100 %	549454868
3999	NC_022521	GAC	2	6	215011	215016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454868
4000	NC_022521	TGAT	2	8	215163	215170	25 %	50 %	25 %	0 %	549454868

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