MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 23316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022521	CAG	2	6	224218	224223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454878
3002	NC_022521	CCT	2	6	224275	224280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454878
3003	NC_022521	GAG	2	6	224378	224383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454878
3004	NC_022521	TAC	2	6	224490	224495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454878
3005	NC_022521	AGC	2	6	224506	224511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454878
3006	NC_022521	AGG	3	9	224682	224690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454878
3007	NC_022521	TGG	2	6	224706	224711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454878
3008	NC_022521	GAG	2	6	224734	224739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454878
3009	NC_022521	TGC	2	6	224808	224813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454878
3010	NC_022521	GAG	2	6	224840	224845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454878
3011	NC_022521	GCG	2	6	224851	224856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454878
3012	NC_022521	GGC	2	6	224907	224912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454879
3013	NC_022521	GGT	2	6	224969	224974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454879
3014	NC_022521	CGA	2	6	225011	225016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454879
3015	NC_022521	AGC	2	6	225027	225032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454879
3016	NC_022521	TCC	2	6	225061	225066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454879
3017	NC_022521	CTC	2	6	225174	225179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454879
3018	NC_022521	ACG	2	6	225325	225330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454879
3019	NC_022521	GGA	2	6	225416	225421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454879
3020	NC_022521	GGC	2	6	225422	225427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454879
3021	NC_022521	TTC	2	6	225530	225535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454880
3022	NC_022521	ATG	3	9	225581	225589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454880
3023	NC_022521	AGG	2	6	225617	225622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454880
3024	NC_022521	TCG	2	6	225645	225650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454880
3025	NC_022521	GGA	2	6	225652	225657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454880
3026	NC_022521	GTT	3	9	225683	225691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454880
3027	NC_022521	GGC	2	6	225808	225813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454880
3028	NC_022521	AGG	2	6	225847	225852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454880
3029	NC_022521	GTT	2	6	225968	225973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454880
3030	NC_022521	GGA	3	9	225997	226005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454880
3031	NC_022521	GGC	2	6	226011	226016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454880
3032	NC_022521	TCG	2	6	226035	226040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454880
3033	NC_022521	CCT	2	6	226056	226061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454880
3034	NC_022521	GAG	2	6	226097	226102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454880
3035	NC_022521	AGG	2	6	226109	226114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454880
3036	NC_022521	CTA	2	6	226304	226309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454880
3037	NC_022521	TTA	2	6	226394	226399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454881
3038	NC_022521	TAT	2	6	226470	226475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454881
3039	NC_022521	GCC	2	6	226524	226529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454881
3040	NC_022521	GTA	2	6	226593	226598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454881
3041	NC_022521	ATC	2	6	226638	226643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454881
3042	NC_022521	CTC	2	6	226746	226751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454881
3043	NC_022521	TCC	2	6	226757	226762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454881
3044	NC_022521	CCT	2	6	226860	226865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454881
3045	NC_022521	CCT	2	6	226903	226908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454881
3046	NC_022521	TCC	2	6	226926	226931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454881
3047	NC_022521	CCT	2	6	226949	226954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454881
3048	NC_022521	GGA	2	6	227067	227072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454881
3049	NC_022521	CAG	2	6	227102	227107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454881
3050	NC_022521	CCT	2	6	227112	227117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454881
3051	NC_022521	GAG	2	6	227275	227280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454882
3052	NC_022521	CCT	2	6	227289	227294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454882
3053	NC_022521	CCT	2	6	227451	227456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454882
3054	NC_022521	GGT	2	6	227487	227492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454882
3055	NC_022521	TAT	2	6	227665	227670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454882
3056	NC_022521	CAC	2	6	227692	227697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454882
3057	NC_022521	TCC	2	6	227723	227728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454882
3058	NC_022521	TGC	2	6	227736	227741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454882
3059	NC_022521	GAG	2	6	227806	227811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454882
3060	NC_022521	ACC	2	6	227834	227839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454882
3061	NC_022521	CAT	2	6	227880	227885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454882
3062	NC_022521	GGC	2	6	227899	227904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454882
3063	NC_022521	GGA	2	6	227908	227913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454882
3064	NC_022521	TAG	2	6	228039	228044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454882
3065	NC_022521	GTA	2	6	228139	228144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454882
3066	NC_022521	CGT	2	6	228153	228158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454882
3067	NC_022521	CCT	2	6	228163	228168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454882
3068	NC_022521	CTC	2	6	228238	228243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454882
3069	NC_022521	CAA	2	6	228276	228281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454882
3070	NC_022521	CCG	2	6	228332	228337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454882
3071	NC_022521	GAA	2	6	228381	228386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454882
3072	NC_022521	CGG	2	6	228897	228902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454883
3073	NC_022521	ACA	2	6	228934	228939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454883
3074	NC_022521	TCC	2	6	228957	228962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454883
3075	NC_022521	TTG	2	6	229072	229077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454883
3076	NC_022521	GAA	2	6	229083	229088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549454883
3077	NC_022521	GCC	2	6	229108	229113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454883
3078	NC_022521	CTC	2	6	229170	229175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454883
3079	NC_022521	TCG	2	6	229186	229191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454883
3080	NC_022521	CAG	2	6	229328	229333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454883
3081	NC_022521	CTC	2	6	229568	229573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454884
3082	NC_022521	CTT	2	6	229580	229585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454884
3083	NC_022521	CTC	3	9	229586	229594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454884
3084	NC_022521	CCT	2	6	229654	229659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454884
3085	NC_022521	GTC	2	6	229706	229711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454884
3086	NC_022521	TCG	2	6	229749	229754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454884
3087	NC_022521	CGT	2	6	229765	229770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454884
3088	NC_022521	GCT	2	6	229847	229852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454884
3089	NC_022521	GGA	2	6	230050	230055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454885
3090	NC_022521	AGG	2	6	230064	230069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454885
3091	NC_022521	AGG	2	6	230075	230080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454885
3092	NC_022521	GGA	2	6	230165	230170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454885
3093	NC_022521	TTG	3	9	230175	230183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454885
3094	NC_022521	GGA	2	6	230206	230211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454885
3095	NC_022521	AGG	2	6	230238	230243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454885
3096	NC_022521	GGA	2	6	230260	230265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454885
3097	NC_022521	CTG	2	6	230357	230362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454885
3098	NC_022521	GGA	2	6	230380	230385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454885
3099	NC_022521	CCT	2	6	230442	230447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454886
3100	NC_022521	ACA	2	6	230468	230473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454886
3101	NC_022521	CCT	2	6	230496	230501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454886
3102	NC_022521	CTC	2	6	230510	230515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454886
3103	NC_022521	CTT	2	6	230623	230628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454886
3104	NC_022521	GTC	2	6	230683	230688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454886
3105	NC_022521	CAA	2	6	230709	230714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454886
3106	NC_022521	TGA	2	6	230715	230720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454886
3107	NC_022521	CAG	2	6	230728	230733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454886
3108	NC_022521	CCA	2	6	230769	230774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454886
3109	NC_022521	GCC	2	6	230779	230784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454886
3110	NC_022521	CAG	2	6	230889	230894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454886
3111	NC_022521	AGC	2	6	230960	230965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454886
3112	NC_022521	CCG	2	6	231180	231185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454886
3113	NC_022521	AAC	2	6	231211	231216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454886
3114	NC_022521	TCC	2	6	231290	231295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454886
3115	NC_022521	CCT	2	6	231381	231386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454886
3116	NC_022521	ACA	2	6	231425	231430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454886
3117	NC_022521	GCT	2	6	231459	231464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454886
3118	NC_022521	GAG	2	6	231613	231618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454886
3119	NC_022521	GAG	2	6	231631	231636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454886
3120	NC_022521	CCA	2	6	231651	231656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454886
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3241	NC_022521	TCG	2	6	239653	239658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454893
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3358	NC_022521	CCA	2	6	246852	246857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549454898
3359	NC_022521	ATT	2	6	246914	246919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454898
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3362	NC_022521	CCT	2	6	247109	247114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454899
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3370	NC_022521	CGC	2	6	247455	247460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454899
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3464	NC_022521	CCT	2	6	253862	253867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454912
3465	NC_022521	AAC	2	6	253925	253930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454912
3466	NC_022521	TCT	2	6	253978	253983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454912
3467	NC_022521	CTC	2	6	253986	253991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454912
3468	NC_022521	CTT	2	6	254009	254014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454912
3469	NC_022521	GTA	2	6	254018	254023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549454912
3470	NC_022521	TGC	2	6	254034	254039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454912
3471	NC_022521	ACT	2	6	254040	254045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549454912
3472	NC_022521	TCC	2	6	254050	254055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454912
3473	NC_022521	CCG	2	6	254203	254208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549454912
3474	NC_022521	GAG	2	6	254452	254457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454913
3475	NC_022521	GTG	2	6	254460	254465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549454913
3476	NC_022521	TCC	2	6	254536	254541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454914
3477	NC_022521	TCT	2	6	254632	254637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549454914
3478	NC_022521	CTC	2	6	254642	254647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454914
3479	NC_022521	CCT	3	9	254724	254732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454915
3480	NC_022521	CTC	2	6	254734	254739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454915
3481	NC_022521	TCC	2	6	254786	254791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454915
3482	NC_022521	CCT	2	6	254835	254840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454915
3483	NC_022521	CCT	3	9	254844	254852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454915
3484	NC_022521	TAT	2	6	254896	254901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454915
3485	NC_022521	CGA	2	6	254955	254960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454915
3486	NC_022521	CCT	2	6	255109	255114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454915
3487	NC_022521	GCT	2	6	255189	255194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454915
3488	NC_022521	CCT	2	6	255240	255245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454915
3489	NC_022521	CCT	2	6	255250	255255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454915
3490	NC_022521	TAT	2	6	255277	255282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549454915
3491	NC_022521	CTG	2	6	255347	255352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549454915
3492	NC_022521	GAG	2	6	255403	255408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549454915
3493	NC_022521	AAC	2	6	255430	255435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454915
3494	NC_022521	TTG	2	6	255600	255605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549454916
3495	NC_022521	GCG	2	6	255606	255611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454916
3496	NC_022521	CAG	2	6	255629	255634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549454916
3497	NC_022521	GGC	2	6	255650	255655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549454916
3498	NC_022521	CCT	2	6	255704	255709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454916
3499	NC_022521	CCT	2	6	255731	255736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549454916
3500	NC_022521	ACA	2	6	255762	255767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549454916

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