MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp5

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021993	TTA	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232702
2	NC_021993	GCA	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232702
3	NC_021993	ATC	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232702
4	NC_021993	GGT	2	6	1211	1216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232702
5	NC_021993	TCG	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232702
6	NC_021993	GCT	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232702
7	NC_021993	TGG	2	6	1362	1367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232702
8	NC_021993	AGA	2	6	1796	1801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
9	NC_021993	CCA	2	6	1814	1819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529232703
10	NC_021993	GCA	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232703
11	NC_021993	GCG	2	6	1842	1847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232703
12	NC_021993	GCG	2	6	1903	1908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232703
13	NC_021993	GGC	2	6	1944	1949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232703
14	NC_021993	CAA	2	6	2070	2075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232703
15	NC_021993	GCC	2	6	2284	2289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232703
16	NC_021993	CCG	2	6	2361	2366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232703
17	NC_021993	CCG	2	6	2451	2456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232703
18	NC_021993	GAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
19	NC_021993	GAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
20	NC_021993	CAT	2	6	2538	2543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232703
21	NC_021993	TTG	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232703
22	NC_021993	GAG	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529232703
23	NC_021993	CAT	2	6	2668	2673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232703
24	NC_021993	CGT	3	9	2728	2736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232703
25	NC_021993	TTG	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232703
26	NC_021993	GAA	2	6	2832	2837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232703
27	NC_021993	TGG	2	6	2927	2932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232703
28	NC_021993	GAT	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232703
29	NC_021993	CAT	2	6	3047	3052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232703
30	NC_021993	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232704
31	NC_021993	GCC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232705
32	NC_021993	CAG	2	6	3643	3648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232705
33	NC_021993	TGC	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232705
34	NC_021993	GGC	2	6	3856	3861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232706
35	NC_021993	GTG	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232706
36	NC_021993	TCG	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232706
37	NC_021993	TTC	2	6	4125	4130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232706
38	NC_021993	CAA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232707
39	NC_021993	CAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232707
40	NC_021993	TCG	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232707
41	NC_021993	GCA	2	6	4348	4353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232707
42	NC_021993	CGC	2	6	4381	4386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232707
43	NC_021993	CAT	3	9	4387	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232707
44	NC_021993	CAT	3	9	4450	4458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232707
45	NC_021993	GCC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232708
46	NC_021993	TGC	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232708
47	NC_021993	CGC	2	6	5492	5497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232709
48	NC_021993	TCA	2	6	5645	5650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232709
49	NC_021993	GCT	2	6	5681	5686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232709
50	NC_021993	GGT	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232709
51	NC_021993	TCA	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232709
52	NC_021993	GTT	2	6	5814	5819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232709
53	NC_021993	GGT	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529232709
54	NC_021993	TGT	2	6	5880	5885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232709
55	NC_021993	GCT	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232709
56	NC_021993	TGC	2	6	6276	6281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232710
57	NC_021993	TGT	2	6	6446	6451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232710
58	NC_021993	GCG	2	6	6461	6466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232710
59	NC_021993	GCA	2	6	6467	6472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232710
60	NC_021993	TGA	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232710
61	NC_021993	TGC	2	6	6615	6620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232710
62	NC_021993	GGC	2	6	6631	6636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232710
63	NC_021993	GAA	2	6	6752	6757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529232710
64	NC_021993	CAA	2	6	7016	7021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529232711
65	NC_021993	AGC	2	6	7074	7079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232711
66	NC_021993	CTT	2	6	7140	7145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232711
67	NC_021993	GTC	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529232711
68	NC_021993	AAT	2	6	7357	7362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232712
69	NC_021993	ATG	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232712
70	NC_021993	TTA	2	6	7681	7686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529232712
71	NC_021993	TTC	2	6	7692	7697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232712
72	NC_021993	CTT	2	6	7816	7821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529232712
73	NC_021993	CGG	2	6	8038	8043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529232712
74	NC_021993	TTG	2	6	8059	8064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529232712
75	NC_021993	TGA	2	6	8111	8116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529232712
76	NC_021993	GCA	2	6	8181	8186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529232712
77	NC_021993	GCC	2	6	8217	8222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529232712
78	NC_021993	TAC	2	6	8335	8340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529232712
79	NC_021993	ATA	2	6	8373	8378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529232712

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.