MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp1

Total Repeats: 407

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021976	CCAG	2	8	309	316	25 %	0 %	25 %	50 %	529218540
2	NC_021976	GGGA	2	8	1135	1142	25 %	0 %	75 %	0 %	529218541
3	NC_021976	ACCA	2	8	1307	1314	50 %	0 %	0 %	50 %	529218541
4	NC_021976	GCAG	2	8	1591	1598	25 %	0 %	50 %	25 %	529218541
5	NC_021976	CGGT	2	8	1731	1738	0 %	25 %	50 %	25 %	529218541
6	NC_021976	ATTG	2	8	2022	2029	25 %	50 %	25 %	0 %	529218542
7	NC_021976	TGCG	2	8	3134	3141	0 %	25 %	50 %	25 %	529218542
8	NC_021976	GCGT	2	8	3549	3556	0 %	25 %	50 %	25 %	529218543
9	NC_021976	GATG	2	8	4896	4903	25 %	25 %	50 %	0 %	529218544
10	NC_021976	GGAT	2	8	4982	4989	25 %	25 %	50 %	0 %	529218544
11	NC_021976	GTTC	2	8	5001	5008	0 %	50 %	25 %	25 %	529218544
12	NC_021976	GGCT	2	8	5614	5621	0 %	25 %	50 %	25 %	529218545
13	NC_021976	TGAT	2	8	5658	5665	25 %	50 %	25 %	0 %	529218545
14	NC_021976	CAGA	2	8	5778	5785	50 %	0 %	25 %	25 %	529218545
15	NC_021976	GAAA	2	8	6355	6362	75 %	0 %	25 %	0 %	529218546
16	NC_021976	CAGG	2	8	6791	6798	25 %	0 %	50 %	25 %	529218546
17	NC_021976	TCCG	2	8	6931	6938	0 %	25 %	25 %	50 %	529218547
18	NC_021976	GATG	2	8	8052	8059	25 %	25 %	50 %	0 %	529218548
19	NC_021976	GCCA	2	8	8276	8283	25 %	0 %	25 %	50 %	529218548
20	NC_021976	CCGG	2	8	8757	8764	0 %	0 %	50 %	50 %	529218548
21	NC_021976	AGAT	2	8	9123	9130	50 %	25 %	25 %	0 %	529218548
22	NC_021976	GCTG	2	8	10236	10243	0 %	25 %	50 %	25 %	529218549
23	NC_021976	TTGG	2	8	10657	10664	0 %	50 %	50 %	0 %	529218550
24	NC_021976	TGAT	2	8	10934	10941	25 %	50 %	25 %	0 %	529218550
25	NC_021976	CTGT	2	8	10969	10976	0 %	50 %	25 %	25 %	529218550
26	NC_021976	TGGT	2	8	12143	12150	0 %	50 %	50 %	0 %	529218551
27	NC_021976	GATG	2	8	12351	12358	25 %	25 %	50 %	0 %	529218551
28	NC_021976	TGCC	2	8	13582	13589	0 %	25 %	25 %	50 %	529218552
29	NC_021976	CCAG	2	8	13930	13937	25 %	0 %	25 %	50 %	529218553
30	NC_021976	GGGC	2	8	14977	14984	0 %	0 %	75 %	25 %	529218554
31	NC_021976	GCAG	2	8	15453	15460	25 %	0 %	50 %	25 %	529218554
32	NC_021976	AGCT	2	8	16087	16094	25 %	25 %	25 %	25 %	529239391
33	NC_021976	GCTG	2	8	17154	17161	0 %	25 %	50 %	25 %	529218556
34	NC_021976	GAAA	2	8	17311	17318	75 %	0 %	25 %	0 %	529218556
35	NC_021976	CTCA	2	8	17341	17348	25 %	25 %	0 %	50 %	529218556
36	NC_021976	GCGA	2	8	18678	18685	25 %	0 %	50 %	25 %	529218557
37	NC_021976	GCGG	2	8	19186	19193	0 %	0 %	75 %	25 %	529218558
38	NC_021976	CTGG	2	8	19476	19483	0 %	25 %	50 %	25 %	529218558
39	NC_021976	ACCA	2	8	19549	19556	50 %	0 %	0 %	50 %	529218558
40	NC_021976	ATCG	2	8	19848	19855	25 %	25 %	25 %	25 %	529218558
41	NC_021976	TCCG	2	8	19871	19878	0 %	25 %	25 %	50 %	529218558
42	NC_021976	TGGC	2	8	20035	20042	0 %	25 %	50 %	25 %	529218558
43	NC_021976	CCAG	2	8	20141	20148	25 %	0 %	25 %	50 %	529218559
44	NC_021976	ATGA	2	8	21318	21325	50 %	25 %	25 %	0 %	529218559
45	NC_021976	TCCG	2	8	21464	21471	0 %	25 %	25 %	50 %	529218559
46	NC_021976	TCTG	2	8	22088	22095	0 %	50 %	25 %	25 %	529218560
47	NC_021976	CCAG	2	8	22204	22211	25 %	0 %	25 %	50 %	529218560
48	NC_021976	GCGT	2	8	22463	22470	0 %	25 %	50 %	25 %	529218560
49	NC_021976	CTAC	2	8	22957	22964	25 %	25 %	0 %	50 %	529218561
50	NC_021976	TGCC	2	8	23290	23297	0 %	25 %	25 %	50 %	529218561
51	NC_021976	CTGG	2	8	23624	23631	0 %	25 %	50 %	25 %	529218561
52	NC_021976	GCAG	2	8	24483	24490	25 %	0 %	50 %	25 %	529218562
53	NC_021976	TGCG	2	8	24553	24560	0 %	25 %	50 %	25 %	529218562
54	NC_021976	ATCC	2	8	24561	24568	25 %	25 %	0 %	50 %	529218562
55	NC_021976	CGGG	2	8	24772	24779	0 %	0 %	75 %	25 %	529239392
56	NC_021976	ACGC	2	8	25096	25103	25 %	0 %	25 %	50 %	529239392
57	NC_021976	AGAT	2	8	25809	25816	50 %	25 %	25 %	0 %	529218564
58	NC_021976	CCAT	2	8	26373	26380	25 %	25 %	0 %	50 %	529218565
59	NC_021976	GTTC	2	8	27365	27372	0 %	50 %	25 %	25 %	529218567
60	NC_021976	TCTG	2	8	28792	28799	0 %	50 %	25 %	25 %	529218570
61	NC_021976	TTTG	2	8	28802	28809	0 %	75 %	25 %	0 %	529218570
62	NC_021976	TGAA	2	8	29934	29941	50 %	25 %	25 %	0 %	529218571
63	NC_021976	TGTA	2	8	30000	30007	25 %	50 %	25 %	0 %	529218571
64	NC_021976	TGAT	2	8	31827	31834	25 %	50 %	25 %	0 %	529218574
65	NC_021976	GTTT	2	8	32963	32970	0 %	75 %	25 %	0 %	529218576
66	NC_021976	GAAG	2	8	33252	33259	50 %	0 %	50 %	0 %	529218576
67	NC_021976	TTAT	2	8	33519	33526	25 %	75 %	0 %	0 %	529218576
68	NC_021976	GCTG	2	8	34058	34065	0 %	25 %	50 %	25 %	529239393
69	NC_021976	TTCC	2	8	34158	34165	0 %	50 %	0 %	50 %	529239393
70	NC_021976	CTTG	2	8	34235	34242	0 %	50 %	25 %	25 %	529239393
71	NC_021976	ATTG	2	8	34366	34373	25 %	50 %	25 %	0 %	529239393
72	NC_021976	GGTC	2	8	34464	34471	0 %	25 %	50 %	25 %	529218578
73	NC_021976	GACC	2	8	34928	34935	25 %	0 %	25 %	50 %	529218578
74	NC_021976	GCCA	2	8	35795	35802	25 %	0 %	25 %	50 %	529218579
75	NC_021976	TTGA	2	8	38326	38333	25 %	50 %	25 %	0 %	529218585
76	NC_021976	CATG	2	8	38841	38848	25 %	25 %	25 %	25 %	529218585
77	NC_021976	TGAT	2	8	40012	40019	25 %	50 %	25 %	0 %	529218586
78	NC_021976	ACAA	2	8	40034	40041	75 %	0 %	0 %	25 %	529218586
79	NC_021976	CAGA	2	8	40340	40347	50 %	0 %	25 %	25 %	529218587
80	NC_021976	GGGA	2	8	42793	42800	25 %	0 %	75 %	0 %	529218589
81	NC_021976	CAGG	2	8	42819	42826	25 %	0 %	50 %	25 %	529218589
82	NC_021976	GGCG	2	8	42906	42913	0 %	0 %	75 %	25 %	529218589
83	NC_021976	TCCG	2	8	43232	43239	0 %	25 %	25 %	50 %	529218589
84	NC_021976	CCAT	2	8	44657	44664	25 %	25 %	0 %	50 %	529218590
85	NC_021976	GGTC	2	8	46185	46192	0 %	25 %	50 %	25 %	529218592
86	NC_021976	CAGA	2	8	47472	47479	50 %	0 %	25 %	25 %	529218593
87	NC_021976	GAGT	2	8	47535	47542	25 %	25 %	50 %	0 %	529218593
88	NC_021976	CTGA	2	8	48288	48295	25 %	25 %	25 %	25 %	529218595
89	NC_021976	AAAC	2	8	48869	48876	75 %	0 %	0 %	25 %	529218595
90	NC_021976	CATC	2	8	49194	49201	25 %	25 %	0 %	50 %	529218596
91	NC_021976	CGTC	2	8	49626	49633	0 %	25 %	25 %	50 %	529218596
92	NC_021976	CCTT	2	8	49976	49983	0 %	50 %	0 %	50 %	529218597
93	NC_021976	CTTG	2	8	50135	50142	0 %	50 %	25 %	25 %	529218597
94	NC_021976	TCGA	2	8	50326	50333	25 %	25 %	25 %	25 %	529218597
95	NC_021976	CGGG	2	8	50386	50393	0 %	0 %	75 %	25 %	529218597
96	NC_021976	TGGT	2	8	50708	50715	0 %	50 %	50 %	0 %	529218597
97	NC_021976	AGGG	2	8	51197	51204	25 %	0 %	75 %	0 %	529218598
98	NC_021976	GATT	2	8	51914	51921	25 %	50 %	25 %	0 %	529239394
99	NC_021976	TGCT	2	8	53131	53138	0 %	50 %	25 %	25 %	529239395
100	NC_021976	GAAG	2	8	53145	53152	50 %	0 %	50 %	0 %	529239395
101	NC_021976	GACG	2	8	53920	53927	25 %	0 %	50 %	25 %	529218601
102	NC_021976	TGAT	2	8	54171	54178	25 %	50 %	25 %	0 %	529218601
103	NC_021976	ACCG	2	8	54292	54299	25 %	0 %	25 %	50 %	529218602
104	NC_021976	ATGC	2	8	54744	54751	25 %	25 %	25 %	25 %	529218603
105	NC_021976	GTAA	2	8	55213	55220	50 %	25 %	25 %	0 %	529218603
106	NC_021976	TCAC	2	8	55750	55757	25 %	25 %	0 %	50 %	529218604
107	NC_021976	GATG	2	8	55858	55865	25 %	25 %	50 %	0 %	529218604
108	NC_021976	GATC	2	8	56111	56118	25 %	25 %	25 %	25 %	529218605
109	NC_021976	CCAG	2	8	56173	56180	25 %	0 %	25 %	50 %	529218605
110	NC_021976	TCTT	2	8	56988	56995	0 %	75 %	0 %	25 %	529218606
111	NC_021976	CCTT	2	8	57301	57308	0 %	50 %	0 %	50 %	529218606
112	NC_021976	CGTG	2	8	57325	57332	0 %	25 %	50 %	25 %	529218606
113	NC_021976	CTGC	2	8	57524	57531	0 %	25 %	25 %	50 %	529218606
114	NC_021976	CCTC	2	8	57564	57571	0 %	25 %	0 %	75 %	529218606
115	NC_021976	TTGA	2	8	57986	57993	25 %	50 %	25 %	0 %	529218606
116	NC_021976	GTAA	2	8	58695	58702	50 %	25 %	25 %	0 %	529218606
117	NC_021976	CTGC	2	8	59089	59096	0 %	25 %	25 %	50 %	529218607
118	NC_021976	TCAG	2	8	59434	59441	25 %	25 %	25 %	25 %	529218608
119	NC_021976	AGGG	2	8	59557	59564	25 %	0 %	75 %	0 %	529218608
120	NC_021976	TGTC	2	8	60239	60246	0 %	50 %	25 %	25 %	529218611
121	NC_021976	ACCG	2	8	60919	60926	25 %	0 %	25 %	50 %	529218613
122	NC_021976	CAGG	2	8	61348	61355	25 %	0 %	50 %	25 %	529218614
123	NC_021976	CGGC	2	8	61486	61493	0 %	0 %	50 %	50 %	529218614
124	NC_021976	CGGA	2	8	62538	62545	25 %	0 %	50 %	25 %	529218616
125	NC_021976	AAAG	2	8	62912	62919	75 %	0 %	25 %	0 %	529218617
126	NC_021976	GCCC	2	8	63154	63161	0 %	0 %	25 %	75 %	529218617
127	NC_021976	TGGC	2	8	63213	63220	0 %	25 %	50 %	25 %	529218617
128	NC_021976	CTTC	2	8	64156	64163	0 %	50 %	0 %	50 %	529218619
129	NC_021976	TTTC	2	8	64186	64193	0 %	75 %	0 %	25 %	529218619
130	NC_021976	TGGC	2	8	64485	64492	0 %	25 %	50 %	25 %	529218620
131	NC_021976	TGGC	2	8	64569	64576	0 %	25 %	50 %	25 %	529218620
132	NC_021976	AGGG	2	8	64923	64930	25 %	0 %	75 %	0 %	529218620
133	NC_021976	GGAC	2	8	65826	65833	25 %	0 %	50 %	25 %	529218621
134	NC_021976	ACGC	2	8	66321	66328	25 %	0 %	25 %	50 %	529218622
135	NC_021976	AGGC	2	8	67191	67198	25 %	0 %	50 %	25 %	529218622
136	NC_021976	CGGG	2	8	67491	67498	0 %	0 %	75 %	25 %	529218623
137	NC_021976	AAAG	2	8	67639	67646	75 %	0 %	25 %	0 %	529218623
138	NC_021976	GTTC	2	8	67912	67919	0 %	50 %	25 %	25 %	529218623
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140	NC_021976	CGGA	2	8	69258	69265	25 %	0 %	50 %	25 %	529218623
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.