MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 22155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021881	TCTT	2	8	82386	82393	0 %	75 %	0 %	25 %	526464146
1502	NC_021881	TCC	2	6	82428	82433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464146
1503	NC_021881	GCA	2	6	82502	82507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464146
1504	NC_021881	ATG	2	6	82617	82622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464146
1505	NC_021881	GA	3	6	83150	83155	50 %	0 %	50 %	0 %	526464744
1506	NC_021881	TG	3	6	83186	83191	0 %	50 %	50 %	0 %	526464744
1507	NC_021881	GTG	3	9	83189	83197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464744
1508	NC_021881	GCGA	2	8	83206	83213	25 %	0 %	50 %	25 %	526464744
1509	NC_021881	GCA	2	6	83232	83237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464744
1510	NC_021881	GTA	2	6	83276	83281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464744
1511	NC_021881	CAT	2	6	83294	83299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464744
1512	NC_021881	CAACGC	2	12	83340	83351	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	526464744
1513	NC_021881	TAG	2	6	83366	83371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464744
1514	NC_021881	A	6	6	83387	83392	100 %	0 %	0 %	0 %	526464744
1515	NC_021881	CTA	2	6	83407	83412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464744
1516	NC_021881	GGT	2	6	83428	83433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526464744
1517	NC_021881	GTT	2	6	83437	83442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464744
1518	NC_021881	CACCCT	2	12	83494	83505	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	526464745
1519	NC_021881	CAA	2	6	83977	83982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464147
1520	NC_021881	TGC	2	6	84043	84048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464147
1521	NC_021881	TAGCTA	2	12	84270	84281	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526464147
1522	NC_021881	CAAA	2	8	84339	84346	75 %	0 %	0 %	25 %	526464147
1523	NC_021881	AGT	2	6	84369	84374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464147
1524	NC_021881	TAA	2	6	84376	84381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464147
1525	NC_021881	A	6	6	84380	84385	100 %	0 %	0 %	0 %	526464147
1526	NC_021881	GCA	2	6	84386	84391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464147
1527	NC_021881	GAA	2	6	84411	84416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464147
1528	NC_021881	GAG	2	6	84441	84446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464147
1529	NC_021881	A	6	6	84490	84495	100 %	0 %	0 %	0 %	526464147
1530	NC_021881	ATACAG	2	12	84522	84533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	526464147
1531	NC_021881	TCA	2	6	84539	84544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464147
1532	NC_021881	AAC	2	6	84545	84550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464147
1533	NC_021881	A	6	6	84571	84576	100 %	0 %	0 %	0 %	526464147
1534	NC_021881	TG	3	6	84619	84624	0 %	50 %	50 %	0 %	526464147
1535	NC_021881	GAA	2	6	84742	84747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464147
1536	NC_021881	ACA	2	6	84749	84754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464147
1537	NC_021881	AAC	2	6	84773	84778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464147
1538	NC_021881	TGA	2	6	84807	84812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464147
1539	NC_021881	AGGA	2	8	84853	84860	50 %	0 %	50 %	0 %	526464147
1540	NC_021881	GCA	2	6	85059	85064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464148
1541	NC_021881	TTG	2	6	85135	85140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464148
1542	NC_021881	TCT	2	6	85148	85153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464148
1543	NC_021881	CAC	2	6	85224	85229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464148
1544	NC_021881	AGT	2	6	85370	85375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464149
1545	NC_021881	GAA	2	6	85382	85387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464149
1546	NC_021881	TAA	2	6	85503	85508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464149
1547	NC_021881	TGA	2	6	85543	85548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464149
1548	NC_021881	TGA	2	6	85573	85578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464149
1549	NC_021881	CTG	2	6	86058	86063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464150
1550	NC_021881	CTA	2	6	86075	86080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464150
1551	NC_021881	CAAT	2	8	86111	86118	50 %	25 %	0 %	25 %	526464150
1552	NC_021881	TGA	2	6	86158	86163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464150
1553	NC_021881	ATCT	2	8	86187	86194	25 %	50 %	0 %	25 %	526464150
1554	NC_021881	CAC	2	6	86254	86259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464150
1555	NC_021881	CAA	2	6	86273	86278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464150
1556	NC_021881	ATTT	2	8	86359	86366	25 %	75 %	0 %	0 %	526464151
1557	NC_021881	CCGTA	2	10	86437	86446	20 %	20 %	20 %	40 %	526464151
1558	NC_021881	CGT	2	6	86594	86599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464151
1559	NC_021881	ATA	2	6	86726	86731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464151
1560	NC_021881	CCA	2	6	86737	86742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464151
1561	NC_021881	CAG	2	6	86744	86749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464151
1562	NC_021881	GCC	2	6	86757	86762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464151
1563	NC_021881	AGCC	2	8	86805	86812	25 %	0 %	25 %	50 %	526464151
1564	NC_021881	ATA	2	6	86856	86861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464151
1565	NC_021881	AAC	2	6	86923	86928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464151
1566	NC_021881	ATC	2	6	87084	87089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464151
1567	NC_021881	TA	3	6	87552	87557	50 %	50 %	0 %	0 %	526464152
1568	NC_021881	CTT	2	6	87604	87609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464152
1569	NC_021881	TCTCG	2	10	87612	87621	0 %	40 %	20 %	40 %	526464152
1570	NC_021881	TAT	2	6	87708	87713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464152
1571	NC_021881	CTT	2	6	87729	87734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464152
1572	NC_021881	GCA	2	6	87833	87838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464152
1573	NC_021881	CAC	2	6	87912	87917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464152
1574	NC_021881	ATT	2	6	87976	87981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464152
1575	NC_021881	CTA	2	6	87984	87989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464152
1576	NC_021881	ACA	2	6	87995	88000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464152
1577	NC_021881	TGC	2	6	88015	88020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464152
1578	NC_021881	ACC	2	6	88204	88209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464152
1579	NC_021881	GAA	2	6	88220	88225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464152
1580	NC_021881	CTT	2	6	88232	88237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464152
1581	NC_021881	AGT	2	6	88241	88246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464152
1582	NC_021881	GAT	2	6	88277	88282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464152
1583	NC_021881	CAG	2	6	88350	88355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464152
1584	NC_021881	CTT	2	6	88362	88367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464152
1585	NC_021881	AT	3	6	88373	88378	50 %	50 %	0 %	0 %	526464152
1586	NC_021881	CCT	2	6	88506	88511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464152
1587	NC_021881	TAC	2	6	88539	88544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464152
1588	NC_021881	TAC	2	6	88593	88598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464746
1589	NC_021881	TAG	2	6	88609	88614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464746
1590	NC_021881	CA	3	6	88806	88811	50 %	0 %	0 %	50 %	526464746
1591	NC_021881	AACGC	2	10	88882	88891	40 %	0 %	20 %	40 %	526464746
1592	NC_021881	TGC	2	6	88920	88925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464746
1593	NC_021881	CTT	2	6	88945	88950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464746
1594	NC_021881	TC	3	6	89061	89066	0 %	50 %	0 %	50 %	526464746
1595	NC_021881	GCGG	2	8	89117	89124	0 %	0 %	75 %	25 %	526464746
1596	NC_021881	C	6	6	89145	89150	0 %	0 %	0 %	100 %	526464746
1597	NC_021881	A	6	6	89163	89168	100 %	0 %	0 %	0 %	526464746
1598	NC_021881	GCA	2	6	89203	89208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464746
1599	NC_021881	TTC	2	6	89246	89251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464746
1600	NC_021881	ATA	2	6	89411	89416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526464746
1601	NC_021881	TG	4	8	89429	89436	0 %	50 %	50 %	0 %	526464746
1602	NC_021881	AAG	2	6	93995	94000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464153
1603	NC_021881	CAT	2	6	94032	94037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464153
1604	NC_021881	CAG	2	6	94098	94103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464153
1605	NC_021881	CAG	2	6	94128	94133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464153
1606	NC_021881	TCT	2	6	94136	94141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464153
1607	NC_021881	ATT	2	6	94166	94171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464153
1608	NC_021881	GTACT	2	10	94392	94401	20 %	40 %	20 %	20 %	526464153
1609	NC_021881	AAC	2	6	94432	94437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464153
1610	NC_021881	G	6	6	94530	94535	0 %	0 %	100 %	0 %	526464154
1611	NC_021881	GCC	2	6	94679	94684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464154
1612	NC_021881	AGC	2	6	94709	94714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464154
1613	NC_021881	GAAT	2	8	94750	94757	50 %	25 %	25 %	0 %	526464154
1614	NC_021881	TAC	2	6	94759	94764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464154
1615	NC_021881	CCTT	2	8	94794	94801	0 %	50 %	0 %	50 %	526464154
1616	NC_021881	TCA	2	6	94878	94883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464154
1617	NC_021881	ATC	2	6	94905	94910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464154
1618	NC_021881	ACA	2	6	94911	94916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464154
1619	NC_021881	GCA	2	6	94926	94931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464154
1620	NC_021881	CCA	2	6	94965	94970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464154
1621	NC_021881	ACTCCG	2	12	94980	94991	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526464154
1622	NC_021881	ACAG	2	8	95000	95007	50 %	0 %	25 %	25 %	526464154
1623	NC_021881	CTG	2	6	95137	95142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464154
1624	NC_021881	TATT	2	8	95206	95213	25 %	75 %	0 %	0 %	526464154
1625	NC_021881	ACT	2	6	95244	95249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464154
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1747	NC_021881	TCT	2	6	102536	102541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464161
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1995	NC_021881	AT	3	6	117351	117356	50 %	50 %	0 %	0 %	526464168
1996	NC_021881	TC	3	6	117367	117372	0 %	50 %	0 %	50 %	526464168
1997	NC_021881	AG	3	6	117396	117401	50 %	0 %	50 %	0 %	526464168
1998	NC_021881	TCT	2	6	117443	117448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464168
1999	NC_021881	TTTG	2	8	117488	117495	0 %	75 %	25 %	0 %	526464756
2000	NC_021881	T	6	6	117524	117529	0 %	100 %	0 %	0 %	526464756

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