MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 15221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021880	TCG	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462841
2	NC_021880	TAT	2	6	179	184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462841
3	NC_021880	AGG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462841
4	NC_021880	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462841
5	NC_021880	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462841
6	NC_021880	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462841
7	NC_021880	TAC	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462841
8	NC_021880	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462841
9	NC_021880	ATA	2	6	678	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526462841
10	NC_021880	CTG	2	6	714	719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462841
11	NC_021880	ATG	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462841
12	NC_021880	TGC	2	6	991	996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462841
13	NC_021880	AGT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462841
14	NC_021880	GGA	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462841
15	NC_021880	TGC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462841
16	NC_021880	CAG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462841
17	NC_021880	GGC	2	6	1201	1206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526462841
18	NC_021880	GTT	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462841
19	NC_021880	ATG	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462841
20	NC_021880	ATG	2	6	1265	1270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462841
21	NC_021880	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462841
22	NC_021880	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462841
23	NC_021880	TGA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462841
24	NC_021880	GAA	3	9	1595	1603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462841
25	NC_021880	CAG	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462841
26	NC_021880	AGC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462841
27	NC_021880	ATT	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462841
28	NC_021880	CGT	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462841
29	NC_021880	TAT	2	6	2132	2137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462841
30	NC_021880	AGA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462841
31	NC_021880	ACA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526462841
32	NC_021880	GGA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462841
33	NC_021880	AGT	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462841
34	NC_021880	ATT	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462841
35	NC_021880	AGA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462841
36	NC_021880	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462841
37	NC_021880	AAG	2	6	2586	2591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462841
38	NC_021880	TGT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462842
39	NC_021880	AGC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462842
40	NC_021880	TGA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462842
41	NC_021880	ATC	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462842
42	NC_021880	TAA	2	6	3196	3201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526462842
43	NC_021880	CAC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526462842
44	NC_021880	GGA	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462842
45	NC_021880	GAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462842
46	NC_021880	TCA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462842
47	NC_021880	TGG	2	6	3422	3427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462842
48	NC_021880	GTT	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462842
49	NC_021880	TGC	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462842
50	NC_021880	GCT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462843
51	NC_021880	TAG	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462843
52	NC_021880	GCG	2	6	3933	3938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526462843
53	NC_021880	TGT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462843
54	NC_021880	GAG	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462843
55	NC_021880	ACA	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526462843
56	NC_021880	AGC	2	6	4301	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462843
57	NC_021880	CAA	3	9	4403	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526462844
58	NC_021880	GTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462844
59	NC_021880	AGG	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462844
60	NC_021880	TAT	2	6	4811	4816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462844
61	NC_021880	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462844
62	NC_021880	GGT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462844
63	NC_021880	TTA	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463469
64	NC_021880	TAT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463469
65	NC_021880	ATG	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463469
66	NC_021880	ATG	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463469
67	NC_021880	ATG	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463469
68	NC_021880	TTC	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463469
69	NC_021880	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463470
70	NC_021880	GGA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463470
71	NC_021880	TGT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526463470
72	NC_021880	GTG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526463470
73	NC_021880	TCA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463470
74	NC_021880	TAT	2	6	6642	6647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463470
75	NC_021880	TCC	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526463470
76	NC_021880	CTA	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463470
77	NC_021880	GGA	2	6	6799	6804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526463470
78	NC_021880	ATA	2	6	6841	6846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526463470
79	NC_021880	TGA	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463470
80	NC_021880	TGA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463470
81	NC_021880	TGT	2	6	7183	7188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462845
82	NC_021880	GAA	3	9	7214	7222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462845
83	NC_021880	TGG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462845
84	NC_021880	ATT	2	6	7341	7346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462845
85	NC_021880	AAG	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462845
86	NC_021880	TGC	2	6	7465	7470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462845
87	NC_021880	TAG	2	6	7477	7482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462845
88	NC_021880	GCG	2	6	7539	7544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526462845
89	NC_021880	TGG	2	6	7677	7682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462845
90	NC_021880	TAC	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462846
91	NC_021880	CCG	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526462846
92	NC_021880	CCT	2	6	8355	8360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526462846
93	NC_021880	TCT	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462846
94	NC_021880	GAT	2	6	8427	8432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462846
95	NC_021880	TTG	2	6	8465	8470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462846
96	NC_021880	TCA	2	6	8481	8486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462846
97	NC_021880	TGC	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462846
98	NC_021880	CTT	2	6	8711	8716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462846
99	NC_021880	ACT	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462846
100	NC_021880	TCC	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526462846
101	NC_021880	CTA	2	6	8866	8871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462846
102	NC_021880	AGT	2	6	8962	8967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462846
103	NC_021880	ATC	2	6	8975	8980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462846
104	NC_021880	TAA	2	6	9034	9039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526462846
105	NC_021880	TGT	2	6	9046	9051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462846
106	NC_021880	TAC	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462847
107	NC_021880	TGT	2	6	9350	9355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462847
108	NC_021880	GGT	2	6	9363	9368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462847
109	NC_021880	TAG	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462847
110	NC_021880	GAA	2	6	9432	9437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462847
111	NC_021880	ATG	2	6	9526	9531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462847
112	NC_021880	ATC	2	6	9539	9544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462847
113	NC_021880	ATG	2	6	9568	9573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462847
114	NC_021880	GCT	2	6	9580	9585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462847
115	NC_021880	TGA	2	6	9614	9619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462847
116	NC_021880	TTA	2	6	9691	9696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462847
117	NC_021880	CAT	2	6	9894	9899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462847
118	NC_021880	AGA	2	6	10031	10036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462847
119	NC_021880	ACT	2	6	10046	10051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462847
120	NC_021880	ATA	2	6	10248	10253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526462847
121	NC_021880	AGA	2	6	10407	10412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462847
122	NC_021880	CAA	2	6	10414	10419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526462847
123	NC_021880	CTT	2	6	11582	11587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526463471
124	NC_021880	ATC	2	6	11600	11605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463471
125	NC_021880	CAA	2	6	11641	11646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463471
126	NC_021880	TAT	2	6	11728	11733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526463471
127	NC_021880	ACC	2	6	11744	11749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526463471
128	NC_021880	ACA	2	6	11787	11792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463471
129	NC_021880	ATC	2	6	11856	11861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463471
130	NC_021880	CAT	2	6	12086	12091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526463471
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132	NC_021880	CAT	2	6	12622	12627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462848
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223	NC_021880	TAT	2	6	19582	19587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462854
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252	NC_021880	TAC	2	6	22002	22007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462856
253	NC_021880	TGC	2	6	22165	22170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462856
254	NC_021880	AGA	2	6	22174	22179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526462856
255	NC_021880	TCT	2	6	22188	22193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462856
256	NC_021880	TAT	2	6	22224	22229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526462856
257	NC_021880	TCA	2	6	22285	22290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462856
258	NC_021880	TGT	2	6	22627	22632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462857
259	NC_021880	GGA	2	6	22656	22661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462857
260	NC_021880	GGA	2	6	22688	22693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462857
261	NC_021880	TAC	2	6	22880	22885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462857
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271	NC_021880	CAA	2	6	23893	23898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526463473
272	NC_021880	TGA	2	6	23907	23912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463473
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275	NC_021880	GTA	2	6	24037	24042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526463473
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285	NC_021880	GAG	2	6	24817	24822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526462858
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292	NC_021880	TAA	2	6	25220	25225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526462858
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