MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. HZ2

Total Repeats: 22326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021879	ATT	2	6	82184	82189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461641
1502	NC_021879	TCT	2	6	82254	82259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461641
1503	NC_021879	CATG	2	8	82307	82314	25 %	25 %	25 %	25 %	526461641
1504	NC_021879	TGC	2	6	82330	82335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461641
1505	NC_021879	TGT	2	6	82400	82405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461641
1506	NC_021879	TCTT	2	8	82417	82424	0 %	75 %	0 %	25 %	526461641
1507	NC_021879	TCC	2	6	82459	82464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526461641
1508	NC_021879	GCA	2	6	82533	82538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461641
1509	NC_021879	ATG	2	6	82648	82653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461641
1510	NC_021879	GA	3	6	83181	83186	50 %	0 %	50 %	0 %	526462242
1511	NC_021879	TG	3	6	83217	83222	0 %	50 %	50 %	0 %	526462242
1512	NC_021879	GTG	3	9	83220	83228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462242
1513	NC_021879	GCGA	2	8	83237	83244	25 %	0 %	50 %	25 %	526462242
1514	NC_021879	GCA	2	6	83263	83268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462242
1515	NC_021879	GTA	2	6	83307	83312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462242
1516	NC_021879	CAT	2	6	83325	83330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462242
1517	NC_021879	CAACGC	2	12	83371	83382	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	526462242
1518	NC_021879	TAG	2	6	83397	83402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462242
1519	NC_021879	A	6	6	83418	83423	100 %	0 %	0 %	0 %	526462242
1520	NC_021879	CTA	2	6	83438	83443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462242
1521	NC_021879	GGT	2	6	83459	83464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526462242
1522	NC_021879	GTT	2	6	83468	83473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526462242
1523	NC_021879	CAA	2	6	84008	84013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461642
1524	NC_021879	TGC	2	6	84074	84079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461642
1525	NC_021879	TAGCTA	2	12	84301	84312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526461642
1526	NC_021879	CAAA	2	8	84370	84377	75 %	0 %	0 %	25 %	526461642
1527	NC_021879	AGT	2	6	84400	84405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461642
1528	NC_021879	TAA	2	6	84407	84412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461642
1529	NC_021879	A	6	6	84411	84416	100 %	0 %	0 %	0 %	526461642
1530	NC_021879	GCA	2	6	84417	84422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461642
1531	NC_021879	GAA	2	6	84442	84447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461642
1532	NC_021879	GAG	2	6	84472	84477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526461642
1533	NC_021879	A	6	6	84521	84526	100 %	0 %	0 %	0 %	526461642
1534	NC_021879	ATACAG	2	12	84553	84564	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	526461642
1535	NC_021879	TCA	2	6	84570	84575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461642
1536	NC_021879	AAC	2	6	84576	84581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461642
1537	NC_021879	A	6	6	84602	84607	100 %	0 %	0 %	0 %	526461642
1538	NC_021879	TG	3	6	84650	84655	0 %	50 %	50 %	0 %	526461642
1539	NC_021879	GAA	2	6	84773	84778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461642
1540	NC_021879	ACA	2	6	84780	84785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461642
1541	NC_021879	AAC	2	6	84804	84809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461642
1542	NC_021879	TGA	2	6	84838	84843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461642
1543	NC_021879	AGGA	2	8	84884	84891	50 %	0 %	50 %	0 %	526461642
1544	NC_021879	GCA	2	6	85090	85095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461643
1545	NC_021879	TTG	2	6	85166	85171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526461643
1546	NC_021879	TCT	2	6	85179	85184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461643
1547	NC_021879	CAC	2	6	85255	85260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526461643
1548	NC_021879	AGT	2	6	85401	85406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461644
1549	NC_021879	GAA	2	6	85413	85418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461644
1550	NC_021879	TAA	2	6	85534	85539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461644
1551	NC_021879	TGA	2	6	85574	85579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461644
1552	NC_021879	TGA	2	6	85604	85609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461644
1553	NC_021879	CTG	2	6	86089	86094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461645
1554	NC_021879	CTA	2	6	86106	86111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461645
1555	NC_021879	CAAT	2	8	86142	86149	50 %	25 %	0 %	25 %	526461645
1556	NC_021879	TGA	2	6	86189	86194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461645
1557	NC_021879	ATCT	2	8	86218	86225	25 %	50 %	0 %	25 %	526461645
1558	NC_021879	CAC	2	6	86285	86290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526461645
1559	NC_021879	CAA	2	6	86304	86309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461645
1560	NC_021879	ATTT	2	8	86390	86397	25 %	75 %	0 %	0 %	526461646
1561	NC_021879	CCGTA	2	10	86468	86477	20 %	20 %	20 %	40 %	526461646
1562	NC_021879	CGT	2	6	86625	86630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461646
1563	NC_021879	ATA	2	6	86757	86762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461646
1564	NC_021879	CCA	2	6	86768	86773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526461646
1565	NC_021879	CAG	2	6	86775	86780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461646
1566	NC_021879	GCC	2	6	86788	86793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526461646
1567	NC_021879	AGCC	2	8	86836	86843	25 %	0 %	25 %	50 %	526461646
1568	NC_021879	ATA	2	6	86887	86892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526461646
1569	NC_021879	AAC	2	6	86954	86959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461646
1570	NC_021879	ATC	2	6	87115	87120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461646
1571	NC_021879	TA	3	6	87583	87588	50 %	50 %	0 %	0 %	526461647
1572	NC_021879	CTT	2	6	87635	87640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461647
1573	NC_021879	TCTCG	2	10	87643	87652	0 %	40 %	20 %	40 %	526461647
1574	NC_021879	TAT	2	6	87739	87744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461647
1575	NC_021879	CTT	2	6	87760	87765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461647
1576	NC_021879	GCA	2	6	87864	87869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461647
1577	NC_021879	CAC	2	6	87943	87948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526461647
1578	NC_021879	ATT	2	6	88007	88012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461647
1579	NC_021879	CTA	2	6	88015	88020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461647
1580	NC_021879	ACA	2	6	88026	88031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461647
1581	NC_021879	TGC	2	6	88046	88051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461647
1582	NC_021879	ACC	2	6	88235	88240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526461647
1583	NC_021879	GAA	2	6	88251	88256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461647
1584	NC_021879	CTT	2	6	88263	88268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461647
1585	NC_021879	AGT	2	6	88272	88277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461647
1586	NC_021879	GAT	2	6	88308	88313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461647
1587	NC_021879	CAG	2	6	88381	88386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461647
1588	NC_021879	CTT	2	6	88393	88398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461647
1589	NC_021879	AT	3	6	88404	88409	50 %	50 %	0 %	0 %	526461647
1590	NC_021879	CCT	2	6	88537	88542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526461647
1591	NC_021879	TAC	2	6	88570	88575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461647
1592	NC_021879	TAC	2	6	88624	88629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526462243
1593	NC_021879	TAG	2	6	88640	88645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526462243
1594	NC_021879	CA	3	6	88837	88842	50 %	0 %	0 %	50 %	526462243
1595	NC_021879	AACGC	2	10	88913	88922	40 %	0 %	20 %	40 %	526462243
1596	NC_021879	TGC	2	6	88951	88956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526462243
1597	NC_021879	CTT	2	6	88976	88981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462243
1598	NC_021879	TC	3	6	89092	89097	0 %	50 %	0 %	50 %	526462243
1599	NC_021879	GCGG	2	8	89148	89155	0 %	0 %	75 %	25 %	526462243
1600	NC_021879	C	6	6	89176	89181	0 %	0 %	0 %	100 %	526462243
1601	NC_021879	A	6	6	89194	89199	100 %	0 %	0 %	0 %	526462243
1602	NC_021879	GCA	2	6	89234	89239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526462243
1603	NC_021879	TTC	2	6	89277	89282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526462243
1604	NC_021879	ATA	2	6	89442	89447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526462243
1605	NC_021879	TG	4	8	89460	89467	0 %	50 %	50 %	0 %	526462243
1606	NC_021879	AAG	2	6	94026	94031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526461648
1607	NC_021879	CAT	2	6	94063	94068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461648
1608	NC_021879	CAG	2	6	94129	94134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461648
1609	NC_021879	CAG	2	6	94159	94164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461648
1610	NC_021879	TCT	2	6	94167	94172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461648
1611	NC_021879	ATT	2	6	94197	94202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461648
1612	NC_021879	GTACT	2	10	94423	94432	20 %	40 %	20 %	20 %	526461648
1613	NC_021879	AAC	2	6	94463	94468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461648
1614	NC_021879	G	6	6	94561	94566	0 %	0 %	100 %	0 %	526461649
1615	NC_021879	GCC	2	6	94710	94715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526461649
1616	NC_021879	AGC	2	6	94740	94745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461649
1617	NC_021879	GAAT	2	8	94781	94788	50 %	25 %	25 %	0 %	526461649
1618	NC_021879	TAC	2	6	94790	94795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461649
1619	NC_021879	CCTT	2	8	94825	94832	0 %	50 %	0 %	50 %	526461649
1620	NC_021879	TCA	2	6	94909	94914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461649
1621	NC_021879	ATC	2	6	94936	94941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461649
1622	NC_021879	ACA	2	6	94942	94947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526461649
1623	NC_021879	GCA	2	6	94957	94962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461649
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1625	NC_021879	ACTCCG	2	12	95011	95022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526461649
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1859	NC_021879	TCCA	2	8	109540	109547	25 %	25 %	0 %	50 %	526461660
1860	NC_021879	CGT	2	6	109779	109784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526461660
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1866	NC_021879	CTA	2	6	110774	110779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526461661
1867	NC_021879	T	7	7	110781	110787	0 %	100 %	0 %	0 %	526461661
1868	NC_021879	GAGTTC	2	12	110803	110814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526461661
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1870	NC_021879	TAT	2	6	110865	110870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526461661
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1872	NC_021879	CTT	2	6	110955	110960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526461661
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1994	NC_021879	TGGA	2	8	117172	117179	25 %	25 %	50 %	0 %	526461663
1995	NC_021879	GTA	2	6	117209	117214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526461663
1996	NC_021879	GGT	2	6	117319	117324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526461663
1997	NC_021879	AGC	2	6	117374	117379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526461663
1998	NC_021879	AT	3	6	117383	117388	50 %	50 %	0 %	0 %	526461663
1999	NC_021879	TC	3	6	117399	117404	0 %	50 %	0 %	50 %	526461663
2000	NC_021879	AG	3	6	117428	117433	50 %	0 %	50 %	0 %	526461663

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