MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complete genome

Total Repeats: 173646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021285	C	6	6	325	330	0 %	0 %	0 %	100 %	528981797
2	NC_021285	GCA	2	6	431	436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981797
3	NC_021285	TGC	2	6	485	490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981797
4	NC_021285	GCC	2	6	532	537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981797
5	NC_021285	GACGCC	2	12	591	602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528981797
6	NC_021285	CTG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981797
7	NC_021285	CAT	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528981797
8	NC_021285	GGT	2	6	645	650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528981797
9	NC_021285	GGCC	2	8	702	709	0 %	0 %	50 %	50 %	528981797
10	NC_021285	AGA	2	6	755	760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528981797
11	NC_021285	GGC	2	6	829	834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981797
12	NC_021285	GGC	2	6	879	884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981797
13	NC_021285	CCGGCG	2	12	943	954	0 %	0 %	50 %	50 %	528981797
14	NC_021285	CTG	2	6	955	960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981797
15	NC_021285	AG	3	6	983	988	50 %	0 %	50 %	0 %	528981797
16	NC_021285	TGC	2	6	989	994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981797
17	NC_021285	TGG	2	6	1001	1006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528981797
18	NC_021285	CAC	3	9	1041	1049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981797
19	NC_021285	CGA	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981797
20	NC_021285	CGC	2	6	1177	1182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981797
21	NC_021285	GGC	2	6	1198	1203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981797
22	NC_021285	ATC	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528981797
23	NC_021285	CGG	2	6	1254	1259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981797
24	NC_021285	TCG	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981797
25	NC_021285	CGA	2	6	1281	1286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981797
26	NC_021285	GGC	2	6	1354	1359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981797
27	NC_021285	GGA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528981797
28	NC_021285	GAA	2	6	1425	1430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528981797
29	NC_021285	GC	3	6	1438	1443	0 %	0 %	50 %	50 %	528981797
30	NC_021285	TGG	2	6	1487	1492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528981797
31	NC_021285	CG	3	6	1562	1567	0 %	0 %	50 %	50 %	528981797
32	NC_021285	CGC	2	6	1580	1585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981797
33	NC_021285	GC	3	6	1627	1632	0 %	0 %	50 %	50 %	528981797
34	NC_021285	GTG	2	6	1675	1680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528981797
35	NC_021285	CCT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528981798
36	NC_021285	GC	3	6	2030	2035	0 %	0 %	50 %	50 %	528981798
37	NC_021285	CGG	3	9	2052	2060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981798
38	NC_021285	GGGC	2	8	2081	2088	0 %	0 %	75 %	25 %	528981798
39	NC_021285	TGC	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981798
40	NC_021285	CGGC	2	8	2121	2128	0 %	0 %	50 %	50 %	528981798
41	NC_021285	GC	3	6	2127	2132	0 %	0 %	50 %	50 %	528981798
42	NC_021285	CCA	2	6	2138	2143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981798
43	NC_021285	GC	3	6	2176	2181	0 %	0 %	50 %	50 %	528981798
44	NC_021285	AGG	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528981798
45	NC_021285	GC	3	6	2199	2204	0 %	0 %	50 %	50 %	528981798
46	NC_021285	GCC	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981798
47	NC_021285	CTGG	2	8	2283	2290	0 %	25 %	50 %	25 %	528981798
48	NC_021285	CGA	2	6	2292	2297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981798
49	NC_021285	TGC	2	6	2312	2317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981798
50	NC_021285	GCCGT	2	10	2387	2396	0 %	20 %	40 %	40 %	528981798
51	NC_021285	CCG	2	6	2459	2464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981798
52	NC_021285	GCC	2	6	2521	2526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981798
53	NC_021285	GCA	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981798
54	NC_021285	CAT	2	6	2535	2540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528981798
55	NC_021285	CCAAGG	2	12	2594	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981798
56	NC_021285	CGA	3	9	2622	2630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981798
57	NC_021285	GCG	2	6	2648	2653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981798
58	NC_021285	ATC	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528981798
59	NC_021285	TGCG	2	8	2704	2711	0 %	25 %	50 %	25 %	528981798
60	NC_021285	CAC	2	6	2724	2729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981798
61	NC_021285	CA	3	6	2761	2766	50 %	0 %	0 %	50 %	528981798
62	NC_021285	GCC	2	6	2841	2846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981798
63	NC_021285	CGCTGG	2	12	2876	2887	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528981798
64	NC_021285	GC	3	6	2908	2913	0 %	0 %	50 %	50 %	528981798
65	NC_021285	GGC	2	6	2938	2943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981798
66	NC_021285	C	6	6	3026	3031	0 %	0 %	0 %	100 %	528981798
67	NC_021285	GC	3	6	3063	3068	0 %	0 %	50 %	50 %	528981798
68	NC_021285	GCG	2	6	3162	3167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981798
69	NC_021285	GGCGCT	2	12	3171	3182	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528981798
70	NC_021285	ACC	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981798
71	NC_021285	CCGC	2	8	3236	3243	0 %	0 %	25 %	75 %	528981798
72	NC_021285	GGC	2	6	3252	3257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981798
73	NC_021285	GC	3	6	3261	3266	0 %	0 %	50 %	50 %	528981798
74	NC_021285	GCC	2	6	3340	3345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981799
75	NC_021285	GCC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981799
76	NC_021285	GCC	2	6	3361	3366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981799
77	NC_021285	GCCG	2	8	3412	3419	0 %	0 %	50 %	50 %	528981799
78	NC_021285	GC	3	6	3453	3458	0 %	0 %	50 %	50 %	528981799
79	NC_021285	CGG	2	6	3487	3492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981799
80	NC_021285	CTG	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981800
81	NC_021285	TCA	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528981800
82	NC_021285	CGG	2	6	3652	3657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981800
83	NC_021285	CGGC	2	8	3682	3689	0 %	0 %	50 %	50 %	528981800
84	NC_021285	GCA	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981800
85	NC_021285	GCCAG	2	10	3727	3736	20 %	0 %	40 %	40 %	528981800
86	NC_021285	CG	3	6	3749	3754	0 %	0 %	50 %	50 %	528981800
87	NC_021285	CAC	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981800
88	NC_021285	GC	3	6	3820	3825	0 %	0 %	50 %	50 %	528981800
89	NC_021285	GGCGCG	2	12	3837	3848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981800
90	NC_021285	CGT	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981800
91	NC_021285	CAC	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981800
92	NC_021285	CAC	2	6	3915	3920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981800
93	NC_021285	CGC	2	6	3921	3926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981800
94	NC_021285	GCC	2	6	3927	3932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981800
95	NC_021285	GCG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981801
96	NC_021285	GGCTTG	2	12	4017	4028	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	528981801
97	NC_021285	GCC	2	6	4033	4038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981801
98	NC_021285	CCGCGT	2	12	4063	4074	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528981801
99	NC_021285	CGGC	2	8	4081	4088	0 %	0 %	50 %	50 %	528981801
100	NC_021285	CAG	3	9	4109	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981801
101	NC_021285	GCCG	2	8	4127	4134	0 %	0 %	50 %	50 %	528981801
102	NC_021285	CGT	3	9	4141	4149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981801
103	NC_021285	GCC	2	6	4209	4214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981801
104	NC_021285	CA	3	6	4251	4256	50 %	0 %	0 %	50 %	528981801
105	NC_021285	CGGGC	2	10	4302	4311	0 %	0 %	60 %	40 %	528981801
106	NC_021285	GC	3	6	4450	4455	0 %	0 %	50 %	50 %	528981801
107	NC_021285	CGCC	2	8	4533	4540	0 %	0 %	25 %	75 %	528981802
108	NC_021285	CCGA	2	8	4556	4563	25 %	0 %	25 %	50 %	528981802
109	NC_021285	CAGC	2	8	4572	4579	25 %	0 %	25 %	50 %	528981802
110	NC_021285	GC	3	6	4578	4583	0 %	0 %	50 %	50 %	528981802
111	NC_021285	GCC	2	6	4595	4600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981802
112	NC_021285	GCC	2	6	4798	4803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981802
113	NC_021285	GTA	2	6	4804	4809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528981802
114	NC_021285	GAT	2	6	4875	4880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528981802
115	NC_021285	GTGG	2	8	4891	4898	0 %	25 %	75 %	0 %	528981802
116	NC_021285	CATGC	2	10	4916	4925	20 %	20 %	20 %	40 %	528981802
117	NC_021285	CGG	3	9	4940	4948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981802
118	NC_021285	GCG	2	6	4995	5000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981802
119	NC_021285	CAG	2	6	5023	5028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981802
120	NC_021285	CG	3	6	5034	5039	0 %	0 %	50 %	50 %	528981802
121	NC_021285	CCG	2	6	5040	5045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981802
122	NC_021285	TGG	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528981802
123	NC_021285	GCA	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981802
124	NC_021285	GCA	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981803
125	NC_021285	GGC	2	6	5166	5171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981803
126	NC_021285	CGC	2	6	5321	5326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981803
127	NC_021285	CGA	2	6	5330	5335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981803
128	NC_021285	CACG	2	8	5410	5417	25 %	0 %	25 %	50 %	528981804
129	NC_021285	CG	4	8	5474	5481	0 %	0 %	50 %	50 %	528981804
130	NC_021285	AGCC	3	12	5515	5526	25 %	0 %	25 %	50 %	528981804
131	NC_021285	CAG	3	9	5540	5548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981804
132	NC_021285	CCA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981804
133	NC_021285	GC	3	6	5606	5611	0 %	0 %	50 %	50 %	528981804
134	NC_021285	TGC	2	6	5672	5677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981804
135	NC_021285	CTG	2	6	5899	5904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981805
136	NC_021285	CA	3	6	5922	5927	50 %	0 %	0 %	50 %	528981805
137	NC_021285	ATC	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528981805
138	NC_021285	CCAT	2	8	6016	6023	25 %	25 %	0 %	50 %	528981805
139	NC_021285	TGC	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981805
140	NC_021285	TC	3	6	6132	6137	0 %	50 %	0 %	50 %	528981805
141	NC_021285	CCG	2	6	6138	6143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981805
142	NC_021285	GTT	2	6	6170	6175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528981805
143	NC_021285	GGC	2	6	6209	6214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981805
144	NC_021285	ATC	2	6	6227	6232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528981805
145	NC_021285	CCA	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981805
146	NC_021285	GAA	2	6	6284	6289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528981805
147	NC_021285	GTC	2	6	6432	6437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981805
148	NC_021285	ACCA	2	8	6562	6569	50 %	0 %	0 %	50 %	528981805
149	NC_021285	AGC	2	6	6590	6595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981805
150	NC_021285	GCC	2	6	6662	6667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981805
151	NC_021285	GCG	2	6	6670	6675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981805
152	NC_021285	GC	3	6	6735	6740	0 %	0 %	50 %	50 %	528981805
153	NC_021285	C	8	8	6758	6765	0 %	0 %	0 %	100 %	528981805
154	NC_021285	CCAC	2	8	6801	6808	25 %	0 %	0 %	75 %	528981805
155	NC_021285	CTG	2	6	6923	6928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981805
156	NC_021285	CCT	2	6	6967	6972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528981805
157	NC_021285	CCT	2	6	7152	7157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528981805
158	NC_021285	CTT	2	6	7182	7187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528981805
159	NC_021285	TGA	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528981806
160	NC_021285	A	7	7	8262	8268	100 %	0 %	0 %	0 %	528981806
161	NC_021285	CCG	2	6	8350	8355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981806
162	NC_021285	CAG	2	6	8492	8497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981806
163	NC_021285	TGG	2	6	8617	8622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528981806
164	NC_021285	TCG	2	6	8652	8657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981806
165	NC_021285	TGT	2	6	8815	8820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528981806
166	NC_021285	TGA	2	6	8860	8865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528981806
167	NC_021285	CCA	2	6	8875	8880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981806
168	NC_021285	GCC	2	6	8972	8977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981807
169	NC_021285	AAGGA	2	10	9002	9011	60 %	0 %	40 %	0 %	528981807
170	NC_021285	CAG	2	6	9028	9033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981807
171	NC_021285	GCC	2	6	9091	9096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981807
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174	NC_021285	AACTG	2	10	9176	9185	40 %	20 %	20 %	20 %	528981807
175	NC_021285	GCG	2	6	9203	9208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981807
176	NC_021285	ACGGAT	2	12	9234	9245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528981807
177	NC_021285	CTT	2	6	9310	9315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528981807
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182	NC_021285	GTT	2	6	9421	9426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528981807
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186	NC_021285	TGC	2	6	9687	9692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981807
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188	NC_021285	GCGCTC	2	12	9750	9761	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	528981807
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232	NC_021285	ATC	2	6	12118	12123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528981811
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239	NC_021285	GCTG	2	8	12518	12525	0 %	25 %	50 %	25 %	528981812
240	NC_021285	CCA	2	6	12560	12565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981812
241	NC_021285	CAC	2	6	12597	12602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981812
242	NC_021285	CAG	2	6	12645	12650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981812
243	NC_021285	CG	3	6	12656	12661	0 %	0 %	50 %	50 %	528981812
244	NC_021285	CGC	2	6	12671	12676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981812
245	NC_021285	GCA	2	6	12689	12694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981812
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247	NC_021285	ACG	2	6	12725	12730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981812
248	NC_021285	CTG	2	6	12816	12821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981812
249	NC_021285	GCG	2	6	12868	12873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981812
250	NC_021285	TCG	2	6	12917	12922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981812
251	NC_021285	GCC	2	6	13028	13033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981813
252	NC_021285	GTT	2	6	13118	13123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528981813
253	NC_021285	GCA	2	6	13161	13166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981813
254	NC_021285	GGC	2	6	13172	13177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981813
255	NC_021285	TTC	2	6	13218	13223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528981813
256	NC_021285	ACG	2	6	13263	13268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981813
257	NC_021285	GC	3	6	13269	13274	0 %	0 %	50 %	50 %	528981813
258	NC_021285	CTT	2	6	13292	13297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528981813
259	NC_021285	GGT	2	6	13316	13321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528981813
260	NC_021285	CGG	2	6	13372	13377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981813
261	NC_021285	CTG	2	6	13418	13423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528981813
262	NC_021285	CG	3	6	13426	13431	0 %	0 %	50 %	50 %	528981813
263	NC_021285	ATG	2	6	13440	13445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528981813
264	NC_021285	GGT	2	6	13534	13539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528981813
265	NC_021285	GCC	2	6	13547	13552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981813
266	NC_021285	GTT	2	6	13568	13573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528981813
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271	NC_021285	GAT	2	6	13862	13867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528981813
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291	NC_021285	CG	3	6	14530	14535	0 %	0 %	50 %	50 %	528981813
292	NC_021285	GCC	2	6	14601	14606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981813
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345	NC_021285	ACG	2	6	16751	16756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528981817
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385	NC_021285	ATC	2	6	18447	18452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528981820
386	NC_021285	A	6	6	18458	18463	100 %	0 %	0 %	0 %	528981820
387	NC_021285	CGC	2	6	18509	18514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981820
388	NC_021285	CCG	2	6	18579	18584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528981820
389	NC_021285	CAC	2	6	18664	18669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981821
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391	NC_021285	CCA	2	6	18843	18848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528981821
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400	NC_021285	CGG	3	9	19125	19133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528981822
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404	NC_021285	CTT	2	6	19234	19239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528981822
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500	NC_021285	TTG	2	6	22605	22610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528981826

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