MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 221691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021252	CTG	2	6	313327	313332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928855
8002	NC_021252	TGC	2	6	313349	313354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928855
8003	NC_021252	GGC	2	6	313356	313361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928855
8004	NC_021252	TCC	3	9	313367	313375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928855
8005	NC_021252	CGA	2	6	313404	313409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928855
8006	NC_021252	GCT	2	6	313431	313436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928855
8007	NC_021252	CT	3	6	313449	313454	0 %	50 %	0 %	50 %	506928855
8008	NC_021252	TCT	2	6	313490	313495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928855
8009	NC_021252	CGG	2	6	313553	313558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928855
8010	NC_021252	GAG	2	6	313597	313602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928855
8011	NC_021252	CGG	2	6	313618	313623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928855
8012	NC_021252	GCT	2	6	313649	313654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928855
8013	NC_021252	CGA	2	6	313710	313715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928855
8014	NC_021252	CGT	2	6	313719	313724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928855
8015	NC_021252	CGACAC	2	12	313725	313736	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	506928855
8016	NC_021252	CACG	2	8	313784	313791	25 %	0 %	25 %	50 %	506928855
8017	NC_021252	GC	3	6	313794	313799	0 %	0 %	50 %	50 %	506928855
8018	NC_021252	CG	3	6	313809	313814	0 %	0 %	50 %	50 %	506928855
8019	NC_021252	CGA	2	6	313851	313856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928855
8020	NC_021252	ACG	2	6	313964	313969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928855
8021	NC_021252	CCT	2	6	313983	313988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928855
8022	NC_021252	GACCG	2	10	314041	314050	20 %	0 %	40 %	40 %	506928855
8023	NC_021252	TGA	2	6	314072	314077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928855
8024	NC_021252	GCT	2	6	314085	314090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928855
8025	NC_021252	CGC	2	6	314127	314132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928855
8026	NC_021252	CG	3	6	314137	314142	0 %	0 %	50 %	50 %	506928855
8027	NC_021252	CGCC	2	8	314181	314188	0 %	0 %	25 %	75 %	506928855
8028	NC_021252	TTC	2	6	314209	314214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928855
8029	NC_021252	CCT	2	6	314310	314315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928855
8030	NC_021252	GCGTCG	2	12	314318	314329	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	506928855
8031	NC_021252	CGG	2	6	314352	314357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928855
8032	NC_021252	CGA	2	6	314937	314942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928856
8033	NC_021252	TCG	2	6	315038	315043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928856
8034	NC_021252	CATC	2	8	315114	315121	25 %	25 %	0 %	50 %	506928856
8035	NC_021252	GAGCGA	2	12	316913	316924	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	506928857
8036	NC_021252	TCA	2	6	316927	316932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928857
8037	NC_021252	AGC	2	6	317036	317041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928857
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8039	NC_021252	GCCG	2	8	317081	317088	0 %	0 %	50 %	50 %	506928857
8040	NC_021252	GCTG	2	8	317175	317182	0 %	25 %	50 %	25 %	506928857
8041	NC_021252	GGGAT	2	10	317220	317229	20 %	20 %	60 %	0 %	506928857
8042	NC_021252	CCGC	2	8	317242	317249	0 %	0 %	25 %	75 %	506928857
8043	NC_021252	ACG	2	6	317262	317267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928857
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8045	NC_021252	CGG	2	6	317338	317343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928857
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8047	NC_021252	ACG	2	6	317397	317402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928857
8048	NC_021252	ATC	2	6	317466	317471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506928857
8049	NC_021252	TCT	2	6	317501	317506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506928857
8050	NC_021252	CTTC	2	8	317519	317526	0 %	50 %	0 %	50 %	506928857
8051	NC_021252	TAA	2	6	317534	317539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	506928857
8052	NC_021252	GGCGT	2	10	317596	317605	0 %	20 %	60 %	20 %	506928857
8053	NC_021252	TC	3	6	317660	317665	0 %	50 %	0 %	50 %	506928857
8054	NC_021252	GGAT	2	8	317751	317758	25 %	25 %	50 %	0 %	506928857
8055	NC_021252	CTTC	2	8	317801	317808	0 %	50 %	0 %	50 %	506928857
8056	NC_021252	AG	3	6	317839	317844	50 %	0 %	50 %	0 %	506928857
8057	NC_021252	TTG	2	6	317926	317931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506928857
8058	NC_021252	AGA	2	6	317968	317973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928857
8059	NC_021252	GGC	2	6	318001	318006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928857
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8061	NC_021252	GCAG	2	8	318115	318122	25 %	0 %	50 %	25 %	506928857
8062	NC_021252	CGA	2	6	318230	318235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928857
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8069	NC_021252	GTT	2	6	318638	318643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506928857
8070	NC_021252	GGC	2	6	318686	318691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928857
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8072	NC_021252	GA	3	6	318709	318714	50 %	0 %	50 %	0 %	506928857
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8074	NC_021252	GGT	2	6	318740	318745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928857
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8085	NC_021252	CGA	2	6	319464	319469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928858
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8088	NC_021252	GTCGA	2	10	319646	319655	20 %	20 %	40 %	20 %	506928858
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8093	NC_021252	ACCA	2	8	319887	319894	50 %	0 %	0 %	50 %	506928858
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8116	NC_021252	CG	3	6	321125	321130	0 %	0 %	50 %	50 %	506928859
8117	NC_021252	AAG	2	6	321136	321141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506928859
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8122	NC_021252	AGT	2	6	321467	321472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928859
8123	NC_021252	CG	3	6	323463	323468	0 %	0 %	50 %	50 %	506928860
8124	NC_021252	TCG	2	6	323479	323484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928860
8125	NC_021252	CCG	2	6	323489	323494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928860
8126	NC_021252	CGC	2	6	323561	323566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928860
8127	NC_021252	TCG	2	6	323587	323592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928860
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8130	NC_021252	CGT	2	6	323780	323785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928860
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8132	NC_021252	G	6	6	323868	323873	0 %	0 %	100 %	0 %	506928860
8133	NC_021252	CGT	2	6	323951	323956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928860
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8152	NC_021252	GCA	2	6	325282	325287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928862
8153	NC_021252	GCG	2	6	325299	325304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928862
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8234	NC_021252	CGG	2	6	327918	327923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928865
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8237	NC_021252	TCGAC	2	10	327993	328002	20 %	20 %	20 %	40 %	506928865
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8240	NC_021252	TCC	2	6	328034	328039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928865
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8242	NC_021252	GC	4	8	328060	328067	0 %	0 %	50 %	50 %	506928865
8243	NC_021252	CGG	2	6	328104	328109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928865
8244	NC_021252	CGC	2	6	328149	328154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928865
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8246	NC_021252	TCG	2	6	328235	328240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928865
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8347	NC_021252	CCA	2	6	332672	332677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506928872
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8352	NC_021252	GCG	2	6	332943	332948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928873
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8360	NC_021252	CTC	2	6	333538	333543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928874
8361	NC_021252	GTG	2	6	333554	333559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506928874
8362	NC_021252	GCC	2	6	333578	333583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928874
8363	NC_021252	TCGAAC	2	12	333594	333605	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	506928874
8364	NC_021252	GGA	2	6	333673	333678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928874
8365	NC_021252	C	6	6	333680	333685	0 %	0 %	0 %	100 %	506928874
8366	NC_021252	GAT	2	6	333742	333747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928875
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8368	NC_021252	CTCGCG	2	12	333785	333796	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	506928875
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8370	NC_021252	GTC	2	6	333830	333835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928875
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8372	NC_021252	CCT	2	6	333862	333867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928875
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8374	NC_021252	GCT	2	6	333904	333909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928875
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8378	NC_021252	CCT	2	6	334062	334067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928875
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8381	NC_021252	CTG	2	6	334121	334126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928875
8382	NC_021252	GC	3	6	334137	334142	0 %	0 %	50 %	50 %	506928875
8383	NC_021252	GCG	2	6	334167	334172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928875
8384	NC_021252	CCG	2	6	334173	334178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928875
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8386	NC_021252	CCGCC	2	10	334197	334206	0 %	0 %	20 %	80 %	506928875
8387	NC_021252	GGC	2	6	334213	334218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928875
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8389	NC_021252	TCCCGA	2	12	334323	334334	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	506928875
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8401	NC_021252	CG	3	6	334634	334639	0 %	0 %	50 %	50 %	506928876
8402	NC_021252	GCC	2	6	334652	334657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506928876
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8485	NC_021252	GGA	2	6	337644	337649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506928880
8486	NC_021252	CTC	2	6	337654	337659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928880
8487	NC_021252	CGG	2	6	337666	337671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928880
8488	NC_021252	CTGG	2	8	337672	337679	0 %	25 %	50 %	25 %	506928880
8489	NC_021252	TCG	2	6	337721	337726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506928880
8490	NC_021252	CGG	2	6	337810	337815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506928880
8491	NC_021252	GAT	2	6	337900	337905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506928880
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8493	NC_021252	CTC	2	6	337981	337986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506928880
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8495	NC_021252	CAG	2	6	338053	338058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506928880
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