MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 5411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021030	CGGC	2	8	7534	7541	0 %	0 %	50 %	50 %	479185172
2	NC_021030	GCCT	2	8	13252	13259	0 %	25 %	25 %	50 %	479185173
3	NC_021030	CGAC	2	8	13769	13776	25 %	0 %	25 %	50 %	479185173
4	NC_021030	CGTC	2	8	15759	15766	0 %	25 %	25 %	50 %	479185174
5	NC_021030	ACCG	2	8	16605	16612	25 %	0 %	25 %	50 %	479185174
6	NC_021030	CCGG	2	8	16658	16665	0 %	0 %	50 %	50 %	479185174
7	NC_021030	GTCC	2	8	16784	16791	0 %	25 %	25 %	50 %	479185174
8	NC_021030	TTGG	2	8	16845	16852	0 %	50 %	50 %	0 %	479185174
9	NC_021030	GGCG	2	8	17040	17047	0 %	0 %	75 %	25 %	479185174
10	NC_021030	GCGG	2	8	17448	17455	0 %	0 %	75 %	25 %	479185174
11	NC_021030	TGGT	2	8	17458	17465	0 %	50 %	50 %	0 %	479185174
12	NC_021030	GACC	2	8	17727	17734	25 %	0 %	25 %	50 %	479185174
13	NC_021030	CCAG	2	8	18335	18342	25 %	0 %	25 %	50 %	479185174
14	NC_021030	TCCG	2	8	18351	18358	0 %	25 %	25 %	50 %	479185174
15	NC_021030	CGGT	2	8	20523	20530	0 %	25 %	50 %	25 %	479185175
16	NC_021030	CGAG	2	8	20824	20831	25 %	0 %	50 %	25 %	479185175
17	NC_021030	CGTT	2	8	21498	21505	0 %	50 %	25 %	25 %	479185175
18	NC_021030	GCCA	2	8	22038	22045	25 %	0 %	25 %	50 %	479185175
19	NC_021030	CGAC	2	8	22417	22424	25 %	0 %	25 %	50 %	479185175
20	NC_021030	TTCG	2	8	22467	22474	0 %	50 %	25 %	25 %	479185176
21	NC_021030	CTGG	2	8	22614	22621	0 %	25 %	50 %	25 %	479185176
22	NC_021030	CGGT	2	8	22679	22686	0 %	25 %	50 %	25 %	479185176
23	NC_021030	ACGA	2	8	23089	23096	50 %	0 %	25 %	25 %	479185176
24	NC_021030	CGCC	2	8	23127	23134	0 %	0 %	25 %	75 %	479185176
25	NC_021030	TGCA	2	8	24495	24502	25 %	25 %	25 %	25 %	479185177
26	NC_021030	GCCG	2	8	24515	24522	0 %	0 %	50 %	50 %	479185177
27	NC_021030	CGGT	2	8	24915	24922	0 %	25 %	50 %	25 %	479185177
28	NC_021030	CAAT	2	8	27011	27018	50 %	25 %	0 %	25 %	479185178
29	NC_021030	CGGG	2	8	27029	27036	0 %	0 %	75 %	25 %	479185178
30	NC_021030	GCCG	2	8	29656	29663	0 %	0 %	50 %	50 %	479185179
31	NC_021030	GTCG	2	8	29983	29990	0 %	25 %	50 %	25 %	479185179
32	NC_021030	TGCT	2	8	30434	30441	0 %	50 %	25 %	25 %	479185179
33	NC_021030	CCCG	2	8	31099	31106	0 %	0 %	25 %	75 %	479185179
34	NC_021030	TCGA	2	8	31721	31728	25 %	25 %	25 %	25 %	479185179
35	NC_021030	GTTG	2	8	31797	31804	0 %	50 %	50 %	0 %	479185179
36	NC_021030	TTTG	2	8	32149	32156	0 %	75 %	25 %	0 %	479185180
37	NC_021030	GCGT	2	8	32731	32738	0 %	25 %	50 %	25 %	479185180
38	NC_021030	TACG	2	8	33579	33586	25 %	25 %	25 %	25 %	479185181
39	NC_021030	CCGG	2	8	33632	33639	0 %	0 %	50 %	50 %	479185181
40	NC_021030	GCGG	2	8	33830	33837	0 %	0 %	75 %	25 %	479185181
41	NC_021030	TGGC	2	8	34175	34182	0 %	25 %	50 %	25 %	479185181
42	NC_021030	GACG	2	8	34210	34217	25 %	0 %	50 %	25 %	479185181
43	NC_021030	CGGC	2	8	34498	34505	0 %	0 %	50 %	50 %	479185181
44	NC_021030	CGGA	2	8	34641	34648	25 %	0 %	50 %	25 %	479185181
45	NC_021030	CGGG	2	8	34819	34826	0 %	0 %	75 %	25 %	479185181
46	NC_021030	GATC	2	8	37167	37174	25 %	25 %	25 %	25 %	479185184
47	NC_021030	GCCT	2	8	37419	37426	0 %	25 %	25 %	50 %	479185184
48	NC_021030	ACGA	2	8	37628	37635	50 %	0 %	25 %	25 %	479185184
49	NC_021030	CTCG	2	8	37837	37844	0 %	25 %	25 %	50 %	479185184
50	NC_021030	CAGG	2	8	39126	39133	25 %	0 %	50 %	25 %	479185185
51	NC_021030	GCCG	2	8	39916	39923	0 %	0 %	50 %	50 %	479185185
52	NC_021030	GATT	2	8	40000	40007	25 %	50 %	25 %	0 %	479185185
53	NC_021030	CAGC	2	8	40041	40048	25 %	0 %	25 %	50 %	479185185
54	NC_021030	AGGC	2	8	40131	40138	25 %	0 %	50 %	25 %	479185185
55	NC_021030	GTCG	2	8	40288	40295	0 %	25 %	50 %	25 %	479185185
56	NC_021030	TCCG	2	8	40312	40319	0 %	25 %	25 %	50 %	479185185
57	NC_021030	TTCG	2	8	40365	40372	0 %	50 %	25 %	25 %	479185185
58	NC_021030	CGAC	2	8	40495	40502	25 %	0 %	25 %	50 %	479185185
59	NC_021030	CGAG	2	8	40744	40751	25 %	0 %	50 %	25 %	479185185
60	NC_021030	TTCG	2	8	41984	41991	0 %	50 %	25 %	25 %	479185186
61	NC_021030	GCAT	2	8	44052	44059	25 %	25 %	25 %	25 %	479185187
62	NC_021030	ATCG	2	8	44943	44950	25 %	25 %	25 %	25 %	479185187
63	NC_021030	ATCA	2	8	45309	45316	50 %	25 %	0 %	25 %	479185187
64	NC_021030	GTCG	2	8	45365	45372	0 %	25 %	50 %	25 %	479185187
65	NC_021030	TTGA	2	8	47106	47113	25 %	50 %	25 %	0 %	479185188
66	NC_021030	TGAT	2	8	47656	47663	25 %	50 %	25 %	0 %	479185188
67	NC_021030	CGAA	2	8	47829	47836	50 %	0 %	25 %	25 %	479185188
68	NC_021030	ATGT	2	8	48393	48400	25 %	50 %	25 %	0 %	479185189
69	NC_021030	AATA	2	8	48603	48610	75 %	25 %	0 %	0 %	479185189
70	NC_021030	CCGA	2	8	48690	48697	25 %	0 %	25 %	50 %	479185189
71	NC_021030	TTCG	2	8	49250	49257	0 %	50 %	25 %	25 %	479185189
72	NC_021030	CGTC	2	8	49312	49319	0 %	25 %	25 %	50 %	479185189
73	NC_021030	TCCG	2	8	50377	50384	0 %	25 %	25 %	50 %	479185190
74	NC_021030	ACCG	2	8	51029	51036	25 %	0 %	25 %	50 %	479185190
75	NC_021030	GAAT	2	8	51112	51119	50 %	25 %	25 %	0 %	479185190
76	NC_021030	TTCC	2	8	51994	52001	0 %	50 %	0 %	50 %	479185190
77	NC_021030	CAGG	2	8	52220	52227	25 %	0 %	50 %	25 %	479185190
78	NC_021030	TTCG	2	8	52231	52238	0 %	50 %	25 %	25 %	479185190
79	NC_021030	CGAT	2	8	52995	53002	25 %	25 %	25 %	25 %	479185190
80	NC_021030	CTCG	2	8	53137	53144	0 %	25 %	25 %	50 %	479185190
81	NC_021030	TCGT	2	8	53859	53866	0 %	50 %	25 %	25 %	479185191
82	NC_021030	GGCC	2	8	54430	54437	0 %	0 %	50 %	50 %	479185191
83	NC_021030	GGAA	2	8	54722	54729	50 %	0 %	50 %	0 %	479185191
84	NC_021030	ATTC	2	8	54800	54807	25 %	50 %	0 %	25 %	479185191
85	NC_021030	GGTT	2	8	55642	55649	0 %	50 %	50 %	0 %	479185191
86	NC_021030	CGAG	2	8	58558	58565	25 %	0 %	50 %	25 %	479185192
87	NC_021030	GCTT	2	8	59964	59971	0 %	50 %	25 %	25 %	479185193
88	NC_021030	GACG	2	8	60199	60206	25 %	0 %	50 %	25 %	479185193
89	NC_021030	TGAG	2	8	60489	60496	25 %	25 %	50 %	0 %	479185194
90	NC_021030	CCGT	2	8	60519	60526	0 %	25 %	25 %	50 %	479185194
91	NC_021030	CCGT	2	8	60578	60585	0 %	25 %	25 %	50 %	479185194
92	NC_021030	GTAT	2	8	62263	62270	25 %	50 %	25 %	0 %	479185195
93	NC_021030	GTCG	2	8	62504	62511	0 %	25 %	50 %	25 %	479185195
94	NC_021030	CGGC	2	8	62514	62521	0 %	0 %	50 %	50 %	479185195
95	NC_021030	AGGC	2	8	64518	64525	25 %	0 %	50 %	25 %	479185197
96	NC_021030	TCGA	2	8	64778	64785	25 %	25 %	25 %	25 %	479185198
97	NC_021030	ACAT	2	8	65065	65072	50 %	25 %	0 %	25 %	479185198
98	NC_021030	CATT	2	8	65226	65233	25 %	50 %	0 %	25 %	479185198
99	NC_021030	GCAA	2	8	65447	65454	50 %	0 %	25 %	25 %	479185198
100	NC_021030	ATTT	2	8	65509	65516	25 %	75 %	0 %	0 %	479185198
101	NC_021030	CGTC	2	8	66002	66009	0 %	25 %	25 %	50 %	479185199
102	NC_021030	TGCA	2	8	67207	67214	25 %	25 %	25 %	25 %	479185199
103	NC_021030	CGCC	2	8	67433	67440	0 %	0 %	25 %	75 %	479185199
104	NC_021030	TTCC	2	8	70123	70130	0 %	50 %	0 %	50 %	479185200
105	NC_021030	GTTC	2	8	70259	70266	0 %	50 %	25 %	25 %	479185200
106	NC_021030	GTCC	2	8	70912	70919	0 %	25 %	25 %	50 %	479185200
107	NC_021030	GTCG	2	8	72842	72849	0 %	25 %	50 %	25 %	479185201
108	NC_021030	GGAT	2	8	73158	73165	25 %	25 %	50 %	0 %	479185201
109	NC_021030	CGTC	2	8	74660	74667	0 %	25 %	25 %	50 %	479185202
110	NC_021030	TCGA	2	8	75413	75420	25 %	25 %	25 %	25 %	479185202
111	NC_021030	TTAT	2	8	75666	75673	25 %	75 %	0 %	0 %	479185203
112	NC_021030	CGGT	2	8	75937	75944	0 %	25 %	50 %	25 %	479185203
113	NC_021030	GGCA	2	8	76647	76654	25 %	0 %	50 %	25 %	479185203
114	NC_021030	GGTC	2	8	76676	76683	0 %	25 %	50 %	25 %	479185203
115	NC_021030	ACGT	3	12	76946	76957	25 %	25 %	25 %	25 %	479185203
116	NC_021030	CGTC	2	8	78204	78211	0 %	25 %	25 %	50 %	479185204
117	NC_021030	GTCG	2	8	78379	78386	0 %	25 %	50 %	25 %	479185204
118	NC_021030	TCGA	2	8	79157	79164	25 %	25 %	25 %	25 %	479185204
119	NC_021030	CCTT	2	8	82562	82569	0 %	50 %	0 %	50 %	479185205
120	NC_021030	ACCT	2	8	83837	83844	25 %	25 %	0 %	50 %	479185206
121	NC_021030	ACGA	2	8	83849	83856	50 %	0 %	25 %	25 %	479185206
122	NC_021030	GTCG	2	8	84631	84638	0 %	25 %	50 %	25 %	479185207
123	NC_021030	CGAG	2	8	84915	84922	25 %	0 %	50 %	25 %	479185207
124	NC_021030	GCGT	2	8	85130	85137	0 %	25 %	50 %	25 %	479185207
125	NC_021030	CGTC	2	8	85400	85407	0 %	25 %	25 %	50 %	479185207
126	NC_021030	CGGC	2	8	86166	86173	0 %	0 %	50 %	50 %	479185207
127	NC_021030	CAGC	2	8	89450	89457	25 %	0 %	25 %	50 %	479185208
128	NC_021030	CGGA	2	8	89919	89926	25 %	0 %	50 %	25 %	479185209
129	NC_021030	TCCG	2	8	90293	90300	0 %	25 %	25 %	50 %	479185209
130	NC_021030	GTCG	2	8	90651	90658	0 %	25 %	50 %	25 %	479185209
131	NC_021030	GGGC	2	8	91050	91057	0 %	0 %	75 %	25 %	479185209
132	NC_021030	GGAC	2	8	91332	91339	25 %	0 %	50 %	25 %	479185209
133	NC_021030	GCTT	2	8	91425	91432	0 %	50 %	25 %	25 %	479185209
134	NC_021030	GAAA	2	8	91448	91455	75 %	0 %	25 %	0 %	479185209
135	NC_021030	TTCG	2	8	92736	92743	0 %	50 %	25 %	25 %	479185210
136	NC_021030	GGCA	2	8	93081	93088	25 %	0 %	50 %	25 %	479185210
137	NC_021030	TGGC	2	8	94557	94564	0 %	25 %	50 %	25 %	479185212
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139	NC_021030	GCCG	2	8	101411	101418	0 %	0 %	50 %	50 %	479185215
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