MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agromonas oligotrophica S58 DNA

Total Repeats: 186869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020453	CGTGAT	2	12	539046	539057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	459286950
12502	NC_020453	TGAG	2	8	539131	539138	25 %	25 %	50 %	0 %	459286950
12503	NC_020453	GC	4	8	539182	539189	0 %	0 %	50 %	50 %	459286951
12504	NC_020453	CGA	2	6	539201	539206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12505	NC_020453	TCGC	2	8	539225	539232	0 %	25 %	25 %	50 %	459286951
12506	NC_020453	AGG	2	6	539257	539262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459286951
12507	NC_020453	GCC	2	6	539272	539277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286951
12508	NC_020453	AGC	2	6	539335	539340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12509	NC_020453	CGA	2	6	539345	539350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12510	NC_020453	GCG	2	6	539359	539364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286951
12511	NC_020453	CGG	2	6	539375	539380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286951
12512	NC_020453	GCTGTC	2	12	539402	539413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12513	NC_020453	GCT	2	6	539420	539425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12514	NC_020453	GAG	2	6	539472	539477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459286951
12515	NC_020453	CTG	2	6	539478	539483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12516	NC_020453	GTG	2	6	539505	539510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459286951
12517	NC_020453	GGC	2	6	539517	539522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286951
12518	NC_020453	ATCT	2	8	539580	539587	25 %	50 %	0 %	25 %	459286951
12519	NC_020453	CCGG	2	8	539589	539596	0 %	0 %	50 %	50 %	459286951
12520	NC_020453	TGC	2	6	539602	539607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12521	NC_020453	GCGCC	2	10	539669	539678	0 %	0 %	40 %	60 %	459286951
12522	NC_020453	TCG	2	6	539814	539819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12523	NC_020453	GCT	2	6	539826	539831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12524	NC_020453	GCC	2	6	539866	539871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286951
12525	NC_020453	TCG	2	6	539875	539880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12526	NC_020453	GGA	2	6	539891	539896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459286951
12527	NC_020453	GCT	2	6	539965	539970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12528	NC_020453	ATC	2	6	539982	539987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286951
12529	NC_020453	GC	3	6	540003	540008	0 %	0 %	50 %	50 %	459286951
12530	NC_020453	CGA	2	6	540032	540037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12531	NC_020453	GCG	2	6	540088	540093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286951
12532	NC_020453	ACCT	2	8	540096	540103	25 %	25 %	0 %	50 %	459286951
12533	NC_020453	CTA	2	6	540116	540121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286951
12534	NC_020453	CGG	2	6	540125	540130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286951
12535	NC_020453	TGA	2	6	540142	540147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286951
12536	NC_020453	CATCTC	2	12	540162	540173	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	459286951
12537	NC_020453	ACA	2	6	540208	540213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286951
12538	NC_020453	GAC	2	6	540237	540242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12539	NC_020453	CCGC	2	8	540248	540255	0 %	0 %	25 %	75 %	459286951
12540	NC_020453	TCA	2	6	540325	540330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286951
12541	NC_020453	CGA	2	6	540386	540391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12542	NC_020453	GAA	2	6	540404	540409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286951
12543	NC_020453	CGA	2	6	540416	540421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12544	NC_020453	CGGGC	2	10	540482	540491	0 %	0 %	60 %	40 %	459286951
12545	NC_020453	TGC	2	6	540508	540513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286951
12546	NC_020453	CGG	2	6	540632	540637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286951
12547	NC_020453	GAA	2	6	540653	540658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286951
12548	NC_020453	CGC	2	6	540683	540688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286951
12549	NC_020453	GC	3	6	540687	540692	0 %	0 %	50 %	50 %	459286951
12550	NC_020453	GC	3	6	540726	540731	0 %	0 %	50 %	50 %	459286951
12551	NC_020453	CGC	3	9	540729	540737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286951
12552	NC_020453	CGC	2	6	540748	540753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286951
12553	NC_020453	CGCC	2	8	540791	540798	0 %	0 %	25 %	75 %	459286951
12554	NC_020453	ATG	2	6	540814	540819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286951
12555	NC_020453	ACCCCC	2	12	540993	541004	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	459286952
12556	NC_020453	GGGGA	2	10	541021	541030	20 %	0 %	80 %	0 %	459286952
12557	NC_020453	CAA	2	6	541073	541078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286952
12558	NC_020453	GC	3	6	541221	541226	0 %	0 %	50 %	50 %	459286952
12559	NC_020453	GAA	2	6	541287	541292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286952
12560	NC_020453	ACGC	2	8	541333	541340	25 %	0 %	25 %	50 %	459286952
12561	NC_020453	GCC	2	6	541341	541346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286952
12562	NC_020453	CGGC	2	8	541348	541355	0 %	0 %	50 %	50 %	459286952
12563	NC_020453	GCC	2	6	541369	541374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286952
12564	NC_020453	GCA	2	6	541376	541381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286952
12565	NC_020453	GCG	2	6	541384	541389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286952
12566	NC_020453	CGT	2	6	541397	541402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286952
12567	NC_020453	CCG	2	6	541426	541431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286952
12568	NC_020453	CCA	2	6	541460	541465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286952
12569	NC_020453	GC	3	6	541474	541479	0 %	0 %	50 %	50 %	459286952
12570	NC_020453	TCA	3	9	541493	541501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286952
12571	NC_020453	GCG	2	6	541531	541536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286952
12572	NC_020453	CGTCAT	2	12	541583	541594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	459286952
12573	NC_020453	CGA	2	6	541610	541615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286952
12574	NC_020453	TCG	2	6	541657	541662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286952
12575	NC_020453	GGCG	2	8	541744	541751	0 %	0 %	75 %	25 %	459286952
12576	NC_020453	GCC	2	6	541766	541771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286952
12577	NC_020453	GCC	2	6	542155	542160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286953
12578	NC_020453	CAC	2	6	542188	542193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286953
12579	NC_020453	CG	3	6	542215	542220	0 %	0 %	50 %	50 %	459286953
12580	NC_020453	CG	3	6	542225	542230	0 %	0 %	50 %	50 %	459286953
12581	NC_020453	CG	3	6	542259	542264	0 %	0 %	50 %	50 %	459286953
12582	NC_020453	CGG	2	6	542395	542400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286953
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12585	NC_020453	CGA	2	6	542460	542465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286953
12586	NC_020453	CG	3	6	542485	542490	0 %	0 %	50 %	50 %	459286953
12587	NC_020453	GCC	2	6	542515	542520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286953
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12589	NC_020453	CGA	2	6	542538	542543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286953
12590	NC_020453	CG	3	6	542582	542587	0 %	0 %	50 %	50 %	459286953
12591	NC_020453	TCT	3	9	542616	542624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286953
12592	NC_020453	CCAGCC	2	12	542644	542655	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	459286953
12593	NC_020453	GCC	2	6	542665	542670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286953
12594	NC_020453	GCCAT	2	10	542747	542756	20 %	20 %	20 %	40 %	459286953
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12596	NC_020453	GCCGT	2	10	542786	542795	0 %	20 %	40 %	40 %	459286953
12597	NC_020453	GCA	2	6	542817	542822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286953
12598	NC_020453	ATG	2	6	542861	542866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286953
12599	NC_020453	GTG	2	6	542870	542875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459286953
12600	NC_020453	CGGA	2	8	542898	542905	25 %	0 %	50 %	25 %	459286953
12601	NC_020453	CG	4	8	542932	542939	0 %	0 %	50 %	50 %	459286953
12602	NC_020453	CGT	2	6	542971	542976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286953
12603	NC_020453	CGA	2	6	542980	542985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286953
12604	NC_020453	TGG	2	6	543003	543008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459286953
12605	NC_020453	TCG	2	6	543053	543058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286953
12606	NC_020453	CTC	2	6	543073	543078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459286953
12607	NC_020453	GC	3	6	543212	543217	0 %	0 %	50 %	50 %	459286953
12608	NC_020453	GCG	2	6	543231	543236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286953
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12610	NC_020453	CG	3	6	543330	543335	0 %	0 %	50 %	50 %	459286953
12611	NC_020453	GCT	2	6	543353	543358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286953
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12613	NC_020453	GATC	2	8	543372	543379	25 %	25 %	25 %	25 %	459286953
12614	NC_020453	GTT	2	6	543384	543389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286953
12615	NC_020453	CGC	2	6	543405	543410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286953
12616	NC_020453	CTC	2	6	543475	543480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459286953
12617	NC_020453	GCC	2	6	543522	543527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286953
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12619	NC_020453	AGA	2	6	543567	543572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286953
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12734	NC_020453	GCGCA	2	10	547960	547969	20 %	0 %	40 %	40 %	459286956
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12975	NC_020453	CG	3	6	559669	559674	0 %	0 %	50 %	50 %	459286964
12976	NC_020453	GCC	2	6	559683	559688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459286964
12977	NC_020453	ACG	2	6	559771	559776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286964
12978	NC_020453	CGG	2	6	559778	559783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286964
12979	NC_020453	GGA	2	6	559811	559816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459286964
12980	NC_020453	GCG	2	6	559818	559823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286964
12981	NC_020453	GCG	2	6	559885	559890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286964
12982	NC_020453	TCG	2	6	559987	559992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286964
12983	NC_020453	GCG	2	6	559998	560003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286964
12984	NC_020453	CGA	2	6	560027	560032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286964
12985	NC_020453	GAT	2	6	560082	560087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286964
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12990	NC_020453	GC	3	6	560242	560247	0 %	0 %	50 %	50 %	459286964
12991	NC_020453	AGC	2	6	560263	560268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286964
12992	NC_020453	ATG	3	9	560292	560300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286964
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12997	NC_020453	ATG	2	6	560454	560459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286964
12998	NC_020453	GC	3	6	560464	560469	0 %	0 %	50 %	50 %	459286964
12999	NC_020453	CGG	2	6	560483	560488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286964
13000	NC_020453	CGG	2	6	560522	560527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	459286964

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