MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.06

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019775	TAA	2	6	477	482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685391
2	NC_019775	TTC	2	6	504	509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685391
3	NC_019775	GCT	2	6	679	684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685391
4	NC_019775	ACC	2	6	917	922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685391
5	NC_019775	TCT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685391
6	NC_019775	TTA	2	6	1018	1023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685391
7	NC_019775	AAC	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685392
8	NC_019775	AGC	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
9	NC_019775	TCC	2	6	1200	1205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440685392
10	NC_019775	CAT	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
11	NC_019775	TGC	2	6	1302	1307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
12	NC_019775	TGA	2	6	1344	1349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
13	NC_019775	TAT	2	6	1558	1563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
14	NC_019775	CAA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685392
15	NC_019775	TCT	2	6	1697	1702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
16	NC_019775	CTT	2	6	1810	1815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
17	NC_019775	AGC	2	6	1865	1870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
18	NC_019775	TTG	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685392
19	NC_019775	AGC	2	6	1946	1951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
20	NC_019775	CTT	2	6	2089	2094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
21	NC_019775	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
22	NC_019775	GGC	2	6	2198	2203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440685392
23	NC_019775	CTT	2	6	2209	2214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
24	NC_019775	ATC	2	6	2270	2275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
25	NC_019775	TTA	2	6	2358	2363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
26	NC_019775	TCA	2	6	2400	2405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
27	NC_019775	TTC	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
28	NC_019775	CAG	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685392
29	NC_019775	TCT	2	6	2554	2559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
30	NC_019775	TTC	2	6	2615	2620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
31	NC_019775	CTC	2	6	2621	2626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440685392
32	NC_019775	TAA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
33	NC_019775	TCT	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
34	NC_019775	TTA	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
35	NC_019775	CGT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
36	NC_019775	TTA	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
37	NC_019775	AAT	2	6	3001	3006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
38	NC_019775	ACT	2	6	3048	3053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
39	NC_019775	TAA	2	6	3161	3166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
40	NC_019775	GTT	2	6	3347	3352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685392
41	NC_019775	CGT	2	6	3409	3414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
42	NC_019775	ACC	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685392
43	NC_019775	TGA	2	6	3456	3461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
44	NC_019775	AGT	2	6	3471	3476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685392
45	NC_019775	TCT	2	6	3588	3593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
46	NC_019775	AGA	2	6	3833	3838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685392
47	NC_019775	TCT	2	6	3873	3878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
48	NC_019775	GGA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440685392
49	NC_019775	TCA	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
50	NC_019775	ATC	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
51	NC_019775	TAT	2	6	4138	4143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685392
52	NC_019775	AAG	2	6	4182	4187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685392
53	NC_019775	CTA	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
54	NC_019775	GCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
55	NC_019775	TGG	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440685392
56	NC_019775	CTA	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685392
57	NC_019775	ACC	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685392
58	NC_019775	TGC	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685392
59	NC_019775	TTC	2	6	4784	4789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685392
60	NC_019775	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
61	NC_019775	AAT	2	6	4998	5003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685392
62	NC_019775	AGC	3	9	5917	5925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685393
63	NC_019775	ATC	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685393
64	NC_019775	TAG	2	6	6174	6179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685393
65	NC_019775	AGT	2	6	6188	6193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685393
66	NC_019775	ATC	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685394
67	NC_019775	TGT	2	6	6420	6425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685394
68	NC_019775	ACG	2	6	6805	6810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685395
69	NC_019775	TGA	2	6	6826	6831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685395
70	NC_019775	CAC	2	6	6990	6995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685395
71	NC_019775	AGC	2	6	7147	7152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685395
72	NC_019775	GAT	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685396
73	NC_019775	CTG	2	6	7446	7451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685396
74	NC_019775	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440685396
75	NC_019775	ATT	2	6	7613	7618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685396
76	NC_019775	GAA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685396
77	NC_019775	AAC	2	6	7788	7793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685396
78	NC_019775	GAT	2	6	7832	7837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685396
79	NC_019775	AGC	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685396
80	NC_019775	CAG	2	6	7882	7887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685396
81	NC_019775	GCT	2	6	8254	8259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685397
82	NC_019775	TTG	2	6	8290	8295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685397
83	NC_019775	TTA	2	6	8428	8433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685397
84	NC_019775	AAC	2	6	8446	8451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685397
85	NC_019775	TAC	2	6	8492	8497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685397
86	NC_019775	GCT	2	6	8666	8671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685398
87	NC_019775	TAA	2	6	8716	8721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685398
88	NC_019775	ACT	2	6	8754	8759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685398
89	NC_019775	AAC	2	6	8800	8805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685398
90	NC_019775	CAG	2	6	9277	9282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685399
91	NC_019775	AGA	2	6	9477	9482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685399
92	NC_019775	GCA	2	6	9487	9492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685399
93	NC_019775	TTG	2	6	9661	9666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685399
94	NC_019775	TAA	2	6	9680	9685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685399
95	NC_019775	AGC	2	6	9716	9721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685399
96	NC_019775	TAG	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685399
97	NC_019775	ATT	2	6	9836	9841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685400
98	NC_019775	CAG	2	6	9852	9857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685400
99	NC_019775	TCT	2	6	9903	9908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685400
100	NC_019775	TAC	2	6	10009	10014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685400
101	NC_019775	AGA	2	6	10046	10051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685400
102	NC_019775	TAT	2	6	10084	10089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685400
103	NC_019775	AGA	2	6	10196	10201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685400
104	NC_019775	AGC	2	6	10280	10285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685400
105	NC_019775	ATT	2	6	10398	10403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685400
106	NC_019775	AGC	2	6	10439	10444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685400
107	NC_019775	ACC	2	6	10450	10455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685400
108	NC_019775	ACT	2	6	10522	10527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685400
109	NC_019775	AGG	2	6	10552	10557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440685400
110	NC_019775	ATG	2	6	10621	10626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685400
111	NC_019775	TAG	2	6	10717	10722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685400
112	NC_019775	GCT	2	6	10734	10739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685400
113	NC_019775	ATC	2	6	10755	10760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685400
114	NC_019775	AGC	2	6	10809	10814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685400
115	NC_019775	AAC	2	6	10854	10859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685400
116	NC_019775	ACG	2	6	10885	10890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685400
117	NC_019775	CAA	2	6	10892	10897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440685400
118	NC_019775	GAA	2	6	11003	11008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685400
119	NC_019775	AGA	2	6	11021	11026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685400
120	NC_019775	CGA	2	6	11031	11036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685400
121	NC_019775	TGT	2	6	11066	11071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	440685400
122	NC_019775	CGT	2	6	11073	11078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685400
123	NC_019775	AAT	2	6	11169	11174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685400
124	NC_019775	ATT	2	6	11227	11232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685400
125	NC_019775	TGA	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440685400
126	NC_019775	CCA	2	6	11721	11726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440685400
127	NC_019775	ATA	2	6	11749	11754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685400
128	NC_019775	AGC	2	6	11869	11874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685400
129	NC_019775	AAG	2	6	11914	11919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440685400
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131	NC_019775	TCT	2	6	12621	12626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685401
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133	NC_019775	CCT	2	6	12873	12878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440685401
134	NC_019775	TCT	2	6	12948	12953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440685401
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145	NC_019775	TTA	2	6	13326	13331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440685402
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.