MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.03

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019773	TTAAAG	2	12	7871	7882	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440685211
2	NC_019773	AATTAA	2	12	16129	16140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685221
3	NC_019773	ATTTTG	2	12	17045	17056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	440685221
4	NC_019773	TCATCT	2	12	19750	19761	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	440685224
5	NC_019773	TGTGGC	2	12	21017	21028	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	440685225
6	NC_019773	ATCACC	2	12	21107	21118	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	440685225
7	NC_019773	CATTAA	2	12	22589	22600	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440685225
8	NC_019773	CCGCAC	2	12	26813	26824	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	440685228
9	NC_019773	ATTAGA	2	12	28675	28686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	440685230
10	NC_019773	TATCGT	2	12	32097	32108	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440685236
11	NC_019773	TGGTCA	2	12	32348	32359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440685236
12	NC_019773	TCAGAA	2	12	39888	39899	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440685245
13	NC_019773	ACAAAA	2	12	40553	40564	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	440685245
14	NC_019773	ATCGCT	2	12	42069	42080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	440685247
15	NC_019773	AATCAA	2	12	42207	42218	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440685247
16	NC_019773	AAGCAA	2	12	42582	42593	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	440685247
17	NC_019773	ATGGAA	2	12	44162	44173	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440685249
18	NC_019773	AGGTAA	2	12	44971	44982	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	440685249
19	NC_019773	AGATTT	2	12	49822	49833	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	440685250
20	NC_019773	TACCCC	2	12	52637	52648	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	440685253
21	NC_019773	TTAACT	2	12	57240	57251	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	440685261
22	NC_019773	CAATGC	2	12	61541	61552	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440685264
23	NC_019773	TCTGGC	2	12	63775	63786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685267
24	NC_019773	TCATGA	2	12	65874	65885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440685271
25	NC_019773	CGAATA	2	12	67795	67806	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440685274
26	NC_019773	ACTATC	2	12	68371	68382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440685276
27	NC_019773	TCATAA	2	12	78529	78540	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	440685286
28	NC_019773	GATAAA	2	12	80169	80180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	440685288
29	NC_019773	CGATAG	2	12	83023	83034	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440685290
30	NC_019773	ATGGCA	2	12	83064	83075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	440685290
31	NC_019773	GCGATG	2	12	83124	83135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	440685290
32	NC_019773	TGACTA	2	12	84232	84243	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	440685291
33	NC_019773	GTAGCT	2	12	84711	84722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440685291
34	NC_019773	AATCAA	2	12	88183	88194	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	440685295
35	NC_019773	AACAAA	2	12	89277	89288	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	440685295
36	NC_019773	CAAAGA	2	12	94468	94479	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	440685304
37	NC_019773	TATAAA	2	12	94523	94534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	440685304
38	NC_019773	AACTGA	2	12	96043	96054	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	440685304
39	NC_019773	GCACAG	2	12	96997	97008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440685305
40	NC_019773	GATTTC	2	12	99704	99715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440685308
41	NC_019773	CCAACT	2	12	101225	101236	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	440685311
42	NC_019773	GGGGAC	2	12	106764	106775	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	440685315
43	NC_019773	TTCTGA	2	12	118821	118832	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	440685320
44	NC_019773	GCTTGC	2	12	123381	123392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440685323
45	NC_019773	CTGCCC	2	12	127549	127560	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	440685327

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.