MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.01

Total Repeats: 430

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019772	TGAC	2	8	265	272	25 %	25 %	25 %	25 %	440685052
2	NC_019772	ATGA	2	8	307	314	50 %	25 %	25 %	0 %	440685052
3	NC_019772	AACA	2	8	1930	1937	75 %	0 %	0 %	25 %	440685054
4	NC_019772	GCGA	2	8	2422	2429	25 %	0 %	50 %	25 %	440685054
5	NC_019772	GAGG	2	8	2487	2494	25 %	0 %	75 %	0 %	440685054
6	NC_019772	GTCA	2	8	2880	2887	25 %	25 %	25 %	25 %	440685054
7	NC_019772	TAAT	2	8	5244	5251	50 %	50 %	0 %	0 %	440685056
8	NC_019772	TTTC	2	8	5815	5822	0 %	75 %	0 %	25 %	440685057
9	NC_019772	ATTG	2	8	5840	5847	25 %	50 %	25 %	0 %	440685057
10	NC_019772	ATTA	2	8	6307	6314	50 %	50 %	0 %	0 %	440685057
11	NC_019772	ACCA	2	8	7171	7178	50 %	0 %	0 %	50 %	440685058
12	NC_019772	TGGT	2	8	8182	8189	0 %	50 %	50 %	0 %	440685058
13	NC_019772	AAAG	2	8	8727	8734	75 %	0 %	25 %	0 %	440685058
14	NC_019772	AATG	2	8	9178	9185	50 %	25 %	25 %	0 %	440685059
15	NC_019772	CCAA	2	8	9215	9222	50 %	0 %	0 %	50 %	440685059
16	NC_019772	TGCT	2	8	9667	9674	0 %	50 %	25 %	25 %	440685060
17	NC_019772	ACAA	2	8	9752	9759	75 %	0 %	0 %	25 %	440685060
18	NC_019772	AATT	2	8	9873	9880	50 %	50 %	0 %	0 %	440685060
19	NC_019772	AGTA	2	8	10691	10698	50 %	25 %	25 %	0 %	440685061
20	NC_019772	ATTT	2	8	11053	11060	25 %	75 %	0 %	0 %	440685062
21	NC_019772	TTAA	2	8	11102	11109	50 %	50 %	0 %	0 %	440685062
22	NC_019772	ATTA	2	8	11641	11648	50 %	50 %	0 %	0 %	440685062
23	NC_019772	ATTT	2	8	11751	11758	25 %	75 %	0 %	0 %	440685063
24	NC_019772	CAAT	2	8	13910	13917	50 %	25 %	0 %	25 %	440685065
25	NC_019772	GCCA	2	8	14010	14017	25 %	0 %	25 %	50 %	440685065
26	NC_019772	ATTT	2	8	14232	14239	25 %	75 %	0 %	0 %	440685065
27	NC_019772	AATT	2	8	14629	14636	50 %	50 %	0 %	0 %	440685065
28	NC_019772	TTGA	2	8	14827	14834	25 %	50 %	25 %	0 %	440685065
29	NC_019772	TTGT	2	8	15045	15052	0 %	75 %	25 %	0 %	440685065
30	NC_019772	GTAA	2	8	15562	15569	50 %	25 %	25 %	0 %	440685066
31	NC_019772	AGAT	2	8	15776	15783	50 %	25 %	25 %	0 %	440685066
32	NC_019772	TTGT	2	8	15911	15918	0 %	75 %	25 %	0 %	440685067
33	NC_019772	ATAA	2	8	16356	16363	75 %	25 %	0 %	0 %	440685068
34	NC_019772	ATTG	2	8	16484	16491	25 %	50 %	25 %	0 %	440685068
35	NC_019772	ATGG	2	8	16538	16545	25 %	25 %	50 %	0 %	440685068
36	NC_019772	ATTA	2	8	16691	16698	50 %	50 %	0 %	0 %	440685068
37	NC_019772	CAAG	2	8	16913	16920	50 %	0 %	25 %	25 %	440685068
38	NC_019772	GATA	2	8	17105	17112	50 %	25 %	25 %	0 %	440685068
39	NC_019772	ATTA	2	8	17897	17904	50 %	50 %	0 %	0 %	440685068
40	NC_019772	CAAG	2	8	18096	18103	50 %	0 %	25 %	25 %	440685068
41	NC_019772	AGAA	2	8	18149	18156	75 %	0 %	25 %	0 %	440685068
42	NC_019772	AATA	2	8	19029	19036	75 %	25 %	0 %	0 %	440685068
43	NC_019772	AAAT	2	8	19348	19355	75 %	25 %	0 %	0 %	440685068
44	NC_019772	AGAA	2	8	19583	19590	75 %	0 %	25 %	0 %	440685068
45	NC_019772	TTAG	2	8	19823	19830	25 %	50 %	25 %	0 %	440685069
46	NC_019772	AATT	2	8	19861	19868	50 %	50 %	0 %	0 %	440685069
47	NC_019772	AATT	2	8	19986	19993	50 %	50 %	0 %	0 %	440685069
48	NC_019772	AGGC	2	8	20018	20025	25 %	0 %	50 %	25 %	440685069
49	NC_019772	AATT	2	8	20146	20153	50 %	50 %	0 %	0 %	440685069
50	NC_019772	AAAG	2	8	20576	20583	75 %	0 %	25 %	0 %	440685069
51	NC_019772	AATA	2	8	20695	20702	75 %	25 %	0 %	0 %	440685069
52	NC_019772	GTTA	2	8	20983	20990	25 %	50 %	25 %	0 %	440685069
53	NC_019772	GTAG	2	8	21200	21207	25 %	25 %	50 %	0 %	440685069
54	NC_019772	AACT	2	8	21995	22002	50 %	25 %	0 %	25 %	440685070
55	NC_019772	ATAG	2	8	22040	22047	50 %	25 %	25 %	0 %	440685070
56	NC_019772	CAGC	2	8	22189	22196	25 %	0 %	25 %	50 %	440685070
57	NC_019772	TCAA	2	8	22212	22219	50 %	25 %	0 %	25 %	440685070
58	NC_019772	AAAC	2	8	23027	23034	75 %	0 %	0 %	25 %	440685071
59	NC_019772	CAGT	2	8	23169	23176	25 %	25 %	25 %	25 %	440685071
60	NC_019772	GGTA	2	8	23590	23597	25 %	25 %	50 %	0 %	440685071
61	NC_019772	TCAC	2	8	23810	23817	25 %	25 %	0 %	50 %	440685071
62	NC_019772	CCAA	2	8	24032	24039	50 %	0 %	0 %	50 %	440685071
63	NC_019772	GAAC	2	8	24582	24589	50 %	0 %	25 %	25 %	440685072
64	NC_019772	GTAA	2	8	25630	25637	50 %	25 %	25 %	0 %	440685073
65	NC_019772	TAAC	2	8	25687	25694	50 %	25 %	0 %	25 %	440685073
66	NC_019772	TTCC	2	8	25765	25772	0 %	50 %	0 %	50 %	440685073
67	NC_019772	TTGT	2	8	26740	26747	0 %	75 %	25 %	0 %	440685073
68	NC_019772	TAAT	2	8	27767	27774	50 %	50 %	0 %	0 %	440685074
69	NC_019772	TTTC	2	8	28126	28133	0 %	75 %	0 %	25 %	440685074
70	NC_019772	GTTG	2	8	28552	28559	0 %	50 %	50 %	0 %	440685074
71	NC_019772	CATT	2	8	28676	28683	25 %	50 %	0 %	25 %	440685074
72	NC_019772	CAAG	2	8	29089	29096	50 %	0 %	25 %	25 %	440685075
73	NC_019772	ATTG	2	8	29209	29216	25 %	50 %	25 %	0 %	440685075
74	NC_019772	CAAA	2	8	29374	29381	75 %	0 %	0 %	25 %	440685075
75	NC_019772	GGTT	2	8	31169	31176	0 %	50 %	50 %	0 %	440685077
76	NC_019772	GTTT	2	8	36972	36979	0 %	75 %	25 %	0 %	440685078
77	NC_019772	AAAG	2	8	37001	37008	75 %	0 %	25 %	0 %	440685078
78	NC_019772	CAGT	2	8	37017	37024	25 %	25 %	25 %	25 %	440685078
79	NC_019772	GTAA	2	8	37025	37032	50 %	25 %	25 %	0 %	440685078
80	NC_019772	TTAT	2	8	37881	37888	25 %	75 %	0 %	0 %	440685079
81	NC_019772	GTTT	2	8	38440	38447	0 %	75 %	25 %	0 %	440685079
82	NC_019772	AAAC	2	8	38984	38991	75 %	0 %	0 %	25 %	440685080
83	NC_019772	CAGG	2	8	39441	39448	25 %	0 %	50 %	25 %	440685080
84	NC_019772	AGAA	2	8	39527	39534	75 %	0 %	25 %	0 %	440685080
85	NC_019772	ATTT	2	8	40460	40467	25 %	75 %	0 %	0 %	440685081
86	NC_019772	AACT	2	8	42092	42099	50 %	25 %	0 %	25 %	440685082
87	NC_019772	TGTA	2	8	42272	42279	25 %	50 %	25 %	0 %	440685082
88	NC_019772	ATTT	2	8	42830	42837	25 %	75 %	0 %	0 %	440685083
89	NC_019772	GAAT	2	8	43089	43096	50 %	25 %	25 %	0 %	440685083
90	NC_019772	AGCG	2	8	43231	43238	25 %	0 %	50 %	25 %	440685083
91	NC_019772	AGCC	2	8	43392	43399	25 %	0 %	25 %	50 %	440685083
92	NC_019772	AGCA	2	8	44099	44106	50 %	0 %	25 %	25 %	440685083
93	NC_019772	TGTA	2	8	44865	44872	25 %	50 %	25 %	0 %	440685085
94	NC_019772	CGAA	2	8	44948	44955	50 %	0 %	25 %	25 %	440685085
95	NC_019772	CTTC	2	8	45313	45320	0 %	50 %	0 %	50 %	440685085
96	NC_019772	TACC	2	8	45346	45353	25 %	25 %	0 %	50 %	440685085
97	NC_019772	GGCT	2	8	45433	45440	0 %	25 %	50 %	25 %	440685085
98	NC_019772	AAGG	2	8	45511	45518	50 %	0 %	50 %	0 %	440685085
99	NC_019772	CTGA	2	8	46024	46031	25 %	25 %	25 %	25 %	440685085
100	NC_019772	ATTT	2	8	46306	46313	25 %	75 %	0 %	0 %	440685085
101	NC_019772	ACAA	2	8	46670	46677	75 %	0 %	0 %	25 %	440685085
102	NC_019772	ACTA	2	8	46725	46732	50 %	25 %	0 %	25 %	440685085
103	NC_019772	AGGA	2	8	47114	47121	50 %	0 %	50 %	0 %	440685085
104	NC_019772	TATG	2	8	50247	50254	25 %	50 %	25 %	0 %	440685086
105	NC_019772	ATCA	2	8	50334	50341	50 %	25 %	0 %	25 %	440685086
106	NC_019772	CTTG	2	8	50605	50612	0 %	50 %	25 %	25 %	440685086
107	NC_019772	CTTC	2	8	50930	50937	0 %	50 %	0 %	50 %	440685086
108	NC_019772	TCAC	2	8	50965	50972	25 %	25 %	0 %	50 %	440685086
109	NC_019772	GTTG	2	8	51581	51588	0 %	50 %	50 %	0 %	440685087
110	NC_019772	TTTA	2	8	51590	51597	25 %	75 %	0 %	0 %	440685087
111	NC_019772	ATTT	2	8	51699	51706	25 %	75 %	0 %	0 %	440685087
112	NC_019772	TTTA	2	8	51806	51813	25 %	75 %	0 %	0 %	440685087
113	NC_019772	TAAA	2	8	51898	51905	75 %	25 %	0 %	0 %	440685087
114	NC_019772	TTTC	2	8	52319	52326	0 %	75 %	0 %	25 %	440685087
115	NC_019772	AGTT	2	8	52334	52341	25 %	50 %	25 %	0 %	440685087
116	NC_019772	AAAG	2	8	52688	52695	75 %	0 %	25 %	0 %	440685087
117	NC_019772	TAGA	2	8	52732	52739	50 %	25 %	25 %	0 %	440685087
118	NC_019772	AATC	2	8	52996	53003	50 %	25 %	0 %	25 %	440685088
119	NC_019772	GAAG	2	8	53689	53696	50 %	0 %	50 %	0 %	440685088
120	NC_019772	ATTA	2	8	54329	54336	50 %	50 %	0 %	0 %	440685089
121	NC_019772	CAAG	2	8	54379	54386	50 %	0 %	25 %	25 %	440685089
122	NC_019772	AATC	2	8	54784	54791	50 %	25 %	0 %	25 %	440685090
123	NC_019772	AATG	2	8	55607	55614	50 %	25 %	25 %	0 %	440685091
124	NC_019772	GGTA	2	8	56696	56703	25 %	25 %	50 %	0 %	440685092
125	NC_019772	ATGT	2	8	57377	57384	25 %	50 %	25 %	0 %	440685093
126	NC_019772	TTTG	2	8	61681	61688	0 %	75 %	25 %	0 %	440685094
127	NC_019772	TATT	2	8	62153	62160	25 %	75 %	0 %	0 %	440685095
128	NC_019772	ATTT	2	8	62221	62228	25 %	75 %	0 %	0 %	440685095
129	NC_019772	CTTT	2	8	62420	62427	0 %	75 %	0 %	25 %	440685096
130	NC_019772	ATCA	2	8	62818	62825	50 %	25 %	0 %	25 %	440685096
131	NC_019772	TGTT	2	8	64020	64027	0 %	75 %	25 %	0 %	440685099
132	NC_019772	CAGA	2	8	64493	64500	50 %	0 %	25 %	25 %	440685100
133	NC_019772	AAGA	2	8	65770	65777	75 %	0 %	25 %	0 %	440685101
134	NC_019772	CTAG	2	8	65796	65803	25 %	25 %	25 %	25 %	440685101
135	NC_019772	AATT	2	8	65899	65906	50 %	50 %	0 %	0 %	440685101
136	NC_019772	AGAC	2	8	65924	65931	50 %	0 %	25 %	25 %	440685101
137	NC_019772	TTGA	2	8	68548	68555	25 %	50 %	25 %	0 %	440685103
138	NC_019772	CAAT	2	8	68646	68653	50 %	25 %	0 %	25 %	440685103
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.