MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Anabaena sp. 90 plasmid pANA01

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019428	ATTC	2	8	1111	1118	25 %	50 %	0 %	25 %	414078961
2	NC_019428	TAAT	2	8	1177	1184	50 %	50 %	0 %	0 %	414078961
3	NC_019428	GTTC	2	8	1710	1717	0 %	50 %	25 %	25 %	414078961
4	NC_019428	AATT	2	8	2116	2123	50 %	50 %	0 %	0 %	414078961
5	NC_019428	ATTT	2	8	2839	2846	25 %	75 %	0 %	0 %	414078961
6	NC_019428	GTCC	2	8	3147	3154	0 %	25 %	25 %	50 %	414078961
7	NC_019428	CGCA	2	8	3222	3229	25 %	0 %	25 %	50 %	414078961
8	NC_019428	CTTG	2	8	3420	3427	0 %	50 %	25 %	25 %	414078961
9	NC_019428	TTCG	2	8	3612	3619	0 %	50 %	25 %	25 %	414078961
10	NC_019428	TTCG	2	8	3764	3771	0 %	50 %	25 %	25 %	414078961
11	NC_019428	ATAG	2	8	4140	4147	50 %	25 %	25 %	0 %	414078961
12	NC_019428	ACAA	2	8	4370	4377	75 %	0 %	0 %	25 %	414078961
13	NC_019428	TAAG	2	8	5077	5084	50 %	25 %	25 %	0 %	414078962
14	NC_019428	ACAA	2	8	5201	5208	75 %	0 %	0 %	25 %	414078962
15	NC_019428	TTTA	2	8	6155	6162	25 %	75 %	0 %	0 %	414078963
16	NC_019428	AACT	2	8	6260	6267	50 %	25 %	0 %	25 %	414078963
17	NC_019428	ATGA	2	8	6823	6830	50 %	25 %	25 %	0 %	414078963
18	NC_019428	ATTG	2	8	8601	8608	25 %	50 %	25 %	0 %	414078966
19	NC_019428	ATTA	2	8	9068	9075	50 %	50 %	0 %	0 %	414078966
20	NC_019428	CGAG	2	8	9086	9093	25 %	0 %	50 %	25 %	414078966
21	NC_019428	TATC	2	8	9708	9715	25 %	50 %	0 %	25 %	414078967
22	NC_019428	CCCA	2	8	10359	10366	25 %	0 %	0 %	75 %	414078968
23	NC_019428	TAAA	2	8	11259	11266	75 %	25 %	0 %	0 %	414078969
24	NC_019428	TCCC	2	8	11482	11489	0 %	25 %	0 %	75 %	414078969
25	NC_019428	CATC	2	8	11534	11541	25 %	25 %	0 %	50 %	414078969
26	NC_019428	ATTT	2	8	11835	11842	25 %	75 %	0 %	0 %	414078969
27	NC_019428	TCGC	2	8	12298	12305	0 %	25 %	25 %	50 %	414078970
28	NC_019428	TTAA	2	8	13406	13413	50 %	50 %	0 %	0 %	414078972
29	NC_019428	TCAT	2	8	13600	13607	25 %	50 %	0 %	25 %	414078972
30	NC_019428	AATC	2	8	15604	15611	50 %	25 %	0 %	25 %	414078973
31	NC_019428	ATGA	2	8	16419	16426	50 %	25 %	25 %	0 %	414078974
32	NC_019428	TTGT	2	8	16972	16979	0 %	75 %	25 %	0 %	414078974
33	NC_019428	TAAT	2	8	18397	18404	50 %	50 %	0 %	0 %	414078974
34	NC_019428	ATTA	2	8	18438	18445	50 %	50 %	0 %	0 %	414078974
35	NC_019428	AAAG	2	8	19064	19071	75 %	0 %	25 %	0 %	414078975
36	NC_019428	CTTG	2	8	20362	20369	0 %	50 %	25 %	25 %	414078975
37	NC_019428	TGAT	2	8	20454	20461	25 %	50 %	25 %	0 %	414078975
38	NC_019428	TAAA	2	8	21182	21189	75 %	25 %	0 %	0 %	414078975
39	NC_019428	ATCA	2	8	21419	21426	50 %	25 %	0 %	25 %	414078975
40	NC_019428	ACTG	2	8	21452	21459	25 %	25 %	25 %	25 %	414078975
41	NC_019428	TTTC	2	8	21682	21689	0 %	75 %	0 %	25 %	414078975
42	NC_019428	CCAG	2	8	21746	21753	25 %	0 %	25 %	50 %	414078975
43	NC_019428	TTGC	2	8	22177	22184	0 %	50 %	25 %	25 %	414078975
44	NC_019428	TCGT	2	8	22232	22239	0 %	50 %	25 %	25 %	414078975
45	NC_019428	CCCA	2	8	22798	22805	25 %	0 %	0 %	75 %	414078976
46	NC_019428	AGAT	2	8	23315	23322	50 %	25 %	25 %	0 %	414078977
47	NC_019428	TTGA	2	8	23585	23592	25 %	50 %	25 %	0 %	414078977
48	NC_019428	GCAC	2	8	23829	23836	25 %	0 %	25 %	50 %	414078977
49	NC_019428	ACTG	2	8	23868	23875	25 %	25 %	25 %	25 %	414078977
50	NC_019428	TTGG	2	8	24229	24236	0 %	50 %	50 %	0 %	414078978
51	NC_019428	CAAT	2	8	24425	24432	50 %	25 %	0 %	25 %	414078978
52	NC_019428	TTGA	2	8	24763	24770	25 %	50 %	25 %	0 %	414078978
53	NC_019428	CTAT	2	8	25409	25416	25 %	50 %	0 %	25 %	414078979
54	NC_019428	AGGG	2	8	25996	26003	25 %	0 %	75 %	0 %	414078979
55	NC_019428	TGAT	2	8	26039	26046	25 %	50 %	25 %	0 %	414078979
56	NC_019428	AATT	2	8	26450	26457	50 %	50 %	0 %	0 %	414078979
57	NC_019428	ACTG	2	8	26850	26857	25 %	25 %	25 %	25 %	414078979
58	NC_019428	GATT	2	8	26964	26971	25 %	50 %	25 %	0 %	414078979
59	NC_019428	TCAA	2	8	27407	27414	50 %	25 %	0 %	25 %	414078980
60	NC_019428	GAAA	2	8	27430	27437	75 %	0 %	25 %	0 %	414078980
61	NC_019428	CAAT	2	8	27592	27599	50 %	25 %	0 %	25 %	414078980
62	NC_019428	ATTA	2	8	27606	27613	50 %	50 %	0 %	0 %	414078980
63	NC_019428	GAAA	2	8	27928	27935	75 %	0 %	25 %	0 %	414078980
64	NC_019428	GGGT	2	8	28419	28426	0 %	25 %	75 %	0 %	414078981
65	NC_019428	GTGA	2	8	29904	29911	25 %	25 %	50 %	0 %	414078983
66	NC_019428	AAAT	2	8	30501	30508	75 %	25 %	0 %	0 %	414078983
67	NC_019428	TGAA	2	8	30681	30688	50 %	25 %	25 %	0 %	414078983
68	NC_019428	TGTT	2	8	30860	30867	0 %	75 %	25 %	0 %	414078984
69	NC_019428	TACT	2	8	31012	31019	25 %	50 %	0 %	25 %	414078984
70	NC_019428	CTTT	2	8	31336	31343	0 %	75 %	0 %	25 %	414078985
71	NC_019428	AGTA	2	8	32545	32552	50 %	25 %	25 %	0 %	414078988
72	NC_019428	ATTA	2	8	32908	32915	50 %	50 %	0 %	0 %	414078989
73	NC_019428	ACCA	2	8	34639	34646	50 %	0 %	0 %	50 %	414078992
74	NC_019428	GAAT	2	8	34834	34841	50 %	25 %	25 %	0 %	414078992
75	NC_019428	ATTC	2	8	36399	36406	25 %	50 %	0 %	25 %	414078995
76	NC_019428	TTCT	2	8	36515	36522	0 %	75 %	0 %	25 %	414078996
77	NC_019428	AAAT	2	8	36539	36546	75 %	25 %	0 %	0 %	414078996
78	NC_019428	TAGT	2	8	36787	36794	25 %	50 %	25 %	0 %	414078997
79	NC_019428	ATCA	2	8	37477	37484	50 %	25 %	0 %	25 %	414078998
80	NC_019428	TAAC	2	8	38359	38366	50 %	25 %	0 %	25 %	414079000
81	NC_019428	AATC	2	8	38900	38907	50 %	25 %	0 %	25 %	414079001
82	NC_019428	TAAT	2	8	39169	39176	50 %	50 %	0 %	0 %	414079001
83	NC_019428	AAGT	2	8	40590	40597	50 %	25 %	25 %	0 %	414079005
84	NC_019428	ATTT	2	8	41444	41451	25 %	75 %	0 %	0 %	414079006
85	NC_019428	TTAG	2	8	41695	41702	25 %	50 %	25 %	0 %	414079006
86	NC_019428	ATTT	2	8	42456	42463	25 %	75 %	0 %	0 %	414079007
87	NC_019428	TTCA	2	8	43373	43380	25 %	50 %	0 %	25 %	414079009
88	NC_019428	GGGT	2	8	43602	43609	0 %	25 %	75 %	0 %	414079010
89	NC_019428	TAAA	2	8	44009	44016	75 %	25 %	0 %	0 %	414079010
90	NC_019428	AAAT	2	8	45283	45290	75 %	25 %	0 %	0 %	414079011
91	NC_019428	AGAA	2	8	45951	45958	75 %	0 %	25 %	0 %	414079012
92	NC_019428	TGTT	2	8	46028	46035	0 %	75 %	25 %	0 %	414079012
93	NC_019428	ACCA	2	8	46981	46988	50 %	0 %	0 %	50 %	414079013
94	NC_019428	ATTC	2	8	47876	47883	25 %	50 %	0 %	25 %	414079015
95	NC_019428	ATTA	2	8	48006	48013	50 %	50 %	0 %	0 %	414079015
96	NC_019428	ATTC	2	8	48921	48928	25 %	50 %	0 %	25 %	414079016
97	NC_019428	TCAG	2	8	49474	49481	25 %	25 %	25 %	25 %	414079017
98	NC_019428	AAGC	2	8	50088	50095	50 %	0 %	25 %	25 %	414079018
99	NC_019428	AATT	2	8	51437	51444	50 %	50 %	0 %	0 %	414079020
100	NC_019428	CGGT	2	8	51574	51581	0 %	25 %	50 %	25 %	414079021
101	NC_019428	CTGG	2	8	51707	51714	0 %	25 %	50 %	25 %	414079021
102	NC_019428	AAAT	2	8	51715	51722	75 %	25 %	0 %	0 %	414079021
103	NC_019428	TTTG	2	8	51929	51936	0 %	75 %	25 %	0 %	414079021
104	NC_019428	GTTA	2	8	51998	52005	25 %	50 %	25 %	0 %	414079021
105	NC_019428	GAGT	2	8	53402	53409	25 %	25 %	50 %	0 %	414079023
106	NC_019428	ACTA	2	8	53427	53434	50 %	25 %	0 %	25 %	414079024
107	NC_019428	TCAA	2	8	53678	53685	50 %	25 %	0 %	25 %	414079024
108	NC_019428	CAAC	2	8	54126	54133	50 %	0 %	0 %	50 %	414079024
109	NC_019428	TTGG	2	8	54249	54256	0 %	50 %	50 %	0 %	414079024
110	NC_019428	ATAA	2	8	54932	54939	75 %	25 %	0 %	0 %	414079024
111	NC_019428	ATTG	2	8	56437	56444	25 %	50 %	25 %	0 %	414079027
112	NC_019428	TGGT	2	8	57799	57806	0 %	50 %	50 %	0 %	414079030
113	NC_019428	GGAA	2	8	57832	57839	50 %	0 %	50 %	0 %	414079030
114	NC_019428	TGAG	2	8	58302	58309	25 %	25 %	50 %	0 %	414079031
115	NC_019428	ATCT	2	8	58358	58365	25 %	50 %	0 %	25 %	414079032
116	NC_019428	CTTC	2	8	59626	59633	0 %	50 %	0 %	50 %	414079034
117	NC_019428	AAAT	2	8	60466	60473	75 %	25 %	0 %	0 %	414079035
118	NC_019428	ATCA	2	8	61970	61977	50 %	25 %	0 %	25 %	414079036
119	NC_019428	CAAA	2	8	63011	63018	75 %	0 %	0 %	25 %	414079037
120	NC_019428	GTTT	2	8	63026	63033	0 %	75 %	25 %	0 %	414079037
121	NC_019428	TTTG	2	8	63305	63312	0 %	75 %	25 %	0 %	414079037
122	NC_019428	ATAA	2	8	65408	65415	75 %	25 %	0 %	0 %	414079039
123	NC_019428	ACCA	2	8	65600	65607	50 %	0 %	0 %	50 %	414079039
124	NC_019428	AAAT	2	8	65669	65676	75 %	25 %	0 %	0 %	414079039
125	NC_019428	GTTT	2	8	66115	66122	0 %	75 %	25 %	0 %	414079040
126	NC_019428	TGAT	2	8	66147	66154	25 %	50 %	25 %	0 %	414079040
127	NC_019428	TTTG	2	8	66778	66785	0 %	75 %	25 %	0 %	414079040
128	NC_019428	CTTC	2	8	67279	67286	0 %	50 %	0 %	50 %	414079040
129	NC_019428	ACTT	2	8	67537	67544	25 %	50 %	0 %	25 %	414079040
130	NC_019428	CAAC	2	8	67930	67937	50 %	0 %	0 %	50 %	414079041
131	NC_019428	TATT	2	8	68118	68125	25 %	75 %	0 %	0 %	414079041
132	NC_019428	CTGC	2	8	68138	68145	0 %	25 %	25 %	50 %	414079041
133	NC_019428	ATTG	2	8	68559	68566	25 %	50 %	25 %	0 %	414079041
134	NC_019428	TATC	2	8	68954	68961	25 %	50 %	0 %	25 %	414079042
135	NC_019428	TCAT	2	8	69257	69264	25 %	50 %	0 %	25 %	414079042
136	NC_019428	CTAC	2	8	70002	70009	25 %	25 %	0 %	50 %	414079043
137	NC_019428	GATT	2	8	70052	70059	25 %	50 %	25 %	0 %	414079043
138	NC_019428	AACC	2	8	71003	71010	50 %	0 %	0 %	50 %	414079044
139	NC_019428	GAGT	2	8	71361	71368	25 %	25 %	50 %	0 %	414079044
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141	NC_019428	TTCA	2	8	71956	71963	25 %	50 %	0 %	25 %	414079044
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.