MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 28271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018690	TTG	2	6	176	181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691595
2	NC_018690	TCG	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691595
3	NC_018690	CGG	2	6	284	289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691595
4	NC_018690	AGA	2	6	333	338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
5	NC_018690	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691595
6	NC_018690	CGG	2	6	495	500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691595
7	NC_018690	TTA	2	6	523	528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691595
8	NC_018690	TGA	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691595
9	NC_018690	TAA	2	6	705	710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691595
10	NC_018690	AAG	2	6	722	727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
11	NC_018690	ATT	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691595
12	NC_018690	TAA	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691595
13	NC_018690	ATT	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691595
14	NC_018690	GAA	2	6	817	822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
15	NC_018690	ACC	2	6	867	872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691595
16	NC_018690	TGA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691595
17	NC_018690	GAA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
18	NC_018690	GAA	2	6	937	942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
19	NC_018690	CTT	2	6	1085	1090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691595
20	NC_018690	ACA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691595
21	NC_018690	AAG	2	6	1346	1351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691595
22	NC_018690	ACA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691596
23	NC_018690	AGC	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691596
24	NC_018690	TAA	2	6	1492	1497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691596
25	NC_018690	AGC	2	6	1661	1666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691596
26	NC_018690	GAA	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691596
27	NC_018690	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691596
28	NC_018690	AAG	3	9	2301	2309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691596
29	NC_018690	TGG	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691596
30	NC_018690	GCT	2	6	2442	2447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691596
31	NC_018690	TTA	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691596
32	NC_018690	ATC	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691597
33	NC_018690	AAT	2	6	2590	2595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691597
34	NC_018690	CTG	2	6	2680	2685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691597
35	NC_018690	TGA	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691597
36	NC_018690	TAA	2	6	2871	2876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691597
37	NC_018690	TTA	2	6	2935	2940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691597
38	NC_018690	TGG	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691597
39	NC_018690	CCA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691597
40	NC_018690	CAA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691597
41	NC_018690	ACC	3	9	3745	3753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691598
42	NC_018690	TGC	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691598
43	NC_018690	GTG	2	6	3843	3848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691598
44	NC_018690	GTT	2	6	3859	3864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691598
45	NC_018690	GTT	2	6	3939	3944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691598
46	NC_018690	CCG	2	6	3968	3973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691598
47	NC_018690	CTA	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691598
48	NC_018690	TAC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691598
49	NC_018690	TGG	2	6	4205	4210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691598
50	NC_018690	GCA	3	9	4220	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691598
51	NC_018690	AAT	2	6	4244	4249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691598
52	NC_018690	GAA	2	6	4650	4655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691599
53	NC_018690	TGC	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691599
54	NC_018690	TTA	2	6	4822	4827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
55	NC_018690	TTG	2	6	4858	4863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691599
56	NC_018690	CGG	2	6	4901	4906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691599
57	NC_018690	TAG	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691599
58	NC_018690	AGA	2	6	5015	5020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691599
59	NC_018690	TCA	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691599
60	NC_018690	ATT	2	6	5165	5170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
61	NC_018690	AGA	2	6	5189	5194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691599
62	NC_018690	ATT	2	6	5352	5357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
63	NC_018690	GCG	2	6	5358	5363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691599
64	NC_018690	ACT	2	6	5403	5408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691599
65	NC_018690	ATT	2	6	5522	5527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691599
66	NC_018690	CGT	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691599
67	NC_018690	AAT	2	6	5575	5580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691599
68	NC_018690	CAA	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691600
69	NC_018690	TGT	2	6	5736	5741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691600
70	NC_018690	AGT	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691600
71	NC_018690	CCA	2	6	5870	5875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691600
72	NC_018690	TCA	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691600
73	NC_018690	GAT	2	6	5978	5983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691600
74	NC_018690	CTT	2	6	5999	6004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691600
75	NC_018690	ACG	2	6	6048	6053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691600
76	NC_018690	TCA	2	6	6196	6201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691600
77	NC_018690	ACG	2	6	6348	6353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691600
78	NC_018690	TAA	2	6	6366	6371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691600
79	NC_018690	TGA	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691600
80	NC_018690	CAC	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691600
81	NC_018690	GTT	2	6	6599	6604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691600
82	NC_018690	AAT	2	6	6769	6774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691600
83	NC_018690	ATG	2	6	6988	6993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691601
84	NC_018690	AAG	2	6	6998	7003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691601
85	NC_018690	CGT	2	6	7219	7224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691601
86	NC_018690	GAA	2	6	7306	7311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691601
87	NC_018690	GAT	2	6	7779	7784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691601
88	NC_018690	GCG	2	6	7819	7824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691601
89	NC_018690	TGT	2	6	7835	7840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691601
90	NC_018690	ATT	2	6	8015	8020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691601
91	NC_018690	GAT	2	6	8026	8031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691601
92	NC_018690	AAC	2	6	8063	8068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691601
93	NC_018690	GGC	2	6	8115	8120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691601
94	NC_018690	GGT	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691601
95	NC_018690	TTG	2	6	8263	8268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691602
96	NC_018690	GTT	3	9	8271	8279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691602
97	NC_018690	GAA	2	6	8391	8396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691602
98	NC_018690	CAG	2	6	8406	8411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691602
99	NC_018690	AAG	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691602
100	NC_018690	GTG	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691602
101	NC_018690	GCG	2	6	8661	8666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691602
102	NC_018690	GCG	2	6	8727	8732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691602
103	NC_018690	GCG	2	6	8734	8739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691602
104	NC_018690	ATG	2	6	8745	8750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691602
105	NC_018690	GAA	2	6	8955	8960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691602
106	NC_018690	ATT	2	6	8969	8974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691602
107	NC_018690	CAA	2	6	9085	9090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691602
108	NC_018690	TGA	2	6	9092	9097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691602
109	NC_018690	TTG	2	6	9102	9107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691602
110	NC_018690	AGA	2	6	9151	9156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691602
111	NC_018690	ATT	2	6	9207	9212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691602
112	NC_018690	TAC	2	6	9220	9225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691602
113	NC_018690	ATG	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691602
114	NC_018690	AAT	2	6	9495	9500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691603
115	NC_018690	CTT	2	6	9515	9520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691603
116	NC_018690	CAC	2	6	9633	9638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691603
117	NC_018690	ATA	2	6	9652	9657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691603
118	NC_018690	TAA	2	6	9749	9754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691603
119	NC_018690	GTT	2	6	9761	9766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691603
120	NC_018690	CAA	2	6	9787	9792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691603
121	NC_018690	TTG	2	6	9873	9878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691603
122	NC_018690	GTA	2	6	9940	9945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691603
123	NC_018690	TGT	2	6	10003	10008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691603
124	NC_018690	ATT	2	6	10188	10193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691604
125	NC_018690	ATG	2	6	10325	10330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691604
126	NC_018690	TAA	2	6	10360	10365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691604
127	NC_018690	CTT	2	6	10693	10698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691604
128	NC_018690	CAG	2	6	10722	10727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691604
129	NC_018690	TTA	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691604
130	NC_018690	TAA	2	6	10777	10782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691604
131	NC_018690	TGC	2	6	10786	10791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691604
132	NC_018690	ATT	2	6	10969	10974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691604
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135	NC_018690	AAT	2	6	11237	11242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691604
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139	NC_018690	CGG	2	6	11398	11403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691604
140	NC_018690	ACC	2	6	11623	11628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691605
141	NC_018690	CAT	2	6	11664	11669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691605
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154	NC_018690	TAA	2	6	12951	12956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691606
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243	NC_018690	ATT	2	6	20129	20134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691615
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246	NC_018690	TGA	2	6	20312	20317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691615
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249	NC_018690	TTG	2	6	20510	20515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691615
250	NC_018690	ATT	2	6	20637	20642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691616
251	NC_018690	AAC	2	6	20716	20721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691616
252	NC_018690	AAT	2	6	20731	20736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691616
253	NC_018690	GCA	2	6	20737	20742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691616
254	NC_018690	TAT	2	6	20978	20983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691616
255	NC_018690	ATA	2	6	21007	21012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691616
256	NC_018690	CGG	2	6	21035	21040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691616
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