MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Alistipes finegoldii DSM 17242 chromosome

Total Repeats: 2054

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018011	CGCGG	2	10	3644528	3644537	0 %	0 %	60 %	40 %	390948374
2002	NC_018011	CGGCG	2	10	3644618	3644627	0 %	0 %	60 %	40 %	390948374
2003	NC_018011	CGGCG	2	10	3646666	3646675	0 %	0 %	60 %	40 %	390948377
2004	NC_018011	CACCT	2	10	3649858	3649867	20 %	20 %	0 %	60 %	390948380
2005	NC_018011	GGGGA	2	10	3652334	3652343	20 %	0 %	80 %	0 %	390948383
2006	NC_018011	AAGGC	2	10	3652860	3652869	40 %	0 %	40 %	20 %	390948383
2007	NC_018011	TGCGC	2	10	3653125	3653134	0 %	20 %	40 %	40 %	390948383
2008	NC_018011	AGTGC	2	10	3654019	3654028	20 %	20 %	40 %	20 %	390948384
2009	NC_018011	AAGAG	2	10	3655691	3655700	60 %	0 %	40 %	0 %	390948385
2010	NC_018011	CGGCG	2	10	3657866	3657875	0 %	0 %	60 %	40 %	390948389
2011	NC_018011	ATCGC	2	10	3659863	3659872	20 %	20 %	20 %	40 %	390948390
2012	NC_018011	CGACG	2	10	3660974	3660983	20 %	0 %	40 %	40 %	390948391
2013	NC_018011	CAGCG	2	10	3661306	3661315	20 %	0 %	40 %	40 %	390948392
2014	NC_018011	CGCAG	2	10	3662808	3662817	20 %	0 %	40 %	40 %	390948393
2015	NC_018011	AGCGC	2	10	3665705	3665714	20 %	0 %	40 %	40 %	390948396
2016	NC_018011	CGTGC	2	10	3669116	3669125	0 %	20 %	40 %	40 %	390948397
2017	NC_018011	ACGGC	2	10	3669689	3669698	20 %	0 %	40 %	40 %	390948398
2018	NC_018011	CGGCT	2	10	3671904	3671913	0 %	20 %	40 %	40 %	390948400
2019	NC_018011	GCATC	2	10	3674688	3674697	20 %	20 %	20 %	40 %	390948402
2020	NC_018011	GCACG	2	10	3674911	3674920	20 %	0 %	40 %	40 %	390948402
2021	NC_018011	CAGCG	2	10	3675155	3675164	20 %	0 %	40 %	40 %	390948402
2022	NC_018011	AGCGA	2	10	3677914	3677923	40 %	0 %	40 %	20 %	390948405
2023	NC_018011	CCGGA	2	10	3678173	3678182	20 %	0 %	40 %	40 %	390948405
2024	NC_018011	GCCGT	2	10	3679020	3679029	0 %	20 %	40 %	40 %	390948405
2025	NC_018011	TGCTC	2	10	3679912	3679921	0 %	40 %	20 %	40 %	390948406
2026	NC_018011	CATGG	2	10	3682711	3682720	20 %	20 %	40 %	20 %	390948408
2027	NC_018011	GGCGC	2	10	3684795	3684804	0 %	0 %	60 %	40 %	390948410
2028	NC_018011	AATCG	2	10	3684963	3684972	40 %	20 %	20 %	20 %	390948410
2029	NC_018011	CACGC	2	10	3686712	3686721	20 %	0 %	20 %	60 %	390948412
2030	NC_018011	TCGCA	2	10	3689087	3689096	20 %	20 %	20 %	40 %	390948413
2031	NC_018011	GTCCG	2	10	3696808	3696817	0 %	20 %	40 %	40 %	390948421
2032	NC_018011	TGGCC	2	10	3697616	3697625	0 %	20 %	40 %	40 %	390948422
2033	NC_018011	CGACG	2	10	3698065	3698074	20 %	0 %	40 %	40 %	390948423
2034	NC_018011	GTACC	2	10	3698655	3698664	20 %	20 %	20 %	40 %	390948423
2035	NC_018011	TTTTA	2	10	3700077	3700086	20 %	80 %	0 %	0 %	390948425
2036	NC_018011	CGGAG	2	10	3700462	3700471	20 %	0 %	60 %	20 %	390948426
2037	NC_018011	GACGC	2	10	3701608	3701617	20 %	0 %	40 %	40 %	390948426
2038	NC_018011	AACGC	2	10	3703194	3703203	40 %	0 %	20 %	40 %	390948428
2039	NC_018011	GGTGC	2	10	3703664	3703673	0 %	20 %	60 %	20 %	390948428
2040	NC_018011	ACGGC	2	10	3704983	3704992	20 %	0 %	40 %	40 %	390948430
2041	NC_018011	ATCCG	2	10	3707583	3707592	20 %	20 %	20 %	40 %	390948433
2042	NC_018011	CAGCA	2	10	3710945	3710954	40 %	0 %	20 %	40 %	390948436
2043	NC_018011	ATAAG	2	10	3712331	3712340	60 %	20 %	20 %	0 %	390948438
2044	NC_018011	CCGCG	2	10	3713576	3713585	0 %	0 %	40 %	60 %	390948440
2045	NC_018011	GCCGA	2	10	3719663	3719672	20 %	0 %	40 %	40 %	390948444
2046	NC_018011	AAGCA	2	10	3720387	3720396	60 %	0 %	20 %	20 %	390948446
2047	NC_018011	GGGCG	2	10	3722912	3722921	0 %	0 %	80 %	20 %	390948448
2048	NC_018011	CTCGC	2	10	3723448	3723457	0 %	20 %	20 %	60 %	390948449
2049	NC_018011	GACGC	2	10	3724904	3724913	20 %	0 %	40 %	40 %	390948450
2050	NC_018011	ATCGC	2	10	3725240	3725249	20 %	20 %	20 %	40 %	390948450
2051	NC_018011	ACACG	2	10	3726726	3726735	40 %	0 %	20 %	40 %	390948451
2052	NC_018011	CGCCC	2	10	3727170	3727179	0 %	0 %	20 %	80 %	390948451
2053	NC_018011	GGGGC	2	10	3729845	3729854	0 %	0 %	80 %	20 %	390948453
2054	NC_018011	GCGCA	2	10	3733117	3733126	20 %	0 %	40 %	40 %	390948457

< Previous12345Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.