MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Advenella kashmirensis WT001 plasmid pWTk445

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017965	AAGT	2	8	2053	2060	50 %	25 %	25 %	0 %	389874177
2	NC_017965	AGTT	2	8	2941	2948	25 %	50 %	25 %	0 %	389874178
3	NC_017965	TGTC	2	8	4399	4406	0 %	50 %	25 %	25 %	389874179
4	NC_017965	ACGC	2	8	5298	5305	25 %	0 %	25 %	50 %	389874180
5	NC_017965	CCCA	3	12	5979	5990	25 %	0 %	0 %	75 %	389874181
6	NC_017965	CCGG	2	8	7021	7028	0 %	0 %	50 %	50 %	389874181
7	NC_017965	ATGG	2	8	7036	7043	25 %	25 %	50 %	0 %	389874181
8	NC_017965	ATCG	2	8	7116	7123	25 %	25 %	25 %	25 %	389874181
9	NC_017965	TCTT	2	8	7454	7461	0 %	75 %	0 %	25 %	389874181
10	NC_017965	CCTG	2	8	7805	7812	0 %	25 %	25 %	50 %	389874182
11	NC_017965	CCGG	2	8	8334	8341	0 %	0 %	50 %	50 %	389874182
12	NC_017965	CAGT	2	8	8527	8534	25 %	25 %	25 %	25 %	389874183
13	NC_017965	TCAA	2	8	8603	8610	50 %	25 %	0 %	25 %	389874183
14	NC_017965	GCCA	2	8	8797	8804	25 %	0 %	25 %	50 %	389874183
15	NC_017965	TCGC	2	8	9375	9382	0 %	25 %	25 %	50 %	389874184
16	NC_017965	GAAG	2	8	9461	9468	50 %	0 %	50 %	0 %	389874184
17	NC_017965	CATC	2	8	11280	11287	25 %	25 %	0 %	50 %	389874185
18	NC_017965	CGAC	2	8	14961	14968	25 %	0 %	25 %	50 %	389874190
19	NC_017965	GATC	2	8	15110	15117	25 %	25 %	25 %	25 %	389874190
20	NC_017965	AAAT	2	8	15239	15246	75 %	25 %	0 %	0 %	389874190
21	NC_017965	CTGG	2	8	15499	15506	0 %	25 %	50 %	25 %	389874191
22	NC_017965	TCGG	2	8	15683	15690	0 %	25 %	50 %	25 %	389874191
23	NC_017965	GCAG	2	8	15962	15969	25 %	0 %	50 %	25 %	389874191
24	NC_017965	CAAA	2	8	16455	16462	75 %	0 %	0 %	25 %	389874191
25	NC_017965	TAAT	2	8	16967	16974	50 %	50 %	0 %	0 %	389874191
26	NC_017965	GATT	2	8	17245	17252	25 %	50 %	25 %	0 %	389874191
27	NC_017965	ATTG	2	8	17295	17302	25 %	50 %	25 %	0 %	389874191
28	NC_017965	AGCC	2	8	19186	19193	25 %	0 %	25 %	50 %	389874192
29	NC_017965	GATC	2	8	19606	19613	25 %	25 %	25 %	25 %	389874192
30	NC_017965	CAAC	2	8	19687	19694	50 %	0 %	0 %	50 %	389874192
31	NC_017965	TTTG	2	8	19952	19959	0 %	75 %	25 %	0 %	389874193
32	NC_017965	GAAA	2	8	20827	20834	75 %	0 %	25 %	0 %	389874194
33	NC_017965	AGAC	2	8	21472	21479	50 %	0 %	25 %	25 %	389874195
34	NC_017965	CTGG	2	8	21946	21953	0 %	25 %	50 %	25 %	389874195
35	NC_017965	GCAA	2	8	21980	21987	50 %	0 %	25 %	25 %	389874195
36	NC_017965	AAGT	2	8	22008	22015	50 %	25 %	25 %	0 %	389874195
37	NC_017965	CCGC	2	8	22021	22028	0 %	0 %	25 %	75 %	389874195
38	NC_017965	ACGT	2	8	23077	23084	25 %	25 %	25 %	25 %	389874196
39	NC_017965	GTTT	2	8	23157	23164	0 %	75 %	25 %	0 %	389874196
40	NC_017965	CCGC	2	8	23297	23304	0 %	0 %	25 %	75 %	389874196
41	NC_017965	AGCT	2	8	23510	23517	25 %	25 %	25 %	25 %	389874197
42	NC_017965	CCCA	2	8	23690	23697	25 %	0 %	0 %	75 %	389874197
43	NC_017965	GCCT	2	8	23830	23837	0 %	25 %	25 %	50 %	389874197
44	NC_017965	TTGA	2	8	24233	24240	25 %	50 %	25 %	0 %	389874198
45	NC_017965	TGGC	2	8	24279	24286	0 %	25 %	50 %	25 %	389874198
46	NC_017965	TTAC	2	8	24337	24344	25 %	50 %	0 %	25 %	389874198
47	NC_017965	GATT	2	8	25080	25087	25 %	50 %	25 %	0 %	389874200
48	NC_017965	TAAA	2	8	25283	25290	75 %	25 %	0 %	0 %	389874200
49	NC_017965	TTTC	2	8	26253	26260	0 %	75 %	0 %	25 %	389874202
50	NC_017965	AATC	2	8	26376	26383	50 %	25 %	0 %	25 %	389874202
51	NC_017965	TGGG	2	8	29638	29645	0 %	25 %	75 %	0 %	389874203
52	NC_017965	TATT	2	8	30743	30750	25 %	75 %	0 %	0 %	389874205
53	NC_017965	CGGG	2	8	31914	31921	0 %	0 %	75 %	25 %	389874207
54	NC_017965	TGCT	2	8	32113	32120	0 %	50 %	25 %	25 %	389874207
55	NC_017965	CTGA	2	8	32235	32242	25 %	25 %	25 %	25 %	389874208
56	NC_017965	ATTG	2	8	32698	32705	25 %	50 %	25 %	0 %	389874208
57	NC_017965	TACC	2	8	32829	32836	25 %	25 %	0 %	50 %	389874208
58	NC_017965	CAAT	2	8	33344	33351	50 %	25 %	0 %	25 %	389874209
59	NC_017965	TTAT	2	8	33924	33931	25 %	75 %	0 %	0 %	389874210
60	NC_017965	ACTG	2	8	34545	34552	25 %	25 %	25 %	25 %	389874211
61	NC_017965	AATA	2	8	34615	34622	75 %	25 %	0 %	0 %	389874211
62	NC_017965	ATCT	2	8	35338	35345	25 %	50 %	0 %	25 %	389874212
63	NC_017965	AATT	2	8	35356	35363	50 %	50 %	0 %	0 %	389874212
64	NC_017965	CATT	2	8	36146	36153	25 %	50 %	0 %	25 %	389874213
65	NC_017965	GTTG	2	8	36953	36960	0 %	50 %	50 %	0 %	389874215
66	NC_017965	ACCT	2	8	37479	37486	25 %	25 %	0 %	50 %	389874216
67	NC_017965	AGGC	2	8	37666	37673	25 %	0 %	50 %	25 %	389874216
68	NC_017965	TCGA	2	8	37699	37706	25 %	25 %	25 %	25 %	389874216
69	NC_017965	GGAC	2	8	38019	38026	25 %	0 %	50 %	25 %	389874217
70	NC_017965	TGAC	2	8	38664	38671	25 %	25 %	25 %	25 %	389874217
71	NC_017965	ATTC	2	8	38764	38771	25 %	50 %	0 %	25 %	389874217
72	NC_017965	GGCG	2	8	38917	38924	0 %	0 %	75 %	25 %	389874217
73	NC_017965	ATTA	2	8	41777	41784	50 %	50 %	0 %	0 %	389874219
74	NC_017965	CCAT	2	8	41830	41837	25 %	25 %	0 %	50 %	389874220
75	NC_017965	CAAA	2	8	42373	42380	75 %	0 %	0 %	25 %	389874221
76	NC_017965	GTCG	2	8	43120	43127	0 %	25 %	50 %	25 %	389874222
77	NC_017965	ACTT	2	8	43404	43411	25 %	50 %	0 %	25 %	389874223
78	NC_017965	GTTC	2	8	43827	43834	0 %	50 %	25 %	25 %	389874223
79	NC_017965	GATC	2	8	44044	44051	25 %	25 %	25 %	25 %	389874223
80	NC_017965	AAGT	2	8	45262	45269	50 %	25 %	25 %	0 %	389874224
81	NC_017965	TTTG	2	8	45362	45369	0 %	75 %	25 %	0 %	389874224
82	NC_017965	CGAA	2	8	46304	46311	50 %	0 %	25 %	25 %	389874225
83	NC_017965	TGGC	2	8	46669	46676	0 %	25 %	50 %	25 %	389874225
84	NC_017965	GTTT	2	8	46739	46746	0 %	75 %	25 %	0 %	389874225
85	NC_017965	TCAA	2	8	47302	47309	50 %	25 %	0 %	25 %	389874225
86	NC_017965	ATAA	2	8	48894	48901	75 %	25 %	0 %	0 %	389874227
87	NC_017965	GAAT	2	8	50776	50783	50 %	25 %	25 %	0 %	389874228
88	NC_017965	TCAA	2	8	51010	51017	50 %	25 %	0 %	25 %	389874228
89	NC_017965	GTTG	2	8	51893	51900	0 %	50 %	50 %	0 %	389874229
90	NC_017965	AAGG	2	8	52370	52377	50 %	0 %	50 %	0 %	389874229
91	NC_017965	TGAT	2	8	52877	52884	25 %	50 %	25 %	0 %	389874230
92	NC_017965	TATT	2	8	52929	52936	25 %	75 %	0 %	0 %	389874230
93	NC_017965	TCTA	3	12	53197	53208	25 %	50 %	0 %	25 %	389874230
94	NC_017965	CTGA	2	8	55273	55280	25 %	25 %	25 %	25 %	389874233
95	NC_017965	CAGC	2	8	56030	56037	25 %	0 %	25 %	50 %	389874234
96	NC_017965	CAAT	2	8	57158	57165	50 %	25 %	0 %	25 %	389874235

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.