MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 8646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017186	ACGGC	2	10	125	134	20 %	0 %	40 %	40 %	384145137
2	NC_017186	GCGCG	2	10	186	195	0 %	0 %	60 %	40 %	384145137
3	NC_017186	CCTCC	2	10	2583	2592	0 %	20 %	0 %	80 %	384145138
4	NC_017186	CGAAG	2	10	7441	7450	40 %	0 %	40 %	20 %	384145142
5	NC_017186	CCGCG	2	10	7567	7576	0 %	0 %	40 %	60 %	384145142
6	NC_017186	GAACG	2	10	11313	11322	40 %	0 %	40 %	20 %	384145144
7	NC_017186	GCAGC	2	10	11456	11465	20 %	0 %	40 %	40 %	384145144
8	NC_017186	CGGCG	2	10	17341	17350	0 %	0 %	60 %	40 %	384145148
9	NC_017186	CGGCG	2	10	17852	17861	0 %	0 %	60 %	40 %	384145149
10	NC_017186	TGCGG	2	10	18890	18899	0 %	20 %	60 %	20 %	384145151
11	NC_017186	CGGCG	2	10	19425	19434	0 %	0 %	60 %	40 %	384145152
12	NC_017186	GCAGC	2	10	20914	20923	20 %	0 %	40 %	40 %	384145155
13	NC_017186	CAGCC	2	10	21189	21198	20 %	0 %	20 %	60 %	384145155
14	NC_017186	ATCCC	2	10	22001	22010	20 %	20 %	0 %	60 %	384145156
15	NC_017186	CGACG	2	10	27524	27533	20 %	0 %	40 %	40 %	384145159
16	NC_017186	CGCGG	2	10	29870	29879	0 %	0 %	60 %	40 %	384145162
17	NC_017186	GGCCA	2	10	30802	30811	20 %	0 %	40 %	40 %	384145163
18	NC_017186	CGGCG	2	10	31592	31601	0 %	0 %	60 %	40 %	384145163
19	NC_017186	TCGGC	2	10	32402	32411	0 %	20 %	40 %	40 %	384145163
20	NC_017186	CGGCG	2	10	34224	34233	0 %	0 %	60 %	40 %	384145164
21	NC_017186	CCGGC	2	10	39834	39843	0 %	0 %	40 %	60 %	384145171
22	NC_017186	CGTGG	2	10	41126	41135	0 %	20 %	60 %	20 %	384145173
23	NC_017186	CCAGG	2	10	41538	41547	20 %	0 %	40 %	40 %	384145174
24	NC_017186	CCTCT	2	10	42524	42533	0 %	40 %	0 %	60 %	384145175
25	NC_017186	GTTTC	2	10	44386	44395	0 %	60 %	20 %	20 %	384145178
26	NC_017186	GCGGT	2	10	44918	44927	0 %	20 %	60 %	20 %	384145179
27	NC_017186	CGGTC	2	10	54905	54914	0 %	20 %	40 %	40 %	384145188
28	NC_017186	CCGTG	2	10	55199	55208	0 %	20 %	40 %	40 %	384145189
29	NC_017186	AGGCC	2	10	57772	57781	20 %	0 %	40 %	40 %	384145190
30	NC_017186	GGCTC	2	10	58857	58866	0 %	20 %	40 %	40 %	384145191
31	NC_017186	GCCGC	2	10	61721	61730	0 %	0 %	40 %	60 %	384145194
32	NC_017186	TCGAC	2	10	62485	62494	20 %	20 %	20 %	40 %	384145195
33	NC_017186	CCGCG	2	10	63365	63374	0 %	0 %	40 %	60 %	384145196
34	NC_017186	ACCGC	2	10	64426	64435	20 %	0 %	20 %	60 %	384145197
35	NC_017186	CTCGC	2	10	64623	64632	0 %	20 %	20 %	60 %	384145197
36	NC_017186	CGACC	2	10	65543	65552	20 %	0 %	20 %	60 %	384145197
37	NC_017186	TCGGT	2	10	66790	66799	0 %	40 %	40 %	20 %	384145197
38	NC_017186	CCCGG	2	10	66950	66959	0 %	0 %	40 %	60 %	384145197
39	NC_017186	GGTCG	2	10	67344	67353	0 %	20 %	60 %	20 %	384145198
40	NC_017186	CCGTC	2	10	69212	69221	0 %	20 %	20 %	60 %	384145200
41	NC_017186	CGGCC	2	10	70207	70216	0 %	0 %	40 %	60 %	384145201
42	NC_017186	CCGTT	2	10	70580	70589	0 %	40 %	20 %	40 %	384145201
43	NC_017186	CCGGA	2	10	71855	71864	20 %	0 %	40 %	40 %	384145203
44	NC_017186	CCTGA	2	10	78508	78517	20 %	20 %	20 %	40 %	384145210
45	NC_017186	CTTCG	2	10	80863	80872	0 %	40 %	20 %	40 %	384145211
46	NC_017186	GGTCG	2	10	84158	84167	0 %	20 %	60 %	20 %	384145215
47	NC_017186	GGCCG	2	10	84239	84248	0 %	0 %	60 %	40 %	384145215
48	NC_017186	GCTGG	2	10	85348	85357	0 %	20 %	60 %	20 %	384145216
49	NC_017186	GCCGG	2	10	86119	86128	0 %	0 %	60 %	40 %	384145217
50	NC_017186	GCACC	2	10	86481	86490	20 %	0 %	20 %	60 %	384145217
51	NC_017186	GGCGA	2	10	86521	86530	20 %	0 %	60 %	20 %	384145217
52	NC_017186	GCCCG	2	10	91925	91934	0 %	0 %	40 %	60 %	384145222
53	NC_017186	CGCGC	2	10	92261	92270	0 %	0 %	40 %	60 %	384145222
54	NC_017186	CGGAC	2	10	92603	92612	20 %	0 %	40 %	40 %	384145223
55	NC_017186	CGGCG	2	10	92652	92661	0 %	0 %	60 %	40 %	384145223
56	NC_017186	GCGCG	2	10	94454	94463	0 %	0 %	60 %	40 %	384145226
57	NC_017186	TCGCG	2	10	95170	95179	0 %	20 %	40 %	40 %	384145227
58	NC_017186	GGCCG	2	10	96799	96808	0 %	0 %	60 %	40 %	384145228
59	NC_017186	GACGT	2	10	97201	97210	20 %	20 %	40 %	20 %	384145228
60	NC_017186	AGCGC	2	10	98130	98139	20 %	0 %	40 %	40 %	384145229
61	NC_017186	GCCGC	2	10	100120	100129	0 %	0 %	40 %	60 %	384145232
62	NC_017186	CTGGC	2	10	101288	101297	0 %	20 %	40 %	40 %	384145233
63	NC_017186	TCCGC	2	10	104734	104743	0 %	20 %	20 %	60 %	384145237
64	NC_017186	GCGCC	2	10	106027	106036	0 %	0 %	40 %	60 %	384145238
65	NC_017186	TCCGG	2	10	107236	107245	0 %	20 %	40 %	40 %	384145239
66	NC_017186	CCGGA	2	10	109827	109836	20 %	0 %	40 %	40 %	384145242
67	NC_017186	CGTCC	2	10	110783	110792	0 %	20 %	20 %	60 %	384145243
68	NC_017186	CGGCC	2	10	112277	112286	0 %	0 %	40 %	60 %	384145243
69	NC_017186	GGTGT	2	10	113073	113082	0 %	40 %	60 %	0 %	384145244
70	NC_017186	CGAGT	2	10	113276	113285	20 %	20 %	40 %	20 %	384145244
71	NC_017186	CCCTG	2	10	114359	114368	0 %	20 %	20 %	60 %	384145245
72	NC_017186	CACGC	2	10	114484	114493	20 %	0 %	20 %	60 %	384145245
73	NC_017186	GCACC	2	10	114701	114710	20 %	0 %	20 %	60 %	384145245
74	NC_017186	CCAGC	2	10	115192	115201	20 %	0 %	20 %	60 %	384145246
75	NC_017186	CGCGG	2	10	115856	115865	0 %	0 %	60 %	40 %	384145247
76	NC_017186	GCGCG	2	10	117458	117467	0 %	0 %	60 %	40 %	384145248
77	NC_017186	GCGCG	2	10	122592	122601	0 %	0 %	60 %	40 %	384145254
78	NC_017186	CCGGA	2	10	122752	122761	20 %	0 %	40 %	40 %	384145255
79	NC_017186	GCCGC	2	10	123641	123650	0 %	0 %	40 %	60 %	384145255
80	NC_017186	GCCGT	2	10	123812	123821	0 %	20 %	40 %	40 %	384145255
81	NC_017186	TCGCC	2	10	123997	124006	0 %	20 %	20 %	60 %	384145255
82	NC_017186	GATCG	2	10	124007	124016	20 %	20 %	40 %	20 %	384145255
83	NC_017186	CGAGG	2	10	124163	124172	20 %	0 %	60 %	20 %	384145255
84	NC_017186	GGCCG	2	10	125575	125584	0 %	0 %	60 %	40 %	384145256
85	NC_017186	CGCTG	2	10	126306	126315	0 %	20 %	40 %	40 %	384145257
86	NC_017186	CCGGG	2	10	128234	128243	0 %	0 %	60 %	40 %	384145258
87	NC_017186	GCCGA	2	10	129088	129097	20 %	0 %	40 %	40 %	384145258
88	NC_017186	CCGGT	2	10	129373	129382	0 %	20 %	40 %	40 %	384145258
89	NC_017186	GCCGG	2	10	130385	130394	0 %	0 %	60 %	40 %	384145259
90	NC_017186	TCCGC	2	10	130761	130770	0 %	20 %	20 %	60 %	384145259
91	NC_017186	GGACA	2	10	130999	131008	40 %	0 %	40 %	20 %	384145259
92	NC_017186	CGGGT	2	10	131960	131969	0 %	20 %	60 %	20 %	384145260
93	NC_017186	GGCGG	2	10	132163	132172	0 %	0 %	80 %	20 %	384145260
94	NC_017186	GTCGA	2	10	132364	132373	20 %	20 %	40 %	20 %	384145260
95	NC_017186	CTCGG	2	10	133745	133754	0 %	20 %	40 %	40 %	384145261
96	NC_017186	CGGGG	2	10	137694	137703	0 %	0 %	80 %	20 %	384145266
97	NC_017186	GCGGA	2	10	138004	138013	20 %	0 %	60 %	20 %	384145266
98	NC_017186	GGCCG	2	10	138258	138267	0 %	0 %	60 %	40 %	384145266
99	NC_017186	TCGGG	2	10	138275	138284	0 %	20 %	60 %	20 %	384145266
100	NC_017186	CGGCA	2	10	139737	139746	20 %	0 %	40 %	40 %	384145268
101	NC_017186	CCGGG	2	10	139894	139903	0 %	0 %	60 %	40 %	384145268
102	NC_017186	CGCAC	2	10	142304	142313	20 %	0 %	20 %	60 %	384145270
103	NC_017186	GCCGA	2	10	142672	142681	20 %	0 %	40 %	40 %	384145270
104	NC_017186	CGACG	2	10	143695	143704	20 %	0 %	40 %	40 %	384145271
105	NC_017186	CGGCT	2	10	146157	146166	0 %	20 %	40 %	40 %	384145274
106	NC_017186	GCCGC	2	10	148299	148308	0 %	0 %	40 %	60 %	384145276
107	NC_017186	CCCGC	2	10	148713	148722	0 %	0 %	20 %	80 %	384145276
108	NC_017186	CGACG	2	10	149908	149917	20 %	0 %	40 %	40 %	384145279
109	NC_017186	CTCGG	2	10	150734	150743	0 %	20 %	40 %	40 %	384145279
110	NC_017186	CGGCT	3	15	153937	153951	0 %	20 %	40 %	40 %	384145282
111	NC_017186	GCCAG	2	10	155674	155683	20 %	0 %	40 %	40 %	384145284
112	NC_017186	GCCCG	2	10	156061	156070	0 %	0 %	40 %	60 %	384145285
113	NC_017186	GCCGG	2	10	157632	157641	0 %	0 %	60 %	40 %	384145287
114	NC_017186	ATCGA	2	10	158427	158436	40 %	20 %	20 %	20 %	384145287
115	NC_017186	GCCGG	2	10	158483	158492	0 %	0 %	60 %	40 %	384145287
116	NC_017186	CCGCG	2	10	159445	159454	0 %	0 %	40 %	60 %	384145289
117	NC_017186	TGCCG	2	10	162970	162979	0 %	20 %	40 %	40 %	384145292
118	NC_017186	GTCGG	2	10	165547	165556	0 %	20 %	60 %	20 %	384145294
119	NC_017186	CCAGC	2	10	166056	166065	20 %	0 %	20 %	60 %	384145294
120	NC_017186	CGCGG	2	10	168304	168313	0 %	0 %	60 %	40 %	384145296
121	NC_017186	CCGAG	2	10	169824	169833	20 %	0 %	40 %	40 %	384145298
122	NC_017186	CGGAG	2	10	170360	170369	20 %	0 %	60 %	20 %	384145299
123	NC_017186	ACGCG	2	10	170394	170403	20 %	0 %	40 %	40 %	384145299
124	NC_017186	CGGCG	2	10	171181	171190	0 %	0 %	60 %	40 %	384145300
125	NC_017186	CCGGC	2	10	171490	171499	0 %	0 %	40 %	60 %	384145300
126	NC_017186	GTCGA	2	10	172225	172234	20 %	20 %	40 %	20 %	384145301
127	NC_017186	CCGGC	2	10	175670	175679	0 %	0 %	40 %	60 %	384145303
128	NC_017186	CGGCG	2	10	176105	176114	0 %	0 %	60 %	40 %	384145303
129	NC_017186	GAGCG	2	10	177263	177272	20 %	0 %	60 %	20 %	384145303
130	NC_017186	CGGCG	2	10	177455	177464	0 %	0 %	60 %	40 %	384145303
131	NC_017186	GACGT	2	10	179527	179536	20 %	20 %	40 %	20 %	384145305
132	NC_017186	ACGCC	2	10	180529	180538	20 %	0 %	20 %	60 %	384145306
133	NC_017186	GGGCC	2	10	181728	181737	0 %	0 %	60 %	40 %	384145308
134	NC_017186	TCGGC	2	10	181824	181833	0 %	20 %	40 %	40 %	384145308
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262	NC_017186	GGCGT	2	10	356906	356915	0 %	20 %	60 %	20 %	384145480
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