MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii MDR-ZJ06 plasmid pMDR-ZJ06

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017172	GCA	2	6	224	229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145111
2	NC_017172	GGC	2	6	303	308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145111
3	NC_017172	TTC	2	6	316	321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145111
4	NC_017172	GGT	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145111
5	NC_017172	AGC	2	6	623	628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145112
6	NC_017172	TGG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145112
7	NC_017172	GCG	2	6	677	682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145112
8	NC_017172	GCA	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145112
9	NC_017172	ATA	2	6	956	961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145113
10	NC_017172	TGG	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145113
11	NC_017172	GTT	2	6	1100	1105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145113
12	NC_017172	TGA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145113
13	NC_017172	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145113
14	NC_017172	GTT	2	6	1235	1240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145113
15	NC_017172	ACG	2	6	1280	1285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145113
16	NC_017172	GGA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145113
17	NC_017172	ATG	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145113
18	NC_017172	GAC	2	6	1956	1961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145114
19	NC_017172	TCA	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145114
20	NC_017172	CAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145114
21	NC_017172	TTC	2	6	2202	2207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145114
22	NC_017172	GTG	2	6	2242	2247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145114
23	NC_017172	CAT	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145114
24	NC_017172	CAT	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145114
25	NC_017172	AAC	2	6	2380	2385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145114
26	NC_017172	ATA	2	6	2842	2847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145115
27	NC_017172	TGG	2	6	2901	2906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145115
28	NC_017172	GTT	2	6	2986	2991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145115
29	NC_017172	TGA	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145115
30	NC_017172	CTT	2	6	3112	3117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145115
31	NC_017172	GTT	2	6	3121	3126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145115
32	NC_017172	ACG	2	6	3166	3171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145115
33	NC_017172	GGA	2	6	3172	3177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145115
34	NC_017172	ATG	2	6	3455	3460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145115
35	NC_017172	GAT	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145116
36	NC_017172	CAC	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145116
37	NC_017172	AGA	2	6	3764	3769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145116
38	NC_017172	ACA	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145116
39	NC_017172	GTA	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145116
40	NC_017172	ATT	2	6	3999	4004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145116
41	NC_017172	AAC	2	6	4144	4149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145116
42	NC_017172	CAA	2	6	4163	4168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145116
43	NC_017172	CAG	2	6	4221	4226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145116
44	NC_017172	TGC	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145116
45	NC_017172	CAT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145118
46	NC_017172	TTG	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145118
47	NC_017172	GAT	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145118
48	NC_017172	TAC	2	6	4973	4978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145118
49	NC_017172	CAG	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145119
50	NC_017172	AAC	2	6	5329	5334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145119
51	NC_017172	TGA	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145120
52	NC_017172	TGC	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145120
53	NC_017172	GCA	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
54	NC_017172	GAA	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145120
55	NC_017172	CAG	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
56	NC_017172	GAC	2	6	5803	5808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
57	NC_017172	CGC	2	6	5837	5842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145120
58	NC_017172	CTG	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145120
59	NC_017172	GAA	2	6	5939	5944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145120
60	NC_017172	GCC	2	6	6067	6072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145120
61	NC_017172	ATC	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145120
62	NC_017172	AGC	2	6	6125	6130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
63	NC_017172	GTT	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145120
64	NC_017172	GCA	3	9	6423	6431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145120
65	NC_017172	GCT	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145120
66	NC_017172	GCC	2	6	6655	6660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145120
67	NC_017172	GAT	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145120
68	NC_017172	ACA	2	6	6843	6848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145120
69	NC_017172	CAA	2	6	7046	7051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145120
70	NC_017172	ACT	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145121
71	NC_017172	GCT	2	6	7801	7806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145122
72	NC_017172	GAT	2	6	7866	7871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145122
73	NC_017172	TCT	2	6	7888	7893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145122
74	NC_017172	CAT	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145122
75	NC_017172	CTT	2	6	8189	8194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145122
76	NC_017172	ATT	2	6	8275	8280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145122
77	NC_017172	ACG	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145122
78	NC_017172	GCA	2	6	8459	8464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145122
79	NC_017172	TTG	2	6	8469	8474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145122
80	NC_017172	CAA	2	6	8547	8552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145122
81	NC_017172	TGA	2	6	8673	8678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145123
82	NC_017172	ATA	2	6	8750	8755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145123
83	NC_017172	TCA	2	6	8772	8777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
84	NC_017172	TGA	2	6	8880	8885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145123
85	NC_017172	TAT	2	6	9169	9174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145123
86	NC_017172	TCA	2	6	9185	9190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
87	NC_017172	TCT	2	6	9314	9319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145123
88	NC_017172	GTC	2	6	9402	9407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145123
89	NC_017172	CAG	2	6	9489	9494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145123
90	NC_017172	TCA	3	9	9516	9524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
91	NC_017172	CTT	3	9	9555	9563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145123
92	NC_017172	ACC	2	6	9586	9591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145123
93	NC_017172	TTG	2	6	9775	9780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384145123
94	NC_017172	GCA	2	6	9791	9796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145123
95	NC_017172	ACT	2	6	9991	9996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
96	NC_017172	TCA	2	6	10055	10060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145123
97	NC_017172	TAA	2	6	10110	10115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145123
98	NC_017172	ACC	2	6	10564	10569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145124
99	NC_017172	GTA	2	6	10574	10579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145124
100	NC_017172	CTG	2	6	10593	10598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145124
101	NC_017172	ATA	2	6	10599	10604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145124
102	NC_017172	AGT	2	6	10771	10776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145124
103	NC_017172	TCT	2	6	10799	10804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
104	NC_017172	TTC	2	6	10863	10868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
105	NC_017172	CAA	2	6	10941	10946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145124
106	NC_017172	CTT	2	6	11073	11078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
107	NC_017172	GCT	2	6	11264	11269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145124
108	NC_017172	TCT	2	6	11305	11310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
109	NC_017172	GCG	2	6	11311	11316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145124
110	NC_017172	TCT	2	6	11321	11326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145124
111	NC_017172	ATC	2	6	11419	11424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145124
112	NC_017172	CAA	2	6	11441	11446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145124
113	NC_017172	GCA	2	6	11461	11466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145124
114	NC_017172	ATT	2	6	11499	11504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145124
115	NC_017172	GGT	2	6	11814	11819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145125
116	NC_017172	ATT	2	6	11859	11864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384145125
117	NC_017172	TAC	2	6	12670	12675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145126
118	NC_017172	TCG	2	6	12729	12734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145126
119	NC_017172	AAT	2	6	12748	12753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145126
120	NC_017172	TCG	2	6	12939	12944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145126
121	NC_017172	TCT	2	6	12965	12970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145126
122	NC_017172	AAT	2	6	13001	13006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145126
123	NC_017172	AAT	2	6	13068	13073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384145126
124	NC_017172	TCT	2	6	13098	13103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145126
125	NC_017172	AAC	2	6	13114	13119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145126
126	NC_017172	CAA	2	6	13125	13130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145126
127	NC_017172	TCT	2	6	13170	13175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145126
128	NC_017172	AAC	2	6	13177	13182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145126
129	NC_017172	TCA	2	6	13570	13575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145127
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.