MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017167	GCG	2	6	194059	194064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133979
4002	NC_017167	TCC	2	6	194128	194133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133979
4003	NC_017167	AGC	2	6	194327	194332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133979
4004	NC_017167	ACG	2	6	194417	194422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133979
4005	NC_017167	TCT	2	6	194429	194434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133979
4006	NC_017167	GGGC	2	8	194537	194544	0 %	0 %	75 %	25 %	384133979
4007	NC_017167	TGG	2	6	194550	194555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133979
4008	NC_017167	TCG	2	6	194641	194646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133979
4009	NC_017167	GTC	2	6	194686	194691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133979
4010	NC_017167	TCG	2	6	194707	194712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133979
4011	NC_017167	GC	3	6	194714	194719	0 %	0 %	50 %	50 %	384133979
4012	NC_017167	TGT	2	6	194825	194830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384133979
4013	NC_017167	GCC	2	6	194877	194882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133979
4014	NC_017167	ACC	2	6	194932	194937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133979
4015	NC_017167	GGA	2	6	195244	195249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133980
4016	NC_017167	GCG	2	6	195253	195258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133980
4017	NC_017167	GAG	2	6	195386	195391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133980
4018	NC_017167	CGG	2	6	195394	195399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133980
4019	NC_017167	GAG	2	6	195437	195442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133980
4020	NC_017167	CAT	2	6	195472	195477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133980
4021	NC_017167	GC	3	6	195480	195485	0 %	0 %	50 %	50 %	384133980
4022	NC_017167	GTCG	2	8	195499	195506	0 %	25 %	50 %	25 %	384133980
4023	NC_017167	TCG	2	6	195510	195515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133980
4024	NC_017167	ATCC	2	8	195735	195742	25 %	25 %	0 %	50 %	384133980
4025	NC_017167	CGT	2	6	195762	195767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133980
4026	NC_017167	AGA	2	6	195816	195821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133980
4027	NC_017167	TCT	2	6	195852	195857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133980
4028	NC_017167	GGA	2	6	195877	195882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133980
4029	NC_017167	AGC	2	6	196047	196052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133980
4030	NC_017167	ATC	2	6	196055	196060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133980
4031	NC_017167	CTG	2	6	196097	196102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133980
4032	NC_017167	CGTGG	2	10	196120	196129	0 %	20 %	60 %	20 %	384133980
4033	NC_017167	AGA	2	6	196140	196145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133980
4034	NC_017167	CG	3	6	196282	196287	0 %	0 %	50 %	50 %	384133980
4035	NC_017167	AGA	2	6	196323	196328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133980
4036	NC_017167	A	6	6	196414	196419	100 %	0 %	0 %	0 %	384133981
4037	NC_017167	CAT	2	6	196463	196468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133981
4038	NC_017167	CGA	2	6	196497	196502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133981
4039	NC_017167	TGGA	2	8	196587	196594	25 %	25 %	50 %	0 %	384133982
4040	NC_017167	GCG	2	6	196616	196621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133982
4041	NC_017167	CG	3	6	196620	196625	0 %	0 %	50 %	50 %	384133982
4042	NC_017167	GCG	2	6	196634	196639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133982
4043	NC_017167	GGC	2	6	196654	196659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133982
4044	NC_017167	AGG	2	6	196692	196697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133982
4045	NC_017167	GGCG	2	8	196732	196739	0 %	0 %	75 %	25 %	384133982
4046	NC_017167	GAC	2	6	196778	196783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133982
4047	NC_017167	GTCG	2	8	196801	196808	0 %	25 %	50 %	25 %	384133982
4048	NC_017167	GCC	2	6	196821	196826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133982
4049	NC_017167	GAA	2	6	196886	196891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133982
4050	NC_017167	TGA	2	6	196905	196910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133982
4051	NC_017167	GCC	2	6	196946	196951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133982
4052	NC_017167	GCA	2	6	196966	196971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133982
4053	NC_017167	ATC	2	6	196985	196990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133982
4054	NC_017167	GCA	2	6	197209	197214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133982
4055	NC_017167	CGC	2	6	197225	197230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133982
4056	NC_017167	GGA	2	6	197242	197247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133982
4057	NC_017167	CTT	2	6	197266	197271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133982
4058	NC_017167	CGA	2	6	197278	197283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133982
4059	NC_017167	GAC	2	6	197337	197342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133982
4060	NC_017167	GAAT	2	8	197378	197385	50 %	25 %	25 %	0 %	384133983
4061	NC_017167	GAGG	2	8	197390	197397	25 %	0 %	75 %	0 %	384133983
4062	NC_017167	CAG	2	6	197480	197485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133983
4063	NC_017167	CGT	2	6	197518	197523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133983
4064	NC_017167	GAA	2	6	197552	197557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133983
4065	NC_017167	GC	3	6	197561	197566	0 %	0 %	50 %	50 %	384133983
4066	NC_017167	CGA	2	6	197617	197622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133983
4067	NC_017167	TCG	2	6	197640	197645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133983
4068	NC_017167	CG	3	6	197656	197661	0 %	0 %	50 %	50 %	384133983
4069	NC_017167	AAT	2	6	197687	197692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133983
4070	NC_017167	G	6	6	197706	197711	0 %	0 %	100 %	0 %	384133983
4071	NC_017167	ACG	2	6	197733	197738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133983
4072	NC_017167	TCC	2	6	197751	197756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133983
4073	NC_017167	AACC	2	8	197758	197765	50 %	0 %	0 %	50 %	384133983
4074	NC_017167	TTC	2	6	197777	197782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133983
4075	NC_017167	GCG	2	6	197820	197825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133983
4076	NC_017167	CCG	2	6	197870	197875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133983
4077	NC_017167	GGC	2	6	197912	197917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133983
4078	NC_017167	CG	3	6	197931	197936	0 %	0 %	50 %	50 %	384133983
4079	NC_017167	CG	3	6	198012	198017	0 %	0 %	50 %	50 %	384133983
4080	NC_017167	GCG	2	6	198030	198035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133983
4081	NC_017167	CGC	2	6	198057	198062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133983
4082	NC_017167	CGG	2	6	198073	198078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133983
4083	NC_017167	CGG	2	6	198160	198165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133983
4084	NC_017167	ACG	2	6	198167	198172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133983
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4086	NC_017167	GTG	2	6	198238	198243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133984
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4088	NC_017167	GGA	2	6	198273	198278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133984
4089	NC_017167	GTC	2	6	198280	198285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133984
4090	NC_017167	CTA	2	6	198303	198308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133984
4091	NC_017167	AGC	2	6	198311	198316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133984
4092	NC_017167	GAT	2	6	198339	198344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133984
4093	NC_017167	TCC	2	6	198345	198350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133984
4094	NC_017167	CAT	2	6	198351	198356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133984
4095	NC_017167	GGA	2	6	198357	198362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384133984
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4097	NC_017167	TTCC	2	8	198403	198410	0 %	50 %	0 %	50 %	384133984
4098	NC_017167	CGC	2	6	198452	198457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133984
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4100	NC_017167	TCC	2	6	198640	198645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133984
4101	NC_017167	CA	3	6	198704	198709	50 %	0 %	0 %	50 %	384133984
4102	NC_017167	GTG	2	6	198711	198716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133984
4103	NC_017167	GTC	2	6	198717	198722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133984
4104	NC_017167	AGC	2	6	198794	198799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133984
4105	NC_017167	ATC	2	6	198808	198813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133984
4106	NC_017167	ACG	3	9	198869	198877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133984
4107	NC_017167	CCA	2	6	198996	199001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133984
4108	NC_017167	GGC	2	6	199079	199084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384133984
4109	NC_017167	ATTGAA	2	12	199132	199143	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384133984
4110	NC_017167	GCT	2	6	199152	199157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133984
4111	NC_017167	ATG	2	6	199177	199182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133984
4112	NC_017167	CAA	2	6	199194	199199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133984
4113	NC_017167	GTC	2	6	199231	199236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133984
4114	NC_017167	ATCG	2	8	199261	199268	25 %	25 %	25 %	25 %	384133984
4115	NC_017167	CGGCG	2	10	199284	199293	0 %	0 %	60 %	40 %	384133984
4116	NC_017167	CGC	2	6	199310	199315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133984
4117	NC_017167	GC	3	6	199336	199341	0 %	0 %	50 %	50 %	384133984
4118	NC_017167	CGGA	2	8	199355	199362	25 %	0 %	50 %	25 %	384133984
4119	NC_017167	CGA	2	6	199365	199370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133984
4120	NC_017167	GAT	2	6	199518	199523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133985
4121	NC_017167	CTG	2	6	199537	199542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133985
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4234	NC_017167	GA	3	6	205568	205573	50 %	0 %	50 %	0 %	384133992
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4237	NC_017167	CGC	2	6	205652	205657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384133992
4238	NC_017167	TCCA	2	8	205673	205680	25 %	25 %	0 %	50 %	384133993
4239	NC_017167	TCG	2	6	205682	205687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133993
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4242	NC_017167	CTT	2	6	205788	205793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133993
4243	NC_017167	CAG	2	6	205863	205868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133994
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4351	NC_017167	TTC	2	6	214196	214201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134006
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4360	NC_017167	GT	3	6	214806	214811	0 %	50 %	50 %	0 %	384134007
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4363	NC_017167	CGT	2	6	215494	215499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134008
4364	NC_017167	TGCT	2	8	215539	215546	0 %	50 %	25 %	25 %	384134008
4365	NC_017167	AGC	2	6	215592	215597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134008
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4394	NC_017167	GA	3	6	217509	217514	50 %	0 %	50 %	0 %	384134010
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4465	NC_017167	AGGC	2	8	221062	221069	25 %	0 %	50 %	25 %	384134016
4466	NC_017167	TCG	2	6	221121	221126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134016
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4470	NC_017167	GC	3	6	221563	221568	0 %	0 %	50 %	50 %	384134017
4471	NC_017167	TCA	2	6	221777	221782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134018
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4474	NC_017167	GGCG	2	8	221802	221809	0 %	0 %	75 %	25 %	384134018
4475	NC_017167	CGG	3	9	221841	221849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134018
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4480	NC_017167	TCT	2	6	222029	222034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134018
4481	NC_017167	CTC	2	6	222067	222072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134018
4482	NC_017167	CGT	2	6	222120	222125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134018
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4484	NC_017167	ATG	2	6	222154	222159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134018
4485	NC_017167	CGAGGG	2	12	222177	222188	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384134018
4486	NC_017167	TGT	2	6	222296	222301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134018
4487	NC_017167	CAT	2	6	222322	222327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134018
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