MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_017167	GTC	2	6	2866051	2866056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136714
56002	NC_017167	CAC	3	9	2866173	2866181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136714
56003	NC_017167	GAC	2	6	2866215	2866220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136714
56004	NC_017167	CCG	2	6	2866377	2866382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136715
56005	NC_017167	CTT	2	6	2866397	2866402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136715
56006	NC_017167	GC	4	8	2866417	2866424	0 %	0 %	50 %	50 %	384136715
56007	NC_017167	GC	3	6	2866448	2866453	0 %	0 %	50 %	50 %	384136715
56008	NC_017167	GCC	2	6	2866466	2866471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136715
56009	NC_017167	GTC	2	6	2866529	2866534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136715
56010	NC_017167	CGC	2	6	2866629	2866634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136715
56011	NC_017167	CTT	2	6	2866712	2866717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136716
56012	NC_017167	GGC	2	6	2866788	2866793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136716
56013	NC_017167	CGA	2	6	2866825	2866830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136716
56014	NC_017167	GAC	2	6	2866850	2866855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136716
56015	NC_017167	CACCTC	2	12	2866874	2866885	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384136716
56016	NC_017167	TTG	2	6	2866944	2866949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136716
56017	NC_017167	CGC	2	6	2866958	2866963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136716
56018	NC_017167	CCA	2	6	2866978	2866983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136716
56019	NC_017167	CCA	2	6	2867020	2867025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136716
56020	NC_017167	CGT	2	6	2867045	2867050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136716
56021	NC_017167	TCC	2	6	2867109	2867114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136716
56022	NC_017167	CGC	2	6	2867297	2867302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136717
56023	NC_017167	CG	3	6	2867384	2867389	0 %	0 %	50 %	50 %	384136717
56024	NC_017167	GCG	2	6	2867415	2867420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136717
56025	NC_017167	TCA	2	6	2867663	2867668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136717
56026	NC_017167	CTT	2	6	2867709	2867714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136718
56027	NC_017167	GT	3	6	2867816	2867821	0 %	50 %	50 %	0 %	384136718
56028	NC_017167	CG	3	6	2867823	2867828	0 %	0 %	50 %	50 %	384136718
56029	NC_017167	ATC	2	6	2867863	2867868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136718
56030	NC_017167	CTT	2	6	2867871	2867876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136718
56031	NC_017167	GC	5	10	2867937	2867946	0 %	0 %	50 %	50 %	384136719
56032	NC_017167	TTC	2	6	2867947	2867952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136719
56033	NC_017167	CGAA	2	8	2868075	2868082	50 %	0 %	25 %	25 %	384136719
56034	NC_017167	CGC	2	6	2868093	2868098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136719
56035	NC_017167	CG	3	6	2868111	2868116	0 %	0 %	50 %	50 %	384136719
56036	NC_017167	TCA	2	6	2868129	2868134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136719
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56038	NC_017167	GCT	2	6	2868249	2868254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136719
56039	NC_017167	GC	3	6	2868266	2868271	0 %	0 %	50 %	50 %	384136719
56040	NC_017167	CCG	2	6	2868282	2868287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136719
56041	NC_017167	TCGCC	2	10	2868312	2868321	0 %	20 %	20 %	60 %	384136719
56042	NC_017167	TCT	2	6	2868342	2868347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136719
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56046	NC_017167	CGA	2	6	2868675	2868680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136720
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56048	NC_017167	GAT	2	6	2868843	2868848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136721
56049	NC_017167	CG	4	8	2868875	2868882	0 %	0 %	50 %	50 %	384136721
56050	NC_017167	CG	3	6	2868905	2868910	0 %	0 %	50 %	50 %	384136721
56051	NC_017167	GAT	2	6	2868927	2868932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136721
56052	NC_017167	CAG	2	6	2868935	2868940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136721
56053	NC_017167	ACG	2	6	2869015	2869020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136721
56054	NC_017167	CTT	2	6	2869026	2869031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136721
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56058	NC_017167	CG	3	6	2869231	2869236	0 %	0 %	50 %	50 %	384136722
56059	NC_017167	ACG	2	6	2869301	2869306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136722
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56061	NC_017167	TCG	2	6	2869331	2869336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136722
56062	NC_017167	CTT	2	6	2869348	2869353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136722
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56089	NC_017167	CGC	2	6	2870663	2870668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136725
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56116	NC_017167	GCG	2	6	2872079	2872084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136728
56117	NC_017167	GAT	2	6	2872086	2872091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136728
56118	NC_017167	TTG	2	6	2872189	2872194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136728
56119	NC_017167	ATG	2	6	2872207	2872212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136728
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56220	NC_017167	CAC	2	6	2876737	2876742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136734
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56227	NC_017167	TCG	3	9	2877005	2877013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136734
56228	NC_017167	CTT	2	6	2877030	2877035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136734
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56231	NC_017167	TCA	2	6	2877237	2877242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136734
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56462	NC_017167	CGC	2	6	2888149	2888154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136742
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56466	NC_017167	CG	3	6	2888335	2888340	0 %	0 %	50 %	50 %	384136742
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56492	NC_017167	CCGCG	2	10	2889369	2889378	0 %	0 %	40 %	60 %	384136743
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56497	NC_017167	TGC	2	6	2889638	2889643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136744
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56499	NC_017167	TCGA	2	8	2889676	2889683	25 %	25 %	25 %	25 %	384136744
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