MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii TCDC-AB0715 plasmid p1ABTCDC0715

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017165	A	7	7	254	260	100 %	0 %	0 %	0 %	385239403
2	NC_017165	A	6	6	293	298	100 %	0 %	0 %	0 %	385239403
3	NC_017165	GTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239403
4	NC_017165	TG	3	6	354	359	0 %	50 %	50 %	0 %	385239403
5	NC_017165	A	7	7	362	368	100 %	0 %	0 %	0 %	385239403
6	NC_017165	TTGGA	2	10	388	397	20 %	40 %	40 %	0 %	385239403
7	NC_017165	A	6	6	442	447	100 %	0 %	0 %	0 %	385239403
8	NC_017165	TATT	2	8	449	456	25 %	75 %	0 %	0 %	385239403
9	NC_017165	A	6	6	476	481	100 %	0 %	0 %	0 %	385239403
10	NC_017165	T	6	6	486	491	0 %	100 %	0 %	0 %	385239403
11	NC_017165	A	6	6	625	630	100 %	0 %	0 %	0 %	385239404
12	NC_017165	TAGA	2	8	667	674	50 %	25 %	25 %	0 %	385239404
13	NC_017165	T	7	7	737	743	0 %	100 %	0 %	0 %	385239404
14	NC_017165	A	6	6	811	816	100 %	0 %	0 %	0 %	385239404
15	NC_017165	AGCGA	2	10	825	834	40 %	0 %	40 %	20 %	385239404
16	NC_017165	T	8	8	853	860	0 %	100 %	0 %	0 %	385239404
17	NC_017165	A	6	6	882	887	100 %	0 %	0 %	0 %	385239404
18	NC_017165	AGCGAA	2	12	904	915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385239404
19	NC_017165	AGCGA	2	10	931	940	40 %	0 %	40 %	20 %	385239404
20	NC_017165	GA	3	6	1187	1192	50 %	0 %	50 %	0 %	385239405
21	NC_017165	ACTTAG	2	12	1234	1245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385239405
22	NC_017165	AAC	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239405
23	NC_017165	TTG	2	6	1273	1278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239405
24	NC_017165	ATCA	2	8	1344	1351	50 %	25 %	0 %	25 %	385239405
25	NC_017165	CG	3	6	1412	1417	0 %	0 %	50 %	50 %	385239405
26	NC_017165	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	385239405
27	NC_017165	CTG	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239405
28	NC_017165	GAA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239405
29	NC_017165	TAG	2	6	1598	1603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239405
30	NC_017165	TAG	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239405
31	NC_017165	AGAA	2	8	1695	1702	75 %	0 %	25 %	0 %	385239405
32	NC_017165	AAAT	2	8	1777	1784	75 %	25 %	0 %	0 %	385239405
33	NC_017165	AGA	3	9	1864	1872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239405
34	NC_017165	T	6	6	1915	1920	0 %	100 %	0 %	0 %	385239405
35	NC_017165	A	7	7	2084	2090	100 %	0 %	0 %	0 %	385239405
36	NC_017165	A	6	6	2158	2163	100 %	0 %	0 %	0 %	385239406
37	NC_017165	A	6	6	2288	2293	100 %	0 %	0 %	0 %	385239406
38	NC_017165	ATC	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239406
39	NC_017165	AAG	2	6	2309	2314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239406
40	NC_017165	TGA	2	6	2316	2321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239406
41	NC_017165	A	7	7	2328	2334	100 %	0 %	0 %	0 %	385239406
42	NC_017165	A	6	6	2362	2367	100 %	0 %	0 %	0 %	385239406
43	NC_017165	GAA	2	6	2380	2385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239406
44	NC_017165	CAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239406
45	NC_017165	CAG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239406
46	NC_017165	CAC	2	6	2456	2461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239406
47	NC_017165	ACA	2	6	2506	2511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239406
48	NC_017165	CAA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239406
49	NC_017165	AAT	2	6	2536	2541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239406
50	NC_017165	CACAA	2	10	2642	2651	60 %	0 %	0 %	40 %	385239406
51	NC_017165	A	6	6	2650	2655	100 %	0 %	0 %	0 %	385239406
52	NC_017165	CCA	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239407
53	NC_017165	TTA	2	6	3155	3160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239407
54	NC_017165	TATTAA	2	12	3198	3209	50 %	50 %	0 %	0 %	385239407
55	NC_017165	TA	3	6	3234	3239	50 %	50 %	0 %	0 %	385239407
56	NC_017165	TCA	2	6	3338	3343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239407
57	NC_017165	TGC	2	6	3394	3399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239407
58	NC_017165	CTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239407
59	NC_017165	TAA	2	6	3532	3537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239407
60	NC_017165	A	6	6	3546	3551	100 %	0 %	0 %	0 %	385239407
61	NC_017165	AGAC	2	8	4062	4069	50 %	0 %	25 %	25 %	385239408
62	NC_017165	GAA	2	6	4081	4086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239408
63	NC_017165	TGG	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239408
64	NC_017165	TGA	2	6	4149	4154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239408
65	NC_017165	ATC	2	6	4168	4173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239408
66	NC_017165	GCAAG	2	10	4186	4195	40 %	0 %	40 %	20 %	385239408
67	NC_017165	CA	3	6	4239	4244	50 %	0 %	0 %	50 %	385239409
68	NC_017165	GCTT	2	8	4293	4300	0 %	50 %	25 %	25 %	385239409
69	NC_017165	TGA	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239409
70	NC_017165	CAA	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239409
71	NC_017165	CTTG	2	8	4439	4446	0 %	50 %	25 %	25 %	385239409
72	NC_017165	ATGA	2	8	4481	4488	50 %	25 %	25 %	0 %	385239409
73	NC_017165	ATGCT	2	10	4500	4509	20 %	40 %	20 %	20 %	385239409
74	NC_017165	A	6	6	4519	4524	100 %	0 %	0 %	0 %	385239409
75	NC_017165	TCA	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239409
76	NC_017165	TAAA	2	8	4666	4673	75 %	25 %	0 %	0 %	385239410
77	NC_017165	TAC	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
78	NC_017165	TGA	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
79	NC_017165	ATTC	2	8	4899	4906	25 %	50 %	0 %	25 %	385239410
80	NC_017165	TAT	2	6	4937	4942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239410
81	NC_017165	AGGA	2	8	4951	4958	50 %	0 %	50 %	0 %	385239410
82	NC_017165	AAT	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
83	NC_017165	GTG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239410
84	NC_017165	TAC	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
85	NC_017165	CAG	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239410
86	NC_017165	CTC	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239410
87	NC_017165	AGA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239410
88	NC_017165	ATA	2	6	5440	5445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
89	NC_017165	ATG	2	6	5476	5481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
90	NC_017165	A	6	6	5564	5569	100 %	0 %	0 %	0 %	385239410
91	NC_017165	TAT	2	6	5580	5585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239410
92	NC_017165	GATG	2	8	5594	5601	25 %	25 %	50 %	0 %	385239410
93	NC_017165	ATTA	2	8	5610	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	385239410
94	NC_017165	TCA	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
95	NC_017165	TC	3	6	5671	5676	0 %	50 %	0 %	50 %	385239410
96	NC_017165	ATG	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
97	NC_017165	TA	3	6	5778	5783	50 %	50 %	0 %	0 %	385239410
98	NC_017165	ATT	2	6	5785	5790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239410
99	NC_017165	T	6	6	5826	5831	0 %	100 %	0 %	0 %	385239410
100	NC_017165	ATA	2	6	5923	5928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
101	NC_017165	AAG	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239410
102	NC_017165	ACC	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385239410
103	NC_017165	CAG	2	6	5982	5987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239410
104	NC_017165	ACTTT	2	10	6052	6061	20 %	60 %	0 %	20 %	385239410
105	NC_017165	A	6	6	6115	6120	100 %	0 %	0 %	0 %	385239410
106	NC_017165	TAA	2	6	6146	6151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
107	NC_017165	A	7	7	6172	6178	100 %	0 %	0 %	0 %	385239410
108	NC_017165	TAA	2	6	6179	6184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
109	NC_017165	AAGA	2	8	6316	6323	75 %	0 %	25 %	0 %	385239410
110	NC_017165	CTA	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239410
111	NC_017165	AAT	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
112	NC_017165	GAT	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
113	NC_017165	TACT	2	8	6473	6480	25 %	50 %	0 %	25 %	385239410
114	NC_017165	TA	4	8	6498	6505	50 %	50 %	0 %	0 %	385239410
115	NC_017165	CTG	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239410
116	NC_017165	CT	3	6	6650	6655	0 %	50 %	0 %	50 %	385239410
117	NC_017165	CCT	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239410
118	NC_017165	TGA	2	6	6812	6817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239410
119	NC_017165	ATA	2	6	6862	6867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
120	NC_017165	CA	3	6	6942	6947	50 %	0 %	0 %	50 %	385239410
121	NC_017165	AAT	2	6	6972	6977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239410
122	NC_017165	AT	3	6	7019	7024	50 %	50 %	0 %	0 %	385239410
123	NC_017165	GAA	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239410
124	NC_017165	TTTAG	2	10	7044	7053	20 %	60 %	20 %	0 %	385239410
125	NC_017165	AGATA	2	10	7072	7081	60 %	20 %	20 %	0 %	385239410
126	NC_017165	CT	3	6	7394	7399	0 %	50 %	0 %	50 %	385239411
127	NC_017165	CAA	2	6	7414	7419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239411
128	NC_017165	A	9	9	7418	7426	100 %	0 %	0 %	0 %	385239411
129	NC_017165	AAC	2	6	7439	7444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239411
130	NC_017165	ACT	2	6	7503	7508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239411
131	NC_017165	ATG	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239411
132	NC_017165	TGA	2	6	7626	7631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239411
133	NC_017165	GCA	2	6	7660	7665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239411
134	NC_017165	TCA	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239411
135	NC_017165	TGA	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239411
136	NC_017165	TTGAT	2	10	7820	7829	20 %	60 %	20 %	0 %	385239411
137	NC_017165	ACT	2	6	8334	8339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239412
138	NC_017165	ATC	2	6	8356	8361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239412
139	NC_017165	CAT	2	6	8437	8442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239412
140	NC_017165	ATC	2	6	8503	8508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239412
141	NC_017165	AAT	2	6	8603	8608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239412

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.