MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-07 plasmid pAPA07-010

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017143	GGAAA	2	10	1869	1878	60 %	0 %	40 %	0 %	384055291
2	NC_017143	TGCCA	2	10	3100	3109	20 %	20 %	20 %	40 %	384055292
3	NC_017143	CGATC	2	10	3215	3224	20 %	20 %	20 %	40 %	384055292
4	NC_017143	GAGCT	2	10	3806	3815	20 %	20 %	40 %	20 %	384055293
5	NC_017143	CTGTG	2	10	5534	5543	0 %	40 %	40 %	20 %	384055295
6	NC_017143	ATCCG	2	10	8722	8731	20 %	20 %	20 %	40 %	384055298
7	NC_017143	AAGCC	2	10	9063	9072	40 %	0 %	20 %	40 %	384055299
8	NC_017143	TACGC	2	10	11257	11266	20 %	20 %	20 %	40 %	384055299
9	NC_017143	GGACA	2	10	18664	18673	40 %	0 %	40 %	20 %	384055304
10	NC_017143	ACCAC	2	10	20504	20513	40 %	0 %	0 %	60 %	384055305
11	NC_017143	CCAGC	2	10	20973	20982	20 %	0 %	20 %	60 %	384055307
12	NC_017143	CTGGC	2	10	22804	22813	0 %	20 %	40 %	40 %	384055309
13	NC_017143	TGCAA	2	10	23370	23379	40 %	20 %	20 %	20 %	384055309
14	NC_017143	CTGGT	2	10	23661	23670	0 %	40 %	40 %	20 %	384055309
15	NC_017143	TGTCC	2	10	29539	29548	0 %	40 %	20 %	40 %	384055314
16	NC_017143	CACCT	2	10	32507	32516	20 %	20 %	0 %	60 %	384055317
17	NC_017143	GCAGG	2	10	36224	36233	20 %	0 %	60 %	20 %	384055320
18	NC_017143	GCTGT	2	10	37273	37282	0 %	40 %	40 %	20 %	384055321
19	NC_017143	CATGC	2	10	39458	39467	20 %	20 %	20 %	40 %	384055324
20	NC_017143	TGTCC	2	10	41521	41530	0 %	40 %	20 %	40 %	384055326
21	NC_017143	TGTCC	2	10	43190	43199	0 %	40 %	20 %	40 %	384055327
22	NC_017143	ATGGC	2	10	45892	45901	20 %	20 %	40 %	20 %	384055330
23	NC_017143	CCTGA	2	10	46426	46435	20 %	20 %	20 %	40 %	384055330
24	NC_017143	TTATT	2	10	50878	50887	20 %	80 %	0 %	0 %	384055335
25	NC_017143	CGTTC	2	10	51425	51434	0 %	40 %	20 %	40 %	384055336
26	NC_017143	CGGTC	2	10	53171	53180	0 %	20 %	40 %	40 %	384055337
27	NC_017143	GAAGC	2	10	56315	56324	40 %	0 %	40 %	20 %	384055338
28	NC_017143	TCAAG	2	10	57353	57362	40 %	20 %	20 %	20 %	384055339
29	NC_017143	CAGGA	2	10	58473	58482	40 %	0 %	40 %	20 %	384055340
30	NC_017143	CGGAC	2	10	59327	59336	20 %	0 %	40 %	40 %	384055340
31	NC_017143	CACAT	2	10	62762	62771	40 %	20 %	0 %	40 %	384055343
32	NC_017143	ACACA	2	10	65526	65535	60 %	0 %	0 %	40 %	384055345
33	NC_017143	TTACA	2	10	68924	68933	40 %	40 %	0 %	20 %	384055347
34	NC_017143	ACTGT	2	10	69029	69038	20 %	40 %	20 %	20 %	384055347
35	NC_017143	CAACG	2	10	70441	70450	40 %	0 %	20 %	40 %	384055348
36	NC_017143	CCGTC	2	10	71426	71435	0 %	20 %	20 %	60 %	384055349
37	NC_017143	AGCAG	2	10	73839	73848	40 %	0 %	40 %	20 %	384055351
38	NC_017143	GGACA	2	10	75241	75250	40 %	0 %	40 %	20 %	384055353
39	NC_017143	CACAC	2	10	77055	77064	40 %	0 %	0 %	60 %	384055354
40	NC_017143	ACGCC	2	10	81206	81215	20 %	0 %	20 %	60 %	384055356
41	NC_017143	CCGCG	2	10	82121	82130	0 %	0 %	40 %	60 %	384055357
42	NC_017143	GCACA	2	10	83016	83025	40 %	0 %	20 %	40 %	384055358
43	NC_017143	GCTGT	2	10	84542	84551	0 %	40 %	40 %	20 %	384055360
44	NC_017143	CCGAG	2	10	86957	86966	20 %	0 %	40 %	40 %	384055362
45	NC_017143	GGACA	2	10	88631	88640	40 %	0 %	40 %	20 %	384055363
46	NC_017143	TTTCT	2	10	89964	89973	0 %	80 %	0 %	20 %	384055364
47	NC_017143	TCCTC	2	10	92018	92027	0 %	40 %	0 %	60 %	384055366
48	NC_017143	TGTCC	2	10	94417	94426	0 %	40 %	20 %	40 %	384055368
49	NC_017143	ATGCA	2	10	97985	97994	40 %	20 %	20 %	20 %	384055372
50	NC_017143	CCTGA	2	10	100412	100421	20 %	20 %	20 %	40 %	384055374
51	NC_017143	CATTG	2	10	100452	100461	20 %	40 %	20 %	20 %	384055374
52	NC_017143	CAAGG	2	10	101510	101519	40 %	0 %	40 %	20 %	384055374
53	NC_017143	CTGGG	2	10	101756	101765	0 %	20 %	60 %	20 %	384055374
54	NC_017143	AGGGG	2	10	102000	102009	20 %	0 %	80 %	0 %	384055374
55	NC_017143	CTATT	2	10	105164	105173	20 %	60 %	0 %	20 %	384055378
56	NC_017143	GTCAC	2	10	114532	114541	20 %	20 %	20 %	40 %	384055390
57	NC_017143	TTGGA	2	10	117884	117893	20 %	40 %	40 %	0 %	384055391
58	NC_017143	CGGTT	2	10	118992	119001	0 %	40 %	40 %	20 %	384055392
59	NC_017143	CGTCC	2	10	125739	125748	0 %	20 %	20 %	60 %	384055400
60	NC_017143	TTTCA	2	10	125980	125989	20 %	60 %	0 %	20 %	384055400
61	NC_017143	TTATT	2	10	128712	128721	20 %	80 %	0 %	0 %	384055404
62	NC_017143	GGACA	2	10	129741	129750	40 %	0 %	40 %	20 %	384055406
63	NC_017143	GCCCT	2	10	131732	131741	0 %	20 %	20 %	60 %	384055408
64	NC_017143	GCCAC	2	10	133334	133343	20 %	0 %	20 %	60 %	384055410
65	NC_017143	GCTGG	2	10	133843	133852	0 %	20 %	60 %	20 %	384055410
66	NC_017143	AGCGA	2	10	134278	134287	40 %	0 %	40 %	20 %	384055412
67	NC_017143	TCCGT	2	10	136931	136940	0 %	40 %	20 %	40 %	384055416
68	NC_017143	CTGCG	2	10	137659	137668	0 %	20 %	40 %	40 %	384055416
69	NC_017143	TCGCG	2	10	138194	138203	0 %	20 %	40 %	40 %	384055416
70	NC_017143	CGTCC	2	10	140341	140350	0 %	20 %	20 %	60 %	384055418
71	NC_017143	GGACA	2	10	140843	140852	40 %	0 %	40 %	20 %	384055419
72	NC_017143	CATGG	2	10	142960	142969	20 %	20 %	40 %	20 %	384055421
73	NC_017143	AATTA	2	10	143125	143134	60 %	40 %	0 %	0 %	384055421
74	NC_017143	TGTCC	2	10	145872	145881	0 %	40 %	20 %	40 %	384055422
75	NC_017143	ACCGT	2	10	146974	146983	20 %	20 %	20 %	40 %	384055423
76	NC_017143	GATCA	2	10	147606	147615	40 %	20 %	20 %	20 %	384055423
77	NC_017143	TGGGG	2	10	149552	149561	0 %	20 %	80 %	0 %	384055425
78	NC_017143	GGCAC	2	10	151674	151683	20 %	0 %	40 %	40 %	384055427
79	NC_017143	CCAAC	2	10	157572	157581	40 %	0 %	0 %	60 %	384055434
80	NC_017143	CTGCC	2	10	158689	158698	0 %	20 %	20 %	60 %	384055438
81	NC_017143	GCCAT	2	10	159041	159050	20 %	20 %	20 %	40 %	384055439
82	NC_017143	GCCAC	2	10	159863	159872	20 %	0 %	20 %	60 %	384055440
83	NC_017143	TGTCC	2	10	161326	161335	0 %	40 %	20 %	40 %	384055441
84	NC_017143	TGCCC	2	10	162875	162884	0 %	20 %	20 %	60 %	384055443
85	NC_017143	GGACA	2	10	164112	164121	40 %	0 %	40 %	20 %	384055445
86	NC_017143	CATCT	2	10	165605	165614	20 %	40 %	0 %	40 %	384055446
87	NC_017143	ATCGC	2	10	165864	165873	20 %	20 %	20 %	40 %	384055446
88	NC_017143	CCAAC	2	10	166064	166073	40 %	0 %	0 %	60 %	384055447
89	NC_017143	TCCGG	2	10	167303	167312	0 %	20 %	40 %	40 %	384055447
90	NC_017143	TCCGG	2	10	171792	171801	0 %	20 %	40 %	40 %	384055451
91	NC_017143	TCGCG	2	10	171852	171861	0 %	20 %	40 %	40 %	384055451
92	NC_017143	CCCGG	2	10	172059	172068	0 %	0 %	40 %	60 %	384055452
93	NC_017143	GTCCG	2	10	172663	172672	0 %	20 %	40 %	40 %	384055452
94	NC_017143	TGATC	2	10	173413	173422	20 %	40 %	20 %	20 %	384055453
95	NC_017143	ACACC	2	10	174986	174995	40 %	0 %	0 %	60 %	384055455
96	NC_017143	AGTAG	2	10	175619	175628	40 %	20 %	40 %	0 %	384055455
97	NC_017143	CGATG	2	10	177197	177206	20 %	20 %	40 %	20 %	384055456
98	NC_017143	GGAAA	2	10	178085	178094	60 %	0 %	40 %	0 %	384055457
99	NC_017143	TGTCC	2	10	181934	181943	0 %	40 %	20 %	40 %	384055460
100	NC_017143	TGTCC	2	10	183615	183624	0 %	40 %	20 %	40 %	384055461
101	NC_017143	GCCCA	2	10	184918	184927	20 %	0 %	20 %	60 %	384055463
102	NC_017143	TGCTC	2	10	185727	185736	0 %	40 %	20 %	40 %	384055463
103	NC_017143	CCGAG	2	10	186324	186333	20 %	0 %	40 %	40 %	384055463
104	NC_017143	CATGC	2	10	186871	186880	20 %	20 %	20 %	40 %	384055464
105	NC_017143	CCTGC	2	10	187451	187460	0 %	20 %	20 %	60 %	384055464
106	NC_017143	ACGAC	2	10	190011	190020	40 %	0 %	20 %	40 %	384055465

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.