MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-26 plasmid pAPA26-013

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017130	CTTC	2	8	304	311	0 %	50 %	0 %	50 %	384061217
2	NC_017130	CTGA	2	8	386	393	25 %	25 %	25 %	25 %	384061217
3	NC_017130	GCTG	2	8	1987	1994	0 %	25 %	50 %	25 %	384061219
4	NC_017130	CTGC	2	8	3356	3363	0 %	25 %	25 %	50 %	384061220
5	NC_017130	CAGC	2	8	4068	4075	25 %	0 %	25 %	50 %	384061221
6	NC_017130	TGAT	2	8	5583	5590	25 %	50 %	25 %	0 %	384061223
7	NC_017130	GCAC	2	8	5883	5890	25 %	0 %	25 %	50 %	384061223
8	NC_017130	CCAT	2	8	7170	7177	25 %	25 %	0 %	50 %	384061224
9	NC_017130	GAAA	2	8	7948	7955	75 %	0 %	25 %	0 %	384061225
10	NC_017130	TTGC	2	8	8747	8754	0 %	50 %	25 %	25 %	384061226
11	NC_017130	TTGG	2	8	8768	8775	0 %	50 %	50 %	0 %	384061226
12	NC_017130	TCTT	2	8	8903	8910	0 %	75 %	0 %	25 %	384061226
13	NC_017130	GTCA	2	8	9300	9307	25 %	25 %	25 %	25 %	384061227
14	NC_017130	CCAG	2	8	9820	9827	25 %	0 %	25 %	50 %	384061227
15	NC_017130	TTCT	2	8	10274	10281	0 %	75 %	0 %	25 %	384061227
16	NC_017130	ATGG	2	8	10859	10866	25 %	25 %	50 %	0 %	384061227
17	NC_017130	CAGC	2	8	11443	11450	25 %	0 %	25 %	50 %	384061227
18	NC_017130	AAAG	2	8	11591	11598	75 %	0 %	25 %	0 %	384061227
19	NC_017130	CTTG	2	8	11955	11962	0 %	50 %	25 %	25 %	384061227
20	NC_017130	TTCG	2	8	12338	12345	0 %	50 %	25 %	25 %	384061227
21	NC_017130	GTCA	2	8	12993	13000	25 %	25 %	25 %	25 %	384061227
22	NC_017130	CAGA	2	8	14003	14010	50 %	0 %	25 %	25 %	384061228
23	NC_017130	TGGC	2	8	14343	14350	0 %	25 %	50 %	25 %	384061228
24	NC_017130	GCAC	2	8	14470	14477	25 %	0 %	25 %	50 %	384061228
25	NC_017130	GACA	2	8	14629	14636	50 %	0 %	25 %	25 %	384061228
26	NC_017130	GAAG	2	8	14647	14654	50 %	0 %	50 %	0 %	384061228
27	NC_017130	CGTC	2	8	15286	15293	0 %	25 %	25 %	50 %	384061228
28	NC_017130	TCGG	2	8	15756	15763	0 %	25 %	50 %	25 %	384061229
29	NC_017130	TTGC	2	8	16062	16069	0 %	50 %	25 %	25 %	384061229
30	NC_017130	CGGG	2	8	16559	16566	0 %	0 %	75 %	25 %	384061230
31	NC_017130	CTTC	2	8	17414	17421	0 %	50 %	0 %	50 %	384061230
32	NC_017130	GACG	2	8	18678	18685	25 %	0 %	50 %	25 %	384061232
33	NC_017130	GCGG	2	8	19486	19493	0 %	0 %	75 %	25 %	384061232
34	NC_017130	GCCA	2	8	19621	19628	25 %	0 %	25 %	50 %	384061232
35	NC_017130	TCTG	2	8	19961	19968	0 %	50 %	25 %	25 %	384061232
36	NC_017130	TCGA	2	8	20348	20355	25 %	25 %	25 %	25 %	384061233
37	NC_017130	GAAG	2	8	20515	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	384061233
38	NC_017130	AAGA	2	8	20558	20565	75 %	0 %	25 %	0 %	384061233
39	NC_017130	GAAG	2	8	20943	20950	50 %	0 %	50 %	0 %	384061234
40	NC_017130	TGGA	2	8	21358	21365	25 %	25 %	50 %	0 %	384061235
41	NC_017130	GTCA	2	8	21531	21538	25 %	25 %	25 %	25 %	384061235
42	NC_017130	AGAT	2	8	22339	22346	50 %	25 %	25 %	0 %	384061236
43	NC_017130	GCTC	2	8	23012	23019	0 %	25 %	25 %	50 %	384061237
44	NC_017130	CTAT	2	8	23042	23049	25 %	50 %	0 %	25 %	384061237
45	NC_017130	GCTG	2	8	24150	24157	0 %	25 %	50 %	25 %	384061237
46	NC_017130	AGAA	2	8	24845	24852	75 %	0 %	25 %	0 %	384061237
47	NC_017130	GATA	2	8	24873	24880	50 %	25 %	25 %	0 %	384061237
48	NC_017130	CAAA	2	8	25286	25293	75 %	0 %	0 %	25 %	384061238
49	NC_017130	GGCA	2	8	26056	26063	25 %	0 %	50 %	25 %	384061239
50	NC_017130	TGCG	2	8	26088	26095	0 %	25 %	50 %	25 %	384061239
51	NC_017130	AAGG	2	8	26126	26133	50 %	0 %	50 %	0 %	384061239
52	NC_017130	CCAT	2	8	26812	26819	25 %	25 %	0 %	50 %	384061240
53	NC_017130	CAGA	2	8	28244	28251	50 %	0 %	25 %	25 %	384061242
54	NC_017130	TGGC	2	8	28584	28591	0 %	25 %	50 %	25 %	384061242
55	NC_017130	GCAC	2	8	28711	28718	25 %	0 %	25 %	50 %	384061242
56	NC_017130	GAAG	2	8	28888	28895	50 %	0 %	50 %	0 %	384061242
57	NC_017130	CGTC	2	8	29527	29534	0 %	25 %	25 %	50 %	384061242
58	NC_017130	GTCA	2	8	30145	30152	25 %	25 %	25 %	25 %	384061243
59	NC_017130	ATCT	2	8	31148	31155	25 %	50 %	0 %	25 %	384061244
60	NC_017130	AGGT	2	8	31416	31423	25 %	25 %	50 %	0 %	384061244
61	NC_017130	TTCC	2	8	31640	31647	0 %	50 %	0 %	50 %	384061244
62	NC_017130	AACG	2	8	31981	31988	50 %	0 %	25 %	25 %	384061245
63	NC_017130	GAAC	2	8	32064	32071	50 %	0 %	25 %	25 %	384061245
64	NC_017130	CCAA	2	8	32123	32130	50 %	0 %	0 %	50 %	384061245
65	NC_017130	GGAA	2	8	32802	32809	50 %	0 %	50 %	0 %	384061245
66	NC_017130	TGAT	2	8	33789	33796	25 %	50 %	25 %	0 %	384061246
67	NC_017130	TGGT	2	8	34038	34045	0 %	50 %	50 %	0 %	384061247
68	NC_017130	GCGT	2	8	34442	34449	0 %	25 %	50 %	25 %	384061248
69	NC_017130	ACCC	2	8	34994	35001	25 %	0 %	0 %	75 %	384061248
70	NC_017130	GACA	2	8	35690	35697	50 %	0 %	25 %	25 %	384061248
71	NC_017130	CGTG	2	8	35841	35848	0 %	25 %	50 %	25 %	384061248
72	NC_017130	ATCA	2	8	35860	35867	50 %	25 %	0 %	25 %	384061248
73	NC_017130	CTGG	2	8	35964	35971	0 %	25 %	50 %	25 %	384061248
74	NC_017130	TCAT	2	8	36041	36048	25 %	50 %	0 %	25 %	384061248
75	NC_017130	CGCA	2	8	36318	36325	25 %	0 %	25 %	50 %	384061248
76	NC_017130	CCGT	2	8	36458	36465	0 %	25 %	25 %	50 %	384061248
77	NC_017130	GAGC	2	8	36824	36831	25 %	0 %	50 %	25 %	384061248
78	NC_017130	GAAT	2	8	36985	36992	50 %	25 %	25 %	0 %	384061248
79	NC_017130	CGAT	2	8	37470	37477	25 %	25 %	25 %	25 %	384061249
80	NC_017130	CGGG	2	8	37750	37757	0 %	0 %	75 %	25 %	384061249
81	NC_017130	TTGA	2	8	38077	38084	25 %	50 %	25 %	0 %	384061250
82	NC_017130	ACCC	2	8	38754	38761	25 %	0 %	0 %	75 %	384061251
83	NC_017130	CGCA	2	8	38901	38908	25 %	0 %	25 %	50 %	384061251
84	NC_017130	GGGA	2	8	39524	39531	25 %	0 %	75 %	0 %	384061252
85	NC_017130	CAGA	2	8	39699	39706	50 %	0 %	25 %	25 %	384061253
86	NC_017130	TGGC	2	8	40039	40046	0 %	25 %	50 %	25 %	384061253
87	NC_017130	CAGA	2	8	40218	40225	50 %	0 %	25 %	25 %	384061254
88	NC_017130	TGGC	2	8	40558	40565	0 %	25 %	50 %	25 %	384061254
89	NC_017130	GCAC	2	8	40685	40692	25 %	0 %	25 %	50 %	384061254
90	NC_017130	GAAG	2	8	40862	40869	50 %	0 %	50 %	0 %	384061254
91	NC_017130	CGTC	2	8	41501	41508	0 %	25 %	25 %	50 %	384061254
92	NC_017130	CAGA	2	8	41887	41894	50 %	0 %	25 %	25 %	384061255
93	NC_017130	TGGC	2	8	42227	42234	0 %	25 %	50 %	25 %	384061255
94	NC_017130	GCAC	2	8	42354	42361	25 %	0 %	25 %	50 %	384061255
95	NC_017130	GAAG	2	8	42531	42538	50 %	0 %	50 %	0 %	384061255
96	NC_017130	CGTC	2	8	43170	43177	0 %	25 %	25 %	50 %	384061255
97	NC_017130	TCCG	2	8	44090	44097	0 %	25 %	25 %	50 %	384061256
98	NC_017130	CTGG	2	8	45084	45091	0 %	25 %	50 %	25 %	384061257
99	NC_017130	GGCA	2	8	45146	45153	25 %	0 %	50 %	25 %	384061257
100	NC_017130	ATGG	2	8	45556	45563	25 %	25 %	50 %	0 %	384061258
101	NC_017130	TGCC	2	8	45674	45681	0 %	25 %	25 %	50 %	384061258
102	NC_017130	GCAC	2	8	46052	46059	25 %	0 %	25 %	50 %	384061258
103	NC_017130	GTCT	2	8	46283	46290	0 %	50 %	25 %	25 %	384061258
104	NC_017130	TGGT	2	8	46325	46332	0 %	50 %	50 %	0 %	384061258
105	NC_017130	AATG	2	8	46656	46663	50 %	25 %	25 %	0 %	384061259
106	NC_017130	ACCT	2	8	47780	47787	25 %	25 %	0 %	50 %	384061259
107	NC_017130	ATTG	2	8	47823	47830	25 %	50 %	25 %	0 %	384061259
108	NC_017130	CGTC	2	8	48900	48907	0 %	25 %	25 %	50 %	384061261
109	NC_017130	GCGT	2	8	49064	49071	0 %	25 %	50 %	25 %	384061261
110	NC_017130	GCGT	2	8	49885	49892	0 %	25 %	50 %	25 %	384061262
111	NC_017130	CATC	2	8	50366	50373	25 %	25 %	0 %	50 %	384061262
112	NC_017130	AGCG	2	8	50481	50488	25 %	0 %	50 %	25 %	384061262
113	NC_017130	ACGA	2	8	50886	50893	50 %	0 %	25 %	25 %	384061263
114	NC_017130	GGAC	2	8	51014	51021	25 %	0 %	50 %	25 %	384061263
115	NC_017130	GGTC	2	8	52001	52008	0 %	25 %	50 %	25 %	384061264
116	NC_017130	GAAA	2	8	52639	52646	75 %	0 %	25 %	0 %	384061264
117	NC_017130	TGCC	2	8	54319	54326	0 %	25 %	25 %	50 %	384061265
118	NC_017130	GTGG	2	8	54661	54668	0 %	25 %	75 %	0 %	384061265
119	NC_017130	CCTT	2	8	54674	54681	0 %	50 %	0 %	50 %	384061265
120	NC_017130	CCTT	2	8	55414	55421	0 %	50 %	0 %	50 %	384061266
121	NC_017130	CAGG	2	8	55769	55776	25 %	0 %	50 %	25 %	384061266
122	NC_017130	TGTT	2	8	56599	56606	0 %	75 %	25 %	0 %	384061266
123	NC_017130	TTTC	2	8	56923	56930	0 %	75 %	0 %	25 %	384061267
124	NC_017130	GCGG	2	8	56998	57005	0 %	0 %	75 %	25 %	384061267
125	NC_017130	GGTT	2	8	57033	57040	0 %	50 %	50 %	0 %	384061267
126	NC_017130	TGGA	2	8	57885	57892	25 %	25 %	50 %	0 %	384061268
127	NC_017130	CTCC	2	8	58896	58903	0 %	25 %	0 %	75 %	384061268
128	NC_017130	AGAA	2	8	59360	59367	75 %	0 %	25 %	0 %	384061268
129	NC_017130	CGTC	2	8	59926	59933	0 %	25 %	25 %	50 %	384061268
130	NC_017130	ATGG	2	8	60362	60369	25 %	25 %	50 %	0 %	384061269
131	NC_017130	GGAT	2	8	61786	61793	25 %	25 %	50 %	0 %	384061270
132	NC_017130	CCCG	2	8	62253	62260	0 %	0 %	25 %	75 %	384061270
133	NC_017130	CTGT	2	8	62285	62292	0 %	50 %	25 %	25 %	384061270
134	NC_017130	AATC	2	8	62983	62990	50 %	25 %	0 %	25 %	384061271
135	NC_017130	GACG	2	8	63679	63686	25 %	0 %	50 %	25 %	384061272
136	NC_017130	GGTC	2	8	63949	63956	0 %	25 %	50 %	25 %	384061272
137	NC_017130	CTTC	2	8	64318	64325	0 %	50 %	0 %	50 %	384061272
138	NC_017130	CGGG	2	8	64488	64495	0 %	0 %	75 %	25 %	384061272
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408	NC_017130	ATGG	2	8	185405	185412	25 %	25 %	50 %	0 %	384061391
409	NC_017130	CCGG	2	8	185456	185463	0 %	0 %	50 %	50 %	384061391
410	NC_017130	ACCG	2	8	185876	185883	25 %	0 %	25 %	50 %	384061391
411	NC_017130	CATC	2	8	185902	185909	25 %	25 %	0 %	50 %	384061391
412	NC_017130	CCGC	2	8	186094	186101	0 %	0 %	25 %	75 %	384061391
413	NC_017130	GGCC	2	8	186559	186566	0 %	0 %	50 %	50 %	384061391
414	NC_017130	CTTC	2	8	187254	187261	0 %	50 %	0 %	50 %	384061392
415	NC_017130	CCAA	2	8	188046	188053	50 %	0 %	0 %	50 %	384061392
416	NC_017130	GATC	2	8	189945	189952	25 %	25 %	25 %	25 %	384061393

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.