MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-07 plasmid pAPA07-020

Total Repeats: 405

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017122	CGGG	2	8	87	94	0 %	0 %	75 %	25 %	384052413
2	NC_017122	TCTG	2	8	561	568	0 %	50 %	25 %	25 %	384052414
3	NC_017122	CGTC	2	8	874	881	0 %	25 %	25 %	50 %	384052415
4	NC_017122	AACA	2	8	1292	1299	75 %	0 %	0 %	25 %	384052416
5	NC_017122	TGGC	2	8	2514	2521	0 %	25 %	50 %	25 %	384052418
6	NC_017122	TCGT	2	8	3343	3350	0 %	50 %	25 %	25 %	384052420
7	NC_017122	CCAT	2	8	3600	3607	25 %	25 %	0 %	50 %	384052420
8	NC_017122	ATAA	2	8	3657	3664	75 %	25 %	0 %	0 %	384052420
9	NC_017122	TGGG	2	8	4569	4576	0 %	25 %	75 %	0 %	384052422
10	NC_017122	CCTT	2	8	4594	4601	0 %	50 %	0 %	50 %	384052422
11	NC_017122	CATG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	25 %	25 %	384052423
12	NC_017122	CGGC	2	8	7116	7123	0 %	0 %	50 %	50 %	384052424
13	NC_017122	GCCT	2	8	7360	7367	0 %	25 %	25 %	50 %	384052424
14	NC_017122	GGGC	2	8	7433	7440	0 %	0 %	75 %	25 %	384052424
15	NC_017122	GCCA	2	8	7656	7663	25 %	0 %	25 %	50 %	384052424
16	NC_017122	GATG	2	8	8287	8294	25 %	25 %	50 %	0 %	384052425
17	NC_017122	ACGC	2	8	8768	8775	25 %	0 %	25 %	50 %	384052425
18	NC_017122	GTGC	2	8	9582	9589	0 %	25 %	50 %	25 %	384052426
19	NC_017122	CACC	2	8	10017	10024	25 %	0 %	0 %	75 %	384052426
20	NC_017122	CCAT	2	8	10099	10106	25 %	25 %	0 %	50 %	384052426
21	NC_017122	GACG	2	8	10779	10786	25 %	0 %	50 %	25 %	384052427
22	NC_017122	CTTC	2	8	11418	11425	0 %	50 %	0 %	50 %	384052427
23	NC_017122	CGGG	2	8	11588	11595	0 %	0 %	75 %	25 %	384052427
24	NC_017122	GCCA	2	8	11722	11729	25 %	0 %	25 %	50 %	384052427
25	NC_017122	TCGA	2	8	12627	12634	25 %	25 %	25 %	25 %	384052428
26	NC_017122	ATGG	2	8	13366	13373	25 %	25 %	50 %	0 %	384052429
27	NC_017122	TATC	2	8	13486	13493	25 %	50 %	0 %	25 %	384052429
28	NC_017122	ACCC	2	8	13601	13608	25 %	0 %	0 %	75 %	384052429
29	NC_017122	AGAC	2	8	13721	13728	50 %	0 %	25 %	25 %	384052429
30	NC_017122	TCCT	2	8	14307	14314	0 %	50 %	0 %	50 %	384052430
31	NC_017122	TGCG	2	8	14597	14604	0 %	25 %	50 %	25 %	384052430
32	NC_017122	AGTG	2	8	14704	14711	25 %	25 %	50 %	0 %	384052430
33	NC_017122	CAAT	2	8	15055	15062	50 %	25 %	0 %	25 %	384052430
34	NC_017122	AGAT	2	8	15129	15136	50 %	25 %	25 %	0 %	384052430
35	NC_017122	CAGC	2	8	15743	15750	25 %	0 %	25 %	50 %	384052431
36	NC_017122	AACC	2	8	15848	15855	50 %	0 %	0 %	50 %	384052431
37	NC_017122	AAAC	2	8	16914	16921	75 %	0 %	0 %	25 %	384052432
38	NC_017122	CAGA	2	8	17163	17170	50 %	0 %	25 %	25 %	384052432
39	NC_017122	ACAT	2	8	17816	17823	50 %	25 %	0 %	25 %	384052432
40	NC_017122	GTCA	2	8	18151	18158	25 %	25 %	25 %	25 %	384052432
41	NC_017122	GGGC	2	8	18324	18331	0 %	0 %	75 %	25 %	384052433
42	NC_017122	AGAT	2	8	18582	18589	50 %	25 %	25 %	0 %	384052433
43	NC_017122	CAGA	2	8	19019	19026	50 %	0 %	25 %	25 %	384052434
44	NC_017122	CCGC	2	8	19208	19215	0 %	0 %	25 %	75 %	384052434
45	NC_017122	GTAT	2	8	20679	20686	25 %	50 %	25 %	0 %	384052435
46	NC_017122	GACA	2	8	20979	20986	50 %	0 %	25 %	25 %	384052435
47	NC_017122	TGAA	2	8	21102	21109	50 %	25 %	25 %	0 %	384052435
48	NC_017122	GAAC	2	8	21813	21820	50 %	0 %	25 %	25 %	384052436
49	NC_017122	GAAG	2	8	23380	23387	50 %	0 %	50 %	0 %	384052437
50	NC_017122	GATG	2	8	23793	23800	25 %	25 %	50 %	0 %	384052438
51	NC_017122	GTCA	2	8	23968	23975	25 %	25 %	25 %	25 %	384052438
52	NC_017122	TTTG	2	8	24102	24109	0 %	75 %	25 %	0 %	384052438
53	NC_017122	CATC	2	8	24507	24514	25 %	25 %	0 %	50 %	384052439
54	NC_017122	CGCA	2	8	25688	25695	25 %	0 %	25 %	50 %	384052440
55	NC_017122	ATCA	2	8	25916	25923	50 %	25 %	0 %	25 %	384052440
56	NC_017122	TGCC	2	8	25988	25995	0 %	25 %	25 %	50 %	384052440
57	NC_017122	TCAC	2	8	26123	26130	25 %	25 %	0 %	50 %	384052441
58	NC_017122	AGCC	3	12	26574	26585	25 %	0 %	25 %	50 %	384052441
59	NC_017122	TCCA	2	8	27262	27269	25 %	25 %	0 %	50 %	384052441
60	NC_017122	TGGC	2	8	27494	27501	0 %	25 %	50 %	25 %	384052441
61	NC_017122	GTCC	2	8	27542	27549	0 %	25 %	25 %	50 %	384052441
62	NC_017122	CGGA	2	8	29386	29393	25 %	0 %	50 %	25 %	384052441
63	NC_017122	TGGC	2	8	29654	29661	0 %	25 %	50 %	25 %	384052442
64	NC_017122	CATC	2	8	31929	31936	25 %	25 %	0 %	50 %	384052445
65	NC_017122	AACC	2	8	32208	32215	50 %	0 %	0 %	50 %	384052445
66	NC_017122	AGCC	2	8	33025	33032	25 %	0 %	25 %	50 %	384052445
67	NC_017122	CTGC	2	8	34244	34251	0 %	25 %	25 %	50 %	384052447
68	NC_017122	CCAA	2	8	34290	34297	50 %	0 %	0 %	50 %	384052447
69	NC_017122	TTGT	2	8	34645	34652	0 %	75 %	25 %	0 %	384052447
70	NC_017122	ATCC	2	8	34709	34716	25 %	25 %	0 %	50 %	384052447
71	NC_017122	TGCC	2	8	34783	34790	0 %	25 %	25 %	50 %	384052447
72	NC_017122	CAGC	2	8	35597	35604	25 %	0 %	25 %	50 %	384052448
73	NC_017122	AAGC	2	8	35822	35829	50 %	0 %	25 %	25 %	384052448
74	NC_017122	ACGA	2	8	35937	35944	50 %	0 %	25 %	25 %	384052448
75	NC_017122	AAAT	2	8	36012	36019	75 %	25 %	0 %	0 %	384052449
76	NC_017122	AGCC	2	8	36032	36039	25 %	0 %	25 %	50 %	384052449
77	NC_017122	AAGC	2	8	36262	36269	50 %	0 %	25 %	25 %	384052449
78	NC_017122	AACA	2	8	36440	36447	75 %	0 %	0 %	25 %	384052449
79	NC_017122	AAAG	2	8	36661	36668	75 %	0 %	25 %	0 %	384052449
80	NC_017122	GCAA	2	8	36672	36679	50 %	0 %	25 %	25 %	384052449
81	NC_017122	ATTT	2	8	37196	37203	25 %	75 %	0 %	0 %	384052450
82	NC_017122	CTGC	2	8	37669	37676	0 %	25 %	25 %	50 %	384052450
83	NC_017122	CCAG	2	8	37740	37747	25 %	0 %	25 %	50 %	384052450
84	NC_017122	TTTC	2	8	37873	37880	0 %	75 %	0 %	25 %	384052450
85	NC_017122	TGGA	2	8	38696	38703	25 %	25 %	50 %	0 %	384052451
86	NC_017122	CACG	2	8	39350	39357	25 %	0 %	25 %	50 %	384052452
87	NC_017122	GCCT	2	8	39607	39614	0 %	25 %	25 %	50 %	384052452
88	NC_017122	TTCA	2	8	39663	39670	25 %	50 %	0 %	25 %	384052452
89	NC_017122	TCAC	2	8	40248	40255	25 %	25 %	0 %	50 %	384052453
90	NC_017122	CCAT	2	8	40713	40720	25 %	25 %	0 %	50 %	384052453
91	NC_017122	GGCT	2	8	41097	41104	0 %	25 %	50 %	25 %	384052453
92	NC_017122	TGCG	3	12	41172	41183	0 %	25 %	50 %	25 %	384052453
93	NC_017122	CAGC	2	8	41461	41468	25 %	0 %	25 %	50 %	384052453
94	NC_017122	GTGC	2	8	42249	42256	0 %	25 %	50 %	25 %	384052453
95	NC_017122	CCAC	2	8	42398	42405	25 %	0 %	0 %	75 %	384052453
96	NC_017122	CTCA	2	8	42446	42453	25 %	25 %	0 %	50 %	384052453
97	NC_017122	GCAT	2	8	43157	43164	25 %	25 %	25 %	25 %	384052454
98	NC_017122	TATC	2	8	43212	43219	25 %	50 %	0 %	25 %	384052454
99	NC_017122	CAGA	2	8	43518	43525	50 %	0 %	25 %	25 %	384052454
100	NC_017122	CTGC	2	8	43734	43741	0 %	25 %	25 %	50 %	384052454
101	NC_017122	CCTG	2	8	43752	43759	0 %	25 %	25 %	50 %	384052454
102	NC_017122	ACCA	2	8	43789	43796	50 %	0 %	0 %	50 %	384052454
103	NC_017122	GCAG	2	8	44295	44302	25 %	0 %	50 %	25 %	384052455
104	NC_017122	CTGC	2	8	44309	44316	0 %	25 %	25 %	50 %	384052455
105	NC_017122	AAGC	2	8	44504	44511	50 %	0 %	25 %	25 %	384052455
106	NC_017122	CTGG	2	8	44804	44811	0 %	25 %	50 %	25 %	384052455
107	NC_017122	CCCT	2	8	45165	45172	0 %	25 %	0 %	75 %	384052455
108	NC_017122	CGAA	2	8	45401	45408	50 %	0 %	25 %	25 %	384052455
109	NC_017122	CCGG	2	8	45658	45665	0 %	0 %	50 %	50 %	384052456
110	NC_017122	GGCA	2	8	45743	45750	25 %	0 %	50 %	25 %	384052456
111	NC_017122	GCGT	2	8	47202	47209	0 %	25 %	50 %	25 %	384052458
112	NC_017122	CATC	2	8	47683	47690	25 %	25 %	0 %	50 %	384052458
113	NC_017122	AGCG	2	8	47798	47805	25 %	0 %	50 %	25 %	384052458
114	NC_017122	GACA	2	8	48781	48788	50 %	0 %	25 %	25 %	384052459
115	NC_017122	TGGT	2	8	48824	48831	0 %	50 %	50 %	0 %	384052459
116	NC_017122	CTGA	2	8	48857	48864	25 %	25 %	25 %	25 %	384052459
117	NC_017122	GAAC	2	8	48912	48919	50 %	0 %	25 %	25 %	384052459
118	NC_017122	CATC	2	8	49130	49137	25 %	25 %	0 %	50 %	384052459
119	NC_017122	CAAC	2	8	49859	49866	50 %	0 %	0 %	50 %	384052460
120	NC_017122	CTGA	2	8	49936	49943	25 %	25 %	25 %	25 %	384052460
121	NC_017122	GCCA	2	8	49986	49993	25 %	0 %	25 %	50 %	384052460
122	NC_017122	ATCA	2	8	50310	50317	50 %	25 %	0 %	25 %	384052460
123	NC_017122	CGGG	2	8	50494	50501	0 %	0 %	75 %	25 %	384052461
124	NC_017122	AATG	2	8	51414	51421	50 %	25 %	25 %	0 %	384052462
125	NC_017122	GATC	2	8	52992	52999	25 %	25 %	25 %	25 %	384052464
126	NC_017122	CAGT	2	8	53754	53761	25 %	25 %	25 %	25 %	384052466
127	NC_017122	GCCC	2	8	54389	54396	0 %	0 %	25 %	75 %	384052467
128	NC_017122	CGTC	2	8	54765	54772	0 %	25 %	25 %	50 %	384052467
129	NC_017122	CACC	2	8	54871	54878	25 %	0 %	0 %	75 %	384052467
130	NC_017122	ACAA	2	8	54945	54952	75 %	0 %	0 %	25 %	384052467
131	NC_017122	GGGT	2	8	55844	55851	0 %	25 %	75 %	0 %	384052468
132	NC_017122	CGGG	2	8	56177	56184	0 %	0 %	75 %	25 %	384052469
133	NC_017122	CAGG	2	8	56655	56662	25 %	0 %	50 %	25 %	384052469
134	NC_017122	CAGC	2	8	56840	56847	25 %	0 %	25 %	50 %	384052469
135	NC_017122	CGGA	2	8	57511	57518	25 %	0 %	50 %	25 %	384052470
136	NC_017122	ACGC	2	8	58813	58820	25 %	0 %	25 %	50 %	384052471
137	NC_017122	TTCC	2	8	59185	59192	0 %	50 %	0 %	50 %	384052472
138	NC_017122	CTGG	2	8	59622	59629	0 %	25 %	50 %	25 %	384052472
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.